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反转录差异显示技术及其方法的改进
被引量:
6
1
作者
朱靖
杜立新
《动物医学进展》
CSCD
2005年第1期19-21,共3页
运用mRNA反转录差异显示技术可以了解不同细胞或同类细胞在不同发育阶段、不同生理状态下的基因表达状况 ,为研究生命活动过程提供重要信息。文章对差异显示反转录聚合酶链式反应技术的基本原理 ,优点与缺点 ,以及近年来对该技术涉及的R...
运用mRNA反转录差异显示技术可以了解不同细胞或同类细胞在不同发育阶段、不同生理状态下的基因表达状况 ,为研究生命活动过程提供重要信息。文章对差异显示反转录聚合酶链式反应技术的基本原理 ,优点与缺点 ,以及近年来对该技术涉及的RT PCR方法、引物设计、PCR反应参数、电泳及差异条带的显示方法以及杂交方式进行了论述和评价 ,并对其应用前景进行了简单分析。
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关键词
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差异
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pcr
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向northern印迹
银染
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职称材料
采用差异显示法分离支气管哮喘病因多基因初探
2
作者
陆丽
董晓先
+1 位作者
董伟华
刘金保
《广州医学院学报》
2005年第1期59-61,共3页
目的:初步分离出在哮喘动物模型中发生差异显示的基因条带,为对哮喘的进一步研究打下基础。方法:腹腔注射卵清蛋白复制哮喘动物模型,采用差异显示反转录PCR(DDRT PCR)方法初步分离出发生差异显示的基因条带。结果:哮喘模型组豚鼠耗氧率...
目的:初步分离出在哮喘动物模型中发生差异显示的基因条带,为对哮喘的进一步研究打下基础。方法:腹腔注射卵清蛋白复制哮喘动物模型,采用差异显示反转录PCR(DDRT PCR)方法初步分离出发生差异显示的基因条带。结果:哮喘模型组豚鼠耗氧率明显高于对照组,具有明显差异的条带有30条。结论:这些条带所起作用尚需进一步的分析验证。
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关键词
哮喘
差异
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职称材料
差异基因的高通量筛选研究
被引量:
1
3
作者
刘岩
王海龙
孟智启
《浙江农业科学》
2009年第3期611-613,共3页
随着多个生物体全基因组序列的公布,研究重点更多地转移到基因功能分析上,基于生物品质改良、基因诊断及疾病治疗等考虑,分离并克隆生命体生长发育等过程的时空特异性差异表达基因也越来越受到关注。论文围绕近年来较具代表性的5种分析...
随着多个生物体全基因组序列的公布,研究重点更多地转移到基因功能分析上,基于生物品质改良、基因诊断及疾病治疗等考虑,分离并克隆生命体生长发育等过程的时空特异性差异表达基因也越来越受到关注。论文围绕近年来较具代表性的5种分析方法,即表达序列标签、差异显示反转录PCR、抑制消减杂交、基因表达系列分析和微阵列技术,分析各方法的原理及优缺点,以期对今后开展研究时的选择起到参考作用。
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关键词
差异
基因
表达序列标签
差异显示反转录pcr
抑制消减杂交
基因表达系列分析
微阵列技术
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职称材料
杨树Na^+/H^+反向运输蛋白基因(PtNHX_1、PtNHX_6)的克隆和检测
被引量:
7
4
作者
张德强
赵树堂
+1 位作者
卢孟柱
田林
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006年第11期29-36,共8页
Na+/H+反向运输蛋白基因(NHX)是在细菌、植物和动物体内普遍存在的一类膜蛋白基因家族。迄今已在模式植物拟南芥中分离出AtNHX1、AtNHX2、AtNHX3、AtNHX4、AtNHX5和AtNHX6共6个成员,并发现部分成员对盐胁迫有不同程度的响应。以AtNHX1和...
