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宏基因组二代测序技术在淋巴结结核诊断中的应用价值
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作者 林婷 俞跃辉 +4 位作者 罗佳磊 颜心怡 黄向韵 张莹 杨高怡 《浙江临床医学》 2025年第3期427-428,共2页
目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在淋巴结结核诊断中的应用价值。方法选取2022年10月至2023年7月颈部淋巴结肿大并疑似淋巴结结核患者80例,在超声引导下对肿大淋巴结进行穿刺,对组织分别进行培养、Xpert检测,mNGS,以病理诊断为金标准,... 目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在淋巴结结核诊断中的应用价值。方法选取2022年10月至2023年7月颈部淋巴结肿大并疑似淋巴结结核患者80例,在超声引导下对肿大淋巴结进行穿刺,对组织分别进行培养、Xpert检测,mNGS,以病理诊断为金标准,比较三种检测方法的敏感度、特异度、阴性预测值、阳性预测值。结果根据临床诊断标准明确感染为淋巴结结核61例,非淋巴结结核15例,诊断不明4例。以临床诊断结果为标准,mNGS、常规培养和Xpert检测诊断淋巴结结核的敏感度分别为86.9%、39.3%、62.2%,阴性预测值分别为65.2%、28.8%、39.4%,阳性预测值及特异性均为100%。mNGS敏感度高于Xpert检测和培养(P<0.05)。结论相比于传统病原体检测方式,mNGS诊断淋巴结结核敏感度更高,能检测到其他潜在病原微生物。mNGS对淋巴结结核疑似病例快速诊断具有潜在有效性。 展开更多
关键词 淋巴结 结核 宏基因组二代测序
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肺泡灌洗液快速现场评价联合宏基因组二代测序在重症肺炎患者中的应用价值
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作者 刘亚萌 李冠英 +3 位作者 刘翠 朱劲松 张胜利 梁希军 《临床误诊误治》 2025年第1期45-49,共5页
目的探讨肺泡灌洗液快速现场评价(ROSE)联合宏基因组二代测序(mNGS)在重症肺炎患者中的应用价值。方法筛选2021年10月至2024年4月治疗的94例重症肺炎患者进行前瞻性研究,随机分为对照组(常规病原学检查)47例与观察组(ROSE联合mNGS技术... 目的探讨肺泡灌洗液快速现场评价(ROSE)联合宏基因组二代测序(mNGS)在重症肺炎患者中的应用价值。方法筛选2021年10月至2024年4月治疗的94例重症肺炎患者进行前瞻性研究,随机分为对照组(常规病原学检查)47例与观察组(ROSE联合mNGS技术进行病原学检查)47例,均给予抗生素治疗。记录2组肺泡灌洗液有效病原体检出率、抗生素应用情况、发热时间、机械通气时间、住重症监护室时间,比较2组入院第1、4、7天临床肺部感染评分(CPIS)以及血清C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)水平。结果观察组肺泡灌洗液有效病原体检出率为97.87%(46/47),高于对照组的59.57%(28/47,P<0.05),且观察组可检出病毒及不常见病原体(如鹦鹉热衣原体、结核分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌)。与对照组比较,观察组抗生素使用时间、发热时间、机械通气时间、住重症监护室时间均较短,抗生素使用种类及调整频次较少(P<0.05)。2组入院第4、7天CPIS及血清CRP、PCT水平均较入院第1天降低,且随着治疗时间的增加而降低(P<0.05);与对照组比较,观察组入院第4、7天CPIS及外周血CRP、PCT水平均降低(P<0.05)。结论ROSE联合mNGS技术在重症肺炎患者中有较高的应用价值,可提高病原学检出率,及时明确病原体,从而快速指导临床精准治疗。 展开更多
关键词 重症肺炎 快速现场评价 宏基因组二代测序 病原体 肺泡灌洗液 临床肺部感染评分 C反应蛋白 降钙素原
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宏基因组二代测序在儿童中枢神经系统感染中的应用价值
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作者 南在元 冯德琳 +1 位作者 王春雨 石佳慧 《中国医药科学》 2025年第2期8-11,共4页
