目的 使用孟德尔随机化(MR)分析方法探究近视与特定免疫细胞之间的因果关系。方法 对OPEN-GWAS数据库进行数据挖掘和分析,选取731种免疫细胞特征作为暴露因素,近视作为结局因素。设置显著阈值,筛选与免疫细胞及近视显著相关的单核苷酸...目的 使用孟德尔随机化(MR)分析方法探究近视与特定免疫细胞之间的因果关系。方法 对OPEN-GWAS数据库进行数据挖掘和分析,选取731种免疫细胞特征作为暴露因素,近视作为结局因素。设置显著阈值,筛选与免疫细胞及近视显著相关的单核苷酸多态性(SNP),并排除弱工具变量偏倚的影响。主要的分析方法是采用逆方差加权法(IVW),同时使用简单模式法、加权中位数法、加权模式法和MR-Egger回归进行数据分析。通过比值比和95%置信区间评估循环免疫细胞与近视的因果关系。对于符合假设的免疫细胞SNP,采用Cochran Q检验来评估异质性,并使用MR-Egger回归和MR-PRESSO法来排除SNP的水平多效性,利用留一法分析来评估显著结果是否由单个SNP影响。为了避免反向因果关系,本研究将近视作为暴露变量,免疫细胞表型为结果变量进行反向MR分析。此外,采用多变量MR分析(MVMR)评估这些免疫细胞对近视的因果和独立效应。结果 (1)两样本MR IVW法结果显示,Memory B cell AC(B细胞)和CD24+CD27+AC(B细胞)是近视发生的保护因素。Naive CD8br%CD8br(T细胞)、CD39+CD8br AC(T细胞)、CD25 on CD39+activated Treg(T细胞)、PDL-1 on CD14+CD16+monocyte(单核细胞)以及CD80 on myeloid DC(髓系树突状细胞)是近视发生的风险因素,且其余MR-Egger等方法结果与IVW方向一致。MR-Egger回归和MR-PRESSO分析表明,不存在水平多效性(P>0.05)。(2)双样本反向MR分析结果显示,近视与上述7种免疫细胞之间均无双向因果关系(均为P>0.05)。(3)在MVMR分析中,CD80 on myeloid DC与近视之间的显著因果关系在调整了潜在的混杂变量后依然稳健。结论 本研究通过遗传学手段,揭示了多种免疫表型与近视之间的复杂因果关系,展示了免疫系统与近视之间相互作用的复杂调控模式。展开更多
目的:探讨肠道微生物与乳房恶性肿瘤之间的因果关系,并通过孟德尔随机化(MR)分析确定特定因果微生物分类群。方法:对有关肠道微生物群和乳房恶性肿瘤的全基因组关联研究(GWAS)汇总统计数据,MiBioGen研究GWAS(N=18473)作为暴露样本,IEU O...目的:探讨肠道微生物与乳房恶性肿瘤之间的因果关系,并通过孟德尔随机化(MR)分析确定特定因果微生物分类群。方法:对有关肠道微生物群和乳房恶性肿瘤的全基因组关联研究(GWAS)汇总统计数据,MiBioGen研究GWAS(N=18473)作为暴露样本,IEU Open GWAS数据库中乳房恶性肿瘤的GWAS(N=123579)作为结果样本。采用逆方差加权(IVW)、加权中位数和MR-Egger方法分析MR统计结果。结果:巴斯德菌目(Pasteurellales)丰度的升高会增加乳房恶性肿瘤患病风险(IVW PFDR<0.05,OR=1.21,95%CI:1.07~1.36),水平基因多效性和异质性检测验证不会对因果关系产生影响,留一法敏感性分析表明,已确定的因果关联不是由任何单个工具变量驱动的,因果关系为正向。结论:肠道中巴斯德菌目丰度升高可能会增加乳房恶性肿瘤的发生风险。展开更多
目的通过孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究肠道菌群与肠套叠的关系。方法使用来自MiBioGen和FinnGen联盟的全基因组关联研究(Genome-wide Association Study,GWAS)汇总统计数据,进行双样本MR分析。通过逆方差加权法(invers...目的通过孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究肠道菌群与肠套叠的关系。方法使用来自MiBioGen和FinnGen联盟的全基因组关联研究(Genome-wide Association Study,GWAS)汇总统计数据,进行双样本MR分析。通过逆方差加权法(inverse variance weighted,IVW)、MR-Egger回归法、加权中位数(weighted median estimator,WME)法、加权模型和MR-PRESSO回归法等分析肠道菌群与肠套叠之间的因果关系。结果共纳入211个菌群的3631个工具变量。IVW法共检测出5种肠道细菌与肠套叠有关,其中双歧杆菌对肠套叠的发生反向相关(OR=0.376,95%CI:0.157~0.899),瘤胃球菌(OR=1.461,95%CI:1.058~2.807)、阿德勒克罗伊茨菌(OR=1.893,95%CI:0.318~3.502)、蒜头藻菌(OR=1.715,95%CI:1.009~2.915)、梭状芽孢杆菌(OR=1.974,95%CI:1.046~4.451)与肠套叠的发生正向相关。MR-PRESSO回归分析与MR-Egger回归分析结果表明,不存在异质性及水平多效性。结论双歧杆菌可能降低肠套叠及术后复套的发生风险,瘤胃球菌、阿德勒克罗伊茨菌、蒜头藻菌、梭状芽孢杆菌可能增加肠套叠的发病风险。展开更多
