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题名利用宏病毒组学对鹅痛风病原的鉴定
被引量：4
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作者
王安平
郝福星
张硕
谢军
刘莉
朱善元
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机构
江苏农牧科技职业学院
江苏海洋大学食品科学与工程学院
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出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2021年第12期4661-4670,共10页
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基金
江苏省农业科技自主创新项目(CX(18)1004)
江苏省现代农业产业技术体系集成创新中心(JATS[2020]345)
+1 种基金
江苏高校“青蓝工程”(苏教师函[2020]10号)
江苏省高等学校自然科学研究重大项目(18KJA230001)。
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文摘
为确定2020年江苏盐城一鹅场雏鹅痛风的病原,试验对病料样品进行宏病毒组测序,通过比对分析原始数据发现疑似病原;通过从头组装获得其全基因组序列,并进行相似性比对和遗传进化分析;通过对疑似病毒的分离、鉴定和动物回归试验进行验证。宏病毒组学测序结果显示,在获得的全部599733条原始读长(reads)中,病毒reads有278593条,其中鹅星状病毒序列占95%,未发现其他疑似病毒序列;经从头组装获得了一条完整的鹅星状病毒全基因组序列,命名为YC20,该病毒基因组全长7137 nt,GenBank登录号为:MW536497,基因组结构及特征与其他星状病毒相同。全基因组序列相似性比对结果显示,YC20与新型鹅星状病毒SD01相似性最高,达98.2%;遗传进化分析结果显示,YC20与其他新型鹅星状病毒在同一分支,属于新型鹅星状病毒。禽胚分离结果显示,用鹅胚进行病原分离时,前3代次未出现死亡,第5代次后,可对鹅胚100%致死,而用SPF鸡胚或SPF鸭胚分离病原时,均未出现病变或死亡,PCR检测亦为阴性;纯化的尿囊液经负染后,电镜下可见大小约25 nm的病毒粒子。雏鹅回归试验结果显示,YC20接种3日龄雏鹅后,第6~8天出现死亡高峰期,死亡率为58.3%,剖检死亡鹅可见心脏、肝脏表面覆盖一层白色包膜,膝关节有大量白色颗粒样沉淀,肾脏充血肿大。以上结果说明,该鹅场痛风的病原为新型鹅星状病毒。本研究将宏病毒组学与传统的病毒分离鉴定技术相结合,证实了鹅痛风的病原,对病原的鉴定和研究具有指导意义。
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关键词
痛风
鹅星状病毒
宏病毒组学
分离
鉴定
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Keywords
gout
Goose astrovirus
viral metagenomics
isolation
identification
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分类号
S852.657
[农业科学—基础兽医学]
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