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免疫细胞与慢性胰腺炎之间的因果关系:一项双向孟德尔随机化分析
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作者 吴佼星 曹瑞奇 +5 位作者 冯正源 武帅 段万星 杨雪 周灿灿 仵正 《西安交通大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第3期455-462,共8页
目的通过孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析探究免疫细胞与慢性胰腺炎(chronic pancreatitis,CP)之间的因果关系。方法本研究的免疫细胞表型和CP的全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)数据来自公开数据... 目的通过孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析探究免疫细胞与慢性胰腺炎(chronic pancreatitis,CP)之间的因果关系。方法本研究的免疫细胞表型和CP的全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)数据来自公开数据库,共纳入731种免疫细胞表型。采用双样本双向MR分析法探索免疫细胞与CP之间的因果关系,并使用多种敏感性分析方法对结果的异质性和水平多效性进行验证。结果共发现33个免疫细胞表型与CP存在因果关联,其中18个表现为抑制因素,调节性T细胞(Treg)细胞群中的CD25 on CD4^(+)表现出最显著的抑制作用;其余15个则表现为风险因素,成熟T细胞组的CD8 on TD CD8br、TBNK组的CD8br AC以及Treg组的CD39^(+)CD8br%T cell和CD28 on CD4^(+)表现出显著的促进作用。反向MR结果也进一步证明了因果关系的单向性。结论通过MR方法揭示了免疫细胞与CP之间的密切联系,凸显了免疫系统与CP之间复杂的相互作用模式。 展开更多
关键词 免疫细胞 慢性胰腺炎(CP) 孟德尔随机化(MR)分析
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孟德尔随机化分析方法在非酒精性脂肪性肝病病因探索中的应用 被引量:1
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作者 郭紫薇 武庆娟 +2 位作者 叶永安 陈兰羽 吕文良 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2024年第3期589-593,共5页
非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)是以肝内脂质大量堆积为特点的肝脂质代谢异常类疾病,是目前世界范围内最常见的肝脏疾病。孟德尔随机化(MR)将基因组数据纳入传统的流行病学研究设计中,以推断暴露因素与疾病风险之间的因果关系。近年来,MR在N... 非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)是以肝内脂质大量堆积为特点的肝脂质代谢异常类疾病,是目前世界范围内最常见的肝脏疾病。孟德尔随机化(MR)将基因组数据纳入传统的流行病学研究设计中,以推断暴露因素与疾病风险之间的因果关系。近年来,MR在NAFLD的病因推断研究中得到了较为广泛的应用,本文将系统总结MR在NAFLD研究中的应用进展,为认识疾病本质和科学化干预提供新思路。 展开更多
关键词 非酒精性脂肪性肝病 孟德尔随机化分析 因果律 工具变量
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尿酸介导体重指数与慢性心力衰竭关系的孟德尔随机化分析 被引量:5
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作者 葛腾 房瑛 +3 位作者 齐鸿飞 宁博 吴永青 赵明君 《中国循环杂志》 CSCD 北大核心 2024年第5期495-502,共8页
目的:采用两样本孟德尔随机化分析探讨体重指数、尿酸与慢性心力衰竭(CHF)之间的因果关系。方法:使用公开的东亚人群全基因组关联研究汇总数据集,以逆方差加权(IVW)法为主要分析方法,同时采用MR-Egger回归法、加权中位数模型、简单模型... 目的:采用两样本孟德尔随机化分析探讨体重指数、尿酸与慢性心力衰竭(CHF)之间的因果关系。方法:使用公开的东亚人群全基因组关联研究汇总数据集,以逆方差加权(IVW)法为主要分析方法,同时采用MR-Egger回归法、加权中位数模型、简单模型、加权模型,分析体重指数、尿酸与CHF两两之间的关系。使用MR-Egger回归法检测多效性,使用Cochran Q检验检测异质性,使用留一法进行敏感性分析,绘制漏斗图检测偏倚性,使用MR-PRESSO包剔除离群单核苷酸多态性(SNP)。孟德尔分析后计算中介效应值及中介效应比例,最后分析体重指数、尿酸与CHF两两之间的反向孟德尔随机化研究。结果:两样本孟德尔分析中IVW法显示体重指数(OR=1.685,95%CI:1.417~2.003,P<0.001)、尿酸(OR=1.225,95%CI:1.087~1.380,P<0.001)均与CHF存在因果关系;体重指数(OR=1.204,95%CI:1.139~1.273,P<0.001)与尿酸存在因果关系。尿酸在体重指数与CHF的因果关系中的中介效应比例为7.23%。MR-Egger回归截距的P均>0.05,即筛选出的SNP不存在水平多效性,因果推断方法有效,体重指数-尿酸、体重指数-CHF的孟德尔随机化分析存在异质性(Cochran Q检验P<0.01)。反向孟德尔随机化分析中IVW法显示,CHF与体重指数(OR=0.977,95%CI:0.947~1.008,P>0.05)、CHF与尿酸(OR=1.000,95%CI:0.963~1.038,P>0.05)之间均不存在因果关系,尿酸与体重指数的分析存在基因多效性,故因果推断方法无效。结论:体重指数、尿酸均与CHF存在因果关系且呈正相关,且尿酸在体重指数与CHF的因果关系中为不完全中介因素。 展开更多
