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猪源附红细胞体rnpB基因的克隆与序列比较
被引量：
2
1
作者
王向佩
周鹏
+9 位作者
米荣升
沈莉萍
黄燕
王晓娟
杨晓娇
石凯
刘宇轩
雷晓思
陈兆国
赵权
《中国动物传染病学报》
CAS
2014年第3期26-33,共8页
为了解猪源附红细胞体（Mycoplasma spp.）RNA酶P RNA（RNase P RNA,rnpB）基因序列变异状况,将实验室保存的经16S rRNA基因序列分析鉴定的53份猪源附红细胞体阳性DNA样品用于rnpB基因的扩增,扩增产物克隆至pMD18-T载体并进行序列测定...
为了解猪源附红细胞体（Mycoplasma spp.）RNA酶P RNA（RNase P RNA,rnpB）基因序列变异状况,将实验室保存的经16S rRNA基因序列分析鉴定的53份猪源附红细胞体阳性DNA样品用于rnpB基因的扩增,扩增产物克隆至pMD18-T载体并进行序列测定。将获得的序列与GenBank登录的猪附红细胞体（Mycoplasma suis）德国分离株rnpB基因序列（登录号：EF523602）进行分析和比对,利用MEGA5.0软件构建系统发育树,并与16S rRNA判定结果进行比较。结果共得到42条猪附红细胞体rnpB基因和11条小附红细胞体（M.parvum）rnpB基因序列。猪附红细胞体上海分离株rnpB基因与GenBank登录的猪附红细胞体德国分离株rnpB基因之间的核苷酸序列相似性为98.1%～100.0%;小附红细胞体上海分离株rnpB基因与猪附红细胞体德国分离株rnpB基因序列的相似性为91.0%,与猪附红细胞体上海分离株rnpB基因序列相似性为90.0%～91.0%。系统进化分析显示猪附红细胞体rnpB基因与小附红细胞体rnpB基因分布在不同聚簇上,与16S rRNA基因序列鉴定结果一致。
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关键词
猪
附
红
细胞体
小附红细胞体
rnpB
克隆
序列比较
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职称材料
新种猪源嗜血支原体gapA基因的克隆及分子进化分析
被引量：
4
2
作者
付媛
石团员
+6 位作者
陈建祥
徐丽华
袁秀芳
苏菲
李军星
杨富文
方维焕
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第8期675-677,681,共4页
本实验室前期的流行病学调查中发现浙江省存在新种猪源嗜血支原体(CMh)的流行。为进一步确认该新种CMh,本研究设计兼并引物获得CMh gapA基因部分片段,通过Genome walking的方法获得了全基因cmh-gapA,大小为1 008 bp。基因序列比对分析表...
本实验室前期的流行病学调查中发现浙江省存在新种猪源嗜血支原体(CMh)的流行。为进一步确认该新种CMh,本研究设计兼并引物获得CMh gapA基因部分片段,通过Genome walking的方法获得了全基因cmh-gapA,大小为1 008 bp。基因序列比对分析表明cmh-gapA与犬M.haemocanis的gapA基因亲缘关系最近,同源性为74.6%。核苷酸序列的系统发育分析表明CMh与犬、猫的嗜血支原体位于同一分支,与M.suis和M.parvum亲缘关系较远。本研究为CMh作为新种猪源嗜血支原体提供佐证,并为猪源嗜血支原体GADPH蛋白功能研究和血清学诊断方法的建立奠定基础。
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关键词
猪
附
红
细胞体
小附红细胞体
待定种嗜血支原体
嗜血支原体
甘油醛脱氢酶
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职称材料
题名
猪源附红细胞体rnpB基因的克隆与序列比较
被引量：
2
1
作者
王向佩
周鹏
米荣升
沈莉萍
黄燕
王晓娟
杨晓娇
石凯
刘宇轩
雷晓思
陈兆国
赵权
机构
吉林农业大学动物科学技术学院
中国农业科学院上海兽医研究所农业部动物寄生虫学重点开放实验室中国农业科学院动物源性食品安全研究中心
上海市动物疫病预防控制中心
出处
《中国动物传染病学报》
CAS
