期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
3
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
核酸与分子建模及结构表达启动子强度预测
1
作者
李波
仇亮加
+2 位作者
李劲为
叶楠
李志良
《重庆大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2003年第7期63-65,共3页
从核酸分子的一级结构出发 ,基于分子中原子间距离及各原子电负性 ,构建了能描述核酸分子结构的系列参数 :分子电性边数矢量简称分子电边矢量。据此对 38个脱氧核糖核酸 (DNA)启动子序列的强度进行定量结构活性相关 (QSAR)及定量序列活...
从核酸分子的一级结构出发 ,基于分子中原子间距离及各原子电负性 ,构建了能描述核酸分子结构的系列参数 :分子电性边数矢量简称分子电边矢量。据此对 38个脱氧核糖核酸 (DNA)启动子序列的强度进行定量结构活性相关 (QSAR)及定量序列活性模型 (QSAM)研究 ,取得良好结果。与其它方法相比 ,分子电边矢量具结构分辨率高、活性相关性好、计算简便等特点 。
展开更多
关键词
定量
构
效
相关
模型
定量序效模型
QSAM
分子电边矢量
脱氧核糖核酸
启动子
序
列
DNA链结构
生物大分子
在线阅读
下载PDF
职称材料
多肽一级结构表征与抗菌肽QSAM建模
被引量：
5
2
作者
苏满秀
王立峰
+2 位作者
代志军
袁哲明
柏连阳
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012年第11期2526-2531,共6页
从整体上考虑多肽一级结构,提出了3种仅基于多肽氨基酸序列、计算简便、适于不等长肽和可捕获多肽上下文关联特征的多肽新描述子,即地统计学关联(GS-AA531)描述子、多尺度组分与关联(MSCC)描述子和地统计学关联与多尺度组分(GS-AA531-M...
从整体上考虑多肽一级结构,提出了3种仅基于多肽氨基酸序列、计算简便、适于不等长肽和可捕获多肽上下文关联特征的多肽新描述子,即地统计学关联(GS-AA531)描述子、多尺度组分与关联(MSCC)描述子和地统计学关联与多尺度组分(GS-AA531-MSC)描述子.将其应用于2个抗菌肽体系(等长肽与不等长肽)的结构表征,并以支持向量回归建立QSAM模型.模型的拟合、留一法及独立测试结果表明,结合特征筛选的新描述子GS-AA531与GS-AA531-MSC的预测精度明显稳定且优于其它参比描述子,在多肽QSAM研究中具有广泛应用前景.
展开更多
关键词
结构表征
定量序效模型
抗菌肽
支持向量回归
特征筛选
在线阅读
下载PDF
职称材料
基于高维特征非线性筛选的HLA-A*0201限制性CTL表位预测
被引量：
2
3
作者
韩娜
袁哲明
+2 位作者
陈渊
代志军
王志明
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2013年第9期1945-1953,共9页
高活性细胞毒T细胞(CTL)表位鉴定是设计肿瘤疫苗的关键内容.采用天然氨基酸的531个物理化学性质参数表征HLA-A*0201限制性表位9肽,从531×9个初始描述子出发,经二元矩阵重排过滤器粗筛和多轮末尾淘汰精细筛选,获得18个物理化学意义...
高活性细胞毒T细胞(CTL)表位鉴定是设计肿瘤疫苗的关键内容.采用天然氨基酸的531个物理化学性质参数表征HLA-A*0201限制性表位9肽,从531×9个初始描述子出发,经二元矩阵重排过滤器粗筛和多轮末尾淘汰精细筛选,获得18个物理化学意义明确的保留描述子.18个保留描述子主要涉及除1位、5位外各位置残基的疏水性和空间结构特征,3位残基疏水性对活性影响最大,且2位、4位、9位残基共占10个保留描述子,支持2位和9位残基为锚点、3位为关键位点以及4位残基为标志链的现有认知.对18个保留描述子以支持向量回归构建定量序效模型,其拟合、留一法交叉验证决定系数R^2、Q_(cv)~2分别为0.957、0.708;独立预测决定系数及均方根误差Q_(ext)~2、RMSE_(ext)分别为0.818、0.366,明显优于文献报道.通过对全组合虚拟9肽的预测,得到了多条预测活性高于已知表位肽的9肽,可供实验验证.较全面阐明了特定位置残基对多肽亲和性的影响规律,为高活性多肽疫苗分子设计提供了切实指导.
