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红外光谱差减技术扣除水汽吸收干扰的局限性 被引量:4
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作者 余敏行 王海水 张韫宏 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2017年第6期1673-1677,共5页
红外光谱差减技术在扣除背景组份干扰方面得到广泛应用,但其扣除空气中水汽效果却不尽如人意。研究了不同湿度的水汽光谱与光谱差减效果的关系,以探究光谱差减技术在水汽扣除领域局限性的原因。结果表明:(1)相对湿度改变,水汽的红外光... 红外光谱差减技术在扣除背景组份干扰方面得到广泛应用,但其扣除空气中水汽效果却不尽如人意。研究了不同湿度的水汽光谱与光谱差减效果的关系,以探究光谱差减技术在水汽扣除领域局限性的原因。结果表明:(1)相对湿度改变,水汽的红外光谱也发生变化,不管如何小心地选择比例系数f,从相对湿度x%的水汽光谱Ax%,也不能完全扣除相对湿度为y%的水汽光谱Ay%,即fAx%≠Ay%。(2)相对湿度改变,水分子团簇(H_2O)n的相对组成也会发生变化,这是导致光谱差减技术局限性的主要原因。(3)将湿度为x%和y%的两水汽光谱Ax%和Ay%进行线性组合,则可以高度近似地模拟出介于两者之间的湿度的水汽光谱。比如用40%水汽谱和30%水汽谱,可以模拟得到32%或35%或37%的水汽谱。实验结果表明这是扣除水汽干扰效果更好的路径。(4)论证了水汽补偿湿度滴定法具有高效性的原因。 展开更多
关键词 水汽干扰 红外光谱 差减技术 局限性 空气湿度
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应用抑制性差减杂交技术克隆小鼠胸腺细胞发育相关新基因 被引量:2
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作者 金成刚 李燕 陈慰峰 《北京医科大学学报》 CSCD 2000年第4期303-305,共3页
目的 :克隆胸腺细胞发育相关新基因。方法 :应用抑制性差减杂交技术 (suppressionsubtractivehybridiza tion ,SSH) ,构建了胸腺基质细胞系cDNA差减杂交文库 ,结合RACE及RT PCR进一步克隆并验证新基因的cD NA全长序列。结果 :筛选两个... 目的 :克隆胸腺细胞发育相关新基因。方法 :应用抑制性差减杂交技术 (suppressionsubtractivehybridiza tion ,SSH) ,构建了胸腺基质细胞系cDNA差减杂交文库 ,结合RACE及RT PCR进一步克隆并验证新基因的cD NA全长序列。结果 :筛选两个不同胸腺基质细胞系的差异表达基因 ,获得了差异表达的cDNA片段 ,克隆后挑选阳性克隆进行测序 ,成功克隆 8个新基因片段。对其中两个新基因克隆C5 5和C91进行Northern杂交分析 ,mR NA转录体长度分别为 1.4kb及 1.5kb ,C5 5的表达在两种胸腺基质细胞系中存在显著差异。进一步克隆了C5 5和C91两个新基因的cDNA全长序列 ,已被GenBank所接受。结论 :抑制性差减杂交技术是克隆新基因片段的有效方法 ;成功克隆 展开更多
关键词 抑制性杂效技术 分子克隆 胸腺细胞 DNA
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应用抑制性差减杂交技术研究枣缩果病病程相关基因
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作者 焦小利 杨卉芯 宋晓斌 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1520-1526,共7页
【目的】了解细交链孢菌侵染枣果实过程的差异表达基因。【方法】以白熟期‘蜂蜜罐’枣的果实为材料,人工接种细交链孢菌,分别在接种0.5、1、2、3和4 d后取样,通过抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)构建... 【目的】了解细交链孢菌侵染枣果实过程的差异表达基因。【方法】以白熟期‘蜂蜜罐’枣的果实为材料,人工接种细交链孢菌,分别在接种0.5、1、2、3和4 d后取样,通过抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)构建了病原菌诱导的差异表达的c DNA消减文库。【结果】PCR鉴定随机挑取的阳性克隆,显示插入片段大小为200~900 bp。随机挑选200个阳性克隆进行测序,利用BLASTx在Gen Bank Nr数据库进行序列比对分析,共获得118个Unigenes。对这些ESTs进行功能分类发现细交链孢菌侵染下诱导表达基因涉及植物细胞内的多种代谢和应答过程,其中包括抗病/防御类、信号传导途径类、新陈代谢类、蛋白质合成和加工类及细胞结构的组成等,尤其以抗病/防御类基因所占比例最大(27.17%)。【结论】通过SSH研究了缩果病病原侵染果实过程的差异表达基因,鉴定到一些与枣缩果病相关的基因,为进一步研究相关基因及今后筛选防治枣缩果病提供理论基础。 展开更多
