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一种基于熔解曲线的实时荧光定量PCR仪校准方法 被引量:7
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作者 崔宏恩 张超 姚绍卫 《中国测试》 CAS 北大核心 2018年第A01期22-28,共7页
针对实时荧光定量PCR仪光学校准方法的不完善,通过对实时荧光定量PCR仪校准必要性、基本结构和数学原理的分析,基于熔解曲线从C_t值均匀度、C_t值精密度、通道峰值高度一致性、线性灵敏系数、熔解温度漂移和熔解温度比等方面对实时荧光... 针对实时荧光定量PCR仪光学校准方法的不完善,通过对实时荧光定量PCR仪校准必要性、基本结构和数学原理的分析,基于熔解曲线从C_t值均匀度、C_t值精密度、通道峰值高度一致性、线性灵敏系数、熔解温度漂移和熔解温度比等方面对实时荧光定量PCR仪校准方法进行分析。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 熔解曲线 熔解温度
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一种基于多重实时荧光聚合酶链式反应熔解曲线分析的肉及肉制品掺假鉴别方法 被引量:12
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作者 周彤 李家鹏 +5 位作者 李金春 乔晓玲 黄鑫 陈曦 杨君娜 郭雅 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第12期217-222,共6页
为实现肉及肉制品掺假快速鉴别,分别以猪、牛线粒体DNA的COXⅠ,绵羊、山羊、狗、狐狸、貉线粒体DNA的16S rRNA及鸡、鸭线粒体DNA的12S rRNA基因为靶位点,设计扩增产物熔解温度(T_m值)具有显著性差异的特异性引物,建立一种用于快速鉴别... 为实现肉及肉制品掺假快速鉴别,分别以猪、牛线粒体DNA的COXⅠ,绵羊、山羊、狗、狐狸、貉线粒体DNA的16S rRNA及鸡、鸭线粒体DNA的12S rRNA基因为靶位点,设计扩增产物熔解温度(T_m值)具有显著性差异的特异性引物,建立一种用于快速鉴别肉或肉制品中猪、牛、绵羊、山羊、鸡、鸭、狗、狐、貉9种源性成分的5重实时荧光聚合酶链式反应熔解曲线分析方法,通过特异性、灵敏度及市售样品的检测,对该方法进行检验和评价。结果表明:方法具有良好的特异性及灵敏度,单物种DNA检出限为0.001~1 ng,多物种混合DNA检出限均为0.1 ng,通过市售样品检测表明该方法可用于实际样品(包括生鲜样品和熟制样品)掺假的快速鉴别。 展开更多
关键词 肉类掺假 多重实时荧光聚合酶链式反应 熔解曲线分析 SYBR Green染料 动物源性成分
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猪萨佩罗病毒VP1基因重组质粒实时荧光定量PCR标准曲线的建立
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作者 刘熠凡 张静雯 王平利 《河南畜牧兽医》 2024年第3期7-9,18,共4页
为建立用实时SYBRGreenI荧光定量PCR方法检测PSVVP1基因表达量的标准曲线,试验根据目的基因在NCBI上CDS区的序列设计合成引物,用T4连接酶将目的片段与pMD18-T载体连接,构建重组质粒,采用real-time RT-PCR的检测方法,建立了检测猪萨佩罗... 为建立用实时SYBRGreenI荧光定量PCR方法检测PSVVP1基因表达量的标准曲线,试验根据目的基因在NCBI上CDS区的序列设计合成引物,用T4连接酶将目的片段与pMD18-T载体连接,构建重组质粒,采用real-time RT-PCR的检测方法,建立了检测猪萨佩罗病毒VP1基因表达量的标准曲线。试验结果显示,线性回归系数为0.9981,且熔解曲线只有一个峰值,表明由VP1目的基因所建立的标准曲线线性关系良好。试验成功建立了用SYBRGreenI荧光定量RT-PCR方法检测猪萨佩罗病毒VP1基因表达量的标准曲线,为后续检测基因表达量的变化奠定了基础。 展开更多
关键词 PSV 重组质粒 实时荧光定量pcr 标准曲线
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SYBR Green II荧光定量PCR结合熔解曲线鉴别不同亚型兔病毒性出血症病毒方法的建立 被引量:3
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作者 谭永贵 刘腾 +7 位作者 朱杰 郭慧敏 吴巧梅 李琦 缪秋红 陈宗艳 李传峰 刘光清 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2017年第1期7-11,共5页