目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在儿童中枢神经系统感染中的价值。方法选择2023年1月至2024年5月首都医科大学附属北京儿童医院黑龙江医院收治的45例疑似中枢神经系统感染的患儿,收集脑脊液6 ml,分别进行mNGS与常规检测后进行比较。结... 目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在儿童中枢神经系统感染中的价值。方法选择2023年1月至2024年5月首都医科大学附属北京儿童医院黑龙江医院收治的45例疑似中枢神经系统感染的患儿,收集脑脊液6 ml,分别进行mNGS与常规检测后进行比较。结果经过mNGS技术检测,成功识别出共计26例可疑病原体,同时,脑脊液微生物培养技术检测出3例疑似存在的可疑病原体。在诊断中枢神经系统感染性疾病方面,mNGS组的灵敏度、准确度以及阴性预测值均高于微生物培养组,差异有统计学意义(P<0.05),而mNGS组的特异度及阳性预测值方面均相近于微生物培养组,差异无统计学意义(P>0.05)。结论在评估儿童中枢神经系统感染的诊断时,相较于脑脊液微生物培养检查,mNGS的优势显著,但仍应结合多种检验方法综合判断,以达到准确判断的目的。 展开更多
关键词 儿童 宏基因组二代测序 感染 中枢神经系统
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宏基因组二代测序在骨关节感染病原学诊断中的应用价值
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作者 宋燕华 周子博 闫亚芳 《河南医学研究》 CAS 2024年第24期4471-4474,共4页
目的 分析宏基因组二代测序(mNGS)在骨关节感染病原学诊断中的应用价值。方法 将郑州市骨科医院2020年4月至2023年4月收治的63例疑似骨关节感染患者作为研究对象。均行传统培养法、mNGS检测,以临床综合诊断结果为“金标准”,统计传统培... 目的 分析宏基因组二代测序(mNGS)在骨关节感染病原学诊断中的应用价值。方法 将郑州市骨科医院2020年4月至2023年4月收治的63例疑似骨关节感染患者作为研究对象。均行传统培养法、mNGS检测,以临床综合诊断结果为“金标准”,统计传统培养法、mNGS检测骨关节感染的检测结果和检测灵敏度;比较传统培养法、mNGS检测方法鉴定病原菌类型的结果;比较骨关节感染患者不同治疗方案治疗前和治疗后白细胞计数(WBC)、红细胞沉降率(ESR)、C反应蛋白(CRP)变化。结果 63例疑似骨关节感染患者,临床综合诊断确诊阳性41例、阴性22例;传统培养法培养出真阳性25例、真阴性19例;采用mNGS检测出真阳性34例,真阴性20例。mNGS检测灵敏度[82.93%(34/41)]高于传统培养法[60.98%(25/41)](P<0.05)。传统培养法培养出43株病原菌,mNGS检测出51株病原菌,均以金黄色葡萄球菌、凝固酶阴性葡萄球菌为主,其次为阴沟肠杆菌、肠球菌、布氏杆菌、链球菌、结核分枝杆菌。基于mNGS结果的靶向治疗方案治疗后WBC、ESR、CRP水平低于经验性治疗方案(P<0.05)。结论 mNGS检测应用于骨关节感染病原学诊断中,可提高诊断灵敏度,准确鉴定感染病原菌类型,有利于提高抗感染治疗效果。 展开更多
关键词 骨关节感染 宏基因组二代测序 病原学
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宏基因组二代测序和细胞因子在PD相关腹膜炎早期诊断中的应用 被引量:1
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作者 何萌萌 符姣 +3 位作者 姚玲 邵小淇 李楠 张培 《中国血液净化》 CSCD 2024年第5期351-355,共5页
目的探究宏基因组二代测序(metagenomic second-generation sequencing,mNGS)技术在早期检测腹膜透析相关腹膜炎(peritoneal dialysis-associated peritonitis,PDAP)患者细菌感染的病原学价值,了解不同细菌感染类型中细胞因子分布差异,... 目的探究宏基因组二代测序(metagenomic second-generation sequencing,mNGS)技术在早期检测腹膜透析相关腹膜炎(peritoneal dialysis-associated peritonitis,PDAP)患者细菌感染的病原学价值,了解不同细菌感染类型中细胞因子分布差异,构建相关风险预测模型。