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骨髓增生异常/骨髓增殖性肿瘤-不能分类的差异表达的信号通路蛋白分析
1
作者 惠吴函 叶飞 +2 位作者 张维 刘聪艳 徐娟 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期1062-1068,共7页
目的:对骨髓增生异常/骨髓增殖性肿瘤-不能分类(MDS/MPN-U)的信号通路蛋白进行筛选,探讨差异表达的蛋白在MDS/MPN-U发病机制中可能涉及的作用。方法:采用蛋白通路芯片技术(protein pathway array,PPA)比较10例M DS/M PN-U患者和10例正... 目的:对骨髓增生异常/骨髓增殖性肿瘤-不能分类(MDS/MPN-U)的信号通路蛋白进行筛选,探讨差异表达的蛋白在MDS/MPN-U发病机制中可能涉及的作用。方法:采用蛋白通路芯片技术(protein pathway array,PPA)比较10例M DS/M PN-U患者和10例正常对照中性粒细胞信号通路蛋白表达差异,并通过蛋白质组学数据应用平台(IPA)分析差异蛋白参与的信号传导通路及建立信号传导网络。结果:与正常对照组比较,MDS/MPN-U组中共有25种蛋白存在差异表达,其中15种蛋白表达上调,10种蛋白表达下调。这些蛋白主要参与影响10个信号传导通路,这些通路与细胞增殖和免疫相关,并且相互作用,形成复杂信号传导网络。结论:采用PPA技术筛选M DS/M PN-U信号通路蛋白差异表达谱,有利于揭示M DS/M PN-U发病机制及寻找新的治疗靶点。 展开更多
关键词 骨髓增生异常/骨髓增殖性肿瘤-不能分类 差异表达的信号通路蛋白 蛋白通路芯片
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bta-miR-146b对热应激奶牛乳腺上皮细胞乳蛋白合成信号通路的影响
2
作者 张悦宇 黄美琦 +2 位作者 张琳 齐颖 李秋玲 《浙江农业学报》 北大核心 2025年第6期1212-1220,共9页
为了探究热应激条件下bta-miR-146b对奶牛乳蛋白合成的影响,在奶牛乳腺上皮细胞中分别转染bta-miR-146b模拟物、bta-miR-146b抑制物、bta-miR-146b模拟物阴性对照物、bta-miR-146b抑制物阴性对照物,然后进行热应激(40℃)处理,通过实时... 为了探究热应激条件下bta-miR-146b对奶牛乳蛋白合成的影响,在奶牛乳腺上皮细胞中分别转染bta-miR-146b模拟物、bta-miR-146b抑制物、bta-miR-146b模拟物阴性对照物、bta-miR-146b抑制物阴性对照物,然后进行热应激(40℃)处理,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测各组细胞中的乳蛋白相关基因(CSN2、CSN3)和乳蛋白合成信号通路相关基因(JAK2、STAT5、mTOR、MAPK)的相对表达量,分析过表达bta-miR-146b和抑制表达bta-miR-146b在热应激与非热应激条件下对乳蛋白和乳蛋白合成信号通路的影响。结果显示:转染bta-miR-146b模拟物后乳腺上皮细胞中bta-miR-146b的表达量提高,转染bta-miR-146b抑制物后乳腺上皮细胞中bta-miR-146b的表达量降低;热应激会抑制空白对照组、bta-miR-146b模拟物组和bta-miR-146b抑制物组奶牛乳腺上皮细胞中CSN2、CSN3、JAK2、STAT5、mTOR、MAPK基因的表达;非热应激条件下,过表达bta-miR-146b会使CSN2、CSN3、JAK2、STAT5、mTOR、MAPK基因表达量显著降低,抑制表达bta-miR-146b会使CSN3、JAK2、STAT5、mTOR、MAPK基因表达量显著升高;热应激条件下,过表达bta-miR-146b会使CSN2、CSN3、JAK2、STAT5、mTOR、MAPK基因表达量显著降低,抑制表达bta-miR-146b会使这些基因表达量显著升高。综上所述,热应激处理和过表达bta-miR-146b均会显著抑制乳蛋白和乳蛋白合成信号通路的相关基因的表达,抑制表达bta-miR-146b会促进乳蛋白和乳蛋白合成信号通路相关基因的表达。 展开更多
关键词 奶牛 热应激 乳蛋白 信号通路 表达量
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基于子宫黏膜转录组研究调控蛋鸡产蛋后期蛋壳质量相关的基因和信号通路
3
作者 邵丹 瞿源 +1 位作者 刘良基 童海兵 《动物营养学报》 北大核心 2025年第2期1221-1233,共13页
