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猪瘟病毒石门株不同代次E2基因主要抗原编码区序列差异分析
被引量：
7
1
作者
赵耘
王在时
+2 位作者
王琴
李博
丘惠深
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2002年第7期7-10,共4页
利用 RT- PCR及序列测定对猪瘟病毒石门株不同代次毒株 E2基因主要抗原编码区及同一代次不同年代主要抗原编码区序列进行了分析 ,结果所有毒株 E2基因主要抗原编码区序列呈现较高的同源性 ,石门株不同代次毒株 E2基因主要抗原编码区核...
利用 RT- PCR及序列测定对猪瘟病毒石门株不同代次毒株 E2基因主要抗原编码区及同一代次不同年代主要抗原编码区序列进行了分析 ,结果所有毒株 E2基因主要抗原编码区序列呈现较高的同源性 ,石门株不同代次毒株 E2基因主要抗原编码区核苷酸及氨基酸同源性分别为 97.7%～ 10 0 %、97.3%～ 10 0 % ;同一代次不同年代主要抗原编码区序列核苷酸及氨基酸同源性均为 98.6 %～ 10 0 %。只有 3个代次毒株发生较小的变异 ,核苷酸及氨基酸呈现 1～ 3个碱基或氨基酸的变异 ,其他代次的毒株序列完全一致。初步证实了猪瘟病毒分子结构的遗传稳定性 。
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关键词
猪瘟病毒
石门株
代次
E2基因
抗原编码区
序列
差异
分析
同源性
遗传稳定性
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职称材料
一种基于线性序列差异分析降维的人体行为识别方法
被引量：
13
2
作者
鹿天然
于凤芹
陈莹
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期237-241,249,共6页
在视频数据处理过程中容易出现维数灾难的问题。为此,提出一种线性序列差异分析方法,对视频数据降维来进行人体行为识别。运用ViBe算法对视频帧进行背景减除操作获取行为区域,在该区域内提取稠密轨迹特征从而去除背景数据的干扰。使用Fi...
在视频数据处理过程中容易出现维数灾难的问题。为此,提出一种线性序列差异分析方法,对视频数据降维来进行人体行为识别。运用ViBe算法对视频帧进行背景减除操作获取行为区域,在该区域内提取稠密轨迹特征从而去除背景数据的干扰。使用Fisher Vector对特征编码后进行线性序列差异分析,采用动态线性规整算法计算序列类别间相似度,得到最小化类内残差和最大化类间残差的线性变换,将特征从高维空间投影至低维空间,降低特征维数。利用降维后的特征训练支持向量机,实现人体行为识别。在KTH数据集和UCF101数据集上进行数据仿真,结果表明,与主成分分析算法、线性判别分析法等相比,该方法可有效提高识别准确率。
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关键词
人体行为识别
背景减除
稠密轨迹
线性
序列
差异
分析
降维
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职称材料
丁香假单胞大豆致病变种不同HrpZ蛋白差异区域功能研究
被引量：
2
3
作者
张阳
伍辉军
+2 位作者
张宏月
赵小珍
高学文
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期89-96,共8页
[目的]丁香假单胞大豆致病变种(Pseudomonas syringae pv.glycinea)A1和S1菌株编码产生的Hrp Z蛋白差异序列主要集中在C端的3个区域,并且这2个蛋白诱导非寄主HR的能力也存在差异。本研究将探究Hrp Z蛋白这3个差异区域在烟草上诱导HR(hyp...
[目的]丁香假单胞大豆致病变种(Pseudomonas syringae pv.glycinea)A1和S1菌株编码产生的Hrp Z蛋白差异序列主要集中在C端的3个区域,并且这2个蛋白诱导非寄主HR的能力也存在差异。本研究将探究Hrp Z蛋白这3个差异区域在烟草上诱导HR(hypersensitive response)和抑制烟草花叶病毒(TMV)中所起的作用。[方法]采用常规PCR及重叠PCR方法将这2个hrp Z基因的3个差异区域分别进行互换,构建了相应的重组表达载体,表达并纯化得到了6个重组蛋白,相对分子质量均在41×103左右。并检测了其诱导HR活性、诱导植物抗病性。[结果]检测结果表明:重组蛋白Hrp ZS(S2→A2)和Hrp ZA(A3→S3)诱导HR的能力相比亲本都有所增强,6个重组蛋白诱导烟草抗TMV的活性都明显强于亲本,其中,Hrp ZA(A3→S3)和Hrp ZS(S3→A3)的活性最强。[结论]此试验表明Hrp Z蛋白的这些差异区域(第7、8、9个α-螺旋)是过敏反应能力的主要调控区域,同时C-端第8、9个α-螺旋区域与诱导植物抗病性也显著相关。本研究为改造Hrp Z类harpin蛋白激发子,提高其诱导抗性及功能域研究提供了理论依据。
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关键词
丁香假单胞大豆致病变种
HRP
Z
差异序列分析
过敏性反应
诱导抗病性
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职称材料
题名
猪瘟病毒石门株不同代次E2基因主要抗原编码区序列差异分析
被引量：
7
1
作者
赵耘
王在时
王琴
李博
丘惠深
机构
中国兽医药品监察所
出处
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2002年第7期7-10,共4页
基金
国家自然科学基金重大项目 ( 32 8932 90 -1-2 )
文摘
