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陕西源山羊星状病毒全基因组序列分析
1
作者
于皓同
马勇杰
+3 位作者
王凯茸
张琪
张淑霞
许信刚
《动物医学进展》
北大核心
2025年第9期40-45,共6页
为了解陕西源山羊星状病毒(Caprine astrovirus)遗传变异情况和重组现象,该研究利用RT-PCR技术对山羊腹泻粪便样品进行检测,设计8对特异性引物,对检测阳性的山羊星状病毒进行全基因组扩增,并使用DNAStar软件、MEGA11.0软件、RDP4软件和S...
为了解陕西源山羊星状病毒(Caprine astrovirus)遗传变异情况和重组现象,该研究利用RT-PCR技术对山羊腹泻粪便样品进行检测,设计8对特异性引物,对检测阳性的山羊星状病毒进行全基因组扩增,并使用DNAStar软件、MEGA11.0软件、RDP4软件和Simplot软件对扩增到的山羊星状病毒全基因组序列进行分析。结果显示,成功扩增到山羊星状病毒(命名为SX-1/2023)全基因组序列;SX-1/2023全基因组核苷酸同源性和ORF2基因氨基酸同源性与中国西南地区的SWUN/LJK2-2/2020株最高;系统发育树显示SX-1/2023与其他MAstV-24处于同一分支,属于MAstV-24;重组事件预测显示,SX-1/2023未发生重组事件,但作为主要亲本毒株参与了SWUN/LJK2-2/2020株的重组事件。该研究为山羊星状病毒的流行病学调查及实验室诊断技术开发提供了基础数据。
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关键词
山羊星状病毒
全基因组测序
遗传进化分析
基因重组分析
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职称材料
基于ORF2蛋白的山羊星状病毒抗体间接ELISA检测方法的建立与应用
2
作者
于皓同
马永杰
+4 位作者
王凯茸
丁雨欣
张淑霞
张琪
许信刚
《动物医学进展》
北大核心
2025年第3期17-22,共6页
为了建立山羊星状病毒(Caprine astrovirus)的血清抗体检测方法,从经RT-PCR检测星状病毒阳性的腹泻羊粪便中克隆山羊星状病毒ORF2基因并构建表达载体,用原核表达技术制备重组ORF2蛋白,重组蛋白纯化复性后作为包被抗原,建立山羊星状病毒...
为了建立山羊星状病毒(Caprine astrovirus)的血清抗体检测方法,从经RT-PCR检测星状病毒阳性的腹泻羊粪便中克隆山羊星状病毒ORF2基因并构建表达载体,用原核表达技术制备重组ORF2蛋白,重组蛋白纯化复性后作为包被抗原,建立山羊星状病毒血清抗体间接ELISA检测方法,并对临床收集的山羊血清样本进行检测。结果显示,ORF2重组蛋白大小为42 ku,Western blot证明其具有良好的反应原性;ELISA检测方法最佳工作条件为6μg/mL抗原包被酶标板,一抗血清稀释倍数为1∶100,酶标二抗稀释倍数为1∶5000,阴阳临界值为0.327。用该方法对山羊流产衣原体、立克次体、山羊支原体山羊肺炎亚种及伪结核棒状杆菌的阳性血清进行检测,结果均为阴性;当阳性血清稀释至1024倍时检测结果仍为山羊星状病毒抗体阳性;批内、批间变异系数均小于10%。用该方法对陕西省部分羊场收集到的288份血清样本进行检测,山羊星状病毒抗体阳性率为59.03%。建立了一种检测山羊星状病毒抗体的间接ELISA检测方法,为山羊星状病毒感染的诊断和流行病学调查提供了技术支持。
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关键词
山羊星状病毒
ORF2蛋白
原核表达
间接酶联免疫吸附试验
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职称材料
山羊星状病毒Taq Man荧光定量PCR检测方法的建立与应用
3
作者
于皓同
马勇杰
+3 位作者
王凯茸
张琪
张淑霞
许信刚
《动物医学进展》
北大核心
2025年第8期7-11,共5页
为建立快速检测山羊星状病毒(Caprine astrovirus)的方法,根据GenBank上收录的山羊星状病毒ORF1ab基因序列(OR652457)设计特异性探针和引物,构建重组质粒。以重组质粒为标准品进行反应条件优化及临床样品检测初步应用,旨在建立一种检测...
