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基于转录组测序探索口腔扁平苔藓局部激素治疗敏感性相关分子特征
1
作者
任晓萌
李凯一
李春蕾
《北京大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期32-38,共7页
目的:探索影响口腔扁平苔藓(oral lichen planus,OLP)局部糖皮质激素治疗敏感性相关分子。方法:本研究为前瞻性研究,纳入2019年11月至2023年3月就诊于北京大学口腔医院口腔黏膜科28例有症状的OLP患者,采用0.1 g/L(mg/mL)地塞米松局部涂...
目的:探索影响口腔扁平苔藓(oral lichen planus,OLP)局部糖皮质激素治疗敏感性相关分子。方法:本研究为前瞻性研究,纳入2019年11月至2023年3月就诊于北京大学口腔医院口腔黏膜科28例有症状的OLP患者,采用0.1 g/L(mg/mL)地塞米松局部涂擦,每日3次,每次1 min,治疗4周后根据其临床效果(体征记分、疼痛症状记分、口腔健康程度量表)将OLP分为激素有效组和激素无效组。治疗前收集受试者口腔黏膜组织,提取组织总核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)后进行转录组测序。对测序获得的基因表达数据,使用R软件中的DESeq2包进行差异分析,基于超几何分布算法对差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,从而筛选可能影响局部地塞米松治疗敏感性的相关分子。结果:28例OLP患者经过局部地塞米松治疗4周后,13例患者在治疗前后客观体征记分分别为7.0(4.5,9.0)和5.0(3.0,6.3),疼痛症状记分分别为5.0(2.0,5.5)和2.0(0.0,3.5),口腔健康影响程度分别为5.0(3.5,9.0)和1.0(0.0,5.0),均显著降低(P<0.01)(有效组),15例患者治疗后上述指标与治疗前差异无统计学意义(无效组),两组患者的一般情况及治疗前疾病严重程度差异无统计学意义(P>0.05)。两组患者转录组学测序共鉴定出499个DEGs,其中有效组中274个基因上调,225个基因下调。KEGG富集分析显示有效组上调基因显著富集于白细胞穿血管内皮迁移通路(CLDN8、CTNNA3、MYL2、MYLPF),而下调基因显著富集于肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、白介素-17(interleukin-17,IL-17)、核因子κB(nuclear factor kappa B,NF-κB)及皮质醇合成和分泌信号通路。结论:CLDN8、CTNNA3、MYL2、MYLPF高表达的OLP患者对局部糖皮质激素治疗效果较好,而对TNF、IL-17、NF-κB等炎症通路相关基因及皮质醇合成分泌相关基因高表达的患者治疗效果较差。
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关键词
口腔扁平苔藓
转录组分析
局部糖皮质激素治疗
前瞻性研究
敏感性相关分子
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职称材料
题名
基于转录组测序探索口腔扁平苔藓局部激素治疗敏感性相关分子特征
1
作者
任晓萌
李凯一
李春蕾
机构
北京大学口腔医学院·口腔医院口腔黏膜科
出处
《北京大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期32-38,共7页
基金
北京大学口腔医学院青年科研基金(PKUSS2022103)。
文摘
目的:探索影响口腔扁平苔藓(oral lichen planus,OLP)局部糖皮质激素治疗敏感性相关分子。方法:本研究为前瞻性研究,纳入2019年11月至2023年3月就诊于北京大学口腔医院口腔黏膜科28例有症状的OLP患者,采用0.1 g/L(mg/mL)地塞米松局部涂擦,每日3次,每次1 min,治疗4周后根据其临床效果(体征记分、疼痛症状记分、口腔健康程度量表)将OLP分为激素有效组和激素无效组。治疗前收集受试者口腔黏膜组织,提取组织总核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)后进行转录组测序。对测序获得的基因表达数据,使用R软件中的DESeq2包进行差异分析,基于超几何分布算法对差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,从而筛选可能影响局部地塞米松治疗敏感性的相关分子。结果:28例OLP患者经过局部地塞米松治疗4周后,13例患者在治疗前后客观体征记分分别为7.0(4.5,9.0)和5.0(3.0,6.3),疼痛症状记分分别为5.0(2.0,5.5)和2.0(0.0,3.5),口腔健康影响程度分别为5.0(3.5,9.0)和1.0(0.0,5.0),均显著降低(P<0.01)(有效组),15例患者治疗后上述指标与治疗前差异无统计学意义(无效组),两组患者的一般情况及治疗前疾病严重程度差异无统计学意义(P>0.05)。两组患者转录组学测序共鉴定出499个DEGs,其中有效组中274个基因上调,225个基因下调。KEGG富集分析显示有效组上调基因显著富集于白细胞穿血管内皮迁移通路(CLDN8、CTNNA3、MYL2、MYLPF),而下调基因显著富集于肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、白介素-17(interleukin-17,IL-17)、核因子κB(nuclear factor kappa B,NF-κB)及皮质醇合成和分泌信号通路。结论:CLDN8、CTNNA3、MYL2、MYLPF高表达的OLP患者对局部糖皮质激素治疗效果较好,而对TNF、IL-17、NF-κB等炎症通路相关基因及皮质醇合成分泌相关基因高表达的患者治疗效果较差。
关键词
口腔扁平苔藓
转录组分析
局部糖皮质激素治疗
前瞻性研究
敏感性相关分子
Keywords
Oral lichen planus
Transcriptome analysis
Topical glucocorticoid treatment
Prospective study
Sensitivity related molecular
分类号
R781.5 [医药卫生—口腔医学]
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职称材料
题名
作者
出处
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1
基于转录组测序探索口腔扁平苔藓局部激素治疗敏感性相关分子特征
任晓萌
李凯一
李春蕾
《北京大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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