关键词 体重指数 尿酸 慢性心力衰竭 孟德尔随机化分析 因果关系 中介效应
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双向孟德尔随机化分析总胆固醇升高风险与胆石症发生风险的关系 被引量:4
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作者 赵伟伟 杜晓旭 戈宏焱 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2024年第3期573-580,共8页
目的 运用双向孟德尔随机化评估总胆固醇升高风险与胆石症发生风险之间的关联。方法 总胆固醇与胆石症相关的单核苷酸多态性数据来自open gwas公共数据库,对基于全基因组相关联研究(GWAS)的所有汇总数据进行二次数据分析,分别选择与总... 目的 运用双向孟德尔随机化评估总胆固醇升高风险与胆石症发生风险之间的关联。方法 总胆固醇与胆石症相关的单核苷酸多态性数据来自open gwas公共数据库,对基于全基因组相关联研究(GWAS)的所有汇总数据进行二次数据分析,分别选择与总胆固醇或者胆石症密切关联的遗传位点作为暴露或者结局变量,用Egger回归法、加权中位数法、IVW随机效应模型、IVW固定效应模型等方法进行双向孟德尔随机化分析,以OR值评价总胆固醇和胆石症之间的因果关系。结果 以总胆固醇为暴露、胆石症为结局,去除异质性前总胆固醇-胆石症的总体OR=0.91,95%CI:0.85~0.97;去除异质性后总胆固醇-胆石症的总体OR=0.93,95%CI:0.89~0.97。以胆石症为暴露、总胆固醇为结局,去除异质性前胆石症-总胆固醇的总体OR=0.20,95%CI:0.06~0.65;去除异质性后胆石症-总胆固醇的总体OR=0.28,95%CI:0.10~0.83。基因预测的总胆固醇和胆石症之间存在双向因果关系。结论 本研究证实了总胆固醇与胆石症之间的双向因果关系,随着遗传上有关能使总胆固醇水平升高的等位基因的增加,发生胆石症的风险降低。反之,随着遗传上有关能使胆石症发病增高的等位基因的增加,总胆固醇水平升高的风险降低。 展开更多
关键词 总胆固醇 胆石症 双向孟德尔随机化分析
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孟德尔随机化的良好实践--孟德尔随机化分析的常见设计、关键挑战及优化 被引量:13
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作者 王晶 张国燕 程杉 《首都医科大学学报》 北大核心 2023年第6期1087-1094,共8页
孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究是一种因果推断方法,利用遗传变异作为工具变量来探索暴露(X)与结局(Y)之间的因果关系。首先,文章介绍了MR方法的核心假设以及如何在生物医学研究中挑选常见的MR设计类型。进而,介绍目前M... 孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究是一种因果推断方法,利用遗传变异作为工具变量来探索暴露(X)与结局(Y)之间的因果关系。首先,文章介绍了MR方法的核心假设以及如何在生物医学研究中挑选常见的MR设计类型。进而,介绍目前MR研究面对的关键挑战和解决方案,如:如何选择满足核心假设的工具变量(instrumental variable,IV),如何挑选MR中因果估计方法以及如何在生物学上解释MR结果等。此外,文章提出了包括宏基因组数据MR分析、甲基化数据MR分析等未来研究的方向。总之,MR方法作为一种强大的工具,有助于探索因果关系、选择治疗干预靶点,进行长期基于人群的干预研究。尽管MR不能完全替代随机对照试验,但其在生物医学研究和临床实践中具有广泛的应用前景,有助于更深入地理解健康和疾病之间的复杂关系。 展开更多
关键词 孟德尔随机化分析 常见设计 挑战
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鼻部疾病与COPD的因果关联:两样本孟德尔随机化分析 被引量:1
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作者 丁焕章 王卉 +5 位作者 吴迪 马啸 张璐 高雅婷 郑莉莉 李泽庚 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期1470-1476,共7页
