多溴联苯醚生物富集系数的定量结构-活性关系 被引量：2

1

作者 李吉安 薛秀玲 卢桂宁 《华侨大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2014年第3期305-309,共5页

在B3LYP/6-31G*水平上,运用Gaussian 03对多溴联苯醚(polybrominated diphenyl ethers,PBDEs)分子进行结构优化.采用偏最小二乘法(partial least squares,PLS)对PBDEs的生物富集系数(bioconcentration factor,BCF)与分子结构参数进行关... 在B3LYP/6-31G*水平上,运用Gaussian 03对多溴联苯醚(polybrominated diphenyl ethers,PBDEs)分子进行结构优化.采用偏最小二乘法(partial least squares,PLS)对PBDEs的生物富集系数(bioconcentration factor,BCF)与分子结构参数进行关联.结果表明:BCF结合苯环上溴原子的取代个数(NBr)可以较好地表达PBDEs的理化性质与其分子结构间的定量关系;log(BCF-NBr)优化后模型的相关系数R2Y(cum)为0.980,累积交叉有效性判别系数Q2cum为0.921,该模型具有较高的拟合精度和良好预测能力;分子总能量ET和电子运动空间广度Re对PBDEs的BCF有着重要制约作用;具有较低ET、较大Re的PBDEs呈现出较低的BCF. 展开更多

关键词 多溴联苯醚 定量结构-活性关系 生物富集系数 偏最小二乘法

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人工神经网络用于氯代芳烃定量结构-活性关系研究 被引量：1

2

作者 何琴 李婧 《河北化工》 2012年第9期28-31,共4页

采用误差反传前向人工神经网络(Artificial neural network,ANN)建立了37种氯代芳烃的结构与其对孔雀鱼的急性毒性之间的定量关系模型(ANN模型)。以37种氯代芳烃的量子化学参数作为输入,急性毒性作为输出,采用内外双重验证的办法分析和... 采用误差反传前向人工神经网络(Artificial neural network,ANN)建立了37种氯代芳烃的结构与其对孔雀鱼的急性毒性之间的定量关系模型(ANN模型)。以37种氯代芳烃的量子化学参数作为输入,急性毒性作为输出,采用内外双重验证的办法分析和检验所得模型的稳定性,所构建网络模型的相关系数为0.996 5、交叉检验相关系数为0.991 1、标准偏差为0.04、残差绝对值≤0.18,应用于外部预测集,外部预测集相关系数为0.988 4;而多元线性回归(Multiple linear regression,MLR)法模型的相关系数为0.949 6、交叉检验相关系数为0.928 8、标准偏差为0.14、残差绝对值≤0.32,外部预测集相关系数为0.950 5。结果表明,ANN模型获得了比MLR模型更好的拟合效果。 展开更多

关键词 氯代芳烃 定量结构-活性关系 人工神经网络 急性毒性

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多氯联苯的定量结构-性质(活性)关系 被引量：31

3

作者 邹建卫 蒋勇军 +3 位作者 胡桂香 曾敏 庄树林 俞庆森 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第3期267-272,共6页

多氯联苯(PCBs)是一类重要的持久性环境污染物.首先对所有209个PCB分子进行了HF/6-31G水平上的结构优化,在优化结构上获得了分子的表面静电势分布,并在此基础上对其统计导出的参数进行了计算.其后,运用多元线性回归方法对PCBs的水溶性... 多氯联苯(PCBs)是一类重要的持久性环境污染物.首先对所有209个PCB分子进行了HF/6-31G水平上的结构优化,在优化结构上获得了分子的表面静电势分布,并在此基础上对其统计导出的参数进行了计算.其后,运用多元线性回归方法对PCBs的水溶性、正辛醇/水分配系数、正辛醇/空气分配系数、土壤吸附性、水溶液活度系数、298K超冷流体蒸汽压、总分子表面积、色谱保留指数、升华焓、蒸发焓、熔融焓、PCB结合芳烃受体活性数据、生物降解度以及生物降解速率参数等理化性质和生物活性与分子的结构参数进行了关联.结果表明:分子静电势参数结合分子表面积和常规的量子化学参数可以很好地用于表达多氯联苯分子理化性质和生物活性与其分子结构间的定量关系. 展开更多