本研究通过比较高、低质量蛋壳力学特性、超微结构和蛋鸡的子宫组织形态、基因表达差异,挖掘调控产蛋后期蛋壳质量的重要候选基因和信号通路。选用80周龄海兰褐蛋鸡12只,6只产鸡蛋蛋壳质量相对好[蛋壳强度为(3.54±0.11)kg/cm^(2),... 本研究通过比较高、低质量蛋壳力学特性、超微结构和蛋鸡的子宫组织形态、基因表达差异,挖掘调控产蛋后期蛋壳质量的重要候选基因和信号通路。选用80周龄海兰褐蛋鸡12只,6只产鸡蛋蛋壳质量相对好[蛋壳强度为(3.54±0.11)kg/cm^(2),蛋壳厚度为(385.06±12.46)mm]的为高质量组(HQE组),6只产鸡蛋蛋壳质量相对差[蛋壳强度为(2.54±0.07)kg/cm^(2),蛋壳厚度为(256.17±18.36)mm]的为低质量组(LQE组),每组每天收集6枚鸡蛋,累计收集5 d。鸡蛋称重后采用蛋壳强度仪测定蛋壳强度,螺旋测微仪测定蛋壳厚度,计算蛋壳比例;采用扫描电子显微镜观察蛋壳的超微结构,测定蛋壳有效层厚度、乳突层厚度和乳突宽度,计算乳突层厚度比例;运用组织切片技术比较2组蛋鸡子宫组织形态差异;运用转录组测序(RNA-seq)技术,比较2组子宫样本之间的差异表达基因(DEGs),并对其进行GO和KEGG富集分析。结果显示:与LQE相比,HQE组蛋壳强度、蛋壳厚度、蛋壳重和蛋壳比例显著增加(P<0.05),蛋壳有效层厚度、乳突层厚度和乳突层厚度比例显著增加(P<0.05),蛋鸡子宫黏膜组织管状腺细胞排布更紧密,子宫黏膜绒毛高度显著增加(P<0.05)。以LQE组为对照组,在HQE组子宫黏膜中筛选到303个DEGs,其中103个表达上调,200个表达下调;GO功能分析显示DEGs主要富集在DNA复制、免疫应答等生物过程;KEGG分析发现DEGs主要富集在细胞因子-细胞因子受体互作、Th17细胞分化、肿瘤坏死因子(TNF)、Toll样受体等与免疫、炎症反应相关的信号通路,其中信号转导和转录激活因子1(STAT1)、CC趋化因子受体2(CCR2)、CC趋化因子配体4(CCL4)、CC趋化因子配体20(CCL20)、白细胞介素18受体1(IL18R1)等基因在以上通路中反复富集,且在HQE组显著下调。由以上结果可知,产蛋后期蛋壳力学特性和超微结构变差的同时伴随着蛋鸡子宫组织形态变差,功能分析显示子宫黏膜组织上细胞因子-细胞因子受体互作等信号通路可能通过调控子宫免疫应答、炎症反应相关基因的表达在蛋壳矿化过程中发挥重要作用,该结果可为精准改善产蛋后期蛋壳质量提供理论依据。 展开更多
关键词 蛋鸡 产蛋后期 蛋壳 转录组测序 差异表达基因 信号通路
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FMDV 3D基因真核表达质粒的构建、表达及对Ⅰ型IFN信号通路的作用 被引量：2
4
作者 苗勤 吴香菊 +4 位作者 齐静 丛晓燕 李均同 王林 杜以军 《山东农业科学》 北大核心 2024年第2期144-150,共7页
本研究旨在构建口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)3D基因真核表达质粒,并探究其对Ⅰ型干扰素(interferon,IFN)信号通路的作用。根据GenBank序列合成3D基因并将其插入真核表达载体pXJ41构建真核表达质粒pXJ41-Myc-3D,经PCR... 本研究旨在构建口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)3D基因真核表达质粒,并探究其对Ⅰ型干扰素(interferon,IFN)信号通路的作用。根据GenBank序列合成3D基因并将其插入真核表达载体pXJ41构建真核表达质粒pXJ41-Myc-3D,经PCR、双酶切及测序鉴定正确后分别转染HEK-293T细胞和PK-15细胞,Western blotting及间接免疫荧光试验(indirect immunofluorescence assay,IFA)检测3D蛋白在细胞内的表达及定位。通过双荧光素酶报告基因(Luciferase)、Real-time PCR、TCID50等试验检测HEK-293T细胞中过表达3D蛋白对水疱性口炎病毒(Versicular stomatitis virus,VSV)诱导的Ⅰ型IFN信号通路的影响。结果显示,真核表达质粒pXJ41-Myc-3D构建成功;3D蛋白在HEK-293T细胞中表达,大小约为55 kDa,主要定位在细胞核中;3D蛋白抑制了VSV诱导的IFN-β启动子活性和IFN-β mRNA水平,促进了VSV的复制。本研究为深入探究3D蛋白抑制Ⅰ型IFN信号通路的作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 3D蛋白 真核表达 Ⅰ型IFN信号通路
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大肠癌围手术期患者阴虚证差异表达基因及信号通路分析 被引量：5
5