文摘目的 使用孟德尔随机化(MR)分析方法探究近视与特定免疫细胞之间的因果关系。方法 对OPEN-GWAS数据库进行数据挖掘和分析,选取731种免疫细胞特征作为暴露因素,近视作为结局因素。设置显著阈值,筛选与免疫细胞及近视显著相关的单核苷酸多态性(SNP),并排除弱工具变量偏倚的影响。主要的分析方法是采用逆方差加权法(IVW),同时使用简单模式法、加权中位数法、加权模式法和MR-Egger回归进行数据分析。通过比值比和95%置信区间评估循环免疫细胞与近视的因果关系。对于符合假设的免疫细胞SNP,采用Cochran Q检验来评估异质性,并使用MR-Egger回归和MR-PRESSO法来排除SNP的水平多效性,利用留一法分析来评估显著结果是否由单个SNP影响。为了避免反向因果关系,本研究将近视作为暴露变量,免疫细胞表型为结果变量进行反向MR分析。此外,采用多变量MR分析(MVMR)评估这些免疫细胞对近视的因果和独立效应。结果 (1)两样本MR IVW法结果显示,Memory B cell AC(B细胞)和CD24+CD27+AC(B细胞)是近视发生的保护因素。Naive CD8br%CD8br(T细胞)、CD39+CD8br AC(T细胞)、CD25 on CD39+activated Treg(T细胞)、PDL-1 on CD14+CD16+monocyte(单核细胞)以及CD80 on myeloid DC(髓系树突状细胞)是近视发生的风险因素,且其余MR-Egger等方法结果与IVW方向一致。MR-Egger回归和MR-PRESSO分析表明,不存在水平多效性(P>0.05)。(2)双样本反向MR分析结果显示,近视与上述7种免疫细胞之间均无双向因果关系(均为P>0.05)。(3)在MVMR分析中,CD80 on myeloid DC与近视之间的显著因果关系在调整了潜在的混杂变量后依然稳健。结论 本研究通过遗传学手段,揭示了多种免疫表型与近视之间的复杂因果关系,展示了免疫系统与近视之间相互作用的复杂调控模式。
文摘目的:探讨肠道微生物与乳房恶性肿瘤之间的因果关系,并通过孟德尔随机化(MR)分析确定特定因果微生物分类群。方法:对有关肠道微生物群和乳房恶性肿瘤的全基因组关联研究(GWAS)汇总统计数据,MiBioGen研究GWAS(N=18473)作为暴露样本,IEU Open GWAS数据库中乳房恶性肿瘤的GWAS(N=123579)作为结果样本。采用逆方差加权(IVW)、加权中位数和MR-Egger方法分析MR统计结果。结果:巴斯德菌目(Pasteurellales)丰度的升高会增加乳房恶性肿瘤患病风险(IVW PFDR<0.05,OR=1.21,95%CI:1.07~1.36),水平基因多效性和异质性检测验证不会对因果关系产生影响,留一法敏感性分析表明,已确定的因果关联不是由任何单个工具变量驱动的,因果关系为正向。结论:肠道中巴斯德菌目丰度升高可能会增加乳房恶性肿瘤的发生风险。
文摘目的通过孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究肠道菌群与肠套叠的关系。方法使用来自MiBioGen和FinnGen联盟的全基因组关联研究(Genome-wide Association Study,GWAS)汇总统计数据,进行双样本MR分析。通过逆方差加权法(inverse variance weighted,IVW)、MR-Egger回归法、加权中位数(weighted median estimator,WME)法、加权模型和MR-PRESSO回归法等分析肠道菌群与肠套叠之间的因果关系。结果共纳入211个菌群的3631个工具变量。IVW法共检测出5种肠道细菌与肠套叠有关,其中双歧杆菌对肠套叠的发生反向相关(OR=0.376,95%CI:0.157~0.899),瘤胃球菌(OR=1.461,95%CI:1.058~2.807)、阿德勒克罗伊茨菌(OR=1.893,95%CI:0.318~3.502)、蒜头藻菌(OR=1.715,95%CI:1.009~2.915)、梭状芽孢杆菌(OR=1.974,95%CI:1.046~4.451)与肠套叠的发生正向相关。MR-PRESSO回归分析与MR-Egger回归分析结果表明,不存在异质性及水平多效性。结论双歧杆菌可能降低肠套叠及术后复套的发生风险,瘤胃球菌、阿德勒克罗伊茨菌、蒜头藻菌、梭状芽孢杆菌可能增加肠套叠的发病风险。
