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黄瓜果实CsMYB62克隆及其对CsGR-RBP3表达的调控
被引量：
8
1
作者
王斌
武春爽
+4 位作者
汤冰琳
王光
何金明
曲姗姗
朱世江
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期907-917,共11页
本研究前期证实,低温诱导的CsGR-RBP3表达与黄瓜果实耐冷性密切相关,但调控其表达的具体机理尚不清楚。为鉴定调控CsGR-RBP3表达的MYB转录因子,本研究采用转录组测序,分析了黄瓜果实在5℃低温处理后的转录组变化,并通过共表达趋势分析,...
本研究前期证实,低温诱导的CsGR-RBP3表达与黄瓜果实耐冷性密切相关,但调控其表达的具体机理尚不清楚。为鉴定调控CsGR-RBP3表达的MYB转录因子,本研究采用转录组测序,分析了黄瓜果实在5℃低温处理后的转录组变化,并通过共表达趋势分析,鉴定了与CsGR-RBP3表达趋势一致的MYB基因。结果发现,CsMYB62与CsGR-RBP3表达的相关性很高,且低温处理能诱导黄瓜果实CsMYB62和CsGR-RBP3表达,推测CsMYB62转录因子可能调控CsGR-RBP3表达。为进一步分析CsMYB62基因的功能,从黄瓜果皮中克隆了CsMYB62基因全长序列。结果显示,CsMYB62基因全长834 bp,编码277个氨基酸残基。CsMYB62蛋白含有SANT保守域和MYB DNA结合域,定位在细胞核,在进化过程中高度保守。CsMYB62蛋白具有转录激活活性,能直接绑定到CsGR-RBP3启动子,增强CsGR-RBP3启动子活性,表明CsMYB62通过直接调控CsGR-RBP3表达而增强黄瓜果实耐冷性。本研究结果丰富了MYB调控网络,为进一步解析CsMYB62功能奠定了理论基础。
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关键词
采后黄瓜
耐冷性
MYB转录因子
富
甘
氨
酸
rna
结合
蛋白
转录调控
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职称材料
黄瓜GR-RBP3启动子克隆及低温对其活性的诱导
被引量：
11
2
作者
王斌
黄泳谚
+1 位作者
易景怡
原远
《山东农业科学》
北大核心
2022年第7期15-23,共9页
低温诱导的富甘氨酸RNA结合蛋白GR-RBP3表达与采后黄瓜(Cucumis sativus)耐冷性密切相关。低温处理明显上调采后黄瓜的CsGR-RBP3表达,表明该基因是一个低温诱导型基因。为探究低温处理对CsGR-RBP3表达和启动子活性的诱导作用,本研究以...
低温诱导的富甘氨酸RNA结合蛋白GR-RBP3表达与采后黄瓜(Cucumis sativus)耐冷性密切相关。低温处理明显上调采后黄瓜的CsGR-RBP3表达,表明该基因是一个低温诱导型基因。为探究低温处理对CsGR-RBP3表达和启动子活性的诱导作用,本研究以黄瓜基因组DNA为模板,克隆了CsGR-RBP3开放阅读框上游1541 bp的启动子序列。生物信息学分析发现,克隆的启动子序列中含有真核生物典型的核心启动子元件TATA-box和CAAT-box,表明成功克隆了CsGR-RBP3启动子;含有低温响应元件LTR,推测低温可能通过影响CsGR-RBP3启动子活性激活CsGR-RBP3表达。启动子活性分析表明,CsGR-RBP3启动子能增强LUC活性,且能驱动GUS基因表达,表明该启动子具有启动基因转录的活性。在烟草和拟南芥中的转基因试验结果显示,低温处理明显提高了GUS活性和编码基因的表达,表明低温处理能增强CsGR-RBP3启动子活性。综之,低温通过诱导启动子活性进一步增强CsGR-RBP3的转录。
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关键词
采后黄瓜
富
甘
氨
酸
rna
结合
蛋白
(
gr-rbp
3)
低温
转录调控
启动子活性
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职称材料
烟草属RGP-3基因克隆及多样性分析
被引量：
1
3
作者
陈璇
曾千春
+2 位作者
张家瑞
胡尊红
李文正
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2014年第3期960-965,共6页
前期研究表明普通烟草(N.tabacum cv.Xanthi)中富含甘氨酸RNA结合蛋白基因(NtRGP-3),该基因为涉及渗透胁迫相关的一个重要转录后调节基因,本研究旨在明确烟草属不同种中RGP-3基因多样性。通过PCR同源克隆方法克隆了12个烟草种中RGP-3基...
