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不同培养方法对乳腺癌MDA-MB-231细胞DNA甲基化状态的影响
被引量：
2
1
作者
乔莎
黄映辉
+2 位作者
王世宝
孙延霞
卢振霞
《吉林大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期271-276,I0004,共7页
目的:探讨不同细胞培养方法对乳腺癌MDA-MB-231细胞全基因组DNA甲基化状态的影响,阐明基因组甲基化状态与细胞生长环境的关系及其在肿瘤发生发展中的作用。方法:采用二维(2D)、三维(3D)细胞培养模型及小鼠肿瘤细胞原位移植(Ti)模型培养M...
目的:探讨不同细胞培养方法对乳腺癌MDA-MB-231细胞全基因组DNA甲基化状态的影响,阐明基因组甲基化状态与细胞生长环境的关系及其在肿瘤发生发展中的作用。方法:采用二维(2D)、三维(3D)细胞培养模型及小鼠肿瘤细胞原位移植(Ti)模型培养MDA-MB-231细胞并收集,分别用DNA提取试剂盒对收集的细胞进行DNA提取,DNA甲基化芯片检测3种模型培养后乳腺癌MDA-MB-231细胞全基因组DNA甲基化状态,应用Genomestudio软件计算每1个基因CpG位点的β值、DiffScore和Delta_Beta,并在2种模型之间比较,筛选出差异甲基化基因;采用DAVID在线分析工具对筛选的基因进行GO和Pathway分析。结果:3D与2D模型培养的MDA-MB-231细胞共发现480个差异甲基化基因(P<0.05),3D与Ti模型有86 448个差异甲基化基因(P<0.05),Ti与2D模型有90 005个差异甲基化基因(P<0.05);3D与2D、3D与Ti和Ti与2D模型的差异甲基化基因在多细胞生物体发育和细胞分化条目上有富集(P<0.05);亦在MAPK信号通路、细胞黏附分子和肌动蛋白骨架调节通路上有富集(P<0.05)。结论:采用2D、3D和Ti模型3种方法培养MDAMB-231细胞其全基因组DNA甲基化状态存在差异。
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关键词
三维细胞培养
肿瘤
DNA甲基化
二维细胞培养
小鼠原位移植模型
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题名
不同培养方法对乳腺癌MDA-MB-231细胞DNA甲基化状态的影响
被引量：
2
1
作者
乔莎
黄映辉
王世宝
孙延霞
卢振霞
机构
吉林大学中日联谊医院肿瘤血液科
北京工业大学生命科学与生物工程学院肿瘤研究所
出处
《吉林大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期271-276,I0004,共7页
基金
吉林省科技厅自然科学基金资助课题(201215069)
文摘
目的:探讨不同细胞培养方法对乳腺癌MDA-MB-231细胞全基因组DNA甲基化状态的影响,阐明基因组甲基化状态与细胞生长环境的关系及其在肿瘤发生发展中的作用。方法:采用二维(2D)、三维(3D)细胞培养模型及小鼠肿瘤细胞原位移植(Ti)模型培养MDA-MB-231细胞并收集,分别用DNA提取试剂盒对收集的细胞进行DNA提取,DNA甲基化芯片检测3种模型培养后乳腺癌MDA-MB-231细胞全基因组DNA甲基化状态,应用Genomestudio软件计算每1个基因CpG位点的β值、DiffScore和Delta_Beta,并在2种模型之间比较,筛选出差异甲基化基因;采用DAVID在线分析工具对筛选的基因进行GO和Pathway分析。结果:3D与2D模型培养的MDA-MB-231细胞共发现480个差异甲基化基因(P<0.05),3D与Ti模型有86 448个差异甲基化基因(P<0.05),Ti与2D模型有90 005个差异甲基化基因(P<0.05);3D与2D、3D与Ti和Ti与2D模型的差异甲基化基因在多细胞生物体发育和细胞分化条目上有富集(P<0.05);亦在MAPK信号通路、细胞黏附分子和肌动蛋白骨架调节通路上有富集(P<0.05)。结论:采用2D、3D和Ti模型3种方法培养MDAMB-231细胞其全基因组DNA甲基化状态存在差异。
关键词
三维细胞培养
肿瘤
DNA甲基化
二维细胞培养
小鼠原位移植模型
Keywords
three-dimensional cell culture~ tumor
DNA methylation
two-dimensional cell culture
mouseorthotopic transplantation model
分类号
R73-35 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
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1
不同培养方法对乳腺癌MDA-MB-231细胞DNA甲基化状态的影响
乔莎
黄映辉
王世宝
孙延霞
卢振霞
《吉林大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
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