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应用新一代测序技术测定大室别藻苔虫线粒体基因组全序列
1
作者
申欣
田美
+2 位作者
朱长保
刘会莲
赵方庆
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期136-142,共7页
线粒体基因组的获得传统上通常是采取长PCR结合鸟枪法或步移法测序。近年来新一代测序技术蓬勃发展,以454,Solexa和SOLiD测序平台为代表。应用新一代高通量测序技术(Solexa)并结合巢式PCR扩增,完成了大室别藻苔虫(Membranipora grandice...
线粒体基因组的获得传统上通常是采取长PCR结合鸟枪法或步移法测序。近年来新一代测序技术蓬勃发展,以454,Solexa和SOLiD测序平台为代表。应用新一代高通量测序技术(Solexa)并结合巢式PCR扩增,完成了大室别藻苔虫(Membranipora grandicella)的线粒体基因组全序列。大室别藻苔虫线粒体基因组是目前国际上获得的第一条苔藓动物软壁亚目线粒体基因组全序列,基因组全长为15 861bp,比已完成的4种苔藓动物线粒体基因组略大。大室别藻苔虫线粒体基因组包含13个蛋白质编码基因、2个核糖体RNA基因和20个转运RNA基因。通过与已测得的苔藓动物进行比较,发现目前已完成的5个苔藓动物线粒体基因组的基因排列顺序显著不同。苔藓动物线粒体基因组基因排列的比较,今后可能会成为探讨该类群系统演化关系的重要信息来源。
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关键词
大室别藻苔虫
线粒体基因组
新一代测序技术
巢式PCR
基因排列
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题名
应用新一代测序技术测定大室别藻苔虫线粒体基因组全序列
1
作者
申欣
田美
朱长保
刘会莲
赵方庆
机构
淮海工学院海洋学院
中国科学院北京生命科学研究院
中国科学院海洋研究所
出处
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期136-142,共7页
基金
国家自然科学基金(40906067)
中国科学院基金(Y064021BJ1
+1 种基金
0869011BJ5)
江苏省"青蓝工程"人才基金(苏教师[2010]27号)
文摘
线粒体基因组的获得传统上通常是采取长PCR结合鸟枪法或步移法测序。近年来新一代测序技术蓬勃发展,以454,Solexa和SOLiD测序平台为代表。应用新一代高通量测序技术(Solexa)并结合巢式PCR扩增,完成了大室别藻苔虫(Membranipora grandicella)的线粒体基因组全序列。大室别藻苔虫线粒体基因组是目前国际上获得的第一条苔藓动物软壁亚目线粒体基因组全序列,基因组全长为15 861bp,比已完成的4种苔藓动物线粒体基因组略大。大室别藻苔虫线粒体基因组包含13个蛋白质编码基因、2个核糖体RNA基因和20个转运RNA基因。通过与已测得的苔藓动物进行比较,发现目前已完成的5个苔藓动物线粒体基因组的基因排列顺序显著不同。苔藓动物线粒体基因组基因排列的比较,今后可能会成为探讨该类群系统演化关系的重要信息来源。
关键词
大室别藻苔虫
线粒体基因组
新一代测序技术
巢式PCR
基因排列
Keywords
Membranipora grandicella
mitochondrial genome
next-generation sequencing
nested PCR
gene arrangement
分类号
Q915.815 [天文地球—古生物学与地层学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用新一代测序技术测定大室别藻苔虫线粒体基因组全序列
申欣
田美
朱长保
刘会莲
赵方庆
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
0
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