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基于弹性网络的大鼠肝再生关键基因选择被引量：2: 1; 作者王小玉陈留院 +3 位作者刘云卿杨云李钧涛徐存拴《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2013年第5期26-28,共3页; 针对大鼠肝再生基因表达谱芯片数据挖掘问题,通过把肝再生过程划分为8个不同时间的子过程,将其转化为二分类问题,进而利用弹性网络对每1个子过程分别进行分类和相关基因选择.此外,以细胞增殖为主线,分析了所选择基因间的通路关系,验证... 展开更多; 关键词大鼠肝再生弹性网络基因选择; 在线阅读下载PDF 职称材料

Toll样受体信号通路的3条途径在大鼠肝再生中抑制库普弗细胞免疫反应被引量：1: 2; 作者何玉贵常翠芳 +6 位作者耿直许果果和婷婷梅金鑫周晓春杨亚娟徐存拴《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2014年第4期100-105,共6页; 为从基因转录水平了解大鼠肝再生中Toll样受体信号通路调节库普弗细胞免疫反应的途径和方式,首先建立大鼠2/3肝切除(partial hepatectomy,PH)模型,从中分离库普弗细胞进行基因微阵列分析.发现Toll样受体信号通路的23个基因及其调节免疫... 展开更多; 关键词大鼠肝再生 TOLL样受体信号通路库普弗细胞免疫反应基因表达谱关键基因; 在线阅读下载PDF 职称材料

NF-κB信号通路在大鼠肝再生中调节肝细胞增殖的机理研究被引量：1: 3; 作者王彬彬常翠芳 +2 位作者鲁艳平贾艺峰徐存拴《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2013年第6期167-171,共5页; 为了解大鼠肝再生中肝细胞NF-κB信号通路对肝细胞增殖的调节作用,用Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠肝再生中NF-κB信号通路相关基因表达变化发现,芯片含138个NF-κB信号通路基因,其中46个基因与大鼠肝再生相关.用Ingenuity Pathway An... 展开更多; 关键词大鼠肝再生肝细胞增殖 NF-ΚB信号通路通路创建与分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

大鼠肝再生中肝细胞基因表达与DNA裸露的相关性研究: 4; 作者张亚磊秦丹 +1 位作者王改平徐存拴《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2013年第6期172-177,共6页; 为了解大鼠肝再生中肝细胞的基因表达与DNA裸露的相关性,分离大鼠肝细胞,提取裸露DNA,用SOLEXA方法对DNA测序,用BWA软件拼装测序片段,用IPA软件分析拼装的基因种类和作用,用Rat Genome230 2.0芯片检测基因的转录情况.研究表明,大鼠肝再... 展开更多; 关键词大鼠肝细胞大鼠肝再生裸露DNA 基因转录; 在线阅读下载PDF 职称材料

大鼠再生肝8种细胞的一碳代谢相关基因转录谱研究: 5; 作者张春艳于亚男 +2 位作者宗慧李静雯徐存拴《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期181-184,共4页; 为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的一碳代谢相关基因转录谱及其预示的代谢活动,分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的一碳代谢相关基因表达变化,分析其表达模式及预示的生理活动.结果表明,肝星形细胞的甲硫氨酸转化为S-腺苷甲硫氨酸活动... 展开更多; 关键词大鼠肝再生 RAT GENOME 230 2.0芯片基因转录谱一碳代谢; 在线阅读下载PDF 职称材料

大鼠再生肝8种肝脏细胞的生物氧化相关基因转录谱预示的生理活动被引量：4: 6; 作者杨莹张丽君 +1 位作者刘焕之徐存拴《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期176-180,共5页; 为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的生物氧化相关基因转录谱及其预示的生理活动,用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞和树突状细胞等... 展开更多; 关键词大鼠肝再生 Rat Genome 230 2.0芯片基因转录谱生物氧化; 在线阅读下载PDF 职称材料

大鼠再生肝8种细胞的嘧啶核苷酸代谢相关基因转录谱预示的生理活动被引量：1: 7; 作者王撒房连聪 +1 位作者袁美玲徐存拴《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期185-188,共4页; 为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的嘧啶核苷酸代谢相关基因转录谱及其预示的代谢活动,分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的嘧啶核苷酸代谢相关基因表达变化,分析其表达模式及预示的生理活动.结果表明,50个嘧啶核苷酸代谢相关基因在大鼠... 展开更多; 关键词大鼠肝再生肝脏细胞 RAT Genome2302.0芯片基因转录谱嘧啶核苷酸代谢; 在线阅读下载PDF 职称材料