方法收集2020年4月─2023年4月就诊于安徽医科大学第一附属医院,符合国际腹膜透透协会(international society for peritoneal dialysis,ISPD)诊断标准的腹膜透析(peritoneal dialysis,PD)患者的临床资料,同时将其入院4小时内PD流出液送检mNGS检查及普通培养,并测定上清液中细胞因子水平,比较mNGS检测与实验室微生物培养病原学诊断结果,综合临床意义分为革兰氏阳性菌(G+菌)组、革兰氏阴性菌(G-菌)组和培养阴性(G0)组,比较2组细胞因子水平差异,确认危险因素并构建风险预测模型,同时进行效能检测。结果共50例PD相关腹膜炎患者纳入本研究,mNGS检测中41例患者检出病原体,检测阳性率高于微生物培养(χ^(2)=0.059,P=0.440),mNGS检测时间低于微生物培养(t=5.180,P<0.001)。多因素Logistics回归分析提示PD液中高白细胞介素(IL)10(OR=1.010,95%CI:1.000~1.020,P=0.024)、低IL-6(OR=0.620,95%CI:0.360~0.890,P=0.038)及高血清降钙素原(OR=1.200,95%CI:1.050~1.530,P=0.016)、低C反应蛋白水平(OR=1.014,95%CI:1.010~1.050,P=0.035)为PDAP预测G-菌感染的独立危险因素。ROC曲线及列线图结果显示上述炎症因子联合较单一因子对预测G-菌感染价值更大。结论mNGS在早期快速检测PDAP病原体方面显示了极大的诊断潜力,PD流出液中细胞因子IL-6、IL-10及血清降钙素原、C反应蛋白水平的整合提高了mNGS结果解释的精确度,依据细胞因子构建的风险预测模型可以较好区分不同种类细菌相关PDAP腹膜炎的患者。 展开更多
关键词 腹膜透析 腹膜炎 宏基因组二代测序 分子诊断标志物
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宏基因组二代测序在下呼吸道感染患者支气管肺泡灌洗液中的病原学诊断价值 被引量:5
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作者 程长昆 姜长舟 《安徽医学》 2024年第3期326-330,共5页
目的 比较下呼吸道感染患者支气管肺泡灌洗液(BALF)中病原菌的宏基因组二代测序(mNGS)和常规培养检测结果,分析mNGS检出阳性的影响因素和临床意义。方法 回顾性分析2020年4月至2023年3月安庆市望江县医院的130例下呼吸道感染患者的BALF... 目的 比较下呼吸道感染患者支气管肺泡灌洗液(BALF)中病原菌的宏基因组二代测序(mNGS)和常规培养检测结果,分析mNGS检出阳性的影响因素和临床意义。方法 回顾性分析2020年4月至2023年3月安庆市望江县医院的130例下呼吸道感染患者的BALF样本,进行mNGS和常规培养检测,比较2种方法的阳性率、病原体分布和一致性,分析mNGS检出阳性与患者临床指标和预后的关系。结果 mNGS检出阳性率为76.9%,常规培养检测阳性率为43.1%,差异有统计学意义(P<0.05)。mNGS能够检测出更多种类的病原菌,主要为革兰阴性杆菌、真菌和非典型病原体。mNGS与常规培养检测结果在细菌、真菌和非典型病原体方面具有中等一致性,在病毒和寄生虫方面具有较低一致性。mNGS检出阳性与患者年龄、基础疾病、外周血白细胞和C反应蛋白等因素相关,是影响mNGS检出阳性的危险因素。结论 mNGS在下呼吸道感染患者BALF中的病原学诊断优于常规培养检测,能检测出更多和更广的病原菌,有助于下呼吸道感染患者临床合理用药和改善患者预后。 展开更多
关键词 下呼吸道感染 支气管肺泡灌洗液 宏基因组二代测序 病原学诊断
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1例鹦鹉热衣原体肺炎的宏基因组二代测序诊断及治疗
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作者 罗干 黄志文 《山东医药》 CAS 2024年第33期71-73,共3页