前期研究表明普通烟草(N.tabacum cv.Xanthi)中富含甘氨酸RNA结合蛋白基因(NtRGP-3),该基因为涉及渗透胁迫相关的一个重要转录后调节基因,本研究旨在明确烟草属不同种中RGP-3基因多样性。通过PCR同源克隆方法克隆了12个烟草种中RGP-3基因,对RGP-3基因及其编码蛋白的结构、变异和系统进化等方面进行了分析。结果显示,RGP-3在烟草属不同种中相似性介于89%~100%,其中栽培烟草种(N.tabacum_K326)和野生林烟草(N.sylvestris)相似性为100%;多序列比较显示,RGP-3在不同烟草种中存在484个变异位点,其中外显子中变异占8.88%,内含子中变异占79.55%,3'UTR中变异占11.57%,推导的氨基酸仅有14个变异位点,且RNA识别结构域(RRM)高度保守;系统进化分析显示,普通烟亚属(Tabacum)和碧冬烟亚属(Petunioides)中RGP-3遗传距离较近,而和黄花烟亚属(Rustica)较远,与植物分类学上烟草亲缘关系结论一致。研究结果表明烟草属中RGP-3基因变异丰富,而编码的蛋白较保守,且RGP-3基因能够较好地用于烟草系统进化分析,这些结果为进一步研究烟草属中RGP-3的生理功能奠定了基础。
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关键词
烟草
富
含
甘
氨
酸
rna
结合
蛋白
RGP-
3
克隆
基因多样性
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职称材料
题名
黄瓜果实CsMYB62克隆及其对CsGR-RBP3表达的调控
被引量：
8
1
作者
王斌
武春爽
汤冰琳
王光
何金明
曲姗姗
朱世江
机构
韶关学院英东生物与农业学院
华南农业大学园艺学院
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期907-917,共11页
基金
广东省基础与应用基础研究基金(2020A1515010068)
广东省教育厅青年创新人才项目(2018KQNCX231)
韶关学院博士科研启动项目(99000602)。
文摘
本研究前期证实,低温诱导的CsGR-RBP3表达与黄瓜果实耐冷性密切相关,但调控其表达的具体机理尚不清楚。为鉴定调控CsGR-RBP3表达的MYB转录因子,本研究采用转录组测序,分析了黄瓜果实在5℃低温处理后的转录组变化,并通过共表达趋势分析,鉴定了与CsGR-RBP3表达趋势一致的MYB基因。结果发现,CsMYB62与CsGR-RBP3表达的相关性很高,且低温处理能诱导黄瓜果实CsMYB62和CsGR-RBP3表达,推测CsMYB62转录因子可能调控CsGR-RBP3表达。为进一步分析CsMYB62基因的功能,从黄瓜果皮中克隆了CsMYB62基因全长序列。结果显示,CsMYB62基因全长834 bp,编码277个氨基酸残基。CsMYB62蛋白含有SANT保守域和MYB DNA结合域,定位在细胞核,在进化过程中高度保守。CsMYB62蛋白具有转录激活活性,能直接绑定到CsGR-RBP3启动子,增强CsGR-RBP3启动子活性,表明CsMYB62通过直接调控CsGR-RBP3表达而增强黄瓜果实耐冷性。本研究结果丰富了MYB调控网络,为进一步解析CsMYB62功能奠定了理论基础。
关键词
采后黄瓜
耐冷性
MYB转录因子
富
甘
氨
酸
rna
结合
蛋白
转录调控
Keywords
harvested cucumber
chilling tolerance
MYB transcription factor
glycine-rich
rna
-binding protein
transcriptional regulation
分类号
S642.2 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
黄瓜GR-RBP3启动子克隆及低温对其活性的诱导
被引量：
11
2
作者
王斌
黄泳谚
易景怡
原远
机构
广东省粤北食药资源利用与保护重点实验室
韶关学院英东生物与农业学院
出处
《山东农业科学》
北大核心
2022年第7期15-23,共9页
基金
广东省基础与应用基础研究基金资助项目(2020A1515010068,2022A1515011913)
广东省教育厅青年创新人才项目(2018KQNCX231)。
文摘
