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南美白对虾肠道微生物宏基因组提取方法的比较
被引量：
3
1
作者
徐德峰
李彩虹
+2 位作者
孙力军
王雅玲
叶日英
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第12期119-122,共4页
为获得高质量南美白对虾肠道微生物宏基因组模板,采用传统CTAB法、试剂盒和仪器法提取南美白对虾(Penaeus Vanmamei,P.vannamei)肠道微生物宏基因组,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法和V3区16S rDNA扩增检测所得基因组的完整性、得...
为获得高质量南美白对虾肠道微生物宏基因组模板,采用传统CTAB法、试剂盒和仪器法提取南美白对虾(Penaeus Vanmamei,P.vannamei)肠道微生物宏基因组,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法和V3区16S rDNA扩增检测所得基因组的完整性、得率、纯度和目的片段质量。结果表明3种方法提取得到的DNA结构均较完整,但得率和纯度差别较大,传统CTAB法提取的DNA得率和纯度均试剂盒和仪器法高,试剂盒和仪器法受糖和盐类污染较高,3种方法提取的宏基因组均可特异扩增出V3区保守片段。综合比较得知传统CTAB法提取P.Vanmamei肠道微生物基因组在完整性、得率和纯度方面优于其他两种方法,可为后续分子生物学分析提供良好基因组模板。
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关键词
南美白对虾
肠道微生物
宏基因组提取
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题名
南美白对虾肠道微生物宏基因组提取方法的比较
被引量：
3
1
作者
徐德峰
李彩虹
孙力军
王雅玲
叶日英
机构
广东省水产品加工与安全重点实验室广东海洋大学食品科技学院
广东医学院生物化学与分子生物学教研室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第12期119-122,共4页
基金
国家自然科学基金项目(31201309
31171634)
+1 种基金
十二五国家支撑计划项目(2012BAD29B06)
湛江市科技计划项目(2011D02)
文摘
为获得高质量南美白对虾肠道微生物宏基因组模板,采用传统CTAB法、试剂盒和仪器法提取南美白对虾(Penaeus Vanmamei,P.vannamei)肠道微生物宏基因组,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法和V3区16S rDNA扩增检测所得基因组的完整性、得率、纯度和目的片段质量。结果表明3种方法提取得到的DNA结构均较完整,但得率和纯度差别较大,传统CTAB法提取的DNA得率和纯度均试剂盒和仪器法高,试剂盒和仪器法受糖和盐类污染较高,3种方法提取的宏基因组均可特异扩增出V3区保守片段。综合比较得知传统CTAB法提取P.Vanmamei肠道微生物基因组在完整性、得率和纯度方面优于其他两种方法,可为后续分子生物学分析提供良好基因组模板。
关键词
南美白对虾
肠道微生物
宏基因组提取
Keywords
P. vannamei Intestinal microflora Genomic DNA extraction
分类号
S968.22 [农业科学—水产养殖]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
南美白对虾肠道微生物宏基因组提取方法的比较
徐德峰
李彩虹
孙力军
王雅玲
叶日英
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
3
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