利用 RT- PCR及序列测定对猪瘟病毒石门株不同代次毒株 E2基因主要抗原编码区及同一代次不同年代主要抗原编码区序列进行了分析 ,结果所有毒株 E2基因主要抗原编码区序列呈现较高的同源性 ,石门株不同代次毒株 E2基因主要抗原编码区核苷酸及氨基酸同源性分别为 97.7%～ 10 0 %、97.3%～ 10 0 % ;同一代次不同年代主要抗原编码区序列核苷酸及氨基酸同源性均为 98.6 %～ 10 0 %。只有 3个代次毒株发生较小的变异 ,核苷酸及氨基酸呈现 1～ 3个碱基或氨基酸的变异 ,其他代次的毒株序列完全一致。初步证实了猪瘟病毒分子结构的遗传稳定性 。
关键词
猪瘟病毒
石门株
代次
E2基因
抗原编码区
序列
差异
分析
同源性
遗传稳定性
Keywords
HCV Shimen strain
sequence analysis
identical
variation
genetically stable
分类号
S852.651 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
一种基于线性序列差异分析降维的人体行为识别方法
被引量：
13
2
作者
鹿天然
于凤芹
陈莹
机构
江南大学物联网工程学院
出处
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期237-241,249,共6页
基金
国家自然科学基金(61573168)
中央高校基本科研业务费专项资金(JUSRP51733B)
文摘
在视频数据处理过程中容易出现维数灾难的问题。为此,提出一种线性序列差异分析方法,对视频数据降维来进行人体行为识别。运用ViBe算法对视频帧进行背景减除操作获取行为区域,在该区域内提取稠密轨迹特征从而去除背景数据的干扰。使用Fisher Vector对特征编码后进行线性序列差异分析,采用动态线性规整算法计算序列类别间相似度,得到最小化类内残差和最大化类间残差的线性变换,将特征从高维空间投影至低维空间,降低特征维数。利用降维后的特征训练支持向量机,实现人体行为识别。在KTH数据集和UCF101数据集上进行数据仿真,结果表明,与主成分分析算法、线性判别分析法等相比,该方法可有效提高识别准确率。
关键词
人体行为识别
背景减除
稠密轨迹
线性
序列
差异
分析
降维
Keywords
human action recognition
background substraction
dense trajectories
Linear Sequence Discriminant Analysis(LSDA)
dimension reduction
分类号
TP391.41 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
丁香假单胞大豆致病变种不同HrpZ蛋白差异区域功能研究
被引量：
2
3
作者
张阳
伍辉军
张宏月
赵小珍
高学文
机构
南京农业大学植物保护学院/华东作物有害生物综合治理农业部重点实验室
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期89-96,共8页
基金
国家863计划项目(2012AA101106)
国家公益性行业(农业)科研专项(20130315)
+1 种基金
国家转基因生物新品种培育重大专项(2014ZX08004-004)
江苏省重点研发计划(现代农业)(BE2015354)
文摘
[目的]丁香假单胞大豆致病变种(Pseudomonas syringae pv.glycinea)A1和S1菌株编码产生的Hrp Z蛋白差异序列主要集中在C端的3个区域,并且这2个蛋白诱导非寄主HR的能力也存在差异。本研究将探究Hrp Z蛋白这3个差异区域在烟草上诱导HR(hypersensitive response)和抑制烟草花叶病毒(TMV)中所起的作用。[方法]采用常规PCR及重叠PCR方法将这2个hrp Z基因的3个差异区域分别进行互换,构建了相应的重组表达载体,表达并纯化得到了6个重组蛋白,相对分子质量均在41×103左右。并检测了其诱导HR活性、诱导植物抗病性。[结果]检测结果表明:重组蛋白Hrp ZS(S2→A2)和Hrp ZA(A3→S3)诱导HR的能力相比亲本都有所增强,6个重组蛋白诱导烟草抗TMV的活性都明显强于亲本,其中,Hrp ZA(A3→S3)和Hrp ZS(S3→A3)的活性最强。[结论]此试验表明Hrp Z蛋白的这些差异区域(第7、8、9个α-螺旋)是过敏反应能力的主要调控区域,同时C-端第8、9个α-螺旋区域与诱导植物抗病性也显著相关。本研究为改造Hrp Z类harpin蛋白激发子,提高其诱导抗性及功能域研究提供了理论依据。
关键词
丁香假单胞大豆致病变种
HRP
Z
差异序列分析
过敏性反应
诱导抗病性
Keywords
Pseudomonas syringae pv.glycinea
Hrp Z
protein sequence analysis
hypersensitive response（HR）
disease resistance
分类号
S432.42 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪瘟病毒石门株不同代次E2基因主要抗原编码区序列差异分析
赵耘
王在时
王琴
李博
丘惠深
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2002
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
一种基于线性序列差异分析降维的人体行为识别方法
鹿天然
于凤芹
陈莹
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2019
13
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
丁香假单胞大豆致病变种不同HrpZ蛋白差异区域功能研究
张阳
伍辉军
张宏月
赵小珍
高学文
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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