为建立快速检测山羊星状病毒(Caprine astrovirus)的方法,根据GenBank上收录的山羊星状病毒ORF1ab基因序列(OR652457)设计特异性探针和引物,构建重组质粒。以重组质粒为标准品进行反应条件优化及临床样品检测初步应用,旨在建立一种检测山羊星状病毒的Taq Man荧光定量PCR方法。结果显示,该方法建立的标准曲线具有良好的线性关系;对牛病毒性腹泻病毒、牛冠状病毒、牛轮状病毒、山羊贝氏柯克斯体、山羊支原体等均无交叉反应;对山羊星状病毒重组质粒标准品最低检测限为2.16×10^(1)copies/μL;批内和批间试验结果稳定,变异系数均小于2%;用建立的方法对收集的陕西省部分山羊场的115份腹泻粪便样品进行检测,结果显示山羊星状病毒阳性率为29.57%,与常规RT-PCR的检测结果符合率为94.78%。该方法为山羊星状病毒快速检测提供了技术支持。
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关键词
山羊星状病毒
Taq
Man荧光定量PCR
检测方法
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职称材料
题名
陕西源山羊星状病毒全基因组序列分析
1
作者
于皓同
马勇杰
王凯茸
张琪
张淑霞
许信刚
机构
西北农林科技大学动物医学院
出处
《动物医学进展》
北大核心
2025年第9期40-45,共6页
基金
国家重点研发计划项目(2021YFD1600704)
省级农业专项资金项目(XNDY2210)。
文摘
为了解陕西源山羊星状病毒(Caprine astrovirus)遗传变异情况和重组现象,该研究利用RT-PCR技术对山羊腹泻粪便样品进行检测,设计8对特异性引物,对检测阳性的山羊星状病毒进行全基因组扩增,并使用DNAStar软件、MEGA11.0软件、RDP4软件和Simplot软件对扩增到的山羊星状病毒全基因组序列进行分析。结果显示,成功扩增到山羊星状病毒(命名为SX-1/2023)全基因组序列;SX-1/2023全基因组核苷酸同源性和ORF2基因氨基酸同源性与中国西南地区的SWUN/LJK2-2/2020株最高;系统发育树显示SX-1/2023与其他MAstV-24处于同一分支,属于MAstV-24;重组事件预测显示,SX-1/2023未发生重组事件,但作为主要亲本毒株参与了SWUN/LJK2-2/2020株的重组事件。该研究为山羊星状病毒的流行病学调查及实验室诊断技术开发提供了基础数据。
关键词
山羊星状病毒
全基因组测序
遗传进化分析
基因重组分析
Keywords
Caprine astrovirus
Whole genome sequencing
Genetic evolution analysis
Gene recombination analysis
分类号
S852.654 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
基于ORF2蛋白的山羊星状病毒抗体间接ELISA检测方法的建立与应用
2
作者
于皓同
马永杰
王凯茸
丁雨欣
张淑霞
张琪
许信刚
机构
西北农林科技大学动物医学院
出处
《动物医学进展》
北大核心
2025年第3期17-22,共6页
基金
国家重点研发计划项目(2021YFD1600704)
陕西省农业专项资金项目(XNDY2210)。
文摘
为了建立山羊星状病毒(Caprine astrovirus)的血清抗体检测方法,从经RT-PCR检测星状病毒阳性的腹泻羊粪便中克隆山羊星状病毒ORF2基因并构建表达载体,用原核表达技术制备重组ORF2蛋白,重组蛋白纯化复性后作为包被抗原,建立山羊星状病毒血清抗体间接ELISA检测方法,并对临床收集的山羊血清样本进行检测。结果显示,ORF2重组蛋白大小为42 ku,Western blot证明其具有良好的反应原性;ELISA检测方法最佳工作条件为6μg/mL抗原包被酶标板,一抗血清稀释倍数为1∶100,酶标二抗稀释倍数为1∶5000,阴阳临界值为0.327。用该方法对山羊流产衣原体、立克次体、山羊支原体山羊肺炎亚种及伪结核棒状杆菌的阳性血清进行检测,结果均为阴性;当阳性血清稀释至1024倍时检测结果仍为山羊星状病毒抗体阳性;批内、批间变异系数均小于10%。用该方法对陕西省部分羊场收集到的288份血清样本进行检测,山羊星状病毒抗体阳性率为59.03%。建立了一种检测山羊星状病毒抗体的间接ELISA检测方法,为山羊星状病毒感染的诊断和流行病学调查提供了技术支持。
关键词
山羊星状病毒
ORF2蛋白
原核表达
间接酶联免疫吸附试验
Keywords
Caprine astrovirus
ORF2 protein
Prokaryotic expression
Indirect ELISA
分类号
S852.659.6 [农业科学—基础兽医学]
S858.27 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
山羊星状病毒Taq Man荧光定量PCR检测方法的建立与应用
3
作者
于皓同
马勇杰
王凯茸
张琪
张淑霞
许信刚
机构
西北农林科技大学动物医学院
出处
《动物医学进展》
北大核心
2025年第8期7-11,共5页
基金
国家重点研发计划项目(2021YFD1600704)
陕西省农业专项资金项目(XNDY2210)。
文摘
为建立快速检测山羊星状病毒(Caprine astrovirus)的方法,根据GenBank上收录的山羊星状病毒ORF1ab基因序列(OR652457)设计特异性探针和引物,构建重组质粒。以重组质粒为标准品进行反应条件优化及临床样品检测初步应用,旨在建立一种检测山羊星状病毒的Taq Man荧光定量PCR方法。结果显示,该方法建立的标准曲线具有良好的线性关系;对牛病毒性腹泻病毒、牛冠状病毒、牛轮状病毒、山羊贝氏柯克斯体、山羊支原体等均无交叉反应;对山羊星状病毒重组质粒标准品最低检测限为2.16×10^(1)copies/μL;批内和批间试验结果稳定,变异系数均小于2%;用建立的方法对收集的陕西省部分山羊场的115份腹泻粪便样品进行检测,结果显示山羊星状病毒阳性率为29.57%,与常规RT-PCR的检测结果符合率为94.78%。该方法为山羊星状病毒快速检测提供了技术支持。
关键词
山羊星状病毒
Taq
Man荧光定量PCR
检测方法
Keywords
Caprine astrovirus
Taq Man real-time PCR
Detection method
分类号
S852.654 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
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被引量
操作
1
陕西源山羊星状病毒全基因组序列分析
于皓同
马勇杰
王凯茸
张琪
张淑霞
许信刚
《动物医学进展》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于ORF2蛋白的山羊星状病毒抗体间接ELISA检测方法的建立与应用
于皓同
马永杰
王凯茸
丁雨欣
张淑霞
张琪
许信刚
《动物医学进展》
北大核心
2025
0
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下载PDF
职称材料
3
山羊星状病毒Taq Man荧光定量PCR检测方法的建立与应用
于皓同
马勇杰
王凯茸
张琪
张淑霞
许信刚
《动物医学进展》
北大核心
2025
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