展开更多
关键词
抗原肽
定量序效模型
高维特征
支持向量回归
多肽疫苗
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
核酸与分子建模及结构表达启动子强度预测
1
作者
李波
仇亮加
李劲为
叶楠
李志良
机构
重庆大学化学化工学院
出处
《重庆大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2003年第7期63-65,共3页
基金
重庆市应用基础项目 (0 1-3 -6)
国家春晖计划教育部启动基金 (99-3 8/ 0 4)
+1 种基金
霍英东基金 (98)
国家新药基金(96-10 1-0 1-0 8)资助
文摘
从核酸分子的一级结构出发 ,基于分子中原子间距离及各原子电负性 ,构建了能描述核酸分子结构的系列参数 :分子电性边数矢量简称分子电边矢量。据此对 38个脱氧核糖核酸 (DNA)启动子序列的强度进行定量结构活性相关 (QSAR)及定量序列活性模型 (QSAM)研究 ,取得良好结果。与其它方法相比 ,分子电边矢量具结构分辨率高、活性相关性好、计算简便等特点 。
关键词
定量
构
效
相关
模型
定量序效模型
QSAM
分子电边矢量
脱氧核糖核酸
启动子
序
列
DNA链结构
生物大分子
Keywords
molecular electronegativity edge-distance vector (VMED)
structural parameterization
theoretical descriptors
quantitative sequence-activity models (QSAM)
E.coli transcriptional DNA-promoter sequences
Nucleic acid bases
multiple linear
分类号
Q523 [生物学—生物化学]
Q617 [生物学—生物物理学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
多肽一级结构表征与抗菌肽QSAM建模
被引量：
5
2
作者
苏满秀
王立峰
代志军
袁哲明
柏连阳
机构
湖南农业大学湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室
生物安全科学技术学院
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012年第11期2526-2531,共6页
基金
湖南省杰出青年科学基金(批准号:10JJ1005)
公益性行业(农业)科研专项基金(批准号:201303029-8)
湖南省2011年财政厅项目(批准号:62020411074)资助
文摘
从整体上考虑多肽一级结构,提出了3种仅基于多肽氨基酸序列、计算简便、适于不等长肽和可捕获多肽上下文关联特征的多肽新描述子,即地统计学关联(GS-AA531)描述子、多尺度组分与关联(MSCC)描述子和地统计学关联与多尺度组分(GS-AA531-MSC)描述子.将其应用于2个抗菌肽体系(等长肽与不等长肽)的结构表征,并以支持向量回归建立QSAM模型.模型的拟合、留一法及独立测试结果表明,结合特征筛选的新描述子GS-AA531与GS-AA531-MSC的预测精度明显稳定且优于其它参比描述子,在多肽QSAM研究中具有广泛应用前景.
关键词
结构表征
定量序效模型
抗菌肽
支持向量回归
特征筛选
Keywords
Structural characterization
Quantitative sequence-activity model
Antimicrobial peptide
Supportvector regression
Feature screening
分类号
O641 [理学—物理化学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
基于高维特征非线性筛选的HLA-A*0201限制性CTL表位预测
被引量：
2
3
作者
韩娜
袁哲明
陈渊
代志军
王志明
机构
湖南农业大学
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2013年第9期1945-1953,共9页
基金
湖南省杰出青年科学基金(10JJ1005)
教育部博士点基金(20124320110002)项目资助~~
文摘
高活性细胞毒T细胞(CTL)表位鉴定是设计肿瘤疫苗的关键内容.采用天然氨基酸的531个物理化学性质参数表征HLA-A*0201限制性表位9肽,从531×9个初始描述子出发,经二元矩阵重排过滤器粗筛和多轮末尾淘汰精细筛选,获得18个物理化学意义明确的保留描述子.18个保留描述子主要涉及除1位、5位外各位置残基的疏水性和空间结构特征,3位残基疏水性对活性影响最大,且2位、4位、9位残基共占10个保留描述子,支持2位和9位残基为锚点、3位为关键位点以及4位残基为标志链的现有认知.对18个保留描述子以支持向量回归构建定量序效模型,其拟合、留一法交叉验证决定系数R^2、Q_(cv)~2分别为0.957、0.708;独立预测决定系数及均方根误差Q_(ext)~2、RMSE_(ext)分别为0.818、0.366,明显优于文献报道.通过对全组合虚拟9肽的预测,得到了多条预测活性高于已知表位肽的9肽,可供实验验证.较全面阐明了特定位置残基对多肽亲和性的影响规律,为高活性多肽疫苗分子设计提供了切实指导.
关键词
抗原肽
定量序效模型
高维特征
支持向量回归
多肽疫苗
Keywords
Antigenic peptide
Quantitative sequence activity model
High-dimensional descriptor
Support vector regression
Peptide vaccine
分类号
R392.1 [医药卫生—免疫学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
核酸与分子建模及结构表达启动子强度预测
李波
仇亮加
李劲为
叶楠
李志良
《重庆大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2003
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
多肽一级结构表征与抗菌肽QSAM建模
苏满秀
王立峰
代志军
袁哲明
柏连阳
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
基于高维特征非线性筛选的HLA-A*0201限制性CTL表位预测
韩娜
袁哲明
陈渊
代志军
王志明
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2013
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
