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基于DNA条形码序列的天目竹节人参及其近缘种系统进化分析
1
作者
肖文斐
严建立
+1 位作者
忻雅
柴伟国
《浙江农业科学》
2025年第3期623-626,共4页
为探讨天目竹节人参的进化地位,以天目竹节人参为试材,利用PCR法扩增ITS1/ITS2、ITS2、psbA-trnH、rbcL等4种DNA条形码标记片段序列,同时从NCBI下载8种人参属植物及3种外属植物的同源序列,利用MEGA 11.0软件构建系统发育树,从分子水平...
为探讨天目竹节人参的进化地位,以天目竹节人参为试材,利用PCR法扩增ITS1/ITS2、ITS2、psbA-trnH、rbcL等4种DNA条形码标记片段序列,同时从NCBI下载8种人参属植物及3种外属植物的同源序列,利用MEGA 11.0软件构建系统发育树,从分子水平上对天目竹节人参及其近缘种植物进行比较与系统进化分析。结果表明,ITS1/ITS2序列在种间差异较大,种内较为保守;ITS2序列多态性最丰富,种内也存在分离;psbA-trnH及rbcL序列对某些近缘种无法有效区分。基于ITS1/ITS2序列采用邻接法(neighbor joining)构建进化树,结果显示,天目竹节人参与人参、西洋参亲缘关系较近,归为同一类群;与三七和恩施竹节参差异大于种间最小遗传差异。上述人参属植物种间的遗传距离在0.003~0.033,表明这些物种亲缘关系较近。该研究对人参属的遗传资源保护和探索具有重要意义。
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关键词
天目竹节人参
人参
属
DNA条形码
系统进化
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题名
基于DNA条形码序列的天目竹节人参及其近缘种系统进化分析
1
作者
肖文斐
严建立
忻雅
柴伟国
机构
杭州市农业科学研究院
出处
《浙江农业科学》
2025年第3期623-626,共4页
基金
浙江省公益性技术应用研究项目(LGN21C020003)。
文摘
为探讨天目竹节人参的进化地位,以天目竹节人参为试材,利用PCR法扩增ITS1/ITS2、ITS2、psbA-trnH、rbcL等4种DNA条形码标记片段序列,同时从NCBI下载8种人参属植物及3种外属植物的同源序列,利用MEGA 11.0软件构建系统发育树,从分子水平上对天目竹节人参及其近缘种植物进行比较与系统进化分析。结果表明,ITS1/ITS2序列在种间差异较大,种内较为保守;ITS2序列多态性最丰富,种内也存在分离;psbA-trnH及rbcL序列对某些近缘种无法有效区分。基于ITS1/ITS2序列采用邻接法(neighbor joining)构建进化树,结果显示,天目竹节人参与人参、西洋参亲缘关系较近,归为同一类群;与三七和恩施竹节参差异大于种间最小遗传差异。上述人参属植物种间的遗传距离在0.003~0.033,表明这些物种亲缘关系较近。该研究对人参属的遗传资源保护和探索具有重要意义。
关键词
天目竹节人参
人参
属
DNA条形码
系统进化
Keywords
Panax japonicus(TianMu)
Panax
DNA barcode
phylogenetics
分类号
S567.51 [农业科学—中草药栽培]
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作者
出处
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被引量
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1
基于DNA条形码序列的天目竹节人参及其近缘种系统进化分析
肖文斐
严建立
忻雅
柴伟国
《浙江农业科学》
2025
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