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非酒精性脂肪肝及肝纤维化的免疫浸润分析与中药靶点预测
1
作者
李璐吉
刘晓
+3 位作者
王一
缪伟峰
杨勤
唐莉
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2024年第4期965-977,共13页
目的本研究通过探讨巨噬细胞标志物与NAFLD及肝纤维化的相关性,以期为进一步探求NAFLD肝纤维化的发病机制,探索有效中药成分,为中医药防治肝纤维化提供帮助和借鉴。方法基于生物信息学方法分析NAFLD基因芯片,筛选差异表达基因;通过WGCN...
目的本研究通过探讨巨噬细胞标志物与NAFLD及肝纤维化的相关性,以期为进一步探求NAFLD肝纤维化的发病机制,探索有效中药成分,为中医药防治肝纤维化提供帮助和借鉴。方法基于生物信息学方法分析NAFLD基因芯片,筛选差异表达基因;通过WGCNA共表达网络分析和构建LASSO模型,筛选核心表达基因;利用CIBERSORT进行免疫细胞浸润分析,探索巨噬细胞表型与差异表达基因、纤维化程度的相关性,并通过外部数据集鉴定NAFLD及肝纤维化中巨噬细胞的相关生物标记物,通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)验证核心基因在不同巨噬细胞亚型中的表达差异。通过医学本体信息检索平台Coremine medical数据库,筛选NAFLD的中药治疗靶点并进行归纳分析。结果本研究共筛选出15个与NAFLD及肝纤维化相关的核心基因。CIBERSORT算法分析结果表明,NAFLD的发生与多种免疫细胞相关,其中M1型巨噬细胞在NAFLD组中显著升高,差异显著(P<0.01),M1型巨噬细胞与肝纤维化程度呈正相关,M2型巨噬细胞与肝纤维化程度呈负相关。核心基因与巨噬细胞的相关性分析结果显示,KDM4A、MED30、IKBKG、ENO1、HSPA8与总巨噬细胞数呈负相关,IL-6、FOS、EDN2、NR4A2表达与M1型巨噬细胞数呈负相关,而与M2型巨噬细胞数呈正相关。通过外部数据集验证及体外RT-PCR验证结果显示,在M2型巨噬细胞中FOS、NR4A2 mRNA的表达量高于M1型巨噬细胞(P<0.001),与M1型巨噬细胞呈负相关,而与M2型巨噬细胞呈正相关。其中基于核心靶点通过Coremine medical数据库,根据药物功效与归经筛选出丹参、牡丹皮、地黄、当归、泽泻、枳椇子、人参、山茱萸、山楂等相关中药,功效分析其主要集中在清热解毒、祛湿化痰以及活血化瘀等方面,其中筛选频数最高的药物为牡丹皮。结论肝脏巨噬细胞是治疗肝病的靶细胞,调控巨噬细胞M2极化有助于治疗NAFLD及相关肝纤维化,c-Fos、NR4A2可能是关键作用靶点,其中牡丹皮等中药具有肝保护作用,为进一步研究NAFLD及肝纤维化的发病机制和治疗方法提供了新的参考。
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关键词
非酒精性脂肪肝
肝纤维化
巨噬细胞标志物
免疫浸润
中药靶点
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题名
非酒精性脂肪肝及肝纤维化的免疫浸润分析与中药靶点预测
1
作者
李璐吉
刘晓
王一
缪伟峰
杨勤
唐莉
机构
南京中医药大学附属南京中医院
重庆市中医院
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2024年第4期965-977,共13页
基金
国家自然科学基金委员会青年科学基金项目(82205024):四君子汤改善结肠癌肿瘤浸润CXCR6+CD8+T细胞耗竭增强PD-1抑制剂疗效的作用机制研究,负责人:王一
南京卫生科技发展专项一般课题(YKK20163):ACLF患者免疫细胞代谢功能障碍与预后的相关性及毛蕊异黄酮改善ACLF的机制,负责人:唐莉
文摘
目的本研究通过探讨巨噬细胞标志物与NAFLD及肝纤维化的相关性,以期为进一步探求NAFLD肝纤维化的发病机制,探索有效中药成分,为中医药防治肝纤维化提供帮助和借鉴。方法基于生物信息学方法分析NAFLD基因芯片,筛选差异表达基因;通过WGCNA共表达网络分析和构建LASSO模型,筛选核心表达基因;利用CIBERSORT进行免疫细胞浸润分析,探索巨噬细胞表型与差异表达基因、纤维化程度的相关性,并通过外部数据集鉴定NAFLD及肝纤维化中巨噬细胞的相关生物标记物,通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)验证核心基因在不同巨噬细胞亚型中的表达差异。通过医学本体信息检索平台Coremine medical数据库,筛选NAFLD的中药治疗靶点并进行归纳分析。结果本研究共筛选出15个与NAFLD及肝纤维化相关的核心基因。CIBERSORT算法分析结果表明,NAFLD的发生与多种免疫细胞相关,其中M1型巨噬细胞在NAFLD组中显著升高,差异显著(P<0.01),M1型巨噬细胞与肝纤维化程度呈正相关,M2型巨噬细胞与肝纤维化程度呈负相关。核心基因与巨噬细胞的相关性分析结果显示,KDM4A、MED30、IKBKG、ENO1、HSPA8与总巨噬细胞数呈负相关,IL-6、FOS、EDN2、NR4A2表达与M1型巨噬细胞数呈负相关,而与M2型巨噬细胞数呈正相关。通过外部数据集验证及体外RT-PCR验证结果显示,在M2型巨噬细胞中FOS、NR4A2 mRNA的表达量高于M1型巨噬细胞(P<0.001),与M1型巨噬细胞呈负相关,而与M2型巨噬细胞呈正相关。其中基于核心靶点通过Coremine medical数据库,根据药物功效与归经筛选出丹参、牡丹皮、地黄、当归、泽泻、枳椇子、人参、山茱萸、山楂等相关中药,功效分析其主要集中在清热解毒、祛湿化痰以及活血化瘀等方面,其中筛选频数最高的药物为牡丹皮。结论肝脏巨噬细胞是治疗肝病的靶细胞,调控巨噬细胞M2极化有助于治疗NAFLD及相关肝纤维化,c-Fos、NR4A2可能是关键作用靶点,其中牡丹皮等中药具有肝保护作用,为进一步研究NAFLD及肝纤维化的发病机制和治疗方法提供了新的参考。
关键词
非酒精性脂肪肝
肝纤维化
巨噬细胞标志物
免疫浸润
中药靶点
Keywords
Nonalcoholic fatty liver
Liver fibrosis
Macrophages markers
Immune infiltration
Target in Chinese herbs
分类号
R-058 [医药卫生]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
非酒精性脂肪肝及肝纤维化的免疫浸润分析与中药靶点预测
李璐吉
刘晓
王一
缪伟峰
杨勤
唐莉
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2024
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