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大黄鱼养殖海域沉积物中抗生素抗性基因分布特征及其影响因素
被引量：
2
1
作者
黄薇
刘洋
+4 位作者
饶秋华
罗钦
王为刚
宋永康
罗土炎
《农业环境科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期197-208,共12页
为揭示大黄鱼养殖海域沉积物中抗生素抗性基因(Antibiotic resistance genes,ARGs)的赋存特征及其影响因素,本研究通过野外调查采集了6个站点的大黄鱼养殖海域沉积物样品,利用宏基因组测序分析技术解析沉积物中ARGs的分布特征,同时运用...
为揭示大黄鱼养殖海域沉积物中抗生素抗性基因(Antibiotic resistance genes,ARGs)的赋存特征及其影响因素,本研究通过野外调查采集了6个站点的大黄鱼养殖海域沉积物样品,利用宏基因组测序分析技术解析沉积物中ARGs的分布特征,同时运用化学分析技术和高通量测序技术对沉积物中的环境因子以及微生物群落结构进行分析,以进一步对ARGs与环境因子以及微生物群落结构的相关性进行研究。结果显示:大黄鱼养殖海域沉积物中共检出781个ARGs亚型,分属于38种抗生素抗性类型;不同站点的优势ARGs抗生素抗性类型基本一致,主要为四环素类、大环内酯类和氟喹诺酮类,引起细菌耐药性的主要机制为外排泵。进一步相关性分析结果显示,除PNGM-1与电导率和TN呈显著正相关(P<0.05)外,其余丰度前20的ARGs均与环境因子相关性不显著(P>0.05);而丰度前20的ARGs均与丰度前20的菌属呈显著或极显著相关关系(P<0.05或P<0.01)。研究表明,大黄鱼养殖海域沉积物中含有丰富的ARGs,微生物群落是影响沉积物中ARGs分布的重要因素。
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关键词
抗生素抗性基因
宏基因组测序分析技术
大黄鱼养殖海域
沉积物
微生物群落
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职称材料
大黄鱼养殖海域水体中细菌群落结构和抗生素抗性基因分布特征
被引量：
8
2
作者
刘洋
饶秋华
+4 位作者
李水根
王为刚
张志灯
黄薇
罗土炎
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期366-373,共8页
为探究大黄鱼福建养殖海域水体中微生物群落和抗生素抗性基因(ARG)的分布特征,本研究利用MiSeq和HiSeq高通量测序技术,基于细菌16S rRNA基因V3~V4可变区,对福建6个大黄鱼密集养殖区水体中的细菌群落结构和ARG赋存特征进行研究。Ribosoma...
为探究大黄鱼福建养殖海域水体中微生物群落和抗生素抗性基因(ARG)的分布特征,本研究利用MiSeq和HiSeq高通量测序技术,基于细菌16S rRNA基因V3~V4可变区,对福建6个大黄鱼密集养殖区水体中的细菌群落结构和ARG赋存特征进行研究。Ribosomal Database Project(RDP)注释结果显示6个样品中丰度最高的门为Proteobacteria,占样品序列总数的59.62%~75.34%,不同位置大黄鱼养殖海域水体中的优势菌属存在显著差异(P<0.05)。通过与Comprehensive Antibiotic Resistance Database(CARD)数据库比对发现,水体中共检测出872个ARG,包括20种ARG基因类型;不同养殖区域的优势ARG类型基本一致,主要为四环素类、大环内酯类和氟喹诺酮类抗性基因;抗性机制主要为外排泵。相关性分析结果进一步显示,丰度前20的菌属与丰度前20的ARG均有显著相关性(P<0.05),表明微生物群落是影响大黄鱼养殖海域水体中ARG分布的重要因素。本研究为大黄鱼健康养殖及水体ARG控制及消除提供参考依据。
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关键词
抗生素抗性基因
微生物群落
高通量测序技术
大黄鱼养殖海域
养殖
水体
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职称材料
题名
大黄鱼养殖海域沉积物中抗生素抗性基因分布特征及其影响因素
被引量：
2
1
作者
黄薇
刘洋
饶秋华
罗钦
王为刚
宋永康
罗土炎
机构
福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所/福建省农产品质量安全重点实验室
福建师范大学生命科学学院
连江县水产技术推广站
出处
《农业环境科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期197-208,共12页
基金
福建省属公益类科研院所基本科研专项(2020R1022009,2022R1022002)
