小亚单位核糖体RNA编码区序列在微孢子虫分类上的应用

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作者 Norma.J.Pieniazck 刘吉平 《广东蚕业》 1997年第4期65-66,共2页

近期,微孢子虫分类法正随着分子分类学的应用,主要是核糖体RNA组序列的应用而发展。现行的分类方法没有任何一种能象核糖体RNA的亲缘关系分析方法一样准确而又具有进化论观点。家蚕微孢子虫属Nosema

关键词 微孢子虫亚门 微孢子虫种(Microsporidia) 微孢子虫属(Nosema) 桑蚕微孢子虫(N.bombycis) 粉纹夜蛾微孢子虫(N.trichopluseae) Nosematiclae PCR 小亚单位核糖体rna(SSUrrna) 分类学

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九种微孢子虫核糖体小亚单位RNA(SSUrRNA)基因拷贝数的研究 被引量：1

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作者 王见杨 黄可威 +1 位作者 赵昀 陆长德 《蚕业科学》 CAS CSCD 2001年第3期200-205,共6页

以已克隆测序的家蚕微孢子虫 (镇江株 ,Nosemabombycis)的核糖体小亚单位RNA(SSUrRNA)编码基因(12 0 5bp)为模板 ,用随机引物合成法标记的探针 ,在与 9种微孢子虫及家蚕基因组DNA的 6种限制性内切酶的酶切产物的Southern杂交图谱中 ,9... 以已克隆测序的家蚕微孢子虫 (镇江株 ,Nosemabombycis)的核糖体小亚单位RNA(SSUrRNA)编码基因(12 0 5bp)为模板 ,用随机引物合成法标记的探针 ,在与 9种微孢子虫及家蚕基因组DNA的 6种限制性内切酶的酶切产物的Southern杂交图谱中 ,9种微孢子虫基因组DNA酶切产物的杂交图谱极为相似 ,而与家蚕基因组DNA的任何一种酶的酶切产物均无杂交信号 ,表明微孢子虫和家蚕的SSUrRNA基因同源性很低或没有同源性。同时还证实了已克隆的SSUrRNA基因来源于微孢子虫基因组DNA ,不是从家蚕基因组DNA扩增而来。在酶解较为完全的酶切产物的杂交图谱中 ,微孢子虫基因组DNA中SSUrRNA基因的拷贝数至少在 展开更多

关键词 微孢子虫 SSUrrna基因 拷贝数 核糖体小亚单位rna 基因克隆 家蚕

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胖尾刺虫(纤毛门,旋毛纲,下毛目)16s小亚基单位核糖体RNA基因的序列测定及其系统地位初探 被引量：1

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作者 陈子桂 商慧敏 宋微波 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2002年第2期98-102,共5页

对分离自青岛沿岸的下毛目纤毛虫 胖尾刺虫 (Uronychiatransfuga)的 16s小亚基单位核糖体RNA(16s likeSmallSubunitrRNA)基因进行了序列测定 ,通过与目内其它相近属多种纤毛虫的比较分析 ,认为游仆虫属 (Euplotes)首先从下毛目中分离出... 对分离自青岛沿岸的下毛目纤毛虫 胖尾刺虫 (Uronychiatransfuga)的 16s小亚基单位核糖体RNA(16s likeSmallSubunitrRNA)基因进行了序列测定 ,通过与目内其它相近属多种纤毛虫的比较分析 ,认为游仆虫属 (Euplotes)首先从下毛目中分离出来 ,其次是属刺虫属和双眉虫属 (Diophrys) ,其间邻近的遗传距离共同构成了下毛目内最为进化的类群 游仆亚目 (Euplotina)。同时 ,序列分析也支持该目其它三个亚目的划分 :散毛亚目 (Sporadortrichina) ,排毛亚目 (Stichotrichina)和尾柱亚目 (Urostylina)。这与形态学资料是吻合的。 展开更多

关键词 纤毛门 旋毛纲 下毛目 rna基因 纤毛虫 胖尾刺虫 16s小亚基单位核糖体 序列测定

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家蚕微粒子病原虫(Nosema bombycis)小亚基核糖体RNA全基因的克隆及其二级结构的构建 被引量：15

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作者 王见杨 黄可威 陆长德 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期290-295,共6页