本研究建立了一种荧光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR)结合熔解曲线区分不同亚型兔病毒性出血症病毒(Rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)方法。根据GenBank数据库中已公布的不同亚型RHDV(经典RHDV和RHDV2)的衣... 本研究建立了一种荧光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR)结合熔解曲线区分不同亚型兔病毒性出血症病毒(Rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)方法。根据GenBank数据库中已公布的不同亚型RHDV(经典RHDV和RHDV2)的衣壳蛋白VP60序列保守区设计了1对特异性引物,利用SYBR Green II荧光染料,在实时荧光定量PCR方法的基础上结合熔解曲线进行分析,经典RHDV和RHDV2熔解温度(Tm)分别为(86.3±0.1)℃和(85.1±0.1)℃,扩增产物的熔解曲线分析均只出现单特异峰。结果表明,本研究建立的方法能够快速地鉴别经典RHDV和RHDV2。 展开更多
关键词 兔病毒性出血症病毒 荧光定量pcr 熔解曲线 鉴别
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实时荧光跨越式滚环等温扩增熔解曲线法检测复合调味料中的沙门氏菌
5
作者 陈秀玲 杨倩 +3 位作者 郭威 张蕴哲 袁耀武 张伟 《中国调味品》 CAS 北大核心 2021年第12期144-150,共7页
复合调味料食用方便、口味多样,具有巨大的市场发展潜力,但相关食品安全问题也时有发生。该研究建立了实时荧光跨越式滚环等温扩增(real-time fluorescence-saltatory rolling circle amplification,RF-SRCA)熔解曲线法检测复合调味料... 复合调味料食用方便、口味多样,具有巨大的市场发展潜力,但相关食品安全问题也时有发生。该研究建立了实时荧光跨越式滚环等温扩增(real-time fluorescence-saltatory rolling circle amplification,RF-SRCA)熔解曲线法检测复合调味料中沙门氏菌的方法。RF-SRCA反应完成后,通过熔解曲线法检测沙门氏菌,可排除引物二聚体或非特异产物对检测结果的影响,准确直观地判定检测结果。进行引物特异性验证,并对灵敏度和人工污染样品的检出限进行分析。结果表明,该方法能有效检测沙门氏菌,14株沙门氏菌均为阳性结果,熔解峰形一致,且Tm值范围稳定,25株非沙门氏菌均为阴性结果。RF-SRCA熔解曲线方法的灵敏度为6 fg/μL,较实时荧光PCR(real-time fluorescence-PCR,RF-PCR)灵敏度高出100倍。检出限为4.6×10^(0) CFU/g,比RF-PCR低100倍。与RF-PCR方法相比,RF-SRCA检测方法灵敏度更高,检出限更低。因此,该研究建立的RF-SRCA熔解曲线方法可对复合调味料中沙门氏菌实现快速、准确、特异、灵敏的检测。 展开更多
关键词 实时荧光跨越式滚环等温扩增(RF-SRCA) 熔解曲线 检测 复合调味料 沙门氏菌
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水稻低丰度表达基因OsAMT1;3实时荧光定量PCR方法的建立及其应用 被引量:17
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作者 孙淑斌 李宝珍 +1 位作者 胡江 徐国华 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期8-12,共5页
采用实时荧光定量PCR技术,通过使用特异引物,对水稻中的低丰度表达基因OsAMT1;3进行了转录水平上的定量分析,成功建立了可检测低丰度表达基因的SYBR Green实时荧光定量PCR技术平台。该方法具有很好的准确性和实用性。获得的荧光定量... 采用实时荧光定量PCR技术,通过使用特异引物,对水稻中的低丰度表达基因OsAMT1;3进行了转录水平上的定量分析,成功建立了可检测低丰度表达基因的SYBR Green实时荧光定量PCR技术平台。该方法具有很好的准确性和实用性。获得的荧光定量PCR扩增曲线,基线平整,指数区明显,斜率大且固定;线性范围广,17~36个循环都能测出;稳定性、重复性好,变异系数仅为0.47%;标准曲线表明,循环阈值与PCR体系中起始模板量的对数值之间有着良好的线性关系,可对基因表达进行相对定量;缺氮条件下OsAMT1;3与纯NH4^+处理相比表达量增加4倍以上。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 扩增曲线 标准曲线 铵转运蛋白基因 基因表达 研究方