作者 洪朝金 卢丽琴 +2 位作者 郭勇 钦志泉 袁国荣 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2017年第6期1469-1472,I0016-I0018,共7页
方法:针对大肠癌围手术期患者的主要中医证候阴虚证,采集符合条件病例的大肠癌组织及癌周正常组织,采用罗氏公司含12×135K个基因的人全基因组芯片检测大肠癌组织差异表达基因,筛选并分析阴虚证癌组织组和癌周正常组织组的差异表达... 方法:针对大肠癌围手术期患者的主要中医证候阴虚证,采集符合条件病例的大肠癌组织及癌周正常组织,采用罗氏公司含12×135K个基因的人全基因组芯片检测大肠癌组织差异表达基因,筛选并分析阴虚证癌组织组和癌周正常组织组的差异表达基因,利用Pathway对相关基因进行生物信息学分析。结果:得出大肠癌围手术期患者阴虚证癌组织组和癌周正常组织组表达的差异基因共4869个,包括上调基因1574个,下调基因3295个。经检索数据库Gene Bank,获取基因名称等相关信息。进行Pathway分析,筛选出阴虚证癌组织组和癌周正常组织组之间具有显著差异表达基因主要涉及的信号转导通路。结论:大肠癌围手术期阴虚证癌组织组与癌周正常组织组比较,存在组织差异基因表达特征图谱,主要涉及主要涉及炎症反应,细胞内吞功能,矿物质吸收,酮体合成与分解功能,免疫功能等相关基因。其主要信号转导通路包括MAPK信号通路及p53信号通路等。 展开更多
关键词 大肠癌围手术期 阴虚证 基因差异表达 信号转导通路
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cDNA微阵列结合信号通路分析喉鳞癌差异表达基因 被引量：2
6
作者 陈杰 田勇泉 +3 位作者 肖健云 邢晓为 左朝辉 黄文孝 《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期483-486,共4页
关键词 喉鳞癌 芯片 信号通路 差异表达基因
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胰腺上皮内瘤变和胰腺癌组织中TGF-β/Smad信号通路相关蛋白表达 被引量：4
7
作者 郑建明 朱明华 +3 位作者 倪灿荣 刘晓红 黄玲 李兆申 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期327-331,共5页
目的探讨转化生长因子(TGF)β/Smad信号传导通路中Smad相关蛋白、TGFβ1及其Ⅰ、Ⅱ型受体在胰腺上皮内瘤变(PanIN)和胰腺癌组织中表达的意义。方法用免疫组化EnVision法和SP法检测266灶不同级别PanINs和121例胰腺癌组织中Smad相关蛋白、... 目的探讨转化生长因子(TGF)β/Smad信号传导通路中Smad相关蛋白、TGFβ1及其Ⅰ、Ⅱ型受体在胰腺上皮内瘤变(PanIN)和胰腺癌组织中表达的意义。方法用免疫组化EnVision法和SP法检测266灶不同级别PanINs和121例胰腺癌组织中Smad相关蛋白、TGFβ1及其Ⅰ、Ⅱ型受体的表达,并联系临床病理学指标进行相关分析。结果高级别PanIN病灶Smad4表达率(60.6%,20/33)低于低级别PanINSmad4表达率(79.8%,186/233)(P<0.05);而高级别PanIN中Smad7,TGFβ1,TGFβRⅡ表达率明显高于低级别PanIN(P<0.05)。胰腺癌组织中,Smad4蛋白表达率在淋巴结转移组和神经受累组低于各自对照组(P<0.05);Smad7、TGFβ1及其Ⅰ、Ⅱ型受体的表达率在淋巴结转移组和神经受累组则分别高于各自对照组(P<0.05)。PanIN和胰腺癌组织中Smad2、4、7蛋白,TGFβ1及其Ⅰ、Ⅱ型受体表达率的差异具有显著性(P<0.01)。结论从低级别PanINs到高级别PanINs再到胰腺癌中,Smad4蛋白表达率逐渐降低,而Smad7、TGFβ1及其Ⅰ、Ⅱ型受体表达率逐渐升高,支持胰腺癌形成的分子模型。 展开更多
关键词 胰腺上皮内瘤变 胰腺癌组织 Smad信号通路 TGF-β1 Smad4 Smad7 Ⅱ型受体 蛋白表达率 信号传导通路 转化生长因子 Vision TGF-βR 相关蛋白 神经受累 病理学指标 Smad2 免疫组化 S-P法 相关分析 分子模型 对照组 转移组
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PCV2感染后JAK-STAT信号通路的基因差异表达分析 被引量：1
8
作者 时建立 彭喆 +4 位作者 吴晓燕 王硕 孙盼盼 王妍 李俊 《中国动物检疫》 CAS 2019年第10期78-83,共6页
