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小鼠大脑皮层层次特异表达基因天然反义转录物的筛选与鉴定
被引量:
1
1
作者
李萍
张靖
+4 位作者
李爱花
王珊
谈小超
阴彬
彭小忠
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期620-623,共4页
目的筛选并鉴定小鼠大脑皮层发育过程中皮层层次特异表达的基因是否存在天然反义转录物(NAT)。方法对63个小鼠大脑皮层层次特异表达的基因进行生物信息学预测,筛选出31个可能存在NAT的基因,从小鼠脑组织及神经系统来源的细胞系提取总RNA...
目的筛选并鉴定小鼠大脑皮层发育过程中皮层层次特异表达的基因是否存在天然反义转录物(NAT)。方法对63个小鼠大脑皮层层次特异表达的基因进行生物信息学预测,筛选出31个可能存在NAT的基因,从小鼠脑组织及神经系统来源的细胞系提取总RNA,采用RT-PCR方法对筛选阳性基因进行鉴定并克隆到pGEM-T载体中进行测序。结果 31个经生物信息学预测的基因中,8个为NAT阳性。结论小鼠大脑皮层发育过程中皮层层次特异表达的基因存在NAT,NAT可能通过调控编码基因影响小鼠皮层发育。
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关键词
天然反义转录物
小鼠大脑皮层
筛选
鉴定
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职称材料
天然反义转录物及其调控基因的表达机制
被引量:
9
2
作者
谢兆辉
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期122-128,共7页
天然反义转录(NATs)是一组编码蛋白质或非编码蛋白质的RNAs,与其他(有义)转录物具有互补序列,可以调节有义链的表达。这种调节可以发生在转录水平或转录后水平,调节方式有转录干扰、RNA封闭、双链依赖机制或染色质重建(修饰)等。正义链...
天然反义转录(NATs)是一组编码蛋白质或非编码蛋白质的RNAs,与其他(有义)转录物具有互补序列,可以调节有义链的表达。这种调节可以发生在转录水平或转录后水平,调节方式有转录干扰、RNA封闭、双链依赖机制或染色质重建(修饰)等。正义链和反义链分别加工成小RNAs调节基因表达,也是NATs调节基因表达的重要方式,如piRNAs的"乒乓机制"。实验或计算机研究已经证明了NATs在生物中广泛存在,是一种重要的基因表达调节方式。文章论述了NATs的重要作用和机理,重点论述了NATs的调节机制和相关的小RNAs。
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关键词
天然反义转录物
转录
干扰
RNA封闭
双链依赖机制
染色质重建(修饰)
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职称材料
Dlx1的天然反义转录物在大脑发育中的功能探索
被引量:
2
3
作者
吴朝
赵阿妮
+2 位作者
朱丽媛
阴彬
张靖
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期607-610,共4页
目的探索Dlx1的天然反义转录物(Dlx1as)在小鼠大脑发育过程中的功能。方法根据生物信息学分析与分子生物学实验验证Dlx1as是否具有多聚腺苷酸尾,采用实时定量PCR检测Dlx1as与Dlx1 mRNA在小鼠大脑发育过程中随时间的变化,利用原位杂交的...