目的:探讨鼻部疾病与慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)之间的因果关系,从而深化对中医理论“鼻为肺之官”的认识。方法:本研究基于全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)的汇总统计数据... 目的:探讨鼻部疾病与慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)之间的因果关系,从而深化对中医理论“鼻为肺之官”的认识。方法:本研究基于全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)的汇总统计数据,利用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法,将遗传因素作为工具变量,分析过敏性鼻炎、急性鼻窦炎、慢性鼻窦炎、鼻息肉与COPD之间的因果关系。结果:研究结果显示,在排除多效性和异质性因素后,遗传因素决定的慢性鼻窦炎与COPD的风险增加有关(IVW:P=0.0086);遗传因素决定的鼻息肉与COPD的风险增加显著相关(IVW:P=0.0032)。未发现过敏性鼻炎、急性鼻窦炎与COPD的关联。结论:慢性鼻窦炎、鼻息肉与COPD的患病风险增加有关,但仍需要进行高级别的随机对照试验研究进一步进行验证。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 鼻窦炎 鼻息肉 鼻为肺之官 孟德尔随机化分析 中医
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MR-Egger回归在孟德尔随机化分析中的应用 被引量:11
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作者 徐艺耘 刘振球 +4 位作者 樊虹 张欣 施婷婷 吴声 张铁军 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期804-809,共6页
目的探讨MR-Egger回归在孟德尔随机化分析中的应用。方法利用全基因组关联研究结果确定工具变量,通过MR-Egger回归进行两样本孟德尔随机化分析来检验高密度脂蛋白胆固醇(high density liptein cholesterol,HDL-C)和冠状动脉疾病之间的... 目的探讨MR-Egger回归在孟德尔随机化分析中的应用。方法利用全基因组关联研究结果确定工具变量,通过MR-Egger回归进行两样本孟德尔随机化分析来检验高密度脂蛋白胆固醇(high density liptein cholesterol,HDL-C)和冠状动脉疾病之间的因果效应,评估潜在工具变量的多效性,并将MR-Egger回归结果与逆方差加权法(inverse-variance weighted,IVW)结果进行比较。结果共纳入120个单核苷酸多态性构建工具变量。IVW结果表明HDL-C与冠状动脉疾病之间存在显著的因果关联(OR=0.82,95%CI:0.75~0.89)。MR-Egger回归结果显示HDL-C与冠状动脉疾病之间不存在因果关联(OR=0.96,95%CI:0.83~1.11),并提示基因工具变量存在显著的多效性(截距:-0.01,P=0.008)。结论MR-Egger回归在孟德尔随机化分析中有一定的应用价值,尤其是在多效性偏倚存在的情况下能给出准确的因果效应估计。 展开更多
关键词 MR-Egger回归 孟德尔随机化分析 工具变量(Ⅳ)
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两样本孟德尔随机化分析原发性硬化性胆管炎与结直肠癌发生风险的关系 被引量:5
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作者 李镇圻 杜宁 和红阳 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2023年第3期567-572,共6页
目的运用两样本孟德尔随机化(TSMR)评估原发性硬化性胆管炎(PSC)与结直肠癌(CRC)之间的关联。方法PSC与CRC相关的单核苷酸多态性(SNP)数据分别来自芬兰生物银行及英国生物银行,对基于全基因组关联研究(GWAS)的所有汇总数据进行二次数据... 目的运用两样本孟德尔随机化(TSMR)评估原发性硬化性胆管炎(PSC)与结直肠癌(CRC)之间的关联。方法PSC与CRC相关的单核苷酸多态性(SNP)数据分别来自芬兰生物银行及英国生物银行,对基于全基因组关联研究(GWAS)的所有汇总数据进行二次数据分析,选择与PSC密切关联的遗传位点作为工具变量,分别以孟德尔随机化Egger回归法、中位数加权法、IVW随机效应模型、最大似然比法、线性中位数加权法、IVW radial法、IVW固定效应模型七种方法做TSMR,以OR值评价PSC和CRC风险之间的因果关系。结果基因预测的PSC对CRC存在正向因果关系,以IVW固定效应模型为例,遗传决定的患PSC患者发生CRC风险增加(OR=1.002243,95%CI:1.001319~1.003167)。TSMR结果不存在异质性(P=0.87),无水平多效性(P=0.95)。本次所选PSC的3个工具变量为强工具变量(F=11.86)。结论TSMR发现PSC具有与CRC风险相关的遗传证据。无论是否合并炎症性肠病,在PSC患者中积极进行肠镜筛查或可有利于CRC的早期发现与及时干预。 展开更多
关键词 原发性硬化性胆管炎 结直肠肿瘤 孟德尔随机化分析
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孟德尔随机化分析在骨质疏松症病因学研究中的应用
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作者 魏晓伟 张晓梅 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期928-931,共4页