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转基因烟草中外源基因实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:10
7
作者 王盛 谢芝勋 +6 位作者 谢丽基 谢志勤 黄莉 罗思思 邓显文 黄娇玲 刘加波 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期745-749,共5页
【目的】建立SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测转基因烟草中外源基因拷贝数的方法,为转基因植物中外源基因拷贝数的检测提供参考。【方法】采用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,检测转基因烟草中外源绿色荧光蛋白基因(GFP)的拷贝数,以... 【目的】建立SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测转基因烟草中外源基因拷贝数的方法,为转基因植物中外源基因拷贝数的检测提供参考。【方法】采用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,检测转基因烟草中外源绿色荧光蛋白基因(GFP)的拷贝数,以烟草单拷贝的内源核糖核酸还原酶基因(RNR2)作为内参基因,建立相对定量的双标准曲线法检测转基因烟草中外源基因拷贝数的方法。【结果】构建RNR2基因、GFP基因实时荧光定量PCR的标准曲线,分别为y=-0.2858x+5.6695和y=-0.2826x+2.1048,R2分别为0.9994和0.9989,相关性较高。在检测的5株转基因烟草中GFP基因的拷贝数分别为5、8、19、28和45,非转基因烟草植株的GFP基因拷贝数为0。【结论】建立的转基因烟草中外源基因SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法具有简单、快速、准确等优点,可用于基因工程中对优良转化植株的筛选及外源基因表达量的快速检测和定量分析。 展开更多
关键词 转基因烟草 双标准曲线 外源基因 拷贝数 SYBR Green I实时荧光定量pcr
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分子信标实时荧光定量PCR构绵羊PrP基因质粒和标准曲线 被引量:6
8
作者 王川 吴润 +3 位作者 李发弟 刁小龙 赵春林 王芳 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期708-711,共4页
目的为能够用实时荧光定量PCR研究消化系统PrP mRNA的表达水平,构建目的基因PrP的标准品质粒和标准曲线。方法根据GenBank中绵羊基因编码区保守序列,设计特异性引物和分子信标探针;提取总RNA,经反转录、RT-PCR后,提取质粒,PCR-SSCP及测... 目的为能够用实时荧光定量PCR研究消化系统PrP mRNA的表达水平,构建目的基因PrP的标准品质粒和标准曲线。方法根据GenBank中绵羊基因编码区保守序列,设计特异性引物和分子信标探针;提取总RNA,经反转录、RT-PCR后,提取质粒,PCR-SSCP及测序鉴定,获得ARQ质粒;将质粒梯度稀释,进行荧光定量PCR,获得标准曲线及回归方程。结果结果显示,本实验设计的分子信标具有特异性强、灵敏度高和结果准确的特性;标准曲线相关系数r2=0.999,表明线性关系好,成功构建了目的基因的标准品质粒和标准曲线。 展开更多
关键词 PRP RT-pcr 实时荧光定量pcr 标准曲线 质粒 绵羊
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猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪圆环病毒2型基因重组质粒实时荧光定量PCR标准曲线的构建 被引量:8
9
作者 施开创 郭鑫 +4 位作者 杨汉春 李焕荣 盖新娜 陈艳红 查振林 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2007年第4期10-12,共3页