JAK-STAT信号通路是阐明细胞因子生物学功能及病毒如何发挥作用的分子基础,但对于猪圆环病毒2型(PCV2)感染及病毒复制的作用机制,目前尚无报道。本研究采用PCR列阵方法,建立PK-15细胞JAKSTAT信号通路的功能分类芯片,分析JAK-STAT信号通... JAK-STAT信号通路是阐明细胞因子生物学功能及病毒如何发挥作用的分子基础,但对于猪圆环病毒2型(PCV2)感染及病毒复制的作用机制,目前尚无报道。本研究采用PCR列阵方法,建立PK-15细胞JAKSTAT信号通路的功能分类芯片,分析JAK-STAT信号通路中所有已知的Jak和Stat家族成员、激活JAK-STAT信号通路的受体,以及与Stat蛋白相关的核辅助因子及共同活化因子、Stat诱导蛋白及该通路的负反馈调节蛋白等基因在PCV2感染后的差异表达情况,为进一步明确PK-15细胞JAK-STAT信号通路对病毒复制力和复制机制奠定基础。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型(PCV2) JAK-STAT信号通路 PCR列阵 差异表达
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催乳素通过酪氨酸激酶2/信号传导及转录激活蛋白5信号通路促进奶牛乳腺上皮细胞乳铁蛋白合成和分泌
9
作者 杨跃杰 连帅 +1 位作者 武瑞 王建发 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期1916-1926,共11页
本试验旨在研究催乳素(PRL)对奶牛乳腺上皮细胞(BMECs)中酪氨酸激酶2/信号传导及转录激活蛋白5(JAK2/STAT5)信号通路介导的乳铁蛋白(LF)合成和分泌的影响。添加不同浓度的PRL[0(对照)、10、100、1000 ng/mL]处理BMECs 24 h,分析PRL对LF... 本试验旨在研究催乳素(PRL)对奶牛乳腺上皮细胞(BMECs)中酪氨酸激酶2/信号传导及转录激活蛋白5(JAK2/STAT5)信号通路介导的乳铁蛋白(LF)合成和分泌的影响。添加不同浓度的PRL[0(对照)、10、100、1000 ng/mL]处理BMECs 24 h,分析PRL对LF含量和LF、催乳素受体(PRLR)以及JAK2/STAT5信号通路基因表达量和相关蛋白表达的影响。为了验证STAT5在PRL促进BMECs LF合成和分泌的关键作用,添加STAT5抑制剂匹莫齐特(Pimozide)[未添加Pimozide(对照)、10μmol/L Pimozide、100 ng/mL PRL、10μmol/L Pimo⁃zide+100 ng/mL PRL]处理BMECs 24 h,测定PRL和Pimozide对LF含量和LF、JAK2/STAT5信号通路基因表达量和相关蛋白表达以及相对荧光强度的影响。结果表明:1)与对照组相比,10、100、1000 ng/mL PRL能够显著或极显著提高BMECs上清液中的LF含量(P<0.05或P<0.01);Pimozide组能够极显著降低BMECs上清液中的LF含量(P<0.01);PRL组能够极显著提高BMECs上清液中的LF含量(P<0.01)。2)与对照组相比,10 ng/mL PRL组LF、PRLR、JAK2及STAT5基因相对表达量显著升高(P<0.05);100 ng/mL PRL组LF、PRLR、JAK2和STAT5基因相对表达量极显著升高(P<0.01);1000 ng/mL PRL组PRLR和STAT5基因相对表达量显著或极显著升高(P<0.05或P<0.01);Pimozide组LF基因相对表达量显著降低(P<0.05);PRL组BMECs中LF基因相对表达量显著升高(P<0.05)。3)100、1000 ng/mL PRL组BMECs中LF蛋白表达量极显著升高(P<0.01);10、100、1000 ng/mL PRL显著或极显著提高BMECs中p⁃JAK2/JAK2和p⁃STAT5/STAT5表达量(P<0.05或P<0.01);Pimozide组和Pimo⁃zide+PRL组极显著降低BMECs中LF蛋白表达量(P<0.01);PRL组极显著升高BMECs中LF蛋白表达量(P<0.01)。4)Pimozide组和Pimozide+PRL组显著或极显著降低BMECs中LF或p⁃STAT5的相对荧光强度(P<0.05或P<0.01);PRL组极显著升高BMECs中LF和p⁃STAT5的相对荧光强度(P<0.01)。综上所述,PRL通过JAK2/STAT5信号通路促进BMECs中LF合成和分泌。 展开更多
关键词 乳铁蛋白 催乳素 信号通路 基因表达调控
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PI3K/AKT/TORC1信号通路对丝素蛋白合成转录因子SGF1表达的影响 被引量：2
10
作者 郭亚新 马俐 +1 位作者 李胜 李恺 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期231-237,共7页