在用PCR技术扩增、克隆、测序了家蚕微粒子病原虫Nosemabombycis (镇江株 )小亚基核糖体RNA基因核心序列(5′ 端起 12 0 0bp)的基础上 ,用SSP PCR技术克隆了核心序列 3′ 端下游序列 ,从而获得了家蚕微粒子病原虫小亚基核糖体RNA基因的... 在用PCR技术扩增、克隆、测序了家蚕微粒子病原虫Nosemabombycis (镇江株 )小亚基核糖体RNA基因核心序列(5′ 端起 12 0 0bp)的基础上 ,用SSP PCR技术克隆了核心序列 3′ 端下游序列 ,从而获得了家蚕微粒子病原虫小亚基核糖体RNA基因的全序列共 12 33bp。用RnaViz、Forcon、DCSE等生物软件构建了家蚕微粒子病原虫小亚基核糖体RNA的二级结构 ,与其它微孢子虫及真核生物小亚基核糖体RNA的二级结构相比 ,该二级结构缺乏螺旋 10、E10 1、 11、 18、E2 3 n和43。 展开更多

关键词 家蚕微粒子病原虫 SSP-PCR 小亚基核糖体rna SSUrrna 全基因 二级结构 螺旋

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shRNA对EC9706细胞p70S6K表达的影响

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作者 郭三星 侯桂琴 +3 位作者 李杰 张艳 贝维娟 薛乐勋 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2011年第1期7-9,共3页

目的:观察核糖体40s小亚基S6蛋白激酶(p70S6K)特异性短发夹RNA(shRNA)对EC9706细胞p70S6K表达的影响。方法:根据GenBank p70S6K的mRNA序列,设计并合成p70S6K特异性的shRNA序列,退火形成双链后插入pSIREN-RetroQ-DsRed-Express载体,构建... 目的:观察核糖体40s小亚基S6蛋白激酶(p70S6K)特异性短发夹RNA(shRNA)对EC9706细胞p70S6K表达的影响。方法:根据GenBank p70S6K的mRNA序列,设计并合成p70S6K特异性的shRNA序列,退火形成双链后插入pSIREN-RetroQ-DsRed-Express载体,构建表达载体pshRNA-p70S6K,转染EC9706细胞。采用RT-PCR和Western blot方法分别检测转染24、48、72、96及120h后细胞中p70S6K mRNA和磷酸化p70S6K的表达,设未转染的EC9706细胞为对照。结果:各组细胞p70S6K mRNA和磷酸化p70S6K蛋白的表达差异有统计学意义(F=106.343,721.632,P均<0.001)。转染细胞p70S6K mRNA的表达在转染24、48和72h后均较对照组下降(P<0.05),在第48h表达最低;磷酸化p70S6K蛋白的表达在转染24、48、72和96h后均较对照组下降(P<0.05),第48h表达最低。结论:p70S6K特异性shRNA能够下调EC9706细胞中p70S6K mRNA和蛋白的表达。 展开更多

关键词 食管肿瘤 EC9706 哺乳动物雷帕霉素靶蛋白 核糖体40s小亚基S6蛋白激酶 短发夹rna

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实时荧光定量PCR检测柞蚕微孢子虫的方法 被引量：5

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作者 米锐 冀万杰 +9 位作者 赵振军 王旭达 李佩佩 李青峰 孙永欣 王鹤 王凤成 李亚洁 朱有敏 范琦 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期260-267,共8页

提高柞蚕微孢子虫检测技术的准确性和灵敏度,对控制柞蚕微孢子虫的胚种传染至关重要。以柞蚕微孢子虫小亚单位核糖体RNA(SSU rRNA)基因为靶基因,建立柞蚕微孢子虫的实时荧光定量PCR检测方法。结果显示:该方法能够特异性检测柞蚕微孢子... 提高柞蚕微孢子虫检测技术的准确性和灵敏度,对控制柞蚕微孢子虫的胚种传染至关重要。以柞蚕微孢子虫小亚单位核糖体RNA(SSU rRNA)基因为靶基因,建立柞蚕微孢子虫的实时荧光定量PCR检测方法。结果显示:该方法能够特异性检测柞蚕微孢子虫基因组DNA,而对柞蚕基因组DNA无扩增产物。依据标准曲线确定荧光定量PCR的Ct值≤35作为检测的敏感度区间,对柞蚕微孢子虫基因组DNA的最低检出限为0.004 6 ng。应用该方法对100粒柞蚕蛹样本进行检测,共检出54个样本呈柞蚕微孢子虫感染阳性,而采用普通显微镜镜检与采用常规PCR方法检测呈阳性的样本数量分别为2个和34个。应用该方法对生产中的柞蚕种茧和雌蛾进行抽样检测,柞蚕微孢子虫感染阳性检出率显著高于用普通显微镜镜检的阳性检出率(P<0.05)。建立的柞蚕微孢子虫实时荧光定量PCR检测方法提高了检测的灵敏度。 展开更多

关键词 柞蚕微孢子虫 SYBR Green荧光定量PCR 小亚单位核糖体rna

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玉溪霍尔多巴吉鹅感染贝氏隐孢子虫的分子鉴定

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作者 陈俊蓉 谢昕言 +2 位作者 贺君君 杨建发 王萍 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2024年第3期54-57,共4页