发现可控的致病因素是骨质疏松症防治的必要条件。利用自由组合定律原理,孟德尔随机化分析克服传统观察性研究和随机对照研究的局限性,能够反映暴露因素和疾病间的真实联系,近年来被广泛应用于疾病病因学的研究。通过孟德尔随机化方法,... 发现可控的致病因素是骨质疏松症防治的必要条件。利用自由组合定律原理,孟德尔随机化分析克服传统观察性研究和随机对照研究的局限性,能够反映暴露因素和疾病间的真实联系,近年来被广泛应用于疾病病因学的研究。通过孟德尔随机化方法,国内外学者在对传统观察性研究中发现的骨质疏松相关因素进行分析后发现,欧洲人群中维生素D水平、奶制品摄入、体脂含量、尿酸水平等与骨质疏松的发病无直接因果关系,而雌激素水平下降、青春期延迟、吸烟等因素对骨质疏松发生有促进作用。在亚洲人群研究中探索了维生素D水平与骨质疏松症的因果关系,与欧洲人群取得一致性结论。孟德尔随机化的应用能够解决传统观察性研究及随机对照研究中因果推断存在的问题,从而推动骨质疏松病因学研究的进展,对于指导骨质疏松的防治策略,具有广阔的应用前景。 展开更多
关键词 孟德尔随机化分析 骨质疏松 病因学
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肠道菌群和强直性脊柱炎因果关系的两样本孟德尔随机化研究
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作者 路仁杰 石文俊 +3 位作者 刘少杨 葛硕 刘广跃 石继祥 《中国免疫学杂志》 北大核心 2025年第9期2055-2060,共6页
目的:采用两样本孟德尔随机化(MR)分析研究肠道菌群与强直性脊柱炎(AS)发病风险的因果关系。方法:获取211种肠道菌群和AS的全基因组关联研究(GWAS)数据,将单核苷酸多态性(SNP)作为工具变量,并选择敏感SNPs进行分析。通过逆方差加权法(I... 目的:采用两样本孟德尔随机化(MR)分析研究肠道菌群与强直性脊柱炎(AS)发病风险的因果关系。方法:获取211种肠道菌群和AS的全基因组关联研究(GWAS)数据,将单核苷酸多态性(SNP)作为工具变量,并选择敏感SNPs进行分析。通过逆方差加权法(IVW)、MR-Egger、加权中值法进行两样本MR分析,OR值评估系肠道菌群与AS的因果关系,并对结果进行异质性和多效性检验。结果:IVW分析显示,11种肠道菌群与AS风险存在显著因果关系,其中疣微菌纲(Verrucomicrobiae)、疣微菌目(Verrucomicrobiales)、疣微菌科(Verrucomicrobiaceae)、阿克曼氏菌(Akkermansia)、丹毒荚膜菌属(Erysipelatoclostridium)、霍尔德曼氏菌属(Holdemania)、芽孢杆菌目(Bacillales)和疣微菌门(Verrucomicrobia)对AS风险有正向因果效应,而戴阿利斯特杆菌属(Dialister)、霍华德氏菌属(Howardella)、颤螺旋菌属(Oscillospira)对AS风险有负向因果效应。不同方法(MREgger、加权中值法)得到的因果效应估计方向一致,敏感性检验未发现明显水平多效性及异质性。结论:肠道菌群在AS发病机制中起重要作用,具体机制仍待进一步研究。 展开更多
关键词 强直性脊柱炎 肠道菌群 孟德尔随机化分析 因果关系 遗传变异
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中医五志与头痛关系的探究——一项孟德尔随机化研究
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作者 姚韵娟 刘志鹏 +2 位作者 刘丽静 王志强 朱银杏 《世界中医药》 北大核心 2025年第3期440-445,共6页
目的:采用两样本孟德尔随机化研究中医五志与头痛的因果关系,探索头痛的潜在病因,为中西医治疗头痛提供新思路。方法:从全基因组关联分析(GWAS)数据库获取5种情志(怒、喜、思、悲、恐)及头痛、偏头痛和非偏头痛的其他头痛的汇总数据集,... 目的:采用两样本孟德尔随机化研究中医五志与头痛的因果关系,探索头痛的潜在病因,为中西医治疗头痛提供新思路。方法:从全基因组关联分析(GWAS)数据库获取5种情志(怒、喜、思、悲、恐)及头痛、偏头痛和非偏头痛的其他头痛的汇总数据集,选择独立的单核苷酸多态性(SNP)作为每种疾病的工具变量(IVs)。采用逆方差加权法(IVW),加权中位数法(WME)、MR-Egger回归法探究五志与头痛之间的因果关系。使用MR-PRESSO进行离群值检测并矫正,Cochran Q检验进行异质性评估,Egger intercept法进行水平多效性检验,以保证结果的可靠性。结果:IVW结果表明头痛与易怒(OR=1.708,95%CI为1.079~2.703)、思虑过度(OR=1.647,95%CI为1.255~2.160)和悲伤抑郁(OR=1.535,95%CI为1.158~2.036)显著正相关;偏头痛与易怒(OR=1.017,95%CI为1.002~1.031)和思虑过度(OR=1.013,95%CI为1.002~1.021)正相关;非偏头痛与易怒(OR=1.010,95%CI为1.003~1.017)、思虑过度(OR=1.004,95%CI为1.001~1.008)和悲伤抑郁(OR=1.006,95%CI为1.003~1.010)具有潜在正相关。结论:易怒和思虑过度会增加头痛、偏头痛及非偏头痛的患病风险,悲伤抑郁会影响头痛和非偏头痛的发病。 展开更多
关键词 孟德尔随机化分析 头痛 情志 因果关联 易怒 思虑过度
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基于孟德尔随机化的肝功能和脂质代谢水平与睡眠障碍的因果关联分析 被引量:1