SGF1(silk gland factor 1)是一种转录调控因子,属于Fox家族的Fox A亚家族成员,能够启动丝素基因的表达,合成丝素蛋白。已知果蝇和其他高等动物中的PI3K/AKT/TORC1信号通路可以调控Fox转录蛋白的表达。为了探究家蚕幼虫后部丝腺(PSG)中P... SGF1(silk gland factor 1)是一种转录调控因子,属于Fox家族的Fox A亚家族成员,能够启动丝素基因的表达,合成丝素蛋白。已知果蝇和其他高等动物中的PI3K/AKT/TORC1信号通路可以调控Fox转录蛋白的表达。为了探究家蚕幼虫后部丝腺(PSG)中PI3K/AKT/TORC1信号通路对SGF1表达水平的影响,对4龄第4天和5龄第7天家蚕幼虫分别注射信号通路抑制剂Wort、Rapa和LY294,24 h后解剖取出后部丝腺,一组用于免疫组织化学染色实验,另一组用于提取蛋白质进行Western blot检测。免疫组织化学染色实验表明,与对照组相比,注射3种信号通路抑制剂的家蚕幼虫后部丝腺组织的绿色荧光亮度明显减弱;Western blot检测表明,与对照组相比,实验组家蚕幼虫后部丝腺的蛋白质浓度有所下降。综合以上结果初步得出PI3K/AKT/TORC1信号通路抑制剂处理均可降低家蚕幼虫后部丝腺中SGF1表达的结论,即提示可以通过上游信号通路PI3K/AKT/TORC1影响SGF1的表达水平,进而调控丝素蛋白的合成。 展开更多
关键词 家蚕丝素蛋白 表达调控 SGF1因子 PI3K/AKT/TORC1信号通路 免疫组织化学染色 免疫印迹法
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基于RNA-seq的番茄响应根结线虫MiPDCD6蛋白的SA信号通路基因鉴定与表达分析 被引量：1
11
作者 邓小大 袁永强 +3 位作者 蔡书静 郑礼军 徐春玲 王新荣 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2023年第1期184-195,共12页
为了揭示南方根结线虫MiPDCD6蛋白抑制番茄PTI免疫的分子机理,以番茄品种新金丰1号MiPDCD6超表达苗为试验材料,以番茄品种新金丰1号组培苗为对照,通过转录组测序技术分别对番茄MiPDCD6超表达苗和对照苗进行转录组测序。以番茄栽培品种He... 为了揭示南方根结线虫MiPDCD6蛋白抑制番茄PTI免疫的分子机理,以番茄品种新金丰1号MiPDCD6超表达苗为试验材料,以番茄品种新金丰1号组培苗为对照,通过转录组测序技术分别对番茄MiPDCD6超表达苗和对照苗进行转录组测序。以番茄栽培品种Heinz 1706基因组作为参考基因组进行对比,利用FPKM法计算基因表达量,设定参数(|log_(2)FC|>1且P<0.05)筛选差异表达基因。利用Gene Ontology(GO)数据库进行差异表达基因GO功能富集分析,统计每个GO term中的差异表达基因数目,计算出基因富集的显著性,找出富集显著的功能条目。利用KEGG数据库对差异表达基因进行Pathway富集分析,超几何分布检验方法计算每个Pathway中差异表达基因富集的显著性。以FDR和基因数量来衡量KEGG的富集程度。结合基因差异表达分析和功能富集分析,研究MiPDCD6蛋白对番茄PTI免疫相关通路基因的影响。结果发现:在超表达MiPDCD6番茄植株中,与野生型番茄相比,MiPDCD6过表达番茄植株中有2366个差异表达基因(DEGs),其中1354个上调基因,1012个下调基因。这些DEGs中,通过GO和KEGG注释,植物激素信号转导(sly04075)、植物-病原互作(sly04626)、植物MAPK信号通路(sly04016)和丙环素生物合成(sly00940)等KEGG通路中富集到大量的差异表达基因。SA生物合成途径包括ICS和PAL,MiPDCD6过表达番茄植株中SA合成通路PAL1和PAL-like基因以及SA信号转导途径TGA9、TGA10-like和PR1a2基因均显著下调,表明MiPDCD6基因可能抑制SA合成,从而抑制植物PTI免疫。 展开更多
关键词 番茄 根结线虫 转录组 差异表达基因 SA信号通路 MiPDCD6
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内皮细胞通过表达血红蛋白调控一氧化氮信号通路
12
作者 李福旺 《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期226-226,共1页
在很多细胞类型中,非调控型一氧化氮弥散模式不能解释依赖一氧化氮合酶的生化过程。例如,内皮一氧化氮合酶通过改变平滑肌张力调控血压、血流和氧供给,其过程的调控不能用简单的一氧化氮自由弥散来解释。在Nature发表的一篇文章里,研究... 在很多细胞类型中,非调控型一氧化氮弥散模式不能解释依赖一氧化氮合酶的生化过程。例如,内皮一氧化氮合酶通过改变平滑肌张力调控血压、血流和氧供给,其过程的调控不能用简单的一氧化氮自由弥散来解释。在Nature发表的一篇文章里,研究者阐述了一种新的调控一氧化氮信号通路的模式。 展开更多