福建省农业科学院科技项目(YC2019011,2022KF20,CXTD2021015-3)。
文摘
为揭示大黄鱼养殖海域沉积物中抗生素抗性基因(Antibiotic resistance genes,ARGs)的赋存特征及其影响因素,本研究通过野外调查采集了6个站点的大黄鱼养殖海域沉积物样品,利用宏基因组测序分析技术解析沉积物中ARGs的分布特征,同时运用化学分析技术和高通量测序技术对沉积物中的环境因子以及微生物群落结构进行分析,以进一步对ARGs与环境因子以及微生物群落结构的相关性进行研究。结果显示:大黄鱼养殖海域沉积物中共检出781个ARGs亚型,分属于38种抗生素抗性类型;不同站点的优势ARGs抗生素抗性类型基本一致,主要为四环素类、大环内酯类和氟喹诺酮类,引起细菌耐药性的主要机制为外排泵。进一步相关性分析结果显示,除PNGM-1与电导率和TN呈显著正相关(P<0.05)外,其余丰度前20的ARGs均与环境因子相关性不显著(P>0.05);而丰度前20的ARGs均与丰度前20的菌属呈显著或极显著相关关系(P<0.05或P<0.01)。研究表明,大黄鱼养殖海域沉积物中含有丰富的ARGs,微生物群落是影响沉积物中ARGs分布的重要因素。
关键词
抗生素抗性基因
宏基因组测序分析技术
大黄鱼养殖海域
沉积物
微生物群落
Keywords
antibiotic resistance gene
macro-genome sequencing analysis technology
large yellow croaker culture area
sediment
microbial community
分类号
X55 [环境科学与工程—环境工程]
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职称材料
题名
大黄鱼养殖海域水体中细菌群落结构和抗生素抗性基因分布特征
被引量：
8
2
作者
刘洋
饶秋华
李水根
王为刚
张志灯
黄薇
罗土炎
机构
福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所福建省农产品质量安全重点实验室
福建省水产技术推广总站
连江县水产技术推广站
福州海关技术中心
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期366-373,共8页
基金
福建省属公益类科研院所基本科研专项(2020R1022009、2022R1022002、2022R1101)
福建省农业科学院英才项目(YC2019011)
福建省农业科学院科技服务项目(2023KF20)。
文摘
为探究大黄鱼福建养殖海域水体中微生物群落和抗生素抗性基因(ARG)的分布特征,本研究利用MiSeq和HiSeq高通量测序技术,基于细菌16S rRNA基因V3~V4可变区,对福建6个大黄鱼密集养殖区水体中的细菌群落结构和ARG赋存特征进行研究。Ribosomal Database Project(RDP)注释结果显示6个样品中丰度最高的门为Proteobacteria,占样品序列总数的59.62%~75.34%,不同位置大黄鱼养殖海域水体中的优势菌属存在显著差异(P<0.05)。通过与Comprehensive Antibiotic Resistance Database(CARD)数据库比对发现,水体中共检测出872个ARG,包括20种ARG基因类型;不同养殖区域的优势ARG类型基本一致,主要为四环素类、大环内酯类和氟喹诺酮类抗性基因;抗性机制主要为外排泵。相关性分析结果进一步显示,丰度前20的菌属与丰度前20的ARG均有显著相关性(P<0.05),表明微生物群落是影响大黄鱼养殖海域水体中ARG分布的重要因素。本研究为大黄鱼健康养殖及水体ARG控制及消除提供参考依据。
关键词
抗生素抗性基因
微生物群落
高通量测序技术
大黄鱼养殖海域
养殖
水体
Keywords
Antibiotic resistance genes
microbial communities
high-throughput sequencing technology
large yellow croaker aquaculture area
water samples
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大黄鱼养殖海域沉积物中抗生素抗性基因分布特征及其影响因素
黄薇
刘洋
饶秋华
罗钦
王为刚
宋永康
罗土炎
《农业环境科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
大黄鱼养殖海域水体中细菌群落结构和抗生素抗性基因分布特征
刘洋
饶秋华
李水根
王为刚
张志灯
黄薇
罗土炎
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
8
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职称材料
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