目的总结鹦鹉热衣原体肺炎的有效诊断及治疗方法。方法对1例鹦鹉热衣原体肺炎患者的诊断及治疗过程作回顾性分析。结果患者,女,56岁,因“发热伴下腹痛9天”入院,胸部CT检查结果提示右肺感染、实变,初步考虑为右肺感染,多为社区获得性肺... 目的总结鹦鹉热衣原体肺炎的有效诊断及治疗方法。方法对1例鹦鹉热衣原体肺炎患者的诊断及治疗过程作回顾性分析。结果患者,女,56岁,因“发热伴下腹痛9天”入院,胸部CT检查结果提示右肺感染、实变,初步考虑为右肺感染,多为社区获得性肺炎。经验性给予环丙沙星和头孢他啶抗感染治疗后,仍有间断发热,并出现肝功能损伤。征得患者家属同意后,行支气管镜检查并取样本进行宏基因组二代测序(mNGS),mNGS检出鹦鹉热衣原体。结合患者临床表现,明确诊断为鹦鹉热衣原体肺炎。立即停用激素,调整使用头孢他啶联合阿奇霉素抗感染治疗,患者症状好转后出院。结论鹦鹉热衣原体肺炎临床表现和影像学检查结果无特异性,mNGS可及时明确诊断,阿奇霉素治疗有效。 展开更多
关键词 衣原体 鹦鹉热衣原体 肺炎 衣原体肺炎 鹦鹉热衣原体肺炎 宏基因组二代测序 阿奇霉素
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宏基因组二代测序协助诊疗肾移植受者混合感染的分析
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作者 李喆 朱淑华 +2 位作者 王杨 许书添 李世军 《医学研究与战创伤救治》 CAS 北大核心 2024年第7期758-761,共4页
0引言。肾移植受者的感染,需要根据移植后时间、免疫状态、临床影像学特征等预判高危感染病原体。宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)可协助混合感染、机会性感染、罕见感染病原体检出,需早期取样精准、病... 0引言。肾移植受者的感染,需要根据移植后时间、免疫状态、临床影像学特征等预判高危感染病原体。宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)可协助混合感染、机会性感染、罕见感染病原体检出,需早期取样精准、病情变化动态复查。 展开更多
关键词 宏基因组二代测序技术 肾移植受者 混合感染
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支气管肺泡灌洗液病原体宏基因组二代测序在下呼吸道感染诊断中的应用价值
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作者 董建 李真真 刘紫霄 《临床误诊误治》 CAS 2024年第20期54-59,共6页
目的 探究支气管肺泡灌洗液(BALF)病原体宏基因组二代测序(mNGS)在下呼吸道感染诊断中的应用价值,以提高下呼吸道感染病原体检测正确率、避免延误治疗。方法 选取2019年1月至2021年12月收治的115例下呼吸道感染患者,采集BALF行mNGS、传... 目的 探究支气管肺泡灌洗液(BALF)病原体宏基因组二代测序(mNGS)在下呼吸道感染诊断中的应用价值,以提高下呼吸道感染病原体检测正确率、避免延误治疗。方法 选取2019年1月至2021年12月收治的115例下呼吸道感染患者,采集BALF行mNGS、传统方法培养。对比分析mNGS与传统方法病原体检出时间、检出病原体分布情况,分析mNGS与传统方法检测结果的一致性,比较mNGS检出阳性与阴性患者临床资料,并行多因素Logistic回归分析mNGS检测结果影响因素。结果 mNGS病原体检出时间明显短于传统方法(P<0.05);mNGS病原体阳性检出率为74.78%高于传统方法检测的36.52%(P<0.01),mNGS细菌菌株阳性检出率高于传统方法(P<0.05,P<0.01);mNGS与传统方法检测结果的一致性Kappa指数为0.295;mNGS检出阳性与阴性患者在抗生素使用、糖皮质激素或免疫抑制剂使用、白细胞计数及C反应蛋白方面比较差异有统计学意义(P<0.05,P<0.01);多因素Logistic回归分析显示:抗生素使用、糖皮质激素或免疫抑制剂使用、白细胞计数及C反应蛋白与mNGS检测结果无影响(P>0.05)。结论 mNGS能有效提高下呼吸道感染病原体检测正确率,为抗生素精准治疗提供依据,避免延误治疗。 展开更多
关键词 肺部感染 支气管肺泡灌洗液 呼吸道 病原学 宏基因组二代测序 影响因素分析 应用价值
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隐球菌脑膜炎患者脑脊液宏基因组二代测序结果分析 被引量:13
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作者 葛瑛 范思远 +8 位作者 陈健华 申奥 窦洪涛 肖盟 徐英春 宫燕萍 任海涛 吴红龙 关鸿志 《协和医学杂志》 CSCD 2019年第6期605-611,共7页
