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济南口岸输入性蜚蠊携带病原体宏基因组分析: 1; 作者赵辉辛国辉 +5 位作者闫荣军韩焕美张春新厉淑红彭健宗春辉《口岸卫生控制》 2024年第1期56-58,共3页; 目的探讨利用宏基因组分析为济南口岸防控输入性蜚蠊传播疾病提供技术支持。方法选取2022年至2023年6月间济南海关辖区截获送检的623只蜚蠊作为研究对象。每批次40~50只为一组制作成体表样本和组织样本。对样本进行霍乱弧菌、沙门氏菌... 展开更多; 关键词宏基因组分析输入性蜚蠊病原体; 在线阅读下载PDF 职称材料

宏基因组技术诊断亲内皮疱疹病毒感染致濒危亚洲象死亡病例: 2; 作者沈青春仉伟 +12 位作者刘青刘一朵钱佳豪张博源周师众张宜宸幸倩如丁家波周向梅张广智李秋辰李伟范学政《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期2569-2577,共9页; 本研究旨在借助宏基因组测序分析技术快速发现引起濒危亚洲象死亡的可能病原,再结合常规诊断技术,对大象病因进行分析和确诊,为大象相关疫病的快速诊断和预防提供参考。对死亡大象进行尸检,取心、肝、脾、肺、肾、淋巴结、肌肉、胃、十... 展开更多; 关键词亚洲象亲内皮疱疹病毒宏基因组分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

中央山岛“动物-环境-人”微生物菌群组成及其耐药基因分布: 3; 作者王琳赵格 +9 位作者律娜高玉斌王娟刘娜黄秀梅赵建梅陆明哲刘俊辉曲志娜王君玮《中国动物检疫》 2025年第1期35-43,共9页; 为了解自然状态下“动物-环境-人”微生物菌群结构及其耐药性,2022—2023年采集中央山岛动物、环境、人源样品共75份,应用宏基因组测序分析技术,分析3类样品的微生物菌群组成及其耐药基因分布情况。结果显示;环境和动物源样品中微生物... 展开更多; 关键词细菌耐药微生物菌群宏基因组测序分析中央山岛 One Health; 在线阅读下载PDF 职称材料

赵庄矿区煤层水产气菌群计数和物种分类分析被引量：5: 4; 作者宋燕莉《能源与节能》 2016年第11期51-53,共3页; 对沁水南部赵庄矿区煤层水菌群进行研究,对矿区内部5口煤层气井排采水样做MPN计数培养和提取水样DNA做宏基因分析。得出发酵细菌、硫酸盐还原菌、甲烷菌等几种产气相关菌群的数量,详细了解菌群多样性并分析其在产气中的作用,为该地区开... 展开更多; 关键词水样 MPN计数 DNA提取宏基因组分析主要菌群作用; 在线阅读下载PDF 职称材料

大黄鱼养殖海域沉积物中抗生素抗性基因分布特征及其影响因素被引量：1: 5; 作者黄薇刘洋 +4 位作者饶秋华罗钦王为刚宋永康罗土炎《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期197-208,共12页; 为揭示大黄鱼养殖海域沉积物中抗生素抗性基因(Antibiotic resistance genes,ARGs)的赋存特征及其影响因素,本研究通过野外调查采集了6个站点的大黄鱼养殖海域沉积物样品,利用宏基因组测序分析技术解析沉积物中ARGs的分布特征,同时运用... 展开更多; 关键词抗生素抗性基因宏基因组测序分析技术大黄鱼养殖海域沉积物微生物群落; 在线阅读下载PDF 职称材料

食醋中有害微生物的分离与鉴定被引量：8: 6; 作者曹晋宜赵红年 +1 位作者赵凌雁惠美星《中国酿造》 CAS 北大核心 2017年第2期115-118,共4页; 该研究对发粘食醋与正常食醋中感官指标、理化指标、香气组成进行了对比分析,采用传统培养与16S rDNA序列同源性分析方法对食醋中的有害微生物进行了分离鉴定,同时采用微生物宏基因组分类测序的方法对发粘食醋中的微生物群落结构进行了... 展开更多; 关键词食醋宏基因组分析分离鉴定牛痘乳杆菌; 在线阅读下载PDF 职称材料

