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脱氮系统中全程硝化菌的基因组库构建及特性
1
作者
许少怡
逯慧杰
《中国环境科学》
北大核心
2025年第8期4225-4234,共10页
通过构建全程硝化菌基因组库,定量分析城镇污水脱氮系统,饮用水处理系统等56个不同水处理系统中全程硝化菌基因组的丰度和多样性特性差异,结合统计分析分布影响因子,解析作用机制.结果表明,被调研的城镇污水脱氮系统中全程硝化菌在氨氧...
通过构建全程硝化菌基因组库,定量分析城镇污水脱氮系统,饮用水处理系统等56个不同水处理系统中全程硝化菌基因组的丰度和多样性特性差异,结合统计分析分布影响因子,解析作用机制.结果表明,被调研的城镇污水脱氮系统中全程硝化菌在氨氧化群落占8.2%~99.6%,在Nitrospira群落中占1.4%~48.6%.系统发育分析表明城镇污水脱氮系统的全程硝化菌拼接基因组与Ca.Nitrospira nitrosa基因组系统发育距离较近,核苷酸相似度高于94%,且群落均匀度高于饮用水处理系统,推测Ca.Nitrospira nitrosa种群对城镇污水脱氮系统具有特定的适应能力.相关性分析表明,pH值和COD分别与全程硝化菌的分布显著正相关和负相关,且全程硝化菌在中低浓度NH_(4)^(+),高污泥停留时间,低溶解氧等环境下更易成为优势硝化菌.研究揭示了城镇污水脱氮系统中的优势全程硝化菌Ca.Nitrospira nitrosa及其分布影响因子.
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关键词
城镇污水脱氮系统
全程硝化菌
Ca.Nitrospira
nitrosa
宏基因组组装
基因组
影响因子
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职称材料
基于宏基因组分箱方法揭示房县黄酒加工用小曲中微生物多样性
被引量：
4
2
作者
王玉荣
李文鹏
+4 位作者
蔡文超
刘慧杰
余海燕
侯强川
郭壮
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期209-214,共6页
该研究以房县黄酒加工用小曲为研究对象,使用宏基因组分箱(Binning)技术对其微生物多样性进行解析。在每个样本平均获得148458867条高质量序列,平均测序量为20.74 Gb的基础上发现,硬壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和子...
该研究以房县黄酒加工用小曲为研究对象,使用宏基因组分箱(Binning)技术对其微生物多样性进行解析。在每个样本平均获得148458867条高质量序列,平均测序量为20.74 Gb的基础上发现,硬壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和子囊菌门(Ascomycota)为房县黄酒加工用小曲中的优势菌门,累计占比为99.06%;而戊糖片球菌(Pediococcus pentosaceus,24.04%)、食窦魏斯氏菌(Weissella cibaria,18.86%)和融合魏斯氏菌(Weissella confusa,16.15%)等菌种为优势种。该研究通过宏基因组Binning技术从宏基因组序列中共获得8个高质量的宏基因组组装基因组(metagenome assembly genomes,MAGs),分别隶属于硬壁菌门下的5个菌属。此外,通过ANI(average nucleotide identity)分析从高质量MAGs中发现两个疑似的新物种,分别为Weissella sp.和乳杆菌(Lactobacillus sp.)。基因功能注释结果表明,Lactobacillus sp.具有较高的碳水化合物运输和代谢能力,并含有许多独有的碳水化合物运输和代谢基因,可能促进房县黄酒的发酵进程。由此可见,在后续研究中对房县黄酒加工用小曲中蕴含的微生物资源进行挖掘是极为必要的。
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关键词
房县
黄酒曲
宏
基因组
宏基因组组装
微生物多样性
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职称材料
题名
脱氮系统中全程硝化菌的基因组库构建及特性
1
作者
许少怡
逯慧杰
机构
浙江大学环境与资源学院
江苏省城镇供水安全保障中心
出处
《中国环境科学》
北大核心
2025年第8期4225-4234,共10页
基金
浙江省领雁研发攻关计划资助(2022C03075)。
文摘
通过构建全程硝化菌基因组库,定量分析城镇污水脱氮系统,饮用水处理系统等56个不同水处理系统中全程硝化菌基因组的丰度和多样性特性差异,结合统计分析分布影响因子,解析作用机制.结果表明,被调研的城镇污水脱氮系统中全程硝化菌在氨氧化群落占8.2%~99.6%,在Nitrospira群落中占1.4%~48.6%.系统发育分析表明城镇污水脱氮系统的全程硝化菌拼接基因组与Ca.Nitrospira nitrosa基因组系统发育距离较近,核苷酸相似度高于94%,且群落均匀度高于饮用水处理系统,推测Ca.Nitrospira nitrosa种群对城镇污水脱氮系统具有特定的适应能力.相关性分析表明,pH值和COD分别与全程硝化菌的分布显著正相关和负相关,且全程硝化菌在中低浓度NH_(4)^(+),高污泥停留时间,低溶解氧等环境下更易成为优势硝化菌.研究揭示了城镇污水脱氮系统中的优势全程硝化菌Ca.Nitrospira nitrosa及其分布影响因子.