关键词 定量结构-性质关系 定量结构-活性关系 分子静电势 从头算 多氯联苯

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定量结构-性质/活性关系在分析和环境化学中的进展及应用 被引量：10

4

作者 李鹏霞 陈晶 +1 位作者 周喜斌 卢小泉 《分析科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期241-245,共5页

定量结构-性质/活性关系(QSPR/QSAR)是目前国际上一个比较活跃的研究领域。该方法将理论计算方法和各种统计分析工具相结合,研究系列化合物的结构与其生物活性和各种物理化学性质之间的定量函数关系。QSPR/QSAR不仅可以建立预测化合物... 定量结构-性质/活性关系(QSPR/QSAR)是目前国际上一个比较活跃的研究领域。该方法将理论计算方法和各种统计分析工具相结合,研究系列化合物的结构与其生物活性和各种物理化学性质之间的定量函数关系。QSPR/QSAR不仅可以建立预测化合物的各种理化性质以及生物活性的理论模型,而且可以发现和确定对化合物的各种性质起决定作用的结构因素,从而在分子水平上了解物质的微观结构对各种宏观性质的影响,该研究方法已在很多领域得到了广泛应用。本文简要介绍了定量构效关系的发展历史及其在分析化学和环境化学中的应用研究。 展开更多

关键词 定量结构-性质/活性关系 分析化学 环境化学

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芳烃类化合物结构-毒性定量构效关系 被引量：1

5

作者 秦正龙 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第10期243-246,共4页

基于表征生物活性的原子点价Bi并构建芳烃类化合物的拓扑指数nL,0L,1L及指示参数N与芳烃类化合物对发光菌、大型蚤、呆鲦鱼等三种水生生物的急性毒性关联,得到了良好的相关性,相关系数依次为0.9489、0.9787、0.9648,所建QSAR模型具有良... 基于表征生物活性的原子点价Bi并构建芳烃类化合物的拓扑指数nL,0L,1L及指示参数N与芳烃类化合物对发光菌、大型蚤、呆鲦鱼等三种水生生物的急性毒性关联,得到了良好的相关性,相关系数依次为0.9489、0.9787、0.9648,所建QSAR模型具有良好的稳定性和预测能力,估算结果均明显优于文献方法. 展开更多

关键词 芳烃类化合物 定量结构-活性关系 急性毒性 发光菌 大型蚤 呆鲦鱼

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有机磷农药氯过氧化物酶反应活性的定量构效研究 被引量：6

6

作者 卢桂宁 陈晓鹏 +2 位作者 陶雪琴 易筱筠 党志 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期997-1000,共4页

氯过氧化物酶(CPO)是应用最广的一种过氧化物酶,能催化一系列底物的氧化。采用量子化学从头算方法在HF/6-31G(d)水平下计算了7种含S=P键的有机磷农药的多个量子化学参数,运用偏最小二乘法建立CPO对有机磷农药反应活性的定量结构-活性关... 氯过氧化物酶(CPO)是应用最广的一种过氧化物酶,能催化一系列底物的氧化。采用量子化学从头算方法在HF/6-31G(d)水平下计算了7种含S=P键的有机磷农药的多个量子化学参数,运用偏最小二乘法建立CPO对有机磷农药反应活性的定量结构-活性关系(QSAR)模型。结果表明,CPO对有机磷农药的反应活性与所考查的量子化学参数之间存在非线性关系。以对数关系建模得到了相关系数为0.910的模型,该模型具有较高的拟合精度和较强的预测能力。模型辅助分析表明,农药分子的S=P键中S原子电荷的大小对氧化活性的影响最大,P原子电荷大小的影响次之,分子偶极矩对氧化活性也有一定影响;农药分子中S原子带负电荷越多,P原子所带正电荷越多,分子极性越小,该农药就越容易被CPO催化氧化。最后运用所得模型预测了2种有机磷农药的CPO反应活性。 展开更多

关键词 有机磷农药 氯过氧化物酶 反应活性 量子化学 定量结构-活性关系

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取代芳烃对大型蚤急性毒性的定量构效关系研究 被引量：4

7

作者 王雷 李凤 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第23期12542-12544,共3页