目的评价脑脊液宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术在隐球菌脑膜炎诊断中的潜在应用价值。方法回顾性收集北京协和医院2014年1月至2016年12月采用脑脊液mNGS技术辅助确诊的6例隐球菌脑膜炎患者临床资料... 目的评价脑脊液宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术在隐球菌脑膜炎诊断中的潜在应用价值。方法回顾性收集北京协和医院2014年1月至2016年12月采用脑脊液mNGS技术辅助确诊的6例隐球菌脑膜炎患者临床资料,包括脑脊液常规、生化、细胞学、培养、墨汁染色等实验室检测结果,应用BGISEQ-100测序平台进行脑脊液病原测序,综合分析患者的临床、实验室和辅助检查结果。结果6例患者中,男性4例,女性2例,年龄26~53岁,中位年龄51岁。6例患者均无免疫缺陷性疾病,有头痛、脑膜刺激症状及颅内压增高表现,5例患者出现发热,2例患者出现复视。脑脊液常规检查示白细胞和蛋白轻度升高,糖正常或轻度降低;5例患者脑脊液墨汁染色阳性,4例患者脑脊液隐球菌抗原检测阳性,2例患者脑脊液真菌培养阳性。脑脊液mNGS检测隐球菌核酸序数为108~25361,基因覆盖率0.19%~29.00%;5例提示新型隐球菌感染,其中3例经PCR检测证实为新型隐球菌感染;1例提示格特隐球菌感染,经生物质谱仪检测证实为格特隐球菌感染。结论脑脊液mNGS技术可准确判断隐球菌感染,并对鉴别格特隐球菌具有一定优势,有助于降低免疫功能正常人群隐球菌脑膜炎的漏诊率。 展开更多
关键词 宏基因组二代测序 隐球菌 脑膜炎 脑脊液 诊断
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宏基因组二代测序技术在社区获得性肺炎中的临床应用体会 被引量:2
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作者 秦睿君 王虹 +1 位作者 李虹 李慧芳 《临床医药实践》 2023年第1期33-36,81,共5页
目的:探讨宏基因组二代测序技术(mNGS)在社区获得性肺炎中的临床应用价值。方法:回顾性分析2020年12月—2021年12月因社区获得性肺炎在太原市中心医院呼吸与危重症医学科住院的26例患者的临床资料,对传统病原学检测方法与宏基因组二代... 目的:探讨宏基因组二代测序技术(mNGS)在社区获得性肺炎中的临床应用价值。方法:回顾性分析2020年12月—2021年12月因社区获得性肺炎在太原市中心医院呼吸与危重症医学科住院的26例患者的临床资料,对传统病原学检测方法与宏基因组二代测序检测方法进行对比研究,比较两者结果的一致性。结果:研究共收集26份标本,传统微生物培养法共检出13份阳性,mNGS共检出23份阳性,mNGS灵敏度(88.5%)高于微生物培养灵敏度(50.0%),差异有统计学意义(P=0.007)。在致病菌检出方面,mNGS共检出细菌20种,真菌7种,病毒9种以及寄生虫1种;微生物培养共检出细菌5种,真菌5种。结论:与传统的微生物培养法相比,mNGS法检测敏感性更高,对病原体的检出能力更强,在呼吸系统感染性疾病的诊治中将发挥重要作用。 展开更多
关键词 社区获得性肺炎 宏基因组二代测序技术 临床应用价值
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宏基因组二代测序辅助诊断鹦鹉热衣原体肺炎一例 被引量:1
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作者 李阳 王登本 +4 位作者 魏永梅 马俊彦 刘茜 曹钰洁 李建英 《中华老年多器官疾病杂志》 2023年第3期209-210,共2页
鹦鹉热衣原体作为一种革兰氏阴性、胞内寄生的病原体,通常在鹦鹉及鸽子中被发现。由于鹦鹉热的低发病率及无特异性的临床表现,其发生易被忽视。而且目前所存在的传统检测方法检出鹦鹉热衣原体病原体较为困难,然而宏基因组二代测序(metag... 鹦鹉热衣原体作为一种革兰氏阴性、胞内寄生的病原体,通常在鹦鹉及鸽子中被发现。由于鹦鹉热的低发病率及无特异性的临床表现,其发生易被忽视。而且目前所存在的传统检测方法检出鹦鹉热衣原体病原体较为困难,然而宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)作为一种新型宏基因组二代测序方法,具有快速、准确、全面检测的优势。本文报道1例宏基因组二代测序辅助诊断鹦鹉热衣原体肺炎,加深对mNGS检测方法及鹦鹉热的认识。 展开更多
关键词 鹦鹉热衣原体 肺炎 宏基因组二代测序
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宏基因组二代测序技术在神经外科颅内感染诊断中的应用价值 被引量:3