关键词 枣缩果病 抑制杂交技术 表达序列标签
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大豆花叶病毒诱导的野生大豆抑制差减文库构建及初步分析 被引量:3
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作者 史凤玉 朱英波 +2 位作者 龙茹 武云鹏 乔亚科 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期968-971,共4页
以野生大豆Bian0526为试验材料,通过抑制性差减杂交技术(SSH)构建了大豆花叶病毒(SMV)诱导的cDNA差减文库。在文库中共筛选到15 343个阳性克隆,PCR鉴定插入片段大部分集中在500~800 bp之间。利用BLAST在GenBank文库中进行序列相似性比... 以野生大豆Bian0526为试验材料,通过抑制性差减杂交技术(SSH)构建了大豆花叶病毒(SMV)诱导的cDNA差减文库。在文库中共筛选到15 343个阳性克隆,PCR鉴定插入片段大部分集中在500~800 bp之间。利用BLAST在GenBank文库中进行序列相似性比对,获得有功能的EST 200个。对有功能注释的同源分析发现,其功能涉及植物的细胞自身保护和系统获得性抗性等方面,说明这些基因很可能参与到野生大豆抗大豆花叶病毒反应中。 展开更多
关键词 野生大豆 大豆花叶病毒病 抑制杂交技术(SSH) CDNA文库
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罗非鱼免疫前后白细胞cDNA差减文库的构建及鉴定 被引量:9
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作者 李超 陈明 +7 位作者 李莉萍 黄维义 余晓丽 黄婷 张彬 雷爱莹 陈福艳 梁万文 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2010年第4期1286-1292,共7页
为筛选罗非鱼链球菌疫苗免疫前后白细胞表达变化基因及探讨鱼类白细胞免疫机理,利用抑制性差减杂交(SSH)技术,以链球菌疫苗免疫前后罗非鱼白细胞cDNA为材料,构建了罗非鱼免疫前后正、负2个cDNA差减文库,并采用地高辛(DIG)标记差减文库c... 为筛选罗非鱼链球菌疫苗免疫前后白细胞表达变化基因及探讨鱼类白细胞免疫机理,利用抑制性差减杂交(SSH)技术,以链球菌疫苗免疫前后罗非鱼白细胞cDNA为材料,构建了罗非鱼免疫前后正、负2个cDNA差减文库,并采用地高辛(DIG)标记差减文库cDNA作为探针,进行差异表达片段的筛选鉴定。结果显示:2个文库重组率均在90%以上,插入片段在300~900 bp,接头连接效率超过50%,差减效率非常高效,阳性率均超过70%。杂交筛选后正、负文库各挑选30个阳性克隆进行测序组装聚类,正、负文库各获得16和18条非冗余EST(unigene),所得序列经GenBank同源性分析,正、负文库各有10和11条unigene获得功能注释,且各有6和7条unigene没有同源性匹配,为未知新基因。 展开更多
关键词 罗非鱼 链球菌 白细胞cDNA 文库 抑制性杂交(SSH)技术
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黑斑病菌诱导的紫薯抑制性差减杂交文库构建及ESTs分析 被引量:1
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作者 曾绍华 张聪 +4 位作者 李明 屈会娟 张敏 阎文昭 蒲志刚 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第1期53-58,共6页
本研究以紫薯1号为材料,运用抑制性差减杂交(SSH)技术,构建了经黑斑病菌诱导12、24、36、48、60 h后的甘薯块根混合SSH cDNA文库。随机挑取103个cDNA克隆进行5'端测序,共获得87个非重复序列,其中包括29个重叠群,58个独立的ESTs,利用... 本研究以紫薯1号为材料,运用抑制性差减杂交(SSH)技术,构建了经黑斑病菌诱导12、24、36、48、60 h后的甘薯块根混合SSH cDNA文库。随机挑取103个cDNA克隆进行5'端测序,共获得87个非重复序列,其中包括29个重叠群,58个独立的ESTs,利用tblastx对87个序列在NCBI数据库中进行同源性比对。结果表明,在编号为14的EST中找到了"蔷薇"黑斑抗性muRdr1基因位点,基因全序列包括muRdr1A、muRdr1B、muRdr1C、muRdr1D、muRdr1E、muRdr1F、muRdr1G、muRdr1H、muRdr1I共9个基因。另外有2类基因的含量较高,一类是紫薯组织特异性相关基因,另一类是紫薯受干旱胁迫的抗逆相关基因。构建cDNA文库,应用EST技术并结合生物信息学技术,对紫薯抗病相关基因的表达分析,从基因水平上来研究紫薯抗病机制,为今后的紫薯抗病遗传育种及抗病机理奠定论基础。 展开更多