根据猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ORF7和猪圆环病毒2型(PCV2)ORF1的核苷酸序列设计特异性引物,经RT-PCR/PCR扩增,分别扩增出大小为308 bp和417 bp的部分基因片段。用T4连接酶将目的片段与pGEM-Teasy载体系统连接,并转化到大肠杆菌DH-... 根据猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ORF7和猪圆环病毒2型(PCV2)ORF1的核苷酸序列设计特异性引物,经RT-PCR/PCR扩增,分别扩增出大小为308 bp和417 bp的部分基因片段。用T4连接酶将目的片段与pGEM-Teasy载体系统连接,并转化到大肠杆菌DH-5α株感受态细胞。提取的质粒经PCR、酶切和测序鉴定,证实为PRRSV和PCV2的阳性重组质粒。将重组标准质粒10倍系列稀释后作为模板,通过实时荧光定量PCR方法(Real-time PCR),建立了PRRSV、PCV2的标准曲线及其直线回归方程,并确定其最佳读板温度。该方法具有线性关系好、特异性强、敏感性高、重复性好等特点,为分析PRRSV和PCV2共感染猪体内病毒的绝对含量提供了必要的技术平台。 展开更多
关键词 PRRSV PCV2 实时荧光定量pcr 重组质粒 标准曲线
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实时荧光定量PCR构建绵羊PrP基因标准品质粒和标准曲线 被引量:3
10
作者 韩彩霞 赵德明 +4 位作者 吴长德 宁章勇 杨建民 刘美丽 马李颖 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期1363-1366,共4页
Here we report the construction of sheep PrP gene standard plasmid DNA and curve using real-time RT-PCR.Total RNA was extracted from each sample and the fragments of target gene were amplified by RT-PCR.The plasmid wa... Here we report the construction of sheep PrP gene standard plasmid DNA and curve using real-time RT-PCR.Total RNA was extracted from each sample and the fragments of target gene were amplified by RT-PCR.The plasmid was constructed for calibrating unknown samples.In this study,the constructed plasmid containing only the target gene was used to construct a calibration curve.The absolute standard curve method was shown to be of high linearity,sensitivity and reproducibility.The purpose of this study is to investigate the quantification of PrP mRNA expression for knowing the scrapie pathogenesis and providing powerful tool for further studies on prion diseases pathogenesis. 展开更多
关键词 PRP RT—pcr 实时荧光定量pcr 标准曲线 绵羊
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牛奶β-乳球蛋白质实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:12
11
作者 贾敏 张银志 +1 位作者 张亦凡 孙秀兰 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期605-612,共8页
建立一种快速、特异、灵敏的Taqman实时荧光定量PCR(real-time PCR)方法,用于牛奶主要过敏原β-乳球蛋白质的检测。根据Gen Bank登录的牛β-乳球蛋白质的DNA序列设计,合成一对特异性引物和探针。将扩增产物连接到p MD19-T载体上,制备... 建立一种快速、特异、灵敏的Taqman实时荧光定量PCR(real-time PCR)方法,用于牛奶主要过敏原β-乳球蛋白质的检测。根据Gen Bank登录的牛β-乳球蛋白质的DNA序列设计,合成一对特异性引物和探针。将扩增产物连接到p MD19-T载体上,制备质粒标准品并测序鉴定,10倍梯度稀释含有β-乳球蛋白质基因的重组质粒,进行实时荧光定量PCR扩增,绘制标准曲线,检测该方法的特异性、稳定性、灵敏性,同时将建立的方法用于10种市售食品的检测。成功建立了β-乳球蛋白质的实时荧光定量PCR检测方法,标准曲线的Ct值与模板浓度在3.18×103~3.18×107copies范围内线性关系良好,R2值为0.997 8;检测灵敏度高(318 copies/μL);特异性强,对羊奶、豆浆DNA均无扩增反应;稳定性好,组内、组间的变异系数均在5%以内。对10种食品牛奶过敏原的检测结果与标签相符。表明所建立的实时荧光定量PCR方法可应用于食品中牛奶过敏原β-乳球蛋白质的检测并可推广到其它过敏原的检测。 展开更多