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作者 于海东 朱东 +1 位作者 高麟 李海龙 《临床医药实践》 2023年第11期803-804,833,共3页
目的:分析宏基因组二代测序技术(mNGS)在神经外科颅内感染病原学诊断中的应用价值。方法:选择2020年1月—2022年12月收治的20例神经外科术后拟诊颅内感染患者为研究对象,两周后由3位神经外科专家共同判断是否确诊为颅内感染。对20例患... 目的:分析宏基因组二代测序技术(mNGS)在神经外科颅内感染病原学诊断中的应用价值。方法:选择2020年1月—2022年12月收治的20例神经外科术后拟诊颅内感染患者为研究对象,两周后由3位神经外科专家共同判断是否确诊为颅内感染。对20例患者的脑脊液细菌培养结果和宏基因组二代测序检测结果进行对比。结果:宏基因组二代测序诊断神经外科术后颅内感染的灵敏度、特异度及准确率分别为100.0%(13/13),85.7%(6/7)及95.0%(19/20);细菌培养的灵敏度、特异度及准确率分别为69.2%(9/13),57.1%(4/7),65.0%(13/20);宏基因组二代测序的灵敏度、特异度及准确率均高于脑脊液细菌培养,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:宏基因组二代测序技术在神经外科颅内感染病原学诊断中具有一定价值。 展开更多
关键词 宏基因组二代测序技术 神经外科颅内感染 脑脊液细菌培养
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宏基因组二代测序在初始治疗无反应性肺部感染患者中的应用 被引量:2
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作者 宋晓波 盛春风 赵邦凤 《中国医药导报》 CAS 2023年第10期152-155,共4页
目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在初始治疗无反应性肺部感染患者中的应用。方法回顾性分析于2021年1月至2022年2月就诊上海市松江区中心医院呼吸与危重症医学科的初始治疗无反应性肺部感染患者50例,分别进行痰液、支气管肺泡灌洗液(BA... 目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在初始治疗无反应性肺部感染患者中的应用。方法回顾性分析于2021年1月至2022年2月就诊上海市松江区中心医院呼吸与危重症医学科的初始治疗无反应性肺部感染患者50例,分别进行痰液、支气管肺泡灌洗液(BALF)的常规微生物培养,同时进行BALF的mNGS检测。观察病原微生物的分布情况,并比较传统检测方法与mNGS检测方法对初始治疗无反应性肺部感染微生物检测的差异。结果在50例初始治疗无反应性肺部感染患者中,常规痰培养阳性者2例,常规BALF培养阳性者4例,BALF mNGS检测阳性者44例。BALF mNGS微生物检测阳性率高于常规痰培养和常规BALF培养,差异有统计学意义(P<0.05)。常规痰培养和常规BALF培养微生物检测阳性率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。27例患者根据mNGS检测结果调整抗生素后病情好转。在mNGS检出的微生物中最常见为细菌感染,以肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌为主。结论mNGS应用于初始治疗无反应性肺部感染患者具有较高的微生物检测阳性率,可为临床调整治疗方案提供较强的参考依据。 展开更多
关键词 宏基因组二代测序 支气管肺泡灌洗液 微生物检 肺部感染
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宏基因组二代测序技术协助诊断支气管扩张、慢阻肺重叠综合征合并肺结核1例病例报告 被引量:1
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作者 李航 金志贤 +1 位作者 韩芳 杨丽娟 《中国医学工程》 2022年第9期134-136,共3页