低温诱导的富甘氨酸RNA结合蛋白GR-RBP3表达与采后黄瓜(Cucumis sativus)耐冷性密切相关。低温处理明显上调采后黄瓜的CsGR-RBP3表达,表明该基因是一个低温诱导型基因。为探究低温处理对CsGR-RBP3表达和启动子活性的诱导作用,本研究以黄瓜基因组DNA为模板,克隆了CsGR-RBP3开放阅读框上游1541 bp的启动子序列。生物信息学分析发现,克隆的启动子序列中含有真核生物典型的核心启动子元件TATA-box和CAAT-box,表明成功克隆了CsGR-RBP3启动子;含有低温响应元件LTR,推测低温可能通过影响CsGR-RBP3启动子活性激活CsGR-RBP3表达。启动子活性分析表明,CsGR-RBP3启动子能增强LUC活性,且能驱动GUS基因表达,表明该启动子具有启动基因转录的活性。在烟草和拟南芥中的转基因试验结果显示,低温处理明显提高了GUS活性和编码基因的表达,表明低温处理能增强CsGR-RBP3启动子活性。综之,低温通过诱导启动子活性进一步增强CsGR-RBP3的转录。
关键词
采后黄瓜
富
甘
氨
酸
rna
结合
蛋白
(
gr-rbp
3)
低温
转录调控
启动子活性
Keywords
Harvested cucumber
Glycine-rich
rna
-binding protein(
gr-rbp
3
)
Low temperature
Transcriptional regulation
Promoter activity
分类号
S642.2:Q785 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
烟草属RGP-3基因克隆及多样性分析
被引量：
1
3
作者
陈璇
曾千春
张家瑞
胡尊红
李文正
机构
云南省农业科学院经济作物研究所
云南省烟草农业科学研究院
云南农业大学农学与生物技术学院
红云红河烟草(集团)有限责任公司
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2014年第3期960-965,共6页
基金
国家自然科学基金项目(30560062)
云南省烟草专卖局科技开发计划(2013YN06)
文摘
前期研究表明普通烟草(N.tabacum cv.Xanthi)中富含甘氨酸RNA结合蛋白基因(NtRGP-3),该基因为涉及渗透胁迫相关的一个重要转录后调节基因,本研究旨在明确烟草属不同种中RGP-3基因多样性。通过PCR同源克隆方法克隆了12个烟草种中RGP-3基因,对RGP-3基因及其编码蛋白的结构、变异和系统进化等方面进行了分析。结果显示,RGP-3在烟草属不同种中相似性介于89%~100%,其中栽培烟草种(N.tabacum_K326)和野生林烟草(N.sylvestris)相似性为100%;多序列比较显示,RGP-3在不同烟草种中存在484个变异位点,其中外显子中变异占8.88%,内含子中变异占79.55%,3'UTR中变异占11.57%,推导的氨基酸仅有14个变异位点,且RNA识别结构域(RRM)高度保守;系统进化分析显示,普通烟亚属(Tabacum)和碧冬烟亚属(Petunioides)中RGP-3遗传距离较近,而和黄花烟亚属(Rustica)较远,与植物分类学上烟草亲缘关系结论一致。研究结果表明烟草属中RGP-3基因变异丰富,而编码的蛋白较保守,且RGP-3基因能够较好地用于烟草系统进化分析,这些结果为进一步研究烟草属中RGP-3的生理功能奠定了基础。
关键词
烟草
富
含
甘
氨
酸
rna
结合
蛋白
RGP-
3
克隆
基因多样性
Keywords
Tobacco
Glycine-rich
rna
-binding protein
RGP-
3
Clone
Gene diversity
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
黄瓜果实CsMYB62克隆及其对CsGR-RBP3表达的调控
王斌
武春爽
汤冰琳
王光
何金明
曲姗姗
朱世江
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
黄瓜GR-RBP3启动子克隆及低温对其活性的诱导
王斌
黄泳谚
易景怡
原远
《山东农业科学》
北大核心
2022
11
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
烟草属RGP-3基因克隆及多样性分析
陈璇
曾千春
张家瑞
胡尊红
李文正
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2014
1
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职称材料
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