关键词 紫薯 黑斑病菌诱导 抑制杂交技术 表达序列标签
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DEGCM技术中的RDA、SSH和RSDD
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作者 秦春圃 《生物技术通报》 CAS CSCD 2003年第2期53-54,共2页
关键词 DEGCM技术 RDA SSH RSDD 异表达基因分离技术 代表性式分析法 抑制性杂交PCR法 交互式异RNA显示技术 PCR技术
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水稻精细胞优势表达基因RSG6启动子的克隆及表达 被引量:2
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作者 兰利琼 苗琛 +5 位作者 白洁 徐莺 王胜华 唐琳 颜钫 陈放 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期290-296,共7页
利用已知的RSG6基因序列和GenBank中提供的RSG6前导序列设计引物 ,通过基因组DNA的PCR扩增得到长度为 1 4 0 8bp和 1 1 73bp的两个RSG6启动子片段PB、PS,测定序列分析发现 ,PB、PS分别位于水稻第 1 0和第 4染色体上 ,PB、PS序列之间具... 利用已知的RSG6基因序列和GenBank中提供的RSG6前导序列设计引物 ,通过基因组DNA的PCR扩增得到长度为 1 4 0 8bp和 1 1 73bp的两个RSG6启动子片段PB、PS,测定序列分析发现 ,PB、PS分别位于水稻第 1 0和第 4染色体上 ,PB、PS序列之间具有较高的同源性 ,且都含有大量的启动子元件。通过设计带有酶切位点的引物扩增出PB和PS的各两条缺失片段PB1、PB2、PS1、PS2 ,与质粒 pBI2 2 1连接后得到中间载体pBI2 2 1 PB1、pBI2 2 1 PB2、pBI2 2 1 PS1、pBI2 2 1 PS2 ,再与质粒pBIN1 9连接构建出双元表达载体pBIN GUSB1、pBIN GUSB2、pBIN GUSS1、pBIN GUSS2 ,转化农杆菌EHA1 0 5 ,感染烟草叶片和烟草花粉 ,瞬时表达显示缺失片段PB1、PB2、PS1、PS2均具有启动子功能 ,且PB1、PS1的启动效率较PB2。 展开更多
关键词 水稻 精细胞 优势表达基因RSG6 启动子 基因克隆 基因表达 抑制杂交技术
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钙磷脂结合蛋白Ⅱ在人肝细胞癌中的表达 被引量:1
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作者 朱晓静 张建平 +6 位作者 刘悦芳 徐凛峰 张慧林 李玉华 陈汐敏 冯振卿 管晓虹 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期663-666,731,F0006,共6页
目的:应用抑制差减杂交技术(supressionsubtractivehybridization,SSH)结合cDNA芯片筛选人肝细胞癌中差异表达基因。进一步探讨所筛选出的钙磷脂结合蛋白(annexinⅡ)在肝细胞中的表达及作用。方法:以肝癌组织和非肿瘤肝组织进行SSH,构... 目的:应用抑制差减杂交技术(supressionsubtractivehybridization,SSH)结合cDNA芯片筛选人肝细胞癌中差异表达基因。进一步探讨所筛选出的钙磷脂结合蛋白(annexinⅡ)在肝细胞中的表达及作用。方法:以肝癌组织和非肿瘤肝组织进行SSH,构建正、反向差减杂交文库,差减片断的PCR产物制备cDNA芯片,筛选出肝癌组织中差异表达基因。进一步应用荧光实时定量技术验证芯片结果,免疫组化方法分析annexinⅡ在肝细胞癌和正常肝组织中的表达。结果:成功构建了肝细胞癌差减杂交文库。芯片结果显示annexinⅡ在肝细胞癌中高表达并经荧光实时定量技术证实。免疫组化结果表明annexinⅡ在肝细胞癌和癌旁肝硬化组织中高表达,在正常肝组织中不表达(P<0.05)。在低分化肝细胞癌中annexinⅡ的表达有增高趋势。结论:SSH方法构建的肝细胞癌差减杂交文库富含肝细胞癌差异表达基因。肝细胞癌中高表达基因annexinII可能与肝细胞的恶性转化,肝癌细胞的转移和侵袭能力有关。 展开更多
关键词 肝细胞癌 抑制杂交技术 CDNA芯片 钙磷脂结合蛋白 免疫组化
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