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题名豹纹鳃棘鲈差异流速下肝脏转录组分析
被引量：1
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作者
高进
王永波
刘金叶
郭一兰
符书源
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机构
海南热带海洋学院/热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室
海南省海洋与渔业科学院
海南省热带海水养殖工程技术研究中心
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出处
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期107-117,共11页
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基金
海南省重点研发计划项目(ZDYF2019074,ZDYF2020093)
2021海南省科研院所开发专项。
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文摘
水流速度是影响鱼类生长的重要环境因子之一。为探究豹纹鳃棘鲈(Plectropomus leopardus)在不同流速条件下相关基因的功能和表达情况,利用RNA-Seq技术对差异流速下的豹纹鳃棘鲈肝脏组织进行了转录组分析。挑选相同繁育批次中规格一致的豹纹鳃棘鲈幼苗,分别在正常流速(0.1 m·s^(-1), Low flow velocity, LFV)和高流速(0.4 m·s^(-1), High flow velocity, HFV)实验组中养殖150 d后进行肝脏转录组测序分析,探究豹纹鳃棘鲈在差异流速下个体间的基因表达模式差异。结果显示,经筛选后共获得1 977个LFV-HFV显著性差异表达基因(Differentially expressed genes, DGE),其中上调基因999个,下调基因978个。GO功能注释分类发现,共有1 124个DEGs被GO数据库注释到并归属为56个功能类别。KEGG富集分析结果显示,573个DEGs参与了154条KEGG通路,其中富集最显著的为PPAR信号通路。LFV和HFV两组鱼的肝脏组织学观察结果显示,两者之间脂肪含量差异明显,LFV组肝脏中的脂肪含量显著高于HFV组(P<0.05)。通过转录组分析,筛选了大量豹纹鳃棘鲈差异流速下的DGEs,为深入探讨豹纹鳃棘鲈对流速变化适应性的分子调控机制提供了技术支撑。
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关键词
豹纹鳃棘鲈
差异流速
转录组分析
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Keywords
Plectropomus leopardus
Different flow velocity
Transcriptome analysis
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分类号
S917.4
[农业科学—水产科学]
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题名不同水文条件下光养生物膜藻类对氮、磷营养盐的响应
被引量：2
- 2
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作者
杨宋琪
赵璐
欧阳添
纪璐璐
罗光宏
吴忠兴
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机构
河西学院甘肃省微藻技术创新中心甘肃省河西走廊特色资源利用重点实验室
西南大学三峡库区生态环境教育部重点实验室
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出处
《水生态学杂志》
CSCD
北大核心
2024年第3期94-102,共9页
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基金
甘肃省科技计划资助(22JR5RG565,20JR5RA192)
国家自然科学基金项目(42177055,41877410)。
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文摘
揭示生物膜藻类对河流水体流态与营养盐的响应,为河流生物膜藻类研究及生物多样性保护提供依据。在微型跑道池模拟流水(0.5 m/s)和静水(0 m/s)条件的基础上,通过设置不同浓度氮(1.51、2.51和5.51 mg/L)、磷(0.1、0.2和0.4 mg/L)及氮磷比(8、16和32)环境培养野外采集的原位生物膜并铺设人工基质,探究流速差异和营养浓度对河流光养生物膜藻类物种组成及密度的影响。非度量多维排序(NMDS)分析结果表明,无论流速还是非流速环境下,原位和建群生物膜藻类群落在不同氮、磷和氮磷比环境中均呈现明显分离(P<0.001),且建群生物膜中各分组藻类群落具有更明显的差异。双因素方差分析结果表明,磷与流速单一及交互效应显著影响藻类的生长及建群(P<0.001);而氮处理中,氮与流速的交互效应仅对建群生物膜藻类影响显著(P<0.001)。同时,还发现生物膜中硅藻、蓝藻和绿藻的生长对营养盐与流速变化的响应并不一致,其中非流速-高氮、磷营养盐更适宜于蓝藻和绿藻的生长。总之,差异流速和氮、磷浓度变化影响了光养生物膜藻类的响应模式,且建群初期的生物膜藻类对外界环境变化敏感。
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关键词
流速差异
氮磷浓度
氮磷比
光养生物膜
藻类
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Keywords
watervelocitydifference
nitrogenandphosphoruslevels
N/Pratio
phototrophicbiofilm
algae
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分类号
Q948
[生物学—植物学]
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