关键词
城镇污水脱氮系统
全程硝化菌
Ca.Nitrospira
nitrosa
宏基因组组装
基因组
影响因子
Keywords
urban wastewater nitrogen removal system
comammox bacteria
Ca.Nitrospira nitrosa
metagenome-assembled genomes
influencing factors
分类号
X703 [环境科学与工程—环境工程]
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职称材料
题名
基于宏基因组分箱方法揭示房县黄酒加工用小曲中微生物多样性
被引量：
4
2
作者
王玉荣
李文鹏
蔡文超
刘慧杰
余海燕
侯强川
郭壮
机构
湖北文理学院
湖北文理学院
北京忠和房县生物食品有限公司
湖北庐陵王酒业有限责任公司
出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期209-214,共6页
基金
湖北省教育厅科学技术研究重点项目(D20212601)
湖北文理学院教师科研能力培育基金“科技创新团队”(2020kypytd009)。
文摘
该研究以房县黄酒加工用小曲为研究对象,使用宏基因组分箱(Binning)技术对其微生物多样性进行解析。在每个样本平均获得148458867条高质量序列,平均测序量为20.74 Gb的基础上发现,硬壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和子囊菌门(Ascomycota)为房县黄酒加工用小曲中的优势菌门,累计占比为99.06%;而戊糖片球菌(Pediococcus pentosaceus,24.04%)、食窦魏斯氏菌(Weissella cibaria,18.86%)和融合魏斯氏菌(Weissella confusa,16.15%)等菌种为优势种。该研究通过宏基因组Binning技术从宏基因组序列中共获得8个高质量的宏基因组组装基因组(metagenome assembly genomes,MAGs),分别隶属于硬壁菌门下的5个菌属。此外,通过ANI(average nucleotide identity)分析从高质量MAGs中发现两个疑似的新物种,分别为Weissella sp.和乳杆菌(Lactobacillus sp.)。基因功能注释结果表明,Lactobacillus sp.具有较高的碳水化合物运输和代谢能力,并含有许多独有的碳水化合物运输和代谢基因,可能促进房县黄酒的发酵进程。由此可见,在后续研究中对房县黄酒加工用小曲中蕴含的微生物资源进行挖掘是极为必要的。
关键词
房县
黄酒曲
宏
基因组
宏基因组组装
微生物多样性
Keywords
Fangxian
Huangjiu Xiaoqu
metagenome
metagenome binning
microbial diversity
分类号
TS262.4 [轻工技术与工程—发酵工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
脱氮系统中全程硝化菌的基因组库构建及特性
许少怡
逯慧杰
《中国环境科学》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于宏基因组分箱方法揭示房县黄酒加工用小曲中微生物多样性
王玉荣
李文鹏
蔡文超
刘慧杰
余海燕
侯强川
郭壮
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2023
4
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职称材料
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