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作者 何威 朱述可 +2 位作者 李春雨 杜雪 李佳芮 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2024年第10期2055-2061,共7页
目的采用孟德尔随机化分析肝功能和脂质代谢水平与睡眠障碍的因果关联。方法对GWAS进行分析,暴露因素为肝功能和脂质代谢水平[ALT、AST、GGT、Alb、血清总蛋白(TP)、TBil、ALP、TG、TG与磷酸甘油酯的比例(TG/G3P)、TC、HDL-C、LDL-C、... 目的采用孟德尔随机化分析肝功能和脂质代谢水平与睡眠障碍的因果关联。方法对GWAS进行分析,暴露因素为肝功能和脂质代谢水平[ALT、AST、GGT、Alb、血清总蛋白(TP)、TBil、ALP、TG、TG与磷酸甘油酯的比例(TG/G3P)、TC、HDL-C、LDL-C、多不饱和脂肪酸(PUFA)、总脂肪酸(TFA)、PUFA/TFA],结局因素为睡眠障碍(非器质性)。采用逆方差加权法(IVW)、MR-Egger法、Simple Mode法、加权中位数法和Weighted Mode法等回归模型进行孟德尔随机化分析。结果血清Alb(OR=0.728,95%CI:0.535~0.989,P<0.05),HDL-C(OR=0.879,95%CI:0.784~0.986,P<0.05)和PUFA/TFA(OR=0.800,95%CI:0.642~0.998,P<0.05)与睡眠障碍呈负相关。TG/G3P(OR=1.222,95%CI:1.044~1.431,P<0.05)与睡眠障碍呈正相关。孟德尔随机化结果未显示ALT、AST、GGT、TP、TBil、ALP、TG、TC、LDL-C、PUFA、TFA与睡眠障碍有因果关系(P值均>0.05)。MEEgger截距测试结果表明分析结果不存在多效性(P>0.05),孟德尔随机化在本研究中为因果推断的有效方法。结论根据孟德尔随机化分析结果,肝功能和脂质代谢水平与睡眠障碍之间存在显著关联。在预测睡眠障碍的发生风险以及干预方面,可以考虑利用肝功能和脂质代谢水平作为睡眠障碍发生风险以及干预的指标。 展开更多
关键词 肝功能 脂质代谢 睡眠障碍 孟德尔随机化分析
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基于代谢组学探究非脂质代谢物在肥胖与糖尿病视网膜病变间的中介作用:孟德尔随机化研究
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作者 王爽 吴树法 +6 位作者 令垚 谭茜蔚 曹汝岱 曾慧婷 孔丹莉 丁元林 于海兵 《中国全科医学》 北大核心 2025年第21期2625-2634,共10页
背景肥胖可通过多种途径影响糖尿病视网膜病变(DR)的发生和发展,但目前关于肥胖通过非脂质代谢途径介导而影响DR的研究报道较少见。目的探究非脂质代谢物在肥胖与DR间的中介作用。方法2023年8月,基于全基因组关联数据(GWAS),通过孟德尔... 背景肥胖可通过多种途径影响糖尿病视网膜病变(DR)的发生和发展,但目前关于肥胖通过非脂质代谢途径介导而影响DR的研究报道较少见。目的探究非脂质代谢物在肥胖与DR间的中介作用。方法2023年8月,基于全基因组关联数据(GWAS),通过孟德尔随机化(MR)探究非脂质代谢物在肥胖与DR间的中介作用。结果BMI增大(OR=1.78,P=5.3E-12)、腰臀比(WHR)增大(OR=1.91,P=1.3E-10)均与DR发病风险升高有关。异亮氨酸(OR=0.62,P=0.039)、丙酮酸(OR=0.60,P=0.039)、白蛋白(OR=0.65,P=0.002)、糖蛋白(OR=0.92,P=0.002)、双烯基与双键的比率降低(OR=0.93,P=0.048)均与DR发病风险升高有关。BMI与异亮氨酸(OR=1.21,P=1.0E-08)、糖蛋白(OR=1.33,P=3.2E-14)、丙酮酸(OR=1.08,P=0.03)呈正向因果关联,与白蛋白(OR=0.93,P=0.04)、双烯基与双键的比率(OR=0.82,P=2.8E-05)呈负向因果关联;WHR与异亮氨酸(OR=1.34,P=3.4E-08)、糖蛋白(OR=1.26,P=1.2E-04)呈正向因果关联。异亮氨酸(β=-0.16,P=0.019)、糖蛋白(β=-0.05,P=0.029)、丙酮酸(β=-0.07,P=0.027)、双烯基与双键的比率(β=0.02,P=0.036)介导BMI与DR间的因果关联,异亮氨酸(β=-0.21,P=7.2E-04)、糖蛋白(β=-0.03,P=0.031)介导WHR与DR间的因果关联。结论肥胖与DR有正向因果关联,其中BMI与DR的关联由异亮氨酸、糖蛋白、丙酮酸、双烯基与双键的比率介导,WHR与DR的关联由异亮氨酸、糖蛋白介导,非脂质代谢产物在肥胖与DR间具有中介作用。 展开更多
关键词 糖尿病视网膜病变 肥胖症 代谢组学 非脂质代谢物 体质指数 腰臀比 孟德尔随机化分析
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基于双向孟德尔随机化的不同BMI分型非酒精性脂肪性肝病与2型糖尿病的遗传关联分析 被引量:2
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作者 段浩鑫 江宇泳 +5 位作者 吴亭彧 熊飞翔 姜艳丹 张琴 赵赛赛 于浩 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2024年第10期1992-1999,共8页