[目的]建立具有良好相关性和稳定性的取代芳烃对大型蚤定量结构-活性关系(QSAR)模型。[方法]采用Gaussian03程序包中密度泛函理论(DFT)B3LYP方法计算取代芳烃的部分结构参数和毒性参数。[结果]-lgEC50的回归方程为-lgEC50=4.496+1.5... [目的]建立具有良好相关性和稳定性的取代芳烃对大型蚤定量结构-活性关系(QSAR)模型。[方法]采用Gaussian03程序包中密度泛函理论(DFT)B3LYP方法计算取代芳烃的部分结构参数和毒性参数。[结果]-lgEC50的回归方程为-lgEC50=4.496+1.5×10-2MM+9.958×EHOMO+0.677×ΔQR;方程中各自变量的变异膨胀因子(VIF)分别为:1.508、1.364和1.157。取代芳烃对大型蚤急性毒性的主要影响因子为分子量MM、分子最高占有轨道能EHOMO和苯环上净电荷增量ΔQR,且这3个结构参数与-lgEC50正相关,其标准系数分别为0.986、0.289和0.175。分子量越大,分子总能量(能量为负值)越低,化合物越稳定,毒性越大;分子量越大,lgP越大,化合物的脂溶性越大,毒性越大。[结论]该试验建立的模型具有良好的稳定性和很强的预测能力。 展开更多

关键词 取代芳烃 大型蚤 密度泛函理论 定量结构-活性关系

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邻苯二甲酸酯化合物生物降解性与其化学结构的相关性 被引量：28

8

作者 夏凤毅 郑平 +1 位作者 周琪 冯孝善 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期141-146,共6页

应用定量结构-活性关系(QSAR)研究方法,对邻苯二甲酸酯类化合物的好氧生物降解性能与其化学结构间的相关性进行了研究,建立了受试物的好氧生物降解速率常数与分子连接性指数和结构参数的定量关系.结果表明,对邻苯二甲酸酯类化合物而言,... 应用定量结构-活性关系(QSAR)研究方法,对邻苯二甲酸酯类化合物的好氧生物降解性能与其化学结构间的相关性进行了研究,建立了受试物的好氧生物降解速率常数与分子连接性指数和结构参数的定量关系.结果表明,对邻苯二甲酸酯类化合物而言,取代基的空间结构参数是影响受试物好氧生物降解性能的重要因素. 展开更多

关键词 邻苯二甲酸酯 化合物 生物降解 化学结构 相关性 定量结构-活性关系 QSAR

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QSAR及其在农药设计中的应用和进展 被引量：19

9

作者 钟国华 胡美英 《农药学学报》 CAS CSCD 2001年第2期1-11,共11页

在介绍定量结构 -活性关系 (QSAR)的基本原理后 ,重点评述了 QSAR各种方法的主要原理、优缺点及其在农药设计中的研究应用进展 ,包括取代基多参数法 (Hansch法 )、Free- Wilson法、分子轨道法 (MO)、距离比较法 (DISCO)、比较分子力场... 在介绍定量结构 -活性关系 (QSAR)的基本原理后 ,重点评述了 QSAR各种方法的主要原理、优缺点及其在农药设计中的研究应用进展 ,包括取代基多参数法 (Hansch法 )、Free- Wilson法、分子轨道法 (MO)、距离比较法 (DISCO)、比较分子力场分析法 (Co MFA)、分子模拟法 (MS)、分子对接法 (MD)、人工神经网络法 (ANN)以及 展开更多

关键词 定量结构-活性关系 QSAR 农药 设计 取代基多参数法 分子轨道法

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苯环己胺类药物的QSAR研究 被引量：3

10

作者 史智英 张绍飞 范英芳 《化学研究与应用》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期283-288,共6页

采用量子化学密度泛函DFT/B3LYP方法,计算了30个苯环己胺(PCA)类化合物的电子结构参数,结合Chemoffice8.0软件计算的基于距离的拓扑参数,用逐步多元线性回归法建立了其结构参数与药物活性之间的定量结构-活性关系(QSAR)。所建模型的复... 采用量子化学密度泛函DFT/B3LYP方法,计算了30个苯环己胺(PCA)类化合物的电子结构参数,结合Chemoffice8.0软件计算的基于距离的拓扑参数,用逐步多元线性回归法建立了其结构参数与药物活性之间的定量结构-活性关系(QSAR)。所建模型的复相关系数R=0.9250;用留一法(leave-one-out,LOO)进行交互检验,得到交互检验系数RCV2=0.737。结果表明,此模型具有重要的统计学意义并有很好的预测能力,为快速地筛选高效的药物分子以及为将来设计、合成新的更有效的药物分子提供了一定的参考依据。 展开更多