关键词 一氧化氮合酶 信号通路 内皮细胞 调控 血红蛋白 过表达 细胞类型 生化过程
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去势对淮南猪皮下脂肪PPAR信号通路基因表达量的影响 被引量：8
13
作者 王璟 白献晓 +8 位作者 张家庆 高彬文 陈俊峰 高原 任巧玲 马强 郭红霞 梁永红 邢宝松 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2016年第2期92-97,共6页
为了研究PPAR信号通路在猪去势诱导的脂肪沉积中的作用,采集去势和非去势淮南猪(共6头,每组各3头)的皮下脂肪组织,提取总RNA后构建文库,利用高通量测序技术检测PPAR通路相关基因表达量,表达差异基因的筛选阈值为P<0.05且|log2差异倍... 为了研究PPAR信号通路在猪去势诱导的脂肪沉积中的作用,采集去势和非去势淮南猪(共6头,每组各3头)的皮下脂肪组织,提取总RNA后构建文库,利用高通量测序技术检测PPAR通路相关基因表达量,表达差异基因的筛选阈值为P<0.05且|log2差异倍数|>1。基于mRNA的差异分析以及KEGG富集分析发现,PPAR信号通路中17个基因表达差异达到显著水平,其中14个基因表达量上调、3个基因表达量下调。脑型脂肪酸结合蛋白基因(FABP7)、甘油水孔蛋白基因(AQP7)、视黄素X受体γ基因(RXRγ)等基因上调,而磷酸烯醇丙酮酸羧激酶1基因(PCK1)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅激活因子1α基因(PPARGC1α)、胆固醇7α-羟化酶1基因(CYP7A1)参与分解代谢的基因显著下调。 展开更多
关键词 淮南猪 差异表达基因 高通量测序 PPAR信号通路 脂肪沉积
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应力刺激对-连环蛋白的影响以及Wnt/-连环蛋白在骨代谢信号通路中的作用 被引量：8
14
作者 鲍捷 王国祥 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期781-786,754,共7页
在Wnt家族及其作用途径的相关信号分子中,无论何种亚型或分子的异常表达都可能破坏Wnt系统的平衡机制,导致骨骼发育或代谢异常。
关键词 连环蛋白 信号通路 应力刺激 骨代谢 信号分子 WNT 平衡机制 异常表达
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蛋白质组学在脑缺血再灌注损伤中的作用机制及相关信号通路研究进展 被引量：3
15
作者 胡跃强 庞婷婷 +3 位作者 张月 李靖 陈梓焜 莫雪妮 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2022年第3期6-11,共6页
缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)起病急骤,具有高发病率、高病死率、高复发率和高致残率的特点,是全球范围内导致死亡和残疾的主要原因。随着药物的静脉溶栓或动脉溶栓、介入取栓术等治疗方法的广泛应用,脑缺血再灌注损伤(cerebral is... 缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)起病急骤,具有高发病率、高病死率、高复发率和高致残率的特点,是全球范围内导致死亡和残疾的主要原因。随着药物的静脉溶栓或动脉溶栓、介入取栓术等治疗方法的广泛应用,脑缺血再灌注损伤(cerebral ischemia-reperfusion injury,CI/R)将成为临床面临的主要问题。蛋白质组学在脑血管疾病,尤其是CI/R具有举足轻重的作用,近年来,为明确CI/R治疗的蛋白质靶标和作用通路,已进行了大量的动物和细胞实验研究,对进一步探究CI/R的病理发生途径,寻找有效的治疗药物具有重要意义。对蛋白质组学在CI/R中的病理生理机制,以及筛选的差异蛋白和信号通路作简要综述。 展开更多
关键词 蛋白质组学 CI/R 差异蛋白 信号通路 研究进展
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热激活Rac-MEKK-JNK信号通路与hsp90β基因表达 被引量：1
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作者 李晓燕 路程 +1 位作者 吴宁华 沈珝琲 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期264-268,共5页