目的运用双向双样本孟德尔随机化(MR)评估非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)与2型糖尿病(T2DM)的遗传关联,并进一步探讨不同BMI的NAFLD人群与T2DM的因果关系。方法数据来源于以欧洲人群为研究对象的全基因组关联研究,其中NAFLD的样本量为32941... 目的运用双向双样本孟德尔随机化(MR)评估非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)与2型糖尿病(T2DM)的遗传关联,并进一步探讨不同BMI的NAFLD人群与T2DM的因果关系。方法数据来源于以欧洲人群为研究对象的全基因组关联研究,其中NAFLD的样本量为32941例,T2DM为312646例,BMI为681275例。运用单变量、多变量MR方法评估NAFLD总人群及各BMI亚型与T2DM之间的双向因果关系。采用逆方差加权法、MR-Egger回归、约束最大似然与模型平均法、加权中位数法进行MR分析,采用MR多效性残差和与离群值、径向MR、MR-Egger截距法、Cochran Q检验进行敏感性分析。结果单变量MR分析显示NAFLD总人群与T2DM之间存在双向因果关系(正向OR=9.75,95%CI:2.57~37.00,P<0.001;反向OR=1.01,95%CI:1.00~1.01,P<0.01)。多变量MR分析显示经BMI校正后,NAFLD总人群与T2DM的因果关系仍然保持显著(OR=33.12,95%CI:7.57~144.95,P<0.0001)。亚组分析显示,NAFLD各亚组均与T2DM存在因果关系(瘦型OR=12.19,95%CI:3.35~44.40,P<0.001;超重型OR=4.30,95%CI:1.69~10.92,P<0.01;肥胖型OR=1.67,95%CI:1.14~2.44,P<0.01)。结论本研究从遗传学层面揭示了NAFLD总人群及各BMI亚型与T2DM之间的因果关系。 展开更多
关键词 非酒精性脂肪性肝病 糖尿病 2型 身体质量指数 孟德尔随机化分析
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孟德尔随机化在肝癌研究中的应用 被引量:5
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作者 李凌巍 秦俊杰 +1 位作者 贾云龙 吕浩 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2024年第2期391-396,共6页
近年来,基于全基因组关联研究的孟德尔随机化研究方法被广泛应用于医学领域的病因探索,以其遗传变异的分配随机性和时序优先性的独特优势,可以有效克服传统观察性研究中的混杂偏倚和反向因果的干扰。本文针对该方法及其在肝癌研究领域... 近年来,基于全基因组关联研究的孟德尔随机化研究方法被广泛应用于医学领域的病因探索,以其遗传变异的分配随机性和时序优先性的独特优势,可以有效克服传统观察性研究中的混杂偏倚和反向因果的干扰。本文针对该方法及其在肝癌研究领域的应用进展作一综述,旨在为肝癌的因果关联研究提供新思路。 展开更多
关键词 孟德尔随机化分析 肝肿瘤 全基因组关联研究
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孟德尔随机化在胰腺癌研究中的应用现状与展望 被引量:1
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作者 杜凯豪 侯立朝 +3 位作者 罗兰明慧 东小鸽 蒋威 王展 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2024年第10期2127-2136,共10页
胰腺癌的发病隐匿性强,治疗困难,早期诊断和治疗存在诸多局限性。本文总结了孟德尔随机化(MR)在胰腺癌风险因素探索中的应用进展,特别分析了肠道微生态、生活方式、代谢性疾病等因素的因果关系。通过大规模基因组关联研究(GWAS)数据,MR... 胰腺癌的发病隐匿性强,治疗困难,早期诊断和治疗存在诸多局限性。本文总结了孟德尔随机化(MR)在胰腺癌风险因素探索中的应用进展,特别分析了肠道微生态、生活方式、代谢性疾病等因素的因果关系。通过大规模基因组关联研究(GWAS)数据,MR分析揭示了若干与胰腺癌风险相关的生物标志物。双样本MR是当前研究中的常用方法,包括逆方差加权法、加权中位数、MR-Egger法等,有助于从遗传角度解释疾病的因果网络。尽管MR策略可以为理解胰腺癌的病因学提供新视角,但其在数据合成、工具变量选择及多效性评估方面仍需谨慎。新兴分析模型如贝叶斯加权MR(BWMR)、CAUSE和多变量MR(MVMR)等,为综合评估多重风险因素及其相互关系带来新的可能。未来,结合上述方法及累积增多的遗传流行病学资料,MR分析预期能够为发现胰腺癌的潜在治疗靶点和制订预防策略提供更为坚实的证据基础。 展开更多
关键词 胰腺肿瘤 孟德尔随机化分析 因果律
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半胱氨酸蛋白酶抑制剂C与骨质疏松和骨折具有相关性:一项基于孟德尔随机化的观察性研究
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作者 王文惠 王晗 +1 位作者 雷署丰 何培 《中南大学学报(医学版)》 CSCD 北大核心 2024年第10期1622-1632,共11页