新基因BM390716、BI274487和AA963863与大鼠再生肝8种细胞的细胞外基质代谢: 8; 作者王泽文园园 +3 位作者程振朝郭学强张新胜徐存拴《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期378-388,共11页; 为了解新基因BM390716、BI274487、AA963863在细胞外基质代谢中的作用及其与大鼠肝再生的相关性,文章用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选分离大鼠再生肝的8种细胞,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们的基因表达变化,用Microsoft Exce... 展开更多; 关键词大鼠肝再生 RatGenome 230 2.0芯片基因的同源性和共表达细胞外基质代谢; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于弹性网络的大鼠肝再生关键基因选择被引量：2: 1; 作者王小玉陈留院刘云卿杨云李钧涛徐存拴; 机构河南师范大学数学与信息科学学院河南师范大学学报编辑部河南师范大学河南省-科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地; 出处《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2013年第5期26-28,共3页; 基金国家自然科学基金(61203293) 河南省重点科技攻关计划(122102210131 +5 种基金 122102210132) 132300410390) 河南省高校青年骨干教师资助计划(2012GGJS-063); 文摘针对大鼠肝再生基因表达谱芯片数据挖掘问题,通过把肝再生过程划分为8个不同时间的子过程,将其转化为二分类问题,进而利用弹性网络对每1个子过程分别进行分类和相关基因选择.此外,以细胞增殖为主线,分析了所选择基因间的通路关系,验证了所选基因的生物合理性.; 关键词大鼠肝再生弹性网络基因选择; Keywords rat liver regeneration elastic net gene selection; 分类号 TP273 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名Toll样受体信号通路的3条途径在大鼠肝再生中抑制库普弗细胞免疫反应被引量：1: 2; 作者何玉贵常翠芳耿直许果果和婷婷梅金鑫周晓春杨亚娟徐存拴; 机构河南省科技部共建细胞分化国家重点实验室培育基地河南师范大学生命科学学院; 出处《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2014年第4期100-105,共6页; 基金国家自然科学基金(31201093) 河南省基础与前沿技术研究资助项目(122300413207); 文摘为从基因转录水平了解大鼠肝再生中Toll样受体信号通路调节库普弗细胞免疫反应的途径和方式,首先建立大鼠2/3肝切除(partial hepatectomy,PH)模型,从中分离库普弗细胞进行基因微阵列分析.发现Toll样受体信号通路的23个基因及其调节免疫反应的62个基因与大鼠肝再生相关.基因协同作用(Ep(t)值)和同类提取法分析表明,大鼠肝再生进展阶段,Toll样受体信号通路通过TLR/NF-κB,TLR/MAPK,TLR/IRF等3条途径和TLR4,MAL,UNC93B1,AP1S2,IRF1等5个关键基因抑制库普弗细胞免疫反应.; 关键词大鼠肝再生 TOLL样受体信号通路库普弗细胞免疫反应基因表达谱关键基因; Keywords rat liver regeneration Toll-like receptor signaling pathway Kupffer cells immune response gene expres- sion profiles key genes; 分类号 Q257 [生物学—细胞生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名NF-κB信号通路在大鼠肝再生中调节肝细胞增殖的机理研究被引量：1: 3; 作者王彬彬常翠芳鲁艳平贾艺峰徐存拴; 机构河南师范大学生命科学学院河南省一科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地; 出处《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2013年第6期167-171,共5页; 基金国家973项目前期研究专项基金资助项目(2010CB534905); 文摘为了解大鼠肝再生中肝细胞NF-κB信号通路对肝细胞增殖的调节作用,用Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠肝再生中NF-κB信号通路相关基因表达变化发现,芯片含138个NF-κB信号通路基因,其中46个基因与大鼠肝再生相关.