关键词 定量结构-活性关系 苯环己胺 密度泛函 量子化学参数

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中药毒性预测研究进展与思考 被引量：6

11

作者 沈磐 孙德志 +1 位作者 周维 高月 《中国药物警戒》 2023年第4期473-479,共7页

目的了解中药毒性预测研究现状,为全面深入认识中药毒性提供参考。方法基于文献检索和阅读,对近年来有关中药毒性预测思路和方法进行梳理、归纳和总结。结果根据不同的预测理念,中药毒性预测方法大致可分为3类:基于定量结构-活性关系、... 目的了解中药毒性预测研究现状,为全面深入认识中药毒性提供参考。方法基于文献检索和阅读,对近年来有关中药毒性预测思路和方法进行梳理、归纳和总结。结果根据不同的预测理念,中药毒性预测方法大致可分为3类:基于定量结构-活性关系、网络毒理学及传统中药药性理论的中药毒性预测方法,对中药毒性预测的发展及其在临床用药的指导作用提出了展望,提出“基于多元层面的中药全成分组复合毒性效应网络”的中药毒性预测理念,期望实现一体化中药毒性完整预测,有助于中药毒性的系统性研究和应用,为进一步认识中药毒性预测提供了思路。结论现有的中药毒性预测方法能够为“有毒”中药无毒用药方案的制定提供理论依据,对临床上的中药配伍减毒具有一定的参考。 展开更多

关键词 中药毒性预测 定量结构-活性关系 网络毒理学 中药药性理论

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基于分子对接技术及CoMSIA/HQSAR辅助的二羟基多氯联苯衍生物分子修饰 被引量：5

12

作者 辛美玲 褚振华 李鱼 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第2期299-309,共11页

利用类二噁英类多氯联苯(PCBs)大气氧化降解产物二羟基多氯联苯与2,3-二羟基联苯双加氧酶(Bphc,PDB ID:1KW6)进行分子对接,构建以分子结构参数为自变量,对接打分函数(K_d,代表对接活性)为因变量的分子相似性指数分析(Co MSIA)与分子全... 利用类二噁英类多氯联苯(PCBs)大气氧化降解产物二羟基多氯联苯与2,3-二羟基联苯双加氧酶(Bphc,PDB ID:1KW6)进行分子对接,构建以分子结构参数为自变量,对接打分函数(K_d,代表对接活性)为因变量的分子相似性指数分析(Co MSIA)与分子全息定量结构-活性相关关系(HQSAR)模型,并对二羟基多氯联苯进行分子修饰,研究结果表明,Bphc酶对二羟基多氯联苯均有不同程度的降解能力,影响Bphc酶对接活性的氨基酸残基为His145,Val147,Ile174,His194,His208,His209,His240,Asn242,Tyr249及Thr280,且二羟基多氯联苯与氨基酸残基对接形成的氢键越多对接活性越高.建立了CoMSIA和HQSAR模型耦合的二羟基多氯联苯分子取代活性精确定位方法,以打分函数较低的二羟基多氯联苯5,6-2OH-CB60为目标分子,设计出8种打分函数显著提升的新型分子,其对接活性提高65%~185%,分子毒性(IC_(50))下降10%~83%,生物富集性(BCF)下降4%~27%,迁移性(K_(OA))与半衰期(t_(1/2))增降幅基本不变.所设计新型分子反应路径的推断可以验证二羟基多氯联苯5,6-2OH-CB60在环境中与活性自由基或与活性分子反应生成所设计的新型5,6-2OH-CB60分子,即类二噁英类PCBs可通过大气氧化降解最终生成酶降解性显著提高的新型二羟基多氯联苯,达到进一步控制类二噁英类PCBs环境行为的目的. 展开更多

关键词 类二噁英类多氯联苯 二羟基多氯联苯 Bphc酶 分子对接 分子相似性指数分数 分子全息定量结构-活性相关关系

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