目的:骨质疏松症以骨量减低和骨组织微结构损坏为特征,常引发脆性骨折。骨密度低是导致骨折的关键危险因素。血清半胱氨酸蛋白酶抑制剂C(cystatin C,CysC)是肾小球滤过率的内源性标志物,与骨密度呈负相关,可能是骨质疏松症的潜在危险因... 目的:骨质疏松症以骨量减低和骨组织微结构损坏为特征,常引发脆性骨折。骨密度低是导致骨折的关键危险因素。血清半胱氨酸蛋白酶抑制剂C(cystatin C,CysC)是肾小球滤过率的内源性标志物,与骨密度呈负相关,可能是骨质疏松症的潜在危险因素。本研究旨在通过队列分析和孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析相结合的方法,探究CysC与骨质疏松症和骨折在普通人群中的关联和潜在的致病机制。方法:利用英国生物银行的大规模前瞻性队列数据和欧洲人群的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)汇总统计数据(严格设置排除标准:非白人种族、甲状腺疾病、胃肠功能障碍、肾脏疾病、类风湿性疾病、恶性肿瘤、慢性感染或炎症性疾病、糖尿病和高血压等特殊疾病人群,以及正在服用影响骨代谢药物者)。采用多变量线性回归、Logistic回归和Cox比例风险模型分析CysC与骨密度、骨质疏松症和骨折发生风险的关系。所有分析均采用3个递进模型调整混杂因素:3种不同模型进行分析:模型1调整人口学特征和生活方式因素,模型2在模型1基础上进一步调整肾功能,模型3在模型2基础上调整体力活动水平。通过限制性立方样条模型探究其非线性关系,并使用MR分析评估CysC与骨质疏松症及骨折之间的因果关联。结果:多变量分析显示,在调整基本变量后(模型1),总研究参与者中CysC与估计骨密度(estimated bone mineral density,eBMD)不存在相关性,但是在经过性别分层的男性和女性中均呈显著负相关(均P<0.001)。在调整肾功能(模型2)和体力活动水平(模型3)后,总研究参与者中CysC与eBMD开始呈负相关(P<0.001)。此外,多变量Logistic回归均显示CysC浓度与骨质疏松风险呈显著正相关(P<0.01),这种关联在所有分析模型中均保持稳定。在所有人群和模型中,多变量Cox回归分析结果均显示Q4组的CysC与骨质疏松症发生风险均呈正相关(均P<0.001)。在总人群中,Q4组的CysC与骨折之间的正向关联仅在模型2和模型3中出现,风险比均为1.118(均P<0.001)。然而经过性别分层后,这种关联在男性中消失(P>0.05)。此外,限制性立方样条回归分析结果显示CysC与骨质疏松症和骨折的发病存在非线性关系(P<0.05)。通过筛选167个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)作为工具变量进行MR分析,结果显示CysC与骨质疏松症和骨折之间并不存在直接的因果关系(P≥0.05),这一发现与既往特殊人群研究结果存在差异。结论:CysC水平升高与骨质疏松症和骨折风险增加具有显著相关性,这种关联在女性中表现更为明显。肾功能和体力活动水平可能是影响这种关联的重要因素。CysC与骨质疏松和骨折之间的关联可能的机制包括CysC升高导致维生素D和矿物质代谢异常,抑制骨形成;肾功能损伤加重炎症水平,影响骨吸收;或在骨质疏松症状态下,破骨细胞分化增加导致CysC水平升高。这些发现支持将CysC作为预测潜在骨质疏松症的生物学指标的可能性。 展开更多
关键词 半胱氨酸蛋白酶抑制剂C 骨质疏松症 骨折 孟德尔随机化分析 前瞻性队列研究
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缺血性卒中领域孟德尔随机化研究的文献计量学与可视化分析
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作者 李兰欣 许喆 +5 位作者 勾岚 石延枫 刘阳 赵曼曼 李昊 程丝 《中国卒中杂志》 2023年第3期273-280,共8页
目的 探讨缺血性卒中领域孟德尔随机化研究的现状及热点,为该领域未来研究方向、药物靶点挖掘方向和探索机制提供参考。方法 在WebofScience核心合集中检索截至2022年9月应用孟德尔随机化研究缺血性卒中的相关英文文献,用CiteSpace进行... 目的 探讨缺血性卒中领域孟德尔随机化研究的现状及热点,为该领域未来研究方向、药物靶点挖掘方向和探索机制提供参考。方法 在WebofScience核心合集中检索截至2022年9月应用孟德尔随机化研究缺血性卒中的相关英文文献,用CiteSpace进行发表文献的合作网络分析(国家、机构、学者)、文献共被引情况分析、关键词共现和聚类分析。利用PharmSnap全球新药数据库查询经孟德尔随机化确定与缺血性卒中具有因果关系的生物标志物的药物研发情况。结果 检索到文献200篇,相关研究2018年进入快速发展阶段。英国发文量为80篇、中介中心性为0.37、存在合作的国家有27个,美国发文量为63篇、中介中心性为0.10、存在合作的国家有21个,以上数据均位列所有国家的前3位,使英国和美国成为研究中心;中国发文量达到106篇,但仅与16个国家存在合作,相对较少;德国学者Rainer Malik发文20篇、文献共被引次数552次、合作学者25人,均位列第一。关键词聚类图中,IL-6是关键词聚类图中唯一被定义为聚类标签的生物因子,且炎症因素是关键词共现图中近3年研究第二多的缺血性卒中风险因素。应用孟德尔随机化确定的缺血性卒中生物标志物共12个,其中凝血因子Ⅺ和载脂蛋白α是更具潜力的药物靶点且已有相关药物进入临床研究阶段。结论 缺血性卒中领域的孟德尔随机化研究主要在以英国为代表的欧洲国家、美国和中国开展。IL-6等炎症因素是主要研究热点,且相关研究为凝血因子Ⅺ和载脂蛋白α等生物标志物作为药物靶点提供证据。 展开更多
关键词 缺血性卒中 孟德尔随机化分析 文献计量学 可视化分析 生物标志物
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氧化应激相关基因与前列腺癌关系的多组学分析