初始含水率和菌群演替在雪茄烟叶发酵产香中的作用被引量：3: 7; 作者宋雯陈曦 +3 位作者余君胡路路陈雄王志《湖南农业科学》 2023年第7期82-88,共7页; 以雪茄CX-14烟叶为材料,研究了初始含水率(30%、34%、38%)对雪茄烟叶发酵产香的影响,并通过宏基因组测序技术明确了雪茄烟叶的菌群结构及功能基因变化,分析了优势菌属在发酵过程中的贡献度,探明了菌群演替与雪茄烟叶香气产量变化的相关... 展开更多; 关键词雪茄烟叶初始含水率香气成分宏基因组分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名济南口岸输入性蜚蠊携带病原体宏基因组分析: 1; 作者赵辉辛国辉闫荣军韩焕美张春新厉淑红彭健宗春辉; 机构济南国际旅行卫生保健中心济南海关; 出处《口岸卫生控制》 2024年第1期56-58,共3页; 基金海关总署科研计划项目(2021HK139) 山东省重点研发计划(重大科技创新工程)(2021CXGC11306)。; 文摘目的探讨利用宏基因组分析为济南口岸防控输入性蜚蠊传播疾病提供技术支持。方法选取2022年至2023年6月间济南海关辖区截获送检的623只蜚蠊作为研究对象。每批次40~50只为一组制作成体表样本和组织样本。对样本进行霍乱弧菌、沙门氏菌、志贺氏菌、诺如病毒多重PCR扩增;采用宏基因组测序对蜚蠊携带病原体进行监测分析。结果623只蜚蠊经鉴定均为德国小蠊;霍乱弧菌、沙门氏菌、志贺氏菌、诺如病毒PCR检测均为阴性;15组蜚蠊样本中通过宏基因组检测出蟑螂杆状体细菌、大肠埃希菌、肠球菌属、不动杆菌属、魏斯氏菌属、变形杆菌、克雷伯菌属等多种细菌。结论病原体宏基因组分析可以检出蜚蠊携带的多种病原体,且在大肠杆菌检出方面,灵敏度优于PCR检测技术,口岸需加强蜚蠊监控,及时拦截。; 关键词宏基因组分析输入性蜚蠊病原体; Keywords Metagenomics analysis Intercepted cockroaches Pathogens; 分类号 R384.9 [医药卫生—医学寄生虫学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名宏基因组技术诊断亲内皮疱疹病毒感染致濒危亚洲象死亡病例: 2; 作者沈青春仉伟刘青刘一朵钱佳豪张博源周师众张宜宸幸倩如丁家波周向梅张广智李秋辰李伟范学政; 机构中国农业科学院北京畜牧兽医研究所济南市公园发展服务中心中国农业大学动物医学院; 出处《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期2569-2577,共9页; 基金重大外来动物疫病阻断与防控技术研发项目(2022YFD1800500)。; 文摘本研究旨在借助宏基因组测序分析技术快速发现引起濒危亚洲象死亡的可能病原,再结合常规诊断技术,对大象病因进行分析和确诊,为大象相关疫病的快速诊断和预防提供参考。对死亡大象进行尸检,取心、肝、脾、肺、肾、淋巴结、肌肉、胃、十二指肠、空肠、结肠、盲肠、胰腺等器官制备切片,进行HE染色和病理分析;取腹股沟淋巴结进行宏基因组测序分析;使用特异性PCR方法对特征基因进行扩增和测序,经序列比对绘制进化树,分析其与其他毒株的进化关系。结果显示,死亡大象的剖检和病例切片结果符合象亲内皮疱疹病毒感染的特征,宏基因组分析结果显示,大象的腹股沟淋巴结中含有大量的象β疱疹病毒1型(即亲内皮疱疹病毒)。该大象死亡的原因可能是象亲内皮疱疹病毒感染所致,宏基因组技术对大象亲内皮疱疹病毒感染以及其他濒危动物病例的快速诊断具有良好的应用前景。; 关键词亚洲象亲内皮疱疹病毒宏基因组分析; Keywords Asian elephant endothelial herpesvirus metagenomic analysis; 分类号 S858.93 [农业科学—临床兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名中央山岛“动物-环境-人”微生物菌群组成及其耐药基因分布: 3; 作者王琳赵格律娜高玉斌王娟刘娜黄秀梅赵建梅陆明哲刘俊辉曲志娜王君玮; 机构中国动物卫生与流行病学中心中国科学院微生物研究所; 出处《中国动物检疫》 2025年第1期35-43,共9页; 基金中国动物卫生与流行病学中心创新基金项目(DW2021018)。; 文摘为了解自然状态下“动物-环境-人”微生物菌群结构及其耐药性,2022—2023年采集中央山岛动物、环境、人源样品共75份,应用宏基因组测序分析技术,分析3类样品的微生物菌群组成及其耐药基因分布情况。结果显示;环境和动物源样品中微生物菌群物种数量较多,人源样品中菌群物种数量最少;环境源样品中微生物菌群多样性、均匀度均高于动物和人源样品。环境源样品(空气、水体、土壤和滩涂)中的菌群组成较相似,以变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)为优势菌;动物和人源样品中的菌群组成较相似,以拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)为优势菌;各类样品的优势菌在冬夏两季占比不同。聚类分析发现,土壤和滩涂样品的微生物群落结构最为相近,与水体、空气样品微生物群落结构较为相近,而与动物和人源样品的微生物群落结构较远。