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基于同源双交换的聚球藻PCC 7942基因组大片段无标记删除
1
作者
柯竹芳
徐旭东
高宏
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期342-347,共6页
在蓝藻合成生物学中,对大片段进行无标记删除可以加快基因组简化的进程。研究以聚球藻PCC 7942为材料,基于同源重组技术对基因组中大于10 kb的3个非必需区域进行无标记删除。构建带有两侧同源片段的不可在聚球藻复制的质粒,利用接合转...
在蓝藻合成生物学中,对大片段进行无标记删除可以加快基因组简化的进程。研究以聚球藻PCC 7942为材料,基于同源重组技术对基因组中大于10 kb的3个非必需区域进行无标记删除。构建带有两侧同源片段的不可在聚球藻复制的质粒,利用接合转移将其导入藻细胞获得同源单交换株,再借助于条件致死基因sacB筛选第二步交换的克隆,获得无标记删除突变株。研究证明了传统的同源重组和筛选技术可用于蓝藻基因组的大片段无标记删除。
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关键词
基因组简化
大片段删除
同源重组
筛选
聚球藻PCC
7942
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职称材料
盐胁迫对于聚球藻PCC 7942大片段DNA删除突变株的生理效应
2
作者
许轶
徐旭东
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期592-597,共6页
在对聚球藻PCC 7942开展基因组简化的过程中,发现一些非必需大片段的删除可导致耐盐胁迫能力降低。突变株ΔSynpcc7942_0233-0253和ΔSynpcc7942_2169-2187,其基因组中分别删除了18和14 kb的区域,在BG11培养液中的生长与野生型没有显著...
在对聚球藻PCC 7942开展基因组简化的过程中,发现一些非必需大片段的删除可导致耐盐胁迫能力降低。突变株ΔSynpcc7942_0233-0253和ΔSynpcc7942_2169-2187,其基因组中分别删除了18和14 kb的区域,在BG11培养液中的生长与野生型没有显著差异,但在含有0.4 mol/L NaCl的培养液中的生长相对于野生型被严重抑制。进一步分析发现,在盐胁迫下2个突变株的光合放氧速率比野生型显著下降,光系统Ⅰ和Ⅱ电子传递速率均低于野生型,呼吸耗氧速率与野生型相比却维持在较高水平。这些结果说明,蓝藻基因组中有些非必需基因实际上对于适应胁迫条件是需要的。
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关键词
聚球藻PCC
7942
大片段删除
突变株
盐胁迫
光合作用
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职称材料
利用CRISPR/Cas9技术对人多能干细胞进行高效基因组编辑
被引量：
2
3
作者
刘改改
李爽
+2 位作者
韦余达
张永贤
丁秋蓉
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期1167-1173,共7页
CRISPR/Cas9技术提供了一个全新的基因组编辑体系。本文利用CRISPR/Cas9平台,在人胚胎干细胞株中对选取的一段特定基因组区域进行了多种基因组编辑:通过在基因编码框中引入移码突变进行基因敲除;通过单链DNA提供外源模板经由同源重组定...