目的探索Dlx1的天然反义转录物(Dlx1as)在小鼠大脑发育过程中的功能。方法根据生物信息学分析与分子生物学实验验证Dlx1as是否具有多聚腺苷酸尾,采用实时定量PCR检测Dlx1as与Dlx1 mRNA在小鼠大脑发育过程中随时间的变化,利用原位杂交的技术比较Dlx1as与Dlx1 mRNA空间表达谱。结果 Dlx1as具有多聚腺苷酸尾,在小鼠的胚胎发育过程中,从E14.5到E18.5高表达,与Dlx1 mRNA在各时间点表达水平虽比较接近,但在表达区域存在互补的特点。结论 Dlx1as在小鼠大脑发育过程中有一段时间的高表达,与蛋白编码基因Dlx1 mRNA空间互补,推测其可能是通过调控Dlx1 mRNA来影响小鼠的大脑发育。
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关键词
Dlx1as
小鼠大脑发育
天然反义转录物
原位杂交
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职称材料
题名
小鼠大脑皮层层次特异表达基因天然反义转录物的筛选与鉴定
被引量:
1
1
作者
李萍
张靖
李爱花
王珊
谈小超
阴彬
彭小忠
机构
中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室
出处
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期620-623,共4页
基金
国家自然科学基金(31071203)
Supported by the National Natural Sciences Foundation of China(31071203)
文摘
目的筛选并鉴定小鼠大脑皮层发育过程中皮层层次特异表达的基因是否存在天然反义转录物(NAT)。方法对63个小鼠大脑皮层层次特异表达的基因进行生物信息学预测,筛选出31个可能存在NAT的基因,从小鼠脑组织及神经系统来源的细胞系提取总RNA,采用RT-PCR方法对筛选阳性基因进行鉴定并克隆到pGEM-T载体中进行测序。结果 31个经生物信息学预测的基因中,8个为NAT阳性。结论小鼠大脑皮层发育过程中皮层层次特异表达的基因存在NAT,NAT可能通过调控编码基因影响小鼠皮层发育。
关键词
天然反义转录物
小鼠大脑皮层
筛选
鉴定
Keywords
natural antisense transcript
mouse cerebral cortex
screening
identification
分类号
R739.41 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
天然反义转录物及其调控基因的表达机制
被引量:
9
2
作者
谢兆辉
机构
德州学院生物系
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期122-128,共7页
基金
山东省自然科学基金项目(编号:Y2008D36)资助
文摘
天然反义转录(NATs)是一组编码蛋白质或非编码蛋白质的RNAs,与其他(有义)转录物具有互补序列,可以调节有义链的表达。这种调节可以发生在转录水平或转录后水平,调节方式有转录干扰、RNA封闭、双链依赖机制或染色质重建(修饰)等。正义链和反义链分别加工成小RNAs调节基因表达,也是NATs调节基因表达的重要方式,如piRNAs的"乒乓机制"。实验或计算机研究已经证明了NATs在生物中广泛存在,是一种重要的基因表达调节方式。文章论述了NATs的重要作用和机理,重点论述了NATs的调节机制和相关的小RNAs。
关键词
天然反义转录物
转录
干扰
RNA封闭
双链依赖机制
染色质重建(修饰)
Keywords
natural antisense transcripts (NATs) transcriptional interference RNA masking dsRNA-dependent mechanisms chromatin remodelling (modification)
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
Dlx1的天然反义转录物在大脑发育中的功能探索
被引量:
2
3
作者
吴朝
赵阿妮
朱丽媛
阴彬
张靖
机构
中国医学科学院基础医学研究所
北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室
出处
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期607-610,共4页
基金
国家自然科学基金(31071203)~~
文摘
目的探索Dlx1的天然反义转录物(Dlx1as)在小鼠大脑发育过程中的功能。方法根据生物信息学分析与分子生物学实验验证Dlx1as是否具有多聚腺苷酸尾,采用实时定量PCR检测Dlx1as与Dlx1 mRNA在小鼠大脑发育过程中随时间的变化,利用原位杂交的技术比较Dlx1as与Dlx1 mRNA空间表达谱。结果 Dlx1as具有多聚腺苷酸尾,在小鼠的胚胎发育过程中,从E14.5到E18.5高表达,与Dlx1 mRNA在各时间点表达水平虽比较接近,但在表达区域存在互补的特点。结论 Dlx1as在小鼠大脑发育过程中有一段时间的高表达,与蛋白编码基因Dlx1 mRNA空间互补,推测其可能是通过调控Dlx1 mRNA来影响小鼠的大脑发育。
关键词
Dlx1as
小鼠大脑发育
天然反义转录物
原位杂交
Keywords
Dlxl as
mice brain development
nature antisense transcript
in situ hybridization
分类号
Q752 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小鼠大脑皮层层次特异表达基因天然反义转录物的筛选与鉴定
李萍
张靖
李爱花
王珊
谈小超
阴彬
彭小忠
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
天然反义转录物及其调控基因的表达机制
谢兆辉
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010
9
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
Dlx1的天然反义转录物在大脑发育中的功能探索
吴朝
赵阿妮
朱丽媛
阴彬
张靖
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
2
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职称材料
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