1临床资料1.1患者基本信息患者肖某,男性,70岁,因“反复咳嗽、喘息6年余,加重伴发热半天”于2020年5月27日收入某市级医院进行治疗。患者10余年前开始无明显诱因反复出现咳嗽、喘息症状,咳脓痰,量多,易咳出,活动后喘息明显,曾在某市级... 1临床资料1.1患者基本信息患者肖某,男性,70岁,因“反复咳嗽、喘息6年余,加重伴发热半天”于2020年5月27日收入某市级医院进行治疗。患者10余年前开始无明显诱因反复出现咳嗽、喘息症状,咳脓痰,量多,易咳出,活动后喘息明显,曾在某市级医院呼吸科多次住院,诊断为“支气管扩张、慢性阻塞性肺疾病”,在科内行抗感染及多次行气管镜肺泡灌洗治疗,经治疗后可好转出院,在家氧疗及吸入“布地奈德福莫特罗粉”治疗。既往有“胆囊结石伴慢性胆囊炎、前列腺增生、双下肢动脉粥样硬化并斑形成”病史,曾发现有血糖升高病史,但未进一步明确糖尿病诊断,2015年3月因“支气管扩张并咯血”入住该院呼吸科,并行“支气管动脉、左膈动脉、左肋间动脉栓塞术”,术中造影考虑存在“左右支气管动脉畸形并支气管动脉-肺动脉瘘形成”。 展开更多
关键词 支气管扩张 慢阻肺重叠 肺结核 宏基因组二代测序技术
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经宏基因组二代测序诊断立克次体病3例
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作者 张兰 袁兰 +4 位作者 袁义美 王震 范雪娟 崔宁 袁春 《河南医学研究》 CAS 2022年第1期102-105,共4页
目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在新发立克次体病诊断中的应用价值。方法回顾性分析2020年9月至2021年4月于中国人民解放军联勤保障部队第九九〇医院感染科住院疑诊为立克次体病并最终经mNGS检测技术确诊为立克次体病的3例患者的资料... 目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在新发立克次体病诊断中的应用价值。方法回顾性分析2020年9月至2021年4月于中国人民解放军联勤保障部队第九九〇医院感染科住院疑诊为立克次体病并最终经mNGS检测技术确诊为立克次体病的3例患者的资料。结果3例患者中2例有明确蜱叮咬史,均急性起病,主要表现为发热伴皮疹、头痛、乏力、纳差、全身肌肉酸痛、关节痛等。3例患者外斐试验、布鲁菌病凝集试验、发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒-RNA(SFTSV-RNA)及血培养均阴性,血液mNGS检测到Rickettsia argasii的核酸序列数为160~1739条,基因覆盖率为1.42%~9.79%。患者经多西环素治疗,48 h后体温明显下降,96 h恢复正常,病情恢复后痊愈出院。结论应用mNGS首次证明Rickettsia argasii这一新型立克次体具有致病作用,临床上应注意与发热伴血小板减少综合征(SFTS)鉴别。mNGS为新发立克次体病的研究提供了重要的手段。临床上高度怀疑立克次体病时,可及时采用多西环素进行经验治疗。 展开更多
关键词 立克次体 宏基因组二代测序 发热伴血小板减少综合征 多西环素
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宏基因组二代测序技术在鉴别儿童肠道病原菌与耐药菌中的应用研究
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作者 李小梅 《当代医药论丛》 2023年第5期129-131,共3页
目的:研究宏基因组二代测序技术在鉴别儿童肠道病原菌与耐药菌中的临床应用价值。方法:选取2020年10月至2022年5月郴州市第一人民医院收治的600例腹泻患儿,连续采集其自住院第一天起至出院期间每天的粪便标本,并尽量采集其痊愈出院后的... 目的:研究宏基因组二代测序技术在鉴别儿童肠道病原菌与耐药菌中的临床应用价值。方法:选取2020年10月至2022年5月郴州市第一人民医院收治的600例腹泻患儿,连续采集其自住院第一天起至出院期间每天的粪便标本,并尽量采集其痊愈出院后的粪便一次,以便于进行连续观察。以宏基因组二代测序技术对患儿的标本进行检测,并对其进行药敏试验。统计分析粪便培养和药敏试验的结果。结果:600例腹泻患儿的粪便标本中共分离出病原菌52株,检出率为8.67%。其中主要病原菌有志贺菌属(8株)、大肠埃希菌(6株)、沙门菌属(6株)、变形杆菌属(6株)、肠球菌属(6株)。药敏试验显示,以上5种主要病原菌对亚胺培南的耐药性最低,其次是头孢哌酮、哌拉西林他唑巴坦。结论:借助宏基因组二代测序技术在儿童肠道病原菌检测中发现儿童感染性腹泻病原菌以革兰阴性菌为主,临床治疗时应合理使用抗生素,避免产生耐药性。 展开更多
关键词 宏基因组二代测序技术 儿童 肠道病原菌 耐药菌
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宏基因组二代测序在儿童急性白血病化疗后合并毛霉菌病早期诊断中的应用价值 被引量:6
