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DNA片段拼接中基于定长特征子串的重复序列信息屏蔽方法
被引量：
4
1
作者
张博锋
王正华
《国防科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2002年第6期67-70,共4页
包含重复序列(repeats)的DNA序列的重构是大规模DNA片段拼接所面临的实际困难之一。在考虑片段数据所隐含的位置信息的基础上,提出了一种基于定长特征子串的屏蔽片段数据中重复序列信息的方法,即在进行序列相互比对前利用独特子串标识...
包含重复序列(repeats)的DNA序列的重构是大规模DNA片段拼接所面临的实际困难之一。在考虑片段数据所隐含的位置信息的基础上,提出了一种基于定长特征子串的屏蔽片段数据中重复序列信息的方法,即在进行序列相互比对前利用独特子串标识大多数片段,从而减少可能的错误重叠,讨论了方法中几个参数的确定问题并用计算结果说明了方法的有效性。
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关键词
重复序列
信息屏蔽
生物信息学
片段拼接
重复片段
定长特征子串
DNA序列
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职称材料
题名
DNA片段拼接中基于定长特征子串的重复序列信息屏蔽方法
被引量：
4
1
作者
张博锋
王正华
机构
国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室
出处
《国防科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2002年第6期67-70,共4页
基金
国家自然科学基金资助重点项目(69933030)
文摘
包含重复序列(repeats)的DNA序列的重构是大规模DNA片段拼接所面临的实际困难之一。在考虑片段数据所隐含的位置信息的基础上,提出了一种基于定长特征子串的屏蔽片段数据中重复序列信息的方法,即在进行序列相互比对前利用独特子串标识大多数片段,从而减少可能的错误重叠,讨论了方法中几个参数的确定问题并用计算结果说明了方法的有效性。
关键词
重复序列
信息屏蔽
生物信息学
片段拼接
重复片段
定长特征子串
DNA序列
Keywords
bioinformatics
fragment assembly
repeats
masking-off
definite-sized characteristic substring
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
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出处
发文年
被引量
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1
DNA片段拼接中基于定长特征子串的重复序列信息屏蔽方法
张博锋
王正华
《国防科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2002
4
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