期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
1
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
基于序列和局部信息熵的蛋白质折叠速率预测模型
被引量：
3
1
作者
高建召
胡刚
+1 位作者
王奎
沈世镒
《工程数学学报》
CSCD
北大核心
2010年第6期959-966,共8页
正确预测蛋白质折叠速率对理解蛋白质的折叠机制非常重要。本文从AAindex数据库中的531种残基物理化学性质、序列长度信息和局部结构信息熵中筛选特征,从而提出了一个基于蛋白质序列信息的线性回归模型。针对三种折叠机制two-state,mult...
正确预测蛋白质折叠速率对理解蛋白质的折叠机制非常重要。本文从AAindex数据库中的531种残基物理化学性质、序列长度信息和局部结构信息熵中筛选特征,从而提出了一个基于蛋白质序列信息的线性回归模型。针对三种折叠机制two-state,multi-state和mixed-state,用Jackknife验证模型,预测的折叠速率和实验验证的折叠速率相关系数分别为0.790,0.829和0.778。本文结果表明四阶局部结构信息熵和折叠速率有很高的负相关性;蛋白质的长度和蛋白质的折叠速率成反比关系;螺旋的含量会加快蛋白质的折叠过程。对two-state蛋白质β折叠的含量会减慢蛋白质的折叠过程;和其他模型相比,我们提出的线性回归模型具有输入参数少,计算简单,平均绝对误差小的优点。
展开更多
关键词
蛋白质折叠速率
基因序列的预测方法
局部结构信息熵
线性回归
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
基于序列和局部信息熵的蛋白质折叠速率预测模型
被引量：
3
1
作者
高建召
胡刚
王奎
沈世镒
机构
南开大学数学科学学院与LPMC
出处
《工程数学学报》
CSCD
北大核心
2010年第6期959-966,共8页
基金
国家自然科学基金(10671100
20836005)
+3 种基金
刘徽应用数学研究中心
天津大学
南开大学联合研究项目
天津市自然科学基金(07JCZDJC06400)~~
文摘
正确预测蛋白质折叠速率对理解蛋白质的折叠机制非常重要。本文从AAindex数据库中的531种残基物理化学性质、序列长度信息和局部结构信息熵中筛选特征,从而提出了一个基于蛋白质序列信息的线性回归模型。针对三种折叠机制two-state,multi-state和mixed-state,用Jackknife验证模型,预测的折叠速率和实验验证的折叠速率相关系数分别为0.790,0.829和0.778。本文结果表明四阶局部结构信息熵和折叠速率有很高的负相关性;蛋白质的长度和蛋白质的折叠速率成反比关系;螺旋的含量会加快蛋白质的折叠过程。对two-state蛋白质β折叠的含量会减慢蛋白质的折叠过程;和其他模型相比,我们提出的线性回归模型具有输入参数少,计算简单,平均绝对误差小的优点。
关键词
蛋白质折叠速率
基因序列的预测方法
局部结构信息熵
线性回归
Keywords
protein folding rates
sequence-based prediction
local structural entropy
linear regression
分类号
O236 [理学—运筹学与控制论]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于序列和局部信息熵的蛋白质折叠速率预测模型
高建召
胡刚
王奎
沈世镒
《工程数学学报》
CSCD
北大核心
2010
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