目的探讨Rac-MEKK-JNK(Rac-丝裂原活化的蛋白激酶的激酶的激酶-C-junN端蛋白激酶)信号通路对热诱导hsp90β基因表达的调控作用以及Hsp90蛋白对Rac信号通路传递的调节过程。方法将载体PcDNA3、显性负突变Rac(DN-Rac),显性负突变MEKK(DN-M... 目的探讨Rac-MEKK-JNK(Rac-丝裂原活化的蛋白激酶的激酶的激酶-C-junN端蛋白激酶)信号通路对热诱导hsp90β基因表达的调控作用以及Hsp90蛋白对Rac信号通路传递的调节过程。方法将载体PcDNA3、显性负突变Rac(DN-Rac),显性负突变MEKK(DN-MEKK)和显性负突变JNK(DN-JNK)表达质粒分别与hsp90β基因转录调控片段介导的氯霉素乙酰基转移酶(CAT)报告基因质粒β3.1共转染Jurkat和LETPa-2细胞,采用以竞争性RT-PCR为基础的系统检测CAT报告基因转录水平。用Western印迹分析检测转染了DN-Rac、DN-MEKK和DN-JNK的细胞在热刺激前后c-Jun的表达水平和磷酸化状态。用体外激酶活性分析法检测geldanamycin(GA)对热诱导的JNK活性的影响。结果转染DN-Rac、DN-MEKK及DN-JNK均能抑制42℃1h诱导的β3.1报告基因的表达,Jurkat细胞中CAT的热诱导表达分别为对照组的(72.8±5)%、(60±13.2)%及(47.7±12.1)%;LETPa-2细胞中CAT的热诱导表达分别为对照组的(16.17±5.1)%、(50.2±8.7)%及(47.5±10)%。转录因子c-Jun的表达和磷酸化水平也在一定程度上被抑制。GA处理细胞可明显抑制热诱导激活的JNK激酶活性和c-Jun的磷酸化水平,但不影响JNK和c-Jun的蛋白表达水平。结论Rac-MEKK-JNK通路参与hsp90β基因的热诱导表达,hsp90可能对热激活化? 展开更多
关键词 Rac-MEKK-JNK信号通路 Rac蛋白 丝裂原活化的蛋白激酶的激酶的激酶 C-junN端蛋白激酶 HSP90Β基因 基因表达调控
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人类TBC1D7蛋白的表达纯化及其在mTOR通路中的作用机制研究 被引量：1
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作者 盖中朝 王兵 《华中师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期79-88,共10页
mTOR信号通路在真核细胞代谢调控中发挥着关键的调控作用,该通路核心元件mTORC1复合物的活性受其上游TSC复合物负调控,TSC复合物包括TSC1、TSC2、TBC1D7三种蛋白.以TBC1D7蛋白为研究对象,通过氨基酸序列比对显示多物种来源的TBC1D7蛋白... mTOR信号通路在真核细胞代谢调控中发挥着关键的调控作用,该通路核心元件mTORC1复合物的活性受其上游TSC复合物负调控,TSC复合物包括TSC1、TSC2、TBC1D7三种蛋白.以TBC1D7蛋白为研究对象,通过氨基酸序列比对显示多物种来源的TBC1D7蛋白具有较高的保守性,且蛋白三维结构分析证实其分子表面存在高度保守区域.随后,构建了人类TBC1D7蛋白原核表达载体并在大肠杆菌中表达得到全长TBC1D7蛋白,经过酶切去除标签和凝胶排阻层析得到了高纯度TBC1D7蛋白.另一方面,通过在HCM细胞中对TBC1D7进行敲降和过表达,证实了TBC1D7的表达会直接升高mTORC1的活性;反之,升高TBC1D7的表达则会抑制mTORC1的活性.本研究表达和纯化了人类TBC1D7蛋白,并探讨了在人类心肌细胞中TBC1D7的表达与其下游mTOR信号通路之间的联系,为人类TBC1D7蛋白和mTOR信号通路的进一步研究打下了良好基础. 展开更多
关键词 TBC1D7 蛋白表达 纯化 MTOR信号通路 磷酸化
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核蛋白Lap2β传递力学信号入核直接激活基因表达依赖染色质的拉伸而非压缩
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作者 陈俊威 WANG Ning 《医用生物力学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第S01期290-290,共1页
力学信号可调控蛋白合成甚至基因表达,在组织发育、疾病发生及生理调节中起到非常重要的作用。前期发现力可直接传递至染色质激活基因表达,但此力同时引起染色质的拉伸和压缩,因此力激活基因表达依赖染色质的拉伸还是压缩仍不清楚;此外... 力学信号可调控蛋白合成甚至基因表达,在组织发育、疾病发生及生理调节中起到非常重要的作用。前期发现力可直接传递至染色质激活基因表达,但此力同时引起染色质的拉伸和压缩,因此力激活基因表达依赖染色质的拉伸还是压缩仍不清楚;此外,力如何从核膜传递到染色质,其相关分子通路尚不明确。 展开更多