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作者 李文梓 朱华 +7 位作者 全美洁 王丽 温丽 王嘉敏 李华利 赵艳荣 杨明丽 孟宪彬 《中国小儿血液与肿瘤杂志》 CAS 2022年第6期363-366,共4页
目的通过分析应用宏基因组二代测序(mNGS)方法检测儿童急性白血病化疗后合并毛霉菌病的病例情况,探讨这种检测方法对于儿童急性白血病化疗后合并毛霉菌病的早期诊断的应用价值。方法回顾性分析2020年1月—2021年12月收治于河北省儿童医... 目的通过分析应用宏基因组二代测序(mNGS)方法检测儿童急性白血病化疗后合并毛霉菌病的病例情况,探讨这种检测方法对于儿童急性白血病化疗后合并毛霉菌病的早期诊断的应用价值。方法回顾性分析2020年1月—2021年12月收治于河北省儿童医院血液肿瘤科的7例急性白血病化疗后合并毛霉菌病患儿的临床资料,总结其临床特点,诊疗经过及转归。结果7例患儿中6例为急性淋巴细胞白血病,1例为急性髓系白血病,均经过mNGS检测出毛霉菌感染,其中1例为肺脑型,6例为肺型,经治疗,1例死亡,2例治愈,4例好转。结论mNGS检测方法在儿童急性白血病化疗后合并毛霉菌病的早期诊断中具有重要参考价值。 展开更多
关键词 白血病 儿童 肺毛霉病 颅内感染 宏基因组二代测序
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宏基因组二代测序在肺部感染患者病原微生物检测中的应用价值分析 被引量:7
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作者 李殷康 黎雨 +1 位作者 李文涛 柳广南 《内科》 2021年第3期296-298,307,共4页
目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在肺部感染性疾病诊断中的应用价值。方法选取2019年8月至2020年5月广西医科大学第二附属医院呼吸与危重症医学科收治的肺部感染患者60例作为研究对象,采集患者肺泡灌洗液标本并进行病原微生物mNGS与常... 目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在肺部感染性疾病诊断中的应用价值。方法选取2019年8月至2020年5月广西医科大学第二附属医院呼吸与危重症医学科收治的肺部感染患者60例作为研究对象,采集患者肺泡灌洗液标本并进行病原微生物mNGS与常规涂片+培养检测,评估mNGS的临床应用价值。结果纳入研究的60例患者中,进行mNGS检测,检出病原微生物的患者共50例,检出率为83.33%;进行常规涂片+培养检测,检出病原微生物的患者共14例,检出率为23.33%。对肺部感染患者,进行mNGS检测的病原微生物总检出率显著高于进行常规涂片+培养检测,差异有统计学意义(P<0.05)。结论宏基因组二代测序对肺部感染患者的病原微生物检出率显著高于常规涂片及培养检测,应用价值极高,但检测费用较高,临床上可根据具体情况加以应用。 展开更多
关键词 宏基因组二代测序技术 肺部感染 病原菌 肺泡灌洗
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脑脊液宏基因组二代测序技术及其在中枢神经系统感染性疾病诊断中的应用进展 被引量:15
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作者 张梦瑶 任建发 +1 位作者 陈亚南 邸卫英 《山东医药》 CAS 2020年第27期86-90,共5页
脑脊液宏基因组二代测序技术是一种从脑脊液样品中提取DNA或RNA片段,并在数千至百万条片段中进行高通量随机测序,从而分析出病原体的一种技术。脑脊液宏基因组二代测序技术应用于中枢神经系统感染性疾病包括病毒性脑炎/脑膜炎、细菌性... 脑脊液宏基因组二代测序技术是一种从脑脊液样品中提取DNA或RNA片段,并在数千至百万条片段中进行高通量随机测序,从而分析出病原体的一种技术。脑脊液宏基因组二代测序技术应用于中枢神经系统感染性疾病包括病毒性脑炎/脑膜炎、细菌性脑膜炎、结核性脑膜炎和隐球菌性脑炎等的诊断,在检测新病原体、提高检测阳性率、降低漏诊率和诊断难确诊性感染方面发挥着重要作用。 展开更多
关键词 基因组技术 宏基因组二代测序技术 中枢神经系统感染性疾病 病毒性脑炎 病毒性脑膜炎 细菌性脑膜炎 结核性脑膜炎 隐球菌性脑膜炎
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