为了对云南省玉溪市某养殖场的霍尔多巴吉鹅进行隐孢子虫检测,本试验采集疑似感染隐孢子虫的霍尔多巴吉鹅的粪便样品,利用饱和盐水漂浮法进行镜检,并结合分子生物学鉴定方法,提取粪便样品DNA,采用巢氏PCR扩增隐孢子虫核糖体小亚基RNA(SS... 为了对云南省玉溪市某养殖场的霍尔多巴吉鹅进行隐孢子虫检测,本试验采集疑似感染隐孢子虫的霍尔多巴吉鹅的粪便样品,利用饱和盐水漂浮法进行镜检,并结合分子生物学鉴定方法,提取粪便样品DNA,采用巢氏PCR扩增隐孢子虫核糖体小亚基RNA(SSU rRNA)基因,测序后通过NCBI进行Blast在线比对,构建系统发育进化树。结果显示,所采集的鹅粪便样品中,隐孢子虫检出率为20.45%(9/44);隐孢子虫SSU rRNA基因的PCR扩增结果显示,该鹅源隐孢子虫与贝氏隐孢子虫同源性达100%;系统进化分析显示,二者位于同一分支。结果表明,该养殖场的霍尔多巴吉鹅存在贝氏隐孢子虫感染。 展开更多

关键词 核糖体小亚基rna(SSU rrna) 贝氏隐孢子虫 霍尔多巴吉鹅 分子鉴定

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间日疟原虫荧光定量聚合酶链反应检测方法的建立 被引量：1

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作者 江晓玲 李明 +2 位作者 徐伟文 毕惠祥 程钢 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2002年第3期80-82,共3页

目的　建立间日疟原虫荧光定量聚合酶链式反应 (FQ -PCR)检测方法 ,为快速、准确定量检测间日疟原虫奠定基础。方法　根据间日疟原虫SSURNA基因序列 ,设计并合成引物和荧光标记探针 ,将PCR扩增的间日疟原虫SSURNA基因片段克隆入载体 ,... 目的　建立间日疟原虫荧光定量聚合酶链式反应 (FQ -PCR)检测方法 ,为快速、准确定量检测间日疟原虫奠定基础。方法　根据间日疟原虫SSURNA基因序列 ,设计并合成引物和荧光标记探针 ,将PCR扩增的间日疟原虫SSURNA基因片段克隆入载体 ,对重组质粒进行筛选、鉴定后 ,作为阳性模板 ,用于标准曲线的判定和样品检测。结果　应用重组质粒制作的定量曲线 ,循环阈值与模板浓度具有良好的线形关系 ,12 7份疟区血样和 30份正常血样的检测 ,显示此法有较高的灵敏度和特异度 ,定量检测结果与镜检感染率呈直线相关 ,相关系数为 0 95 9。 展开更多

关键词 荧光定量 PCR 间日疟原虫 小亚单位核糖体核糖核酸 聚合酶链反应 疟疾

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陕南白山羊感染泰勒虫的种类鉴定及其遗传进化分析 被引量：8

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作者 于正青 宋军科 +3 位作者 张会军 刘婷丽 范现成 赵光辉 《动物医学进展》 北大核心 2018年第8期1-5,共5页

为了解陕南地区白山羊泰勒虫的感染情况,采用形态学和分子生物学相结合的方法对121份来自陕西省陕南地区白山羊的血液样品进行检测。血液涂片染色后形态学检测结果表明,112份血液涂片的红细胞中存在大小约1μm,呈圆点形、卵圆形或短杆... 为了解陕南地区白山羊泰勒虫的感染情况,采用形态学和分子生物学相结合的方法对121份来自陕西省陕南地区白山羊的血液样品进行检测。血液涂片染色后形态学检测结果表明,112份血液涂片的红细胞中存在大小约1μm,呈圆点形、卵圆形或短杆状多形性虫体。基于泰勒虫SSU rRNA基因位点对提取的血液样品DNA进行套式PCR扩增。结果表明,陕南地区白山羊的血液样品中泰勒虫阳性率为92.6%(112/121),且该结果与形态学检测结果相一致。通过比对发现,所获得的泰勒虫分离株与获取自GenBank中的吕氏泰勒虫相应基因序列序列同源性在99%以上。进一步构建遗传进化树发现,获得的泰勒虫分离株与吕氏泰勒虫(登录号:JN676988、AF081136)归于同一支,提示陕南地区白山羊感染的泰勒虫种为吕氏泰勒虫。 展开更多

关键词 陕南白山羊 泰勒虫 核糖体小亚基rna 种类

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芽囊原虫LAMP检测方法的建立及其在牦牛中的应用 被引量：2

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作者 王品雪 李云香 +3 位作者 姚倩 任玫 王丹 林青 《动物医学进展》 北大核心 2019年第10期18-23,共6页

