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水生生物环境DNA监测技术的发展、应用与标准化
被引量：
15
1
作者
谷思雨
陈凯
+13 位作者
金小伟
李文攀
陈晓飞
熊晶
汤敏喆
姜传奇
熊杰
李涛
张琪
崔永德
曾宏辉
何舜平
王业耀
缪炜
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期1443-1458,共16页
水生态系统是保障国家生态安全的重要基础。水生生物在水生态系统中扮演着核心角色,是研究水体演变的重要依据,是维护水生态健康的关键。传统水生生物调查和监测通常采用形态学方法,但其存在专业知识要求高、难以标准化和自动化及费时...
水生态系统是保障国家生态安全的重要基础。水生生物在水生态系统中扮演着核心角色,是研究水体演变的重要依据,是维护水生态健康的关键。传统水生生物调查和监测通常采用形态学方法,但其存在专业知识要求高、难以标准化和自动化及费时耗力等缺陷。环境DNA(Environmental DNA,简称eDNA)技术是一种通过监测环境中存在的DNA片段来识别特定生物物种的方法,可以实现基于水体中DNA分子进行水生生物的鉴定和监测,为水生生物的常态化监测提供了一个准确、便捷、可标准化和自动化实施的方案。文章介绍了eDNA技术的基本原理,总结回顾了eDNA技术从萌芽到广泛科研应用的发展历史和过程,介绍了基于eDNA的宏条形码和宏基因组等各类水生生物鉴定监测技术;阐述了eDNA技术在保护种、入侵种及生物类群监测和水生态评估等各领域的应用;分析了eDNA技术当前面临的物种参考序列数据库不完善等各类挑战;提出了通过优化完善数据库、样品采集方法、评价指标和参数、样品保藏、数据分析和存储等来推动eDNA技术标准化和自动化,以解决当前面临的挑战。同时,基于eDNA技术当前的发展阶段,提出了在我国水体结合专业形态分类鉴定开展水生生物eDNA技术标准化监测的实施建议。
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关键词
环境DNA
技术
标准化
水生生物监
测
宏条形码测序技术
宏
基因组
测
序
技术
eDNA数据库
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职称材料
题名
水生生物环境DNA监测技术的发展、应用与标准化
被引量：
15
1
作者
谷思雨
陈凯
金小伟
李文攀
陈晓飞
熊晶
汤敏喆
姜传奇
熊杰
李涛
张琪
崔永德
曾宏辉
何舜平
王业耀
缪炜
机构
中国科学院水生生物研究所
中国环境监测总站
湖北省生态环境科学研究院
湖北省生态环境监测中心站
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期1443-1458,共16页
基金
科技基础资源调查专项(2022FY100400)
第三次新疆综合科学考察项目(2021xjkk0604)
国家自然科学基金(U22A20454)资助。
文摘
水生态系统是保障国家生态安全的重要基础。水生生物在水生态系统中扮演着核心角色,是研究水体演变的重要依据,是维护水生态健康的关键。传统水生生物调查和监测通常采用形态学方法,但其存在专业知识要求高、难以标准化和自动化及费时耗力等缺陷。环境DNA(Environmental DNA,简称eDNA)技术是一种通过监测环境中存在的DNA片段来识别特定生物物种的方法,可以实现基于水体中DNA分子进行水生生物的鉴定和监测,为水生生物的常态化监测提供了一个准确、便捷、可标准化和自动化实施的方案。文章介绍了eDNA技术的基本原理,总结回顾了eDNA技术从萌芽到广泛科研应用的发展历史和过程,介绍了基于eDNA的宏条形码和宏基因组等各类水生生物鉴定监测技术;阐述了eDNA技术在保护种、入侵种及生物类群监测和水生态评估等各领域的应用;分析了eDNA技术当前面临的物种参考序列数据库不完善等各类挑战;提出了通过优化完善数据库、样品采集方法、评价指标和参数、样品保藏、数据分析和存储等来推动eDNA技术标准化和自动化,以解决当前面临的挑战。同时,基于eDNA技术当前的发展阶段,提出了在我国水体结合专业形态分类鉴定开展水生生物eDNA技术标准化监测的实施建议。
关键词
环境DNA
技术
标准化
水生生物监
测
宏条形码测序技术
宏
基因组
测
序
技术
eDNA数据库
Keywords
Environmental DNA technology
Standardization
Aquatic organism monitoring
Metabarcoding sequencing technology
Metagenomic sequencing technology
eDNA database
分类号
S932 [农业科学—渔业资源]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
水生生物环境DNA监测技术的发展、应用与标准化
谷思雨
陈凯
金小伟
李文攀
陈晓飞
熊晶
汤敏喆
姜传奇
熊杰
李涛
张琪
崔永德
曾宏辉
何舜平
王业耀
缪炜
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
15
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