关键词 牛奶过敏原质 β-乳球蛋白质 Taqman实时荧光定量pcr 检测
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实时荧光定量PCR检测猪源Mx1方法的建立及应用 被引量:4
12
作者 张小敏 周斌 +3 位作者 何丹妮 庞然 赵津 陈溥言 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期92-96,共5页
根据GenBank中的猪源抗病毒蛋白Mx1基因(poMx1)序列设计1对特异性引物,从Mx1基因全长片段中扩增和克隆了特异性的115 bp核苷酸片段。测序鉴定正确后将重组质粒进行定量并10倍倍比稀释作为扩增模板,通过SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法... 根据GenBank中的猪源抗病毒蛋白Mx1基因(poMx1)序列设计1对特异性引物,从Mx1基因全长片段中扩增和克隆了特异性的115 bp核苷酸片段。测序鉴定正确后将重组质粒进行定量并10倍倍比稀释作为扩增模板,通过SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,建立Mx1的标准曲线及回归方程。结果显示:该标准曲线的回归方程为Y=-2.986 3 lg X+38.239 3(R2=0.998 5),灵敏度为1×102μL-1;应用该方法对猪瘟兔化弱毒苗接种猪肾细胞(PK-15)后产生的poMx1 mRNA进行定量分析,发现病毒感染细胞4 h后,poMx1的表达量最高(P<0.01),然后随着时间的增加而缓慢减少。结论:建立的SYBRGreenⅠ实时荧光定量PCR方法可以检测poMx1 mRNA的表达水平。 展开更多
关键词 猪源Mx1 实时荧光定量pcr 标准曲线
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实时荧光定量PCR法检测抗虫棉Bt基因拷贝数方法的建立 被引量:5
13
作者 闫喜中 张锐 +3 位作者 孟志刚 孙国清 周涛 郭三堆 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第26期11376-11377,共2页
[目的]建立并完善Taqman实时荧光定量PCR检测转基因抗虫棉Bt基因的方法。[方法]通过Bt基因序列,利用软件Primer5.0设计引物和探针,然后利用10倍系列稀释含有目的基因的质粒pG4AB,进行实时荧光定量PCR反应,制作标准曲线。[结果]抗虫基因... [目的]建立并完善Taqman实时荧光定量PCR检测转基因抗虫棉Bt基因的方法。[方法]通过Bt基因序列,利用软件Primer5.0设计引物和探针,然后利用10倍系列稀释含有目的基因的质粒pG4AB,进行实时荧光定量PCR反应,制作标准曲线。[结果]抗虫基因拷贝数与Ct值的关系为Ct=-3.549 632X+43.783 512,相关系数R2为0.997 867。[结论]实时荧光定量PCR检测转基因抗虫棉Bt基因的方法具有特异性好、灵敏度高的特点。 展开更多
关键词 晚基因 实时荧光定量pcr 标准曲线
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基于荧光熔解曲线模式RT-PCR快速检测H_5N_1亚型禽流感病毒 被引量:1
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作者 岳华 李明义 +3 位作者 马莉 汤承 张兆敏 张斌 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期116-121,共6页