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作者 宁家昕 王浩然 +4 位作者 罗书航 敬吉波 王建业 侯惠民 刘明 《北京大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第4期633-643,共11页
目的:利用基于汇总数据的孟德尔随机化(summary-data-based Mendelian randomization,SMR)、共定位分析和细胞实验,从多组学角度研究氧化应激相关基因与前列腺癌(prostate cancer,PCa)之间的关系。方法:对基因甲基化、基因表达和循环蛋... 目的:利用基于汇总数据的孟德尔随机化(summary-data-based Mendelian randomization,SMR)、共定位分析和细胞实验,从多组学角度研究氧化应激相关基因与前列腺癌(prostate cancer,PCa)之间的关系。方法:对基因甲基化、基因表达和循环蛋白质的汇总级数据在下载后进行筛选,将PRACTICAL队列作为观察队列,deCODE数据库作为验证队列,使用SMR分析和依赖性工具异质性(heterogeneity in dependent instruments,HEIDI)检验评估氧化应激相关基因与PCa的关联性和异质性,采用共定位分析确定氧化应激相关基因与PCa之间是否存在共享突变。进一步对筛选出的基因采用CCK-8、细胞划痕实验、Transwell侵袭实验、蛋白免疫印迹实验探究其对PCa细胞系C4-2生物学行为的影响。结果:经过多组学分析,SCP2在基因甲基化、基因表达和循环蛋白质层面均被确定为与PCa风险增加存在显著关联性,而GSTP1在基因甲基化和循环蛋白质层面,LPO在循环蛋白质层面被认为与PCa风险增加存在显著关联。在基因甲基化层面,SCP2的cg00581603(OR=1.11,95%CI:1.05~1.17)和cg13078931(OR=1.12,95%CI:1.05~1.18)甲基化被认为是PCa的致病因素;GSTP1的cg05244766(OR=0.89,95%CI:0.84~0.95)甲基化被认为是PCa的保护因素。在基因表达层面,SCP2(OR=1.05,95%CI:1.02~1.07)同样被确定为PCa的致病因素。在循环蛋白质层面,SCP2(OR=2.10,95%CI:1.34~3.29)显示出了与基因甲基化和基因表达层面一致的PCa致病趋势,此外,GSTP1(OR=1.16,95%CI:1.07~1.25)和LPO(OR=1.12,95%CI:1.05~1.19)都与PCa风险增加显著相关。进一步的细胞实验表明,敲除SCP2能显著降低PCa细胞的致癌表型。结论:通过多组学分析和细胞实验验证,本研究证实了SCP2与PCa发生风险增加之间存在显著关联性,这一发现加深了对PCa发病机制的了解,并为PCa治疗提供了新的靶点和治疗方向。 展开更多
关键词 孟德尔随机化分析 前列腺肿瘤 氧化应激 多组学分析
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基于两样本孟德尔随机化的失眠与2型糖尿病关联研究
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作者 马雨佳 卢燃藜 +4 位作者 周泽宸 李晓怡 闫泽玉 武轶群 陈大方 《北京大学学报(医学版)》 CAS 2024年第1期174-178,共5页
目的:为克服观察性研究中的混杂因素和反向因果关系的影响,通过两样本孟德尔随机化法探讨失眠与2型糖尿病之间的关联关系。方法:在欧洲裔人群最新的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)中选择与失眠密切相关的遗传位... 目的:为克服观察性研究中的混杂因素和反向因果关系的影响,通过两样本孟德尔随机化法探讨失眠与2型糖尿病之间的关联关系。方法:在欧洲裔人群最新的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)中选择与失眠密切相关的遗传位点作为工具变量。剔除与吸烟、体育活动、饮酒、教育程度、肥胖或2型糖尿病显著相关的位点后,使用逆方差加权评估失眠对2型糖尿病的效应,并采用加权中位数法和MR-Egger回归分析来检验结果的稳健性。通过计算F统计量来检验工具变量的适用性,F统计量大于10认为存在弱工具变量偏倚可能性较小。采用MR-Egger回归进行多效性检验。此外,采用留一法(leave-one-out)进行敏感性分析,以进一步验证结果的稳定性和可靠性。结果:在全基因组水平上选择了248个与失眠独立相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)作为候选工具变量集合,基于千人基因组计划对候选工具变量集合进行修剪并剔除潜在的多效SNPs后,共纳入与失眠相关的167个SNPs作为最终的工具变量。本研究中F统计量为39.74,符合孟德尔随机化的相关性假设。逆方差加权法发现失眠与2型糖尿病的发生风险较高,在失眠的人群中发生2型糖尿病的风险是无失眠人群的1.14倍(95%CI:1.09~1.21,P<0.001)。加权中位数法和MR-Egger回归结果支持失眠对2型糖尿病存在正向关联。多效性检验表明结果受多效性影响的可能性较小,敏感性分析支持研究结果的可靠性与稳定性。结论:失眠是2型糖尿病的危险因素,失眠与2型糖尿病发病存在正向关联,本研究为糖尿病高危人群保持健康的生活方式提供了进一步的理论依据。 展开更多
关键词 入睡和睡眠障碍 糖尿病 2型 孟德尔随机化分析
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