CRISPR/Cas9技术提供了一个全新的基因组编辑体系。本文利用CRISPR/Cas9平台,在人胚胎干细胞株中对选取的一段特定基因组区域进行了多种基因组编辑:通过在基因编码框中引入移码突变进行基因敲除;通过单链DNA提供外源模板经由同源重组定点敲入FLAG序列;通过同时靶向多个位点诱导基因组大片段删除。研究结果表明CRISPR/Cas9可以对多能干细胞进行高效基因编辑,获得的突变干细胞株有助于对基因和基因组区域的功能进行分析和干细胞疾病模型的建立。
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关键词
CRISPR/Cas9基因编辑
人多能干细胞
基因敲除
DNA序列定点插入
基因组
大片段删除
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职称材料
题名
基于同源双交换的聚球藻PCC 7942基因组大片段无标记删除
1
作者
柯竹芳
徐旭东
高宏
机构
中国科学院水生生物研究所中国科学院藻类生物学重点实验室
中国科学院大学
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期342-347,共6页
基金
湖北省知识创新专项(自然科学基金)(2017CFA021)资助。
文摘
在蓝藻合成生物学中,对大片段进行无标记删除可以加快基因组简化的进程。研究以聚球藻PCC 7942为材料,基于同源重组技术对基因组中大于10 kb的3个非必需区域进行无标记删除。构建带有两侧同源片段的不可在聚球藻复制的质粒,利用接合转移将其导入藻细胞获得同源单交换株,再借助于条件致死基因sacB筛选第二步交换的克隆,获得无标记删除突变株。研究证明了传统的同源重组和筛选技术可用于蓝藻基因组的大片段无标记删除。
关键词
基因组简化
大片段删除
同源重组
筛选
聚球藻PCC
7942
Keywords
Genome simplification
Large fragment deletions
Homologous recombination
Selection
Synechococcus elongatus PCC 7942
分类号
Q344 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
盐胁迫对于聚球藻PCC 7942大片段DNA删除突变株的生理效应
2
作者
许轶
徐旭东
机构
中国科学院水生生物研究所
中国科学院大学
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期592-597,共6页
基金
湖北省(自然科学基金)知识创新专项(2017CFA021)资助。
文摘
在对聚球藻PCC 7942开展基因组简化的过程中,发现一些非必需大片段的删除可导致耐盐胁迫能力降低。突变株ΔSynpcc7942_0233-0253和ΔSynpcc7942_2169-2187,其基因组中分别删除了18和14 kb的区域,在BG11培养液中的生长与野生型没有显著差异,但在含有0.4 mol/L NaCl的培养液中的生长相对于野生型被严重抑制。进一步分析发现,在盐胁迫下2个突变株的光合放氧速率比野生型显著下降,光系统Ⅰ和Ⅱ电子传递速率均低于野生型,呼吸耗氧速率与野生型相比却维持在较高水平。这些结果说明,蓝藻基因组中有些非必需基因实际上对于适应胁迫条件是需要的。
关键词
聚球藻PCC
7942
大片段删除
突变株
盐胁迫
光合作用
Keywords
Synechococcus PCC 7942
Large genomic fragment deletion mutant
Salt stress
Photosynthesis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
利用CRISPR/Cas9技术对人多能干细胞进行高效基因组编辑
被引量：
2
3
作者
刘改改
李爽
韦余达
张永贤
丁秋蓉
机构
中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期1167-1173,共7页
基金
上海市浦江人才计划(编号:15PJ1409200)资助
文摘
CRISPR/Cas9技术提供了一个全新的基因组编辑体系。本文利用CRISPR/Cas9平台,在人胚胎干细胞株中对选取的一段特定基因组区域进行了多种基因组编辑:通过在基因编码框中引入移码突变进行基因敲除;通过单链DNA提供外源模板经由同源重组定点敲入FLAG序列;通过同时靶向多个位点诱导基因组大片段删除。研究结果表明CRISPR/Cas9可以对多能干细胞进行高效基因编辑,获得的突变干细胞株有助于对基因和基因组区域的功能进行分析和干细胞疾病模型的建立。
关键词
CRISPR/Cas9基因编辑
人多能干细胞
基因敲除
DNA序列定点插入
基因组
大片段删除
Keywords
CRISPR/Cas9 genome editing
human pluripotent stem cells
gene disruption
targeted DNA insertion
largegenomic deletion
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于同源双交换的聚球藻PCC 7942基因组大片段无标记删除
柯竹芳
徐旭东
高宏
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
盐胁迫对于聚球藻PCC 7942大片段DNA删除突变株的生理效应
许轶
徐旭东
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
利用CRISPR/Cas9技术对人多能干细胞进行高效基因组编辑
刘改改
李爽
韦余达
张永贤
丁秋蓉
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2015
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
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