针对H5N1亚型禽流感病毒(AIV)的HA、NA基因保守序列设计2对引物,建立了SYBR GreenⅠ双重荧光RT-PCR(RRT-PCR)方法,实现了同一反应管内同时检测AIV的H5和N1亚型基因。熔解曲线分析显示,H5和N1扩增片段的熔解温度分别为(79.5±0.3)℃... 针对H5N1亚型禽流感病毒(AIV)的HA、NA基因保守序列设计2对引物,建立了SYBR GreenⅠ双重荧光RT-PCR(RRT-PCR)方法,实现了同一反应管内同时检测AIV的H5和N1亚型基因。熔解曲线分析显示,H5和N1扩增片段的熔解温度分别为(79.5±0.3)℃和(83.3±0.3)℃,无引物二聚体形成,扩增产物片段大小分别为150 bp和474bp,与预期大小相符,测序结果证实为H5和N1亚型基因的靶序列。该方法能从H5N1样本中检出阳性扩增信号,熔解曲线可见H5和N1双特异峰;而H5N2样本有阳性扩增,熔解曲线仅见H5单特异峰。AIV的其他HA亚型和其他病毒的RNA、DNA无扩增信号。本法最低可检测21.0拷贝.μL-1和19.5拷贝.μL-1H5和N1重组质粒,敏感度分别是RT-PCR的100、1 000倍。本研究建立的基于荧光熔解曲线模式RT-PCR可用于HN亚型AIV的检测。 展开更多
关键词 禽流感病毒 H5N1亚型 双重荧光RT—pcr 熔解曲线
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裸大麦PKABA1基因实时荧光定量PCR方法的建立 被引量:2
15
作者 吴昆仑 邓晓青 姚晓华 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2012年第12期16-18,共3页
根据GenBank上小麦(M94726)、大麦(AB058924)和黑麦(DQ295068)的蛋白激酶外显子3的编码基因的同源序列比对,设计基因PKABA1的引物,建立了用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测裸大麦PKABA1基因在不同低温处理时间下mRNA表达量的方法。以... 根据GenBank上小麦(M94726)、大麦(AB058924)和黑麦(DQ295068)的蛋白激酶外显子3的编码基因的同源序列比对,设计基因PKABA1的引物,建立了用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测裸大麦PKABA1基因在不同低温处理时间下mRNA表达量的方法。以样本循环数为纵坐标、以稀释倍数的对数为横坐标建立标准曲线,其相关系数(r2)达到了0.996,扩增效率99%,熔解曲线分析结果显示产物为特异的单峰,退火温度为(80.5±0.5)℃。结果表明,裸大麦PKABA1基因在不同低温处理时间下的表达量稳定,其实时荧光定量PCR法扩增效率高、特异性强、线性范围广、检测周期短,为PKABA1基因作为内参基因进行裸大麦功能基因表达的定量分析奠定了基础。 展开更多
关键词 裸大麦 实时荧光定量 pcr扩增 标准曲线 PKABA1基因
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瘤胃脂肪分解菌实时荧光定量PCR方法的构建 被引量:2
16
作者 范文斌 刘永斌 李长青 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2015年第1期154-157,共4页
为定量测定瘤胃脂肪分解菌,试验构建了脂肪分解菌实时荧光定量PCR的标准品及标准曲线。提取瘤胃微生物总DNA,以脂肪分解菌16S r DNA特异性引物进行PCR扩增,回收PCR产物,与PMD19-T Vector连接并转化大肠杆菌。阳性重组质粒经PCR和测序鉴... 为定量测定瘤胃脂肪分解菌,试验构建了脂肪分解菌实时荧光定量PCR的标准品及标准曲线。提取瘤胃微生物总DNA,以脂肪分解菌16S r DNA特异性引物进行PCR扩增,回收PCR产物,与PMD19-T Vector连接并转化大肠杆菌。阳性重组质粒经PCR和测序鉴定后,将提取的质粒DNA进行梯度稀释并作为模板,利用荧光定量PCR反应做出标准曲线。结果显示:PCR产物与目的基因的相似性大于99%,以不同稀释度的重组质粒为模板获得的荧光定量PCR扩增曲线差异明显,构建了相关系数接近1的标准曲线,且熔解曲线峰值单一。试验建立的实时荧光定量PCR方法可用于瘤胃脂肪分解菌的定量检测,为进一步研究该菌在反刍动物瘤胃发酵中的分子机理奠定了基础。 展开更多
关键词 瘤胃脂肪分解菌 实时荧光定量pcr 标准品质粒 标准曲线
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小麦脱水素基因wzy2表达量实时荧光定量PCR方法的建立和应用 被引量:1
17
作者 赵鑫 张林生 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期1045-1049,共5页
以陕合6号小麦品种为材料,用SYBR GreenⅡ染料,参照小麦脱水素wzy2和-βactin基因序列设计引物,建立小麦wzy2基因的实时荧光定量PCR分析方法.结果表明:通过对标准品标准曲线和熔解曲线分析,其标准曲线的Ct值检测范围为12~30,PCR扩增效... 以陕合6号小麦品种为材料,用SYBR GreenⅡ染料,参照小麦脱水素wzy2和-βactin基因序列设计引物,建立小麦wzy2基因的实时荧光定量PCR分析方法.结果表明:通过对标准品标准曲线和熔解曲线分析,其标准曲线的Ct值检测范围为12~30,PCR扩增效率高达111.3%;不同的标准品扩增曲线的间距为3.078,接近于理想值3.32,且可显示产物特异的单峰,引物的特异性扩增强.小麦脱水素基因wzy2表达量实时荧光定量PCR的测定结果表明,小麦脱水素基因wzy2在胁迫24 h的表达量明显高于胁迫12 h的表达量. 展开更多