Na+/H+反向运输蛋白基因(NHX)是在细菌、植物和动物体内普遍存在的一类膜蛋白基因家族。迄今已在模式植物拟南芥中分离出AtNHX1、AtNHX2、AtNHX3、AtNHX4、AtNHX5和AtNHX6共6个成员,并发现部分成员对盐胁迫有不同程度的响应。以AtNHX1和AtNHX6的cDNA核苷酸序列为信息探针,基于可利用的杨树EST数据库和毛果杨全基因组测序结果,通过电子杂交辅助的克隆技术,从毛白杨形成层cDNA中分离得到长度分别为1635bp和1709bp的2个cDNA,其分别含有编码544个和526个氨基酸残基的完整开放阅读框。由它们所推导的蛋白质序列与拟南芥、水稻、小麦和玉米的NHX1和NHX6基因的蛋白质序列高度同源,同源性分别为79%、76%、69%和74%以及82%、82%、27%和26%,故将其命名为PtNHX1和PtNHX6(GenBank注册号分别为AY660749和AY832912)。Southern杂交分析表明,PtNHX1和PtNHX6均为低拷贝基因(或有一些高度同源的基因),在杨树基因组中以1~4个拷贝形式存在。组织特异性RT-PCR结果显示,PtNHX1和PtNHX6基因在杨树根、茎和叶片中均有表达,但其表达模式稍有不同:PtNHX1在根部、形成层、未成熟木质部、成熟叶和嫩叶中均高度表达,在韧皮部和成熟木质部中有少量表达,而PtNHX6在根部、成熟叶和嫩叶中表达丰度较高,在韧皮部、形成层、未成熟木质部表达丰度较低,在成熟木质部中表达丰度极低。NaCl诱导的杨树叶片差异表达RT-PCR检测结果初步表明,PtNHX1和PtNHX6基因均受盐诱导表达,当溶液中NaCl浓度在100~400mmol.L-1内,随着盐浓度的提高,PtNHX1和PtNHX6基因的表达丰度逐渐增强,但超过400mmol.L-1后,其表达丰度均有所降低,这与所测定的叶片ABA含量匹配。
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关键词
杨树
Na^+/H^+
反
向运输蛋白
反
转录
pcr
盐诱导的
差异
表达
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职称材料
功能基因组学研究进展
被引量:
2
5
作者
庄金秋
贾杏林
《动物医学进展》
CSCD
2004年第4期32-36,共5页
2 1世纪是生物时代和信息时代 ,基因组学的研究已从结构基因组学转向功能基因组学 ,对于基因功能的研究也由单一基因转向大规模、批量分析。文章对功能基因组学及相关学科的概念作了概述 ,介绍了功能基因组学的研究内容与研究方法 ,主...
2 1世纪是生物时代和信息时代 ,基因组学的研究已从结构基因组学转向功能基因组学 ,对于基因功能的研究也由单一基因转向大规模、批量分析。文章对功能基因组学及相关学科的概念作了概述 ,介绍了功能基因组学的研究内容与研究方法 ,主要包括应用差异显示反转录 PCR、基因表达序列分析 (SAGE)、微点阵、蛋白质组学和生物信息学等研究基因组表达概况、基因组多样性和模式生物学等。
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关键词
功能基因组学
差异显示反转录pcr
基因表达
序列分析
微点阵
蛋白质组学
生物信息学
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职称材料
题名
反转录差异显示技术及其方法的改进
被引量:
6
1
作者
朱靖
杜立新
机构
山东农业大学动物科技学院生物工程实验室
中国农业科学院畜牧研究所
出处
《动物医学进展》
CSCD
2005年第1期19-21,共3页
文摘
运用mRNA反转录差异显示技术可以了解不同细胞或同类细胞在不同发育阶段、不同生理状态下的基因表达状况 ,为研究生命活动过程提供重要信息。文章对差异显示反转录聚合酶链式反应技术的基本原理 ,优点与缺点 ,以及近年来对该技术涉及的RT PCR方法、引物设计、PCR反应参数、电泳及差异条带的显示方法以及杂交方式进行了论述和评价 ,并对其应用前景进行了简单分析。
关键词
反
转录
差异
显示
pcr
反
向northern印迹
银染
Keywords
DDRT-
pcr
reverse northern blot
silver stainning
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
采用差异显示法分离支气管哮喘病因多基因初探
2
作者
陆丽
董晓先
董伟华
刘金保
机构
广州医学院病理生理教研室
出处
《广州医学院学报》
2005年第1期59-61,共3页
基金
广东省卫生厅立项(编号:A2001462)
文摘
目的:初步分离出在哮喘动物模型中发生差异显示的基因条带,为对哮喘的进一步研究打下基础。方法:腹腔注射卵清蛋白复制哮喘动物模型,采用差异显示反转录PCR(DDRT PCR)方法初步分离出发生差异显示的基因条带。结果:哮喘模型组豚鼠耗氧率明显高于对照组,具有明显差异的条带有30条。结论:这些条带所起作用尚需进一步的分析验证。
关键词
哮喘
差异
显示
反
转录
Keywords
asthma
differential display
reverse-transcriptase
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
差异基因的高通量筛选研究
被引量:
1
3
作者
刘岩
王海龙
孟智启
机构
浙江省农业科学院蚕桑研究所
浙江师范大学化学与生命科学学院
出处
《浙江农业科学》
2009年第3期611-613,共3页
基金
浙江省人才基金项目(No2007R20006)
文摘
随着多个生物体全基因组序列的公布,研究重点更多地转移到基因功能分析上,基于生物品质改良、基因诊断及疾病治疗等考虑,分离并克隆生命体生长发育等过程的时空特异性差异表达基因也越来越受到关注。论文围绕近年来较具代表性的5种分析方法,即表达序列标签、差异显示反转录PCR、抑制消减杂交、基因表达系列分析和微阵列技术,分析各方法的原理及优缺点,以期对今后开展研究时的选择起到参考作用。