关键词 基因表达 生理调节 分子通路 染色质 力学信号 调控蛋白 核蛋白 拉伸
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细粒棘球绦虫原头蚴蛋白表达谱分析 被引量：10
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作者 王正荣 薄新文 +3 位作者 张艳艳 马勋 王智欣 卢平萍 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期1519-1528,共10页
旨在探索细粒棘球绦虫原头蚴蛋白表达特性,揭示在此发育阶段虫体主要的功能蛋白以及信号通路,为揭示虫体的发育调控、筛选疫苗以及药物靶标奠定基础。本试验采用LC-MS/MS技术对虫体原头蚴表达的蛋白质进行研究,然后对获得数据进行GO、KO... 旨在探索细粒棘球绦虫原头蚴蛋白表达特性,揭示在此发育阶段虫体主要的功能蛋白以及信号通路,为揭示虫体的发育调控、筛选疫苗以及药物靶标奠定基础。本试验采用LC-MS/MS技术对虫体原头蚴表达的蛋白质进行研究,然后对获得数据进行GO、KOG以及KEGG等分析;最后采用qRT-PCR和原位杂交技术对鉴定得到的Wnt信号通路的关键基因β-catenin进行了差异表达和组织定位研究。结果显示,本研究共鉴定得到7 172个肽段,1 197个蛋白质,其中包括多个潜在的抗原蛋白质,如四跨膜蛋白超家族、6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶、表皮抗原蛋白和烯醇酶等。信号通路分析结果显示其中632个蛋白参与276个调控通路,诸如与虫体发育紧密相关的Wnt、Notch、Hedgehog、NF-κB、cAMP以及胆酸盐信号通路。对β-catenin的验证结果显示,此基因分布于细粒棘球绦虫原头蚴顶突的小刺以及散在的细胞中,同时其相对转录量在体外培养0~10d的过程中呈递减趋势。综上,本研究解析了细粒棘球绦虫原头蚴的蛋白质表达元件,揭示了原头蚴主要的调控信号通路,为虫体的生长发育机制以及包虫病的有效防控提供了理论依据。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 原头蚴 蛋白 表达谱 信号通路
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基于转录组数据的蒙古牛皮肤组织抗寒相关信号通路及候选基因的筛选 被引量：9
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作者 齐昱 邢燕平 +3 位作者 潘静 凌宇 曹宇 周欢敏 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期2301-2313,共13页
本研究旨在通过对冬夏两季蒙古牛皮肤组织进行转录组测序和生物信息学分析,找到与蒙古牛抗寒性状相关的信号通路及候选基因。用Ion ProtonTMSequencer分别对冬季和夏季成年蒙古牛的皮肤组织进行转录组测序,随后对转录组数据进行处理、... 本研究旨在通过对冬夏两季蒙古牛皮肤组织进行转录组测序和生物信息学分析,找到与蒙古牛抗寒性状相关的信号通路及候选基因。用Ion ProtonTMSequencer分别对冬季和夏季成年蒙古牛的皮肤组织进行转录组测序,随后对转录组数据进行处理、与参考基因组比对、差异表达分析、GO和KEGG富集分析以及候选基因筛选,并用Real-time PCR方法对转录组数据进行可靠性检测。结果显示,冬季组和夏季组分别得到86 954 060和69 837 009条reads;冬季组与参考基因组的唯一比对率为73.21%,夏季组为75.55%;冬夏两组共有182个差异表达基因(DEGs),与夏季组相比,其中117个在冬季组中上调,65个在冬季组中下调;Real-time PCR分析显示,转录组测序结果可靠;GO分析结果显示,细胞组分、分子功能、生物学过程分别富集到21、39和224个term;KEGG分析结果显示,差异表达基因(DEGs)显著地富集在脂类代谢、凝血、酪氨酸代谢、类固醇合成和视黄醇代谢相关通路上;共筛选出8个候选基因。综上表明,脂类代谢、凝血、黑色素合成相关通路和基因,以及与毛发发生相关的基因可能在蒙古牛抗寒过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 蒙古牛 皮肤组织 转录组 信号通路 差异表达基因
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