空气样品中微生物菌群耐药基因数量最多,多样性和均匀度最高;动物和人源样品的耐药基因多样性和均匀度高于水体、土壤和滩涂等环境样品。聚类分析发现,人源、动物源和空气样品间微生物菌群耐药基因距离较近,它们与水体和土壤样品距离较远。结果表明;中央山岛“动物-环境-人”微生物菌群物种丰富,不同界面组成不同,耐药基因种类和丰度各异。本研究从“动物-环境-人”的角度明晰了自然状态下中央山岛微生物菌群组成及其耐药现状,为后期深入探究细菌耐药发生,研究野鸟携带耐药菌溯源遗传演化和传播生态学机制提供了宝贵的背景信息。; 关键词细菌耐药微生物菌群宏基因组测序分析中央山岛 One Health; Keywords antibiotic resistance microbial community metagenome sequencing analysis Zhongyangshan Island One Health; 分类号 S851.3 [农业科学—预防兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名赵庄矿区煤层水产气菌群计数和物种分类分析被引量：5: 4; 作者宋燕莉; 机构河南理工大学资源环境学院煤与煤层气共采国家重点实验室; 出处《能源与节能》 2016年第11期51-53,共3页; 基金山西省煤层气联合基金项目(2013012015); 文摘对沁水南部赵庄矿区煤层水菌群进行研究,对矿区内部5口煤层气井排采水样做MPN计数培养和提取水样DNA做宏基因分析。得出发酵细菌、硫酸盐还原菌、甲烷菌等几种产气相关菌群的数量,详细了解菌群多样性并分析其在产气中的作用,为该地区开展生物模拟增气提供有力证据。; 关键词水样 MPN计数 DNA提取宏基因组分析主要菌群作用; Keywords water samples MPN counting DNA extraction metagenomic analysis main bacteria role; 分类号 TD8 [矿业工程—矿山开采]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名大黄鱼养殖海域沉积物中抗生素抗性基因分布特征及其影响因素被引量：1: 5; 作者黄薇刘洋饶秋华罗钦王为刚宋永康罗土炎; 机构福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所/福建省农产品质量安全重点实验室福建师范大学生命科学学院连江县水产技术推广站; 出处《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期197-208,共12页; 基金福建省属公益类科研院所基本科研专项(2020R1022009,2022R1022002) 福建省农业科学院科技项目(YC2019011,2022KF20,CXTD2021015-3)。; 文摘为揭示大黄鱼养殖海域沉积物中抗生素抗性基因(Antibiotic resistance genes,ARGs)的赋存特征及其影响因素,本研究通过野外调查采集了6个站点的大黄鱼养殖海域沉积物样品,利用宏基因组测序分析技术解析沉积物中ARGs的分布特征,同时运用化学分析技术和高通量测序技术对沉积物中的环境因子以及微生物群落结构进行分析,以进一步对ARGs与环境因子以及微生物群落结构的相关性进行研究。结果显示:大黄鱼养殖海域沉积物中共检出781个ARGs亚型,分属于38种抗生素抗性类型;不同站点的优势ARGs抗生素抗性类型基本一致,主要为四环素类、大环内酯类和氟喹诺酮类,引起细菌耐药性的主要机制为外排泵。进一步相关性分析结果显示,除PNGM-1与电导率和TN呈显著正相关(P<0.05)外,其余丰度前20的ARGs均与环境因子相关性不显著(P>0.05);而丰度前20的ARGs均与丰度前20的菌属呈显著或极显著相关关系(P<0.05或P<0.01)。研究表明,大黄鱼养殖海域沉积物中含有丰富的ARGs,微生物群落是影响沉积物中ARGs分布的重要因素。; 关键词抗生素抗性基因宏基因组测序分析技术大黄鱼养殖海域沉积物微生物群落; Keywords antibiotic resistance gene macro-genome sequencing analysis technology large yellow croaker culture area sediment microbial community; 分类号 X55 [环境科学与工程—环境工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名食醋中有害微生物的分离与鉴定被引量：8: 6; 作者曹晋宜赵红年赵凌雁惠美星; 机构山西梁汾醋业有限公司; 出处《中国酿造》 CAS 北大核心 2017年第2期115-118,共4页; 基金山西梁汾醋业有限公司专项基金(2015-03); 文摘该研究对发粘食醋与正常食醋中感官指标、理化指标、香气组成进行了对比分析,采用传统培养与16S rDNA序列同源性分析方法对食醋中的有害微生物进行了分离鉴定,同时采用微生物宏基因组分类测序的方法对发粘食醋中的微生物群落结构进行了初步地分析。