用Ingenuity Pathway Analysis 9.0(IPA)软件解析上述基因表达变化预示的该信号通路调节肝细胞增殖作用发现,该通路的白细胞介素-1(IL-1)途径在大鼠肝再生起始阶段促进肝细胞增殖,生长因子(GF)途径在进展阶段促进肝细胞增殖,肿瘤坏死因子-α(TNF-α)途径在起始阶段促进肝细胞增殖,终止阶段抑制肝细胞增殖.; 关键词大鼠肝再生肝细胞增殖 NF-ΚB信号通路通路创建与分析; Keywords rat liver regeneration hepatocyte proliferation NF-κB signaling pathway Ingenuity Pathway Analysis （IPA）; 分类号 Q257 [生物学—细胞生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名大鼠肝再生中肝细胞基因表达与DNA裸露的相关性研究: 4; 作者张亚磊秦丹王改平徐存拴; 机构河南师范大学生命科学学院河南省-科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地; 出处《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2013年第6期172-177,共6页; 基金国家重点基础研究发展计划项目(973计划)(2012CB722304) 河南省基础与前沿技术研究计划项目(102300413213); 文摘为了解大鼠肝再生中肝细胞的基因表达与DNA裸露的相关性,分离大鼠肝细胞,提取裸露DNA,用SOLEXA方法对DNA测序,用BWA软件拼装测序片段,用IPA软件分析拼装的基因种类和作用,用Rat Genome230 2.0芯片检测基因的转录情况.研究表明,大鼠肝再生的12h(PH后12h),肝细胞的裸露DNA涉及16 912个基因,1 701个基因发生了有意义裸露量变化.其中,25个基因的裸露量上调,1 676个基因的裸露量下调.与Rat Genome 230 2.0芯片的检测的基因转录比对表明,肝细胞的AKR7A3,BMYC,CDC25B等26个基因的裸露量和表达量均下调,表明大鼠肝再生12h时,这些基因的表达可能受染色体结构调控.; 关键词大鼠肝细胞大鼠肝再生裸露DNA 基因转录; Keywords rat hepatocyte rat liver regeneration protein-free DNA gene transcription; 分类号 Q291 [生物学—细胞生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名大鼠再生肝8种细胞的一碳代谢相关基因转录谱研究: 5; 作者张春艳于亚男宗慧李静雯徐存拴; 机构河南师范大学生命科学学院河南省-科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地; 出处《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期181-184,共4页; 基金国家973项目前期研究专项资助(2006CB708506); 文摘为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的一碳代谢相关基因转录谱及其预示的代谢活动,分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的一碳代谢相关基因表达变化,分析其表达模式及预示的生理活动.结果表明,肝星形细胞的甲硫氨酸转化为S-腺苷甲硫氨酸活动在肝再生启动阶段增强.胆管上皮细胞的S-腺苷甲硫氨酸转化为S-腺苷高半胱氨酸、N5-甲基四氢叶酸将甲基转移给甲硫氨酸活动在进展阶段增强.肝细胞、陷窝细胞、树突状细胞的聚谷氨酸水解、四氢叶酸与N5-甲酰基四氢叶酸相互转化在肝再生3个阶段增强.结论:大鼠肝再生与一碳代谢相关.; 关键词大鼠肝再生 RAT GENOME 230 2.0芯片基因转录谱一碳代谢; Keywords rat liver regeneration Rat Genome 230 2.0 array genes transcription profiles one carbon metabolism; 分类号 Q418 [生物学—生理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名大鼠再生肝8种肝脏细胞的生物氧化相关基因转录谱预示的生理活动被引量：4: 6; 作者杨莹张丽君刘焕之徐存拴; 机构河南师范大学生命科学学院河南省-科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地; 出处《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期176-180,共5页; 基金国家973项目前期研究专项资助(2006CB708506); 文摘为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的生物氧化相关基因转录谱及其预示的生理活动,用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞和树突状细胞等8种细胞,用Rat Genome2302.0芯片等检测生物氧化相关基因在上述细胞中表达变化,用H-Cluster等软件及生物信息学和系统学生物等方法分析它们的表达模式及预示的生理活动.结果表明:38个生物氧化相关基因在大鼠肝再生中发生了有意义表达变化,相应细胞的基因数为6,32,0,2,3,1,3,2个.肝再生启动阶段和进展阶段的NAD+合成增强,从NADH到O2的电子传递及ATP合成增强.终止阶段的FADH2分解减弱,从FADH2到O2的电子传递减弱.结论:大鼠肝再生与生物氧化密切相关.; 关键词大鼠肝再生 Rat Genome 230 2.0芯片基因转录谱生物氧化; Keywords liver regeneration Rat Genome 230 2.0 array gene transcription profiles biological oxidation; 分类号 Q418 [生物学—生理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名大鼠再生肝8种细胞的嘧啶核苷酸代谢相关基因转录谱预示的生理活动被引量：1: 7; 作者王撒房连聪袁美玲徐存拴; 机构河南师范大学生命科学学院河南省-科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地; 出处《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期185-188,共4页; 基金国家973项目前期研究专项资助(2006CB708506); 文摘为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的嘧啶核苷酸代谢相关基因转录谱及其预示的代谢活动,分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的嘧啶核苷酸代谢相关基因表达变化,分析其表达模式及预示的生理活动.