环介导等温扩增技术(LAMP)作为一种新的分子检测技术,具有广阔的应用前景,为了将该技术应用于牦牛粪便样品中芽囊原虫的检测,提高芽囊原虫的筛查效率,利用芽囊原虫SSU rRNA基因设计引物,建立与优化芽囊原虫的LAMP检测方法,同时对已建立... 环介导等温扩增技术(LAMP)作为一种新的分子检测技术,具有广阔的应用前景,为了将该技术应用于牦牛粪便样品中芽囊原虫的检测,提高芽囊原虫的筛查效率,利用芽囊原虫SSU rRNA基因设计引物,建立与优化芽囊原虫的LAMP检测方法,同时对已建立的芽囊原虫LAMP检测方法进行特异性、灵敏度及重复性的试验,用102份牦牛粪便样品进行临床验证。结果表明,该方法在进行芽囊原虫检测时具有较高的特异性,优于PCR的敏感性、重复性与临床应用性。 展开更多

关键词 牦牛 芽囊原虫 环介导等温扩增技术 小亚基核糖体rna

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云南绵羊感染吕氏泰勒虫的鉴定及其遗传进化分析 被引量：2

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作者 王天葆 杨红远 +1 位作者 信爱国 高华峰 《上海畜牧兽医通讯》 2020年第3期13-16,共4页

为了解云南高海拔地区绵羊泰勒虫的分型,从临床上出现焦虫可疑临床症状的绵羊养殖场采集病料,通过形态学和分子生物学相结合的方法对16份来自高海拔地区昭通永善县的绵羊血液样品进行检测。血液涂片染色后形态学检测结果表明,其中4份血... 为了解云南高海拔地区绵羊泰勒虫的分型,从临床上出现焦虫可疑临床症状的绵羊养殖场采集病料,通过形态学和分子生物学相结合的方法对16份来自高海拔地区昭通永善县的绵羊血液样品进行检测。血液涂片染色后形态学检测结果表明,其中4份血液涂片的红细胞内虫体直径约0.5~1.5μm,呈圆点形、卵圆形或短杆状。血液样品DNA PCR扩增、焦虫18S序列比对及基于核糖体小亚基RNA(small subunit ribosamal RNA,SSU rRNA)基因位点分析结果表明,本次可疑送检绵羊的血液病原为吕氏泰勒虫,检测株与国内报道的感染株同源性为99.6%~100%,属同一亚型,未出现变异虫株。 展开更多

关键词 吕氏泰勒虫 鉴定 核糖体小亚基rna 遗传进化分析

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广西部分地区猪芽囊原虫的分子流行病学调查和亚型鉴定

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作者 褚梦洁 宋雅菲 +4 位作者 卢惠红 刘洋 黄飞 王树艳 周东辉 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期645-649,共5页

目的了解广西部分地区猪芽囊原虫的感染情况和人兽共患特征,以评估人兽共患传播风险。方法本研究采用芽囊原虫小亚基核糖体RNA(SSU rRNA)基因常规PCR检测技术对广西贺州、玉林、南宁、贵港、柳州5个地市猪场采集的894份猪粪便样品进行... 目的了解广西部分地区猪芽囊原虫的感染情况和人兽共患特征,以评估人兽共患传播风险。方法本研究采用芽囊原虫小亚基核糖体RNA(SSU rRNA)基因常规PCR检测技术对广西贺州、玉林、南宁、贵港、柳州5个地市猪场采集的894份猪粪便样品进行芽囊原虫流行病学调查。结果芽囊原虫总感染率为21.9%(196/894)。在本次调查的地区中,贵港市的感染率最高为37.3%(66/177)、其余依次为玉林市24.1%(35/145)、南宁市20.6%(44/214)、贺州市19.7%(37/188)、柳州市8.2%(14/170)。此外,在不同群体猪中芽囊原虫感染率由高到低依次为仔猪39.5%(96/243)、育肥猪23.1%(52/225)、种猪14.1%(29/205)、保育猪8.6%(19/221)。集约化感染率20.9%(121/580),散户猪群感染率23.9%(75/314)。统计学分析表明,芽囊原虫在不同地区,不同群体猪中感染率差异有统计学意义,在不同养殖方式中感染率差异无统计学意义。在所有阳性样品中共发现ST1、ST5两种人兽共患亚型分别占总阳性率的4.6%(9/196)和95.4%(187/196),表明广西地区猪芽囊原虫存在潜在的人兽共患风险。结论本研究首次对广西5地市猪场芽囊原虫感染情况进行了调查,初步评估了广西地区猪芽囊原虫存在的人兽共患风险,为公共卫生学、猪场生物安全防控提供相关的流行病学参考。 展开更多

关键词 芽囊原虫 猪 小亚基核糖体rna ST1 ST5

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