关键词
差异
基因
表达序列标签
差异显示反转录pcr
抑制消减杂交
基因表达系列分析
微阵列技术
分类号
S881 [农业科学—特种经济动物饲养]
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职称材料
题名
杨树Na^+/H^+反向运输蛋白基因(PtNHX_1、PtNHX_6)的克隆和检测
被引量:
7
4
作者
张德强
赵树堂
卢孟柱
田林
机构
中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室
出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006年第11期29-36,共8页
基金
国家自然科学基金项目( 30471409)
国家重大基础研究项目(G19990016002)资助
文摘
Na+/H+反向运输蛋白基因(NHX)是在细菌、植物和动物体内普遍存在的一类膜蛋白基因家族。迄今已在模式植物拟南芥中分离出AtNHX1、AtNHX2、AtNHX3、AtNHX4、AtNHX5和AtNHX6共6个成员,并发现部分成员对盐胁迫有不同程度的响应。以AtNHX1和AtNHX6的cDNA核苷酸序列为信息探针,基于可利用的杨树EST数据库和毛果杨全基因组测序结果,通过电子杂交辅助的克隆技术,从毛白杨形成层cDNA中分离得到长度分别为1635bp和1709bp的2个cDNA,其分别含有编码544个和526个氨基酸残基的完整开放阅读框。由它们所推导的蛋白质序列与拟南芥、水稻、小麦和玉米的NHX1和NHX6基因的蛋白质序列高度同源,同源性分别为79%、76%、69%和74%以及82%、82%、27%和26%,故将其命名为PtNHX1和PtNHX6(GenBank注册号分别为AY660749和AY832912)。Southern杂交分析表明,PtNHX1和PtNHX6均为低拷贝基因(或有一些高度同源的基因),在杨树基因组中以1~4个拷贝形式存在。组织特异性RT-PCR结果显示,PtNHX1和PtNHX6基因在杨树根、茎和叶片中均有表达,但其表达模式稍有不同:PtNHX1在根部、形成层、未成熟木质部、成熟叶和嫩叶中均高度表达,在韧皮部和成熟木质部中有少量表达,而PtNHX6在根部、成熟叶和嫩叶中表达丰度较高,在韧皮部、形成层、未成熟木质部表达丰度较低,在成熟木质部中表达丰度极低。NaCl诱导的杨树叶片差异表达RT-PCR检测结果初步表明,PtNHX1和PtNHX6基因均受盐诱导表达,当溶液中NaCl浓度在100~400mmol.L-1内,随着盐浓度的提高,PtNHX1和PtNHX6基因的表达丰度逐渐增强,但超过400mmol.L-1后,其表达丰度均有所降低,这与所测定的叶片ABA含量匹配。
关键词
杨树
Na^+/H^+
反
向运输蛋白
反
转录
pcr
盐诱导的
差异
表达
Keywords
Populus
Na^+/H^+ antiporters
RT-
pcr
Differential expression induced by salt stress
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
功能基因组学研究进展
被引量:
2
5
作者
庄金秋
贾杏林
机构
山东省滨州畜牧兽医研究所山东省畜禽用蜂胶疫苗研究开发推广中心
出处
《动物医学进展》
CSCD
2004年第4期32-36,共5页
文摘
2 1世纪是生物时代和信息时代 ,基因组学的研究已从结构基因组学转向功能基因组学 ,对于基因功能的研究也由单一基因转向大规模、批量分析。文章对功能基因组学及相关学科的概念作了概述 ,介绍了功能基因组学的研究内容与研究方法 ,主要包括应用差异显示反转录 PCR、基因表达序列分析 (SAGE)、微点阵、蛋白质组学和生物信息学等研究基因组表达概况、基因组多样性和模式生物学等。
关键词
功能基因组学
差异显示反转录pcr
基因表达
序列分析
微点阵
蛋白质组学
生物信息学
Keywords
structural genomics
functional genomics
proteome
model organism
bioinformatics
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
反转录差异显示技术及其方法的改进
朱靖
杜立新
《动物医学进展》
CSCD
2005
6
在线阅读
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职称材料
2
采用差异显示法分离支气管哮喘病因多基因初探
陆丽
董晓先
董伟华
刘金保
《广州医学院学报》
2005
0
在线阅读
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职称材料
3
差异基因的高通量筛选研究
刘岩
王海龙
孟智启
《浙江农业科学》
2009
1
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职称材料
4
杨树Na^+/H^+反向运输蛋白基因(PtNHX_1、PtNHX_6)的克隆和检测
张德强
赵树堂
卢孟柱
田林
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006
7
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职称材料
5
功能基因组学研究进展
庄金秋
贾杏林
《动物医学进展》
CSCD
2004
2
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职称材料
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