结果表明,50个嘧啶核苷酸代谢相关基因在大鼠肝再生中发生了有意义表达变化,8种细胞的相应基因数为25、33、16、24、15、15、21和18.肝细胞、胆管上皮细胞、窦内皮细胞的通过嘧啶核苷酸前体合成嘧啶核苷酸活动增强,除树突状细胞外其他7种细胞的嘧啶核苷酸分解代谢减弱.结论:大鼠肝再生与嘧啶核苷酸代谢密切相关.; 关键词大鼠肝再生肝脏细胞 RAT Genome2302.0芯片基因转录谱嘧啶核苷酸代谢; Keywords liver regeneration Rat Genome 230 2.0 array gene transcription profiles pyrimidine nucleotide metabolism; 分类号 Q418 [生物学—生理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名新基因BM390716、BI274487和AA963863与大鼠再生肝8种细胞的细胞外基质代谢: 8; 作者王泽文园园程振朝郭学强张新胜徐存拴; 机构河南师范大学生命科学学院河南省-科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地; 出处《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期378-388,共11页; 基金国家973项目前期研究专项(编号:2006CB708506)资助; 文摘为了解新基因BM390716、BI274487、AA963863在细胞外基质代谢中的作用及其与大鼠肝再生的相关性,文章用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选分离大鼠再生肝的8种细胞,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们的基因表达变化,用Microsoft Excel、BLAST等软件分析基因的共表达关系、序列同源性及参与的代谢活动。结果表明,BM390716与pparα同源和共表达,BI274487与timp2同源和共表达,AA963863与csgalnact1同源和共表达。根据上述基因的同源性和共表达推测,新基因BM390716、BI274487和AA963863参与大鼠再生肝8种细胞的细胞外基质代谢。; 关键词大鼠肝再生 RatGenome 230 2.0芯片基因的同源性和共表达细胞外基质代谢; Keywords liver regeneration Rat Genome 230 2.0 array gene homology and co-expression extracellular matrix metabolism; 分类号 Q78 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于弹性网络的大鼠肝再生关键基因选择	王小玉陈留院刘云卿杨云李钧涛徐存拴	《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心	2013	2	在线阅读下载PDF 职称材料
2	Toll样受体信号通路的3条途径在大鼠肝再生中抑制库普弗细胞免疫反应	何玉贵常翠芳耿直许果果和婷婷梅金鑫周晓春杨亚娟徐存拴	《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心	2014	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	NF-κB信号通路在大鼠肝再生中调节肝细胞增殖的机理研究	王彬彬常翠芳鲁艳平贾艺峰徐存拴	《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心	2013	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	大鼠肝再生中肝细胞基因表达与DNA裸露的相关性研究	张亚磊秦丹王改平徐存拴	《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心	2013	0	在线阅读下载PDF 职称材料
5	大鼠再生肝8种细胞的一碳代谢相关基因转录谱研究	张春艳于亚男宗慧李静雯徐存拴	《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2010	0	在线阅读下载PDF 职称材料
6	大鼠再生肝8种肝脏细胞的生物氧化相关基因转录谱预示的生理活动	杨莹张丽君刘焕之徐存拴	《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2010	4	在线阅读下载PDF 职称材料
7	大鼠再生肝8种细胞的嘧啶核苷酸代谢相关基因转录谱预示的生理活动	王撒房连聪袁美玲徐存拴	《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2010	1	在线阅读下载PDF 职称材料
8	新基因BM390716、BI274487和AA963863与大鼠再生肝8种细胞的细胞外基质代谢	王泽文园园程振朝郭学强张新胜徐存拴	《遗传》 CAS CSCD 北大核心	2011	0	在线阅读下载PDF 职称材料