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不同基因型PRRSV鉴别诊断多重RT-PCR检测方法的建立 被引量:1
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作者 贾钦瑞 闫乙鑫 +4 位作者 罗志鹏 徐通 陈弟诗 周远成 朱玲 《四川农业大学学报》 北大核心 2025年第2期452-457,478,共7页
【目的】针对PRRSV的多基因型特性,旨在建立一种灵敏、特异且稳定的多重RT-PCR检测方法。【方法】根据GeneBank数据库中公布的ORF1、ORF6和Nsp2基因保守序列分别设计合成3对特异性引物,分别以PRRSV欧洲株(PRRSV-1)、高致病性毒株(HP-PRR... 【目的】针对PRRSV的多基因型特性,旨在建立一种灵敏、特异且稳定的多重RT-PCR检测方法。【方法】根据GeneBank数据库中公布的ORF1、ORF6和Nsp2基因保守序列分别设计合成3对特异性引物,分别以PRRSV欧洲株(PRRSV-1)、高致病性毒株(HP-PRRSV)、美洲经典株(Classic-PRRSV)和NADC30-like株cDNA为模板进行PCR扩增并构建重组质粒,通过对反应体系和反应条件的优化建立不同基因型PRRSV鉴别诊断多重RT-PCR检测方法。对该方法进行特异性、灵敏性、重复性和准确性验证。【结果】优化过后的cDNA模板为7.5μL,引物为0.5μL,退火温度为56℃;该方法与猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪伪狂犬病毒(PRV)、猪细小病毒(PPV)和猪圆环病毒2型(PCV-2)无交叉反应,特异性强。对PRRSV-1、NADC30、HP-PRRSV、Classic-PRRSV株的最低检测下限分别为3.93×10^(2)、4.52×10^(2)、3.70×10^(2)和4.58×10^(2)copies/μL,灵敏性较高。分别以10^(4)copies/μL的混合阳性质粒和4种单一阳性质粒为模板,进行PCR扩增,重复性较好。对来自四川各地的118份临床样本进行检测,总符合率达到98%。【结论】该方法能够精确鉴别PRRSV的不同基因型毒株,具有良好特异性、灵敏性、重复性和准确性,在临床样品中鉴别不同基因型PRRSV毒株的方面具有较高的应用价值。 展开更多
关键词 PRRSV欧洲株 高致病性毒株 美洲经典株 NADC30-like株 多重rt-pcr
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西番莲3种病毒多重RT-PCR检测技术的建立与应用
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作者 韩俊娜 张继荣 +2 位作者 旷艺璇 王莹 黄爱军 《植物保护》 北大核心 2025年第3期289-295,300,共8页
西番莲Passiflora edulis是一种广泛分布于我国热带、亚热带地区的高经济作物,但病毒病害严重制约西番莲的产业发展。尤其马铃薯Y病毒属Potyvirus的夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus,TeMV)、东亚西番莲病毒(East Asian Passiflora v... 西番莲Passiflora edulis是一种广泛分布于我国热带、亚热带地区的高经济作物,但病毒病害严重制约西番莲的产业发展。尤其马铃薯Y病毒属Potyvirus的夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus,TeMV)、东亚西番莲病毒(East Asian Passiflora virus,EAPV)以及西番莲斑驳病毒(Passiflora mottle virus,PaMoV)是西番莲上发生较为普遍的病毒,这些