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基于信息离散度的DNA序列相似性分析
被引量：
4
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作者
骆嘉伟
刘芳
杨华
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2009年第1期269-272,共4页
信息离散性度量方法在生物信息处理领域中获得成功的应用,其基本思想是利用子序列分布差异来表示序列之间的差异,但是子序列长度的变化对结果的影响较大。文中提出了一种新的基于信息离散度的DNA序列相似性分析方法,利用不同距离的碱基...
信息离散性度量方法在生物信息处理领域中获得成功的应用,其基本思想是利用子序列分布差异来表示序列之间的差异,但是子序列长度的变化对结果的影响较大。文中提出了一种新的基于信息离散度的DNA序列相似性分析方法,利用不同距离的碱基对的联合概率分布差异来表示DNA序列之间的差异,并分析了信息集变化对结果的影响。实验结果表明,该方法是分析DNA序列相似性的简单且有效的工具。当信息集变化时,相似度较高的序列间的距离值变化很小。
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关键词
碱基对
完全信息集
离散度函数
相似性
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题名
基于信息离散度的DNA序列相似性分析
被引量：
4
1
作者
骆嘉伟
刘芳
杨华
机构
湖南大学计算机与通信学院
出处
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2009年第1期269-272,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(60873184)
湖南省自然科学基金资助项目(07JJ5086)
文摘
信息离散性度量方法在生物信息处理领域中获得成功的应用,其基本思想是利用子序列分布差异来表示序列之间的差异,但是子序列长度的变化对结果的影响较大。文中提出了一种新的基于信息离散度的DNA序列相似性分析方法,利用不同距离的碱基对的联合概率分布差异来表示DNA序列之间的差异,并分析了信息集变化对结果的影响。实验结果表明,该方法是分析DNA序列相似性的简单且有效的工具。当信息集变化时,相似度较高的序列间的距离值变化很小。
关键词
碱基对
完全信息集
离散度函数
相似性
Keywords
base pair
complete information set
Function of Degree of Disagreement （FDOD）
similarity
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于信息离散度的DNA序列相似性分析
骆嘉伟
刘芳
杨华
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2009
4
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