2014年第3期26-33,共8页
基金
公益性行业(农业)科研专项项目(200903036)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2014JB04)
文摘
为了解猪源附红细胞体（Mycoplasma spp.）RNA酶P RNA（RNase P RNA,rnpB）基因序列变异状况,将实验室保存的经16S rRNA基因序列分析鉴定的53份猪源附红细胞体阳性DNA样品用于rnpB基因的扩增,扩增产物克隆至pMD18-T载体并进行序列测定。将获得的序列与GenBank登录的猪附红细胞体（Mycoplasma suis）德国分离株rnpB基因序列（登录号：EF523602）进行分析和比对,利用MEGA5.0软件构建系统发育树,并与16S rRNA判定结果进行比较。结果共得到42条猪附红细胞体rnpB基因和11条小附红细胞体（M.parvum）rnpB基因序列。猪附红细胞体上海分离株rnpB基因与GenBank登录的猪附红细胞体德国分离株rnpB基因之间的核苷酸序列相似性为98.1%～100.0%;小附红细胞体上海分离株rnpB基因与猪附红细胞体德国分离株rnpB基因序列的相似性为91.0%,与猪附红细胞体上海分离株rnpB基因序列相似性为90.0%～91.0%。系统进化分析显示猪附红细胞体rnpB基因与小附红细胞体rnpB基因分布在不同聚簇上,与16S rRNA基因序列鉴定结果一致。
关键词
猪
附
红
细胞体
小附红细胞体
rnpB
克隆
序列比较
Keywords
Mycoplasma suis
M.parvum
rnpB gene
cloning
sequence alignment
分类号
S852.64 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
新种猪源嗜血支原体gapA基因的克隆及分子进化分析
被引量：
4
2
作者
付媛
石团员
陈建祥
徐丽华
袁秀芳
苏菲
李军星
杨富文
方维焕
机构
浙江大学动物科学学院
浙江省农业科学院畜牧兽医研究所
绍兴市上虞区畜牧兽医技术推广中心
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第8期675-677,681,共4页
基金
浙江省重点科技创新团队(2010R50027-26)
浙江省公益性项目(2017C32018)
文摘
本实验室前期的流行病学调查中发现浙江省存在新种猪源嗜血支原体(CMh)的流行。为进一步确认该新种CMh,本研究设计兼并引物获得CMh gapA基因部分片段,通过Genome walking的方法获得了全基因cmh-gapA,大小为1 008 bp。基因序列比对分析表明cmh-gapA与犬M.haemocanis的gapA基因亲缘关系最近,同源性为74.6%。核苷酸序列的系统发育分析表明CMh与犬、猫的嗜血支原体位于同一分支,与M.suis和M.parvum亲缘关系较远。本研究为CMh作为新种猪源嗜血支原体提供佐证,并为猪源嗜血支原体GADPH蛋白功能研究和血清学诊断方法的建立奠定基础。
关键词
猪
附
红
细胞体
小附红细胞体
待定种嗜血支原体
嗜血支原体
甘油醛脱氢酶
Keywords
Mycoplasma suis
Mycoplasma parvum
candidate Mycoplasma haemosuis
Haemoplasma
Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase
分类号
S852.62 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪源附红细胞体rnpB基因的克隆与序列比较
王向佩
周鹏
米荣升
沈莉萍
黄燕
王晓娟
杨晓娇
石凯
刘宇轩
雷晓思
陈兆国
赵权
《中国动物传染病学报》
CAS
2014
2
在线阅读
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职称材料
2
新种猪源嗜血支原体gapA基因的克隆及分子进化分析
付媛
石团员
陈建祥
徐丽华
袁秀芳
苏菲
李军星
杨富文
方维焕
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
4
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