关键词 脱水素 内参照基因 实时荧光定量pcr 标准曲线
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实时荧光定量PCR法快速测定水中微囊藻 被引量:1
18
作者 李继影 吴昕贤 +2 位作者 徐恒省 刘孟宇 景明 《环境监测管理与技术》 2013年第6期47-51,共5页
以铜绿微囊藻(Microcystis aeruginosa)16S rRNA基因片段为靶序列设计一对特异性引物,采用Real-time PCR法,对铜绿微囊藻进行定性、定量检测。试验表明,仅含铜绿微囊藻DNA模板的样品有特异性扩增,扩增产物熔解曲线平稳,峰尖且窄,熔解温... 以铜绿微囊藻(Microcystis aeruginosa)16S rRNA基因片段为靶序列设计一对特异性引物,采用Real-time PCR法,对铜绿微囊藻进行定性、定量检测。试验表明,仅含铜绿微囊藻DNA模板的样品有特异性扩增,扩增产物熔解曲线平稳,峰尖且窄,熔解温度为(87±1)℃。以重组质粒pMD-18T-16S为标准品,检测区间为1.1×102copies/mL~1.1×108copies/mL,所得标准曲线符合制备实时定量PCR标准曲线的要求,对标准品进行测定,方法检出限为11 copies/mL。用该标准曲线对实验室培养获得的铜绿微囊藻DNA样品进行定量检测,与显微镜计数结果基本一致。 展开更多
关键词 微囊藻 实时荧光定量pcr 16S RRNA 水质
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中华鲟基因SYBR Green实时荧光PCR检测方法的建立
19
作者 祝长青 陈光哲 +5 位作者 周阳 刘欣 石建华 邵景东 蒋原 黄文胜 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第6期60-63,共4页
根据NCBI上已公布的中华鲟D-loop基因、细胞色素b基因、12S rRNA基因的核酸序列设计出4对引物,经SYBR Green实时荧光PCR反应、熔解曲线分析和扩增片段克隆测序后,发现针对D-loop基因的F2-R1引物能够高效、特异地实现对靶序列扩增,选择... 根据NCBI上已公布的中华鲟D-loop基因、细胞色素b基因、12S rRNA基因的核酸序列设计出4对引物,经SYBR Green实时荧光PCR反应、熔解曲线分析和扩增片段克隆测序后,发现针对D-loop基因的F2-R1引物能够高效、特异地实现对靶序列扩增,选择其作为中华鲟基因特异性扩增引物,建立中华鲟基因SYBR Green实时荧光PCR检测方法。所建立的中华鲟D-loop基因SYBR Green实时荧光PCR检测方法特异性好、可操作性强,具有较好的应用价值。 展开更多
关键词 中华鲟 基因鉴定 实时荧光pcr 熔解曲线 克隆测序
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实时荧光定量PCR构建牛源粪肠球菌esp标准曲线
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作者 樊杰 孙康永杰 +4 位作者 魏亚琴 杨宇泽 万学瑞 丁巨财 王川 《中兽医学杂志》 2019年第11期13-15,共3页
为了快速检测牛源粪肠球菌,本实验建立了粪肠球菌esp基因实时荧光定量PCR标准曲线。首先参照esp基因在Genbank中的序列进行引物的设计与合成,利用PCR扩增目的基因并将其连接到pMD18-T载体上,并转化进入大肠埃希菌TOP10感受态细胞,经测... 为了快速检测牛源粪肠球菌,本实验建立了粪肠球菌esp基因实时荧光定量PCR标准曲线。首先参照esp基因在Genbank中的序列进行引物的设计与合成,利用PCR扩增目的基因并将其连接到pMD18-T载体上,并转化进入大肠埃希菌TOP10感受态细胞,经测序鉴定成功后,提取重组质粒并以10倍系列稀释后作为标准模板,进行实时荧光定量PCR。成功建立了牛源粪肠球菌esp基因荧光定量PCR标准曲线及其直线回归方程,所得熔解曲线峰值单一,表明引物具有很好的特异性;标准曲线相关系数r^2=0.9998,说明线性关系良好,目的基因的荧光定量PCR的标准曲线构建成功。本研究为快速检测牛源粪肠球菌奠定了基础。 展开更多
关键词 粪肠球菌 ESP 实时荧光定量pcr 标准曲线
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