结果表明,发粘食醋中总酸、乳酸、乙醇含量明显上升,还原糖、总酯、糠醛含量明显下降;引起食醋发粘的微生物主要是乳酸杆菌属中牛痘乳杆菌(Lactobacillus vaccinostercus)。; 关键词食醋宏基因组分析分离鉴定牛痘乳杆菌; Keywords vinegar metagenomic analysis isolation and identification Lactobacillus vaccinostercus; 分类号 Q393 [生物学—遗传学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名初始含水率和菌群演替在雪茄烟叶发酵产香中的作用被引量：3: 7; 作者宋雯陈曦余君胡路路陈雄王志; 机构湖北工业大学生物工程与食品学院湖北省烟草科学研究院; 出处《湖南农业科学》 2023年第7期82-88,共7页; 基金国家其他部委项目(110202001039)。; 文摘以雪茄CX-14烟叶为材料,研究了初始含水率(30%、34%、38%)对雪茄烟叶发酵产香的影响,并通过宏基因组测序技术明确了雪茄烟叶的菌群结构及功能基因变化,分析了优势菌属在发酵过程中的贡献度,探明了菌群演替与雪茄烟叶香气产量变化的相关规律。结果表明:当雪茄烟叶含水率回潮至34%时,发酵后的苯丙氨酸转化产物、类胡萝卜素降解产物、西柏烷类降解产物、棕色化反应产物含量和香气总量分别比发酵前提高了77.2%、167.1%、28.6%、51.5%和169.3%,香气总量分别比30%和38%含水率组提高了26.6%和21.7%;通过宏基因组学分析,发酵后葡萄球菌属(Staphylococcus)丰度占比高达87.8%,是绝对优势菌属,而且其对发酵过程中的次生代谢物生物合成、ABC转运蛋白、氨基酸生物合成等代谢过程的贡献度超过了85%;经发酵菌属与烟叶香型相关性分析,发现类胡萝卜素转化产物是香型的主要呈现者,而且葡萄球菌菌属在香型节点最突出,是呈现香型的最大贡献者。综上所述,雪茄烟叶发酵前的最适含水率为34%,发酵过程中葡萄球菌属对雪茄烟叶发酵的香气产量有显著促进作用。; 关键词雪茄烟叶初始含水率香气成分宏基因组分析; Keywords cigar tobacco leaves initial moisture content aroma components metagenomic analysis; 分类号 S482.4 [农业科学—农药学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	济南口岸输入性蜚蠊携带病原体宏基因组分析	赵辉辛国辉闫荣军韩焕美张春新厉淑红彭健宗春辉	《口岸卫生控制》	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	宏基因组技术诊断亲内皮疱疹病毒感染致濒危亚洲象死亡病例	沈青春仉伟刘青刘一朵钱佳豪张博源周师众张宜宸幸倩如丁家波周向梅张广智李秋辰李伟范学政	《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	中央山岛“动物-环境-人”微生物菌群组成及其耐药基因分布	王琳赵格律娜高玉斌王娟刘娜黄秀梅赵建梅陆明哲刘俊辉曲志娜王君玮	《中国动物检疫》	2025	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	赵庄矿区煤层水产气菌群计数和物种分类分析	宋燕莉	《能源与节能》	2016	5	在线阅读下载PDF 职称材料
5	大黄鱼养殖海域沉积物中抗生素抗性基因分布特征及其影响因素	黄薇刘洋饶秋华罗钦王为刚宋永康罗土炎	《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心	2023	1	在线阅读下载PDF 职称材料
6	食醋中有害微生物的分离与鉴定	曹晋宜赵红年赵凌雁惠美星	《中国酿造》 CAS 北大核心	2017	8	在线阅读下载PDF 职称材料
7	初始含水率和菌群演替在雪茄烟叶发酵产香中的作用	宋雯陈曦余君胡路路陈雄王志	《湖南农业科学》	2023	3	在线阅读下载PDF 职称材料