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巨蛎属牡蛎DNA序列的比较及鉴定
被引量：
3
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作者
彭敏
罗邦
+7 位作者
朱威霖
杨春玲
赵永贞
李强勇
刘青云
曾地刚
李旻
陈秀荔
《广东海洋大学学报》
CAS
2020年第1期29-37,共9页
【目的】了解巨砺属牡蛎的系统关系和种类区分。【方法】对我国沿海分布的7种巨砺属牡蛎(香港牡蛎、有明牡蛎、熊本牡蛎、岩牡蛎、艾氏牡蛎、太平洋牡蛎、葡萄牙牡蛎)的线粒体DNA片段(COI、12S、16S和tRNAs),以及核糖体RNA基因转录间隔...
【目的】了解巨砺属牡蛎的系统关系和种类区分。【方法】对我国沿海分布的7种巨砺属牡蛎(香港牡蛎、有明牡蛎、熊本牡蛎、岩牡蛎、艾氏牡蛎、太平洋牡蛎、葡萄牙牡蛎)的线粒体DNA片段(COI、12S、16S和tRNAs),以及核糖体RNA基因转录间隔子序列(ITS-1、ITS-2和ITS)进行分子系统学研究。【结果】无论种间或种内,tRNAs序列差异最大,亚种内TS1序列差异最大;tRNAs和COI序列较其它序列变异更快,种间变异与种内变异之间有明显的条形码间隙;12S、16S、ITS和ITS2的种间变异与种内变异无重叠及条形码间隙;ITS1的种间变异与种内变异出现重叠。在亚种层面,12S、ITS、ITS1和ITS2的亚种间变异与亚种内变异出现重叠;16S的亚种间变异与亚种内变异无重叠及条形码间隙;tRNAs与COI序列亚种间变异与亚种内变异之间有明显的条形码间隙,有利于区分亚种。【结论】tRNAs和COI序列可用于种及亚种的鉴定。
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关键词
巨砺属牡蛎
DNA条形码
线粒体DNA
核糖体RNA基因
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职称材料
题名
巨蛎属牡蛎DNA序列的比较及鉴定
被引量：
3
1
作者
彭敏
罗邦
朱威霖
杨春玲
赵永贞
李强勇
刘青云
曾地刚
李旻
陈秀荔
机构
广西壮族自治区水产科学研究院、广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室
出处
《广东海洋大学学报》
CAS
2020年第1期29-37,共9页
基金
广西创新驱动发展专项资金项目(桂科AA17204088-1)
农业基础性长期性科技工作国家渔业科学数据中心观测检测任务(ZX08S211664)
文摘
【目的】了解巨砺属牡蛎的系统关系和种类区分。【方法】对我国沿海分布的7种巨砺属牡蛎(香港牡蛎、有明牡蛎、熊本牡蛎、岩牡蛎、艾氏牡蛎、太平洋牡蛎、葡萄牙牡蛎)的线粒体DNA片段(COI、12S、16S和tRNAs),以及核糖体RNA基因转录间隔子序列(ITS-1、ITS-2和ITS)进行分子系统学研究。【结果】无论种间或种内,tRNAs序列差异最大,亚种内TS1序列差异最大;tRNAs和COI序列较其它序列变异更快,种间变异与种内变异之间有明显的条形码间隙;12S、16S、ITS和ITS2的种间变异与种内变异无重叠及条形码间隙;ITS1的种间变异与种内变异出现重叠。在亚种层面,12S、ITS、ITS1和ITS2的亚种间变异与亚种内变异出现重叠;16S的亚种间变异与亚种内变异无重叠及条形码间隙;tRNAs与COI序列亚种间变异与亚种内变异之间有明显的条形码间隙,有利于区分亚种。【结论】tRNAs和COI序列可用于种及亚种的鉴定。
关键词
巨砺属牡蛎
DNA条形码
线粒体DNA
核糖体RNA基因
Keywords
Oysters of the genus Crassostrea
DNA barcodes
mitochondrial DNA
ribosomal RNA gene
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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作者
出处
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被引量
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1
巨蛎属牡蛎DNA序列的比较及鉴定
彭敏
罗邦
朱威霖
杨春玲
赵永贞
李强勇
刘青云
曾地刚
李旻
陈秀荔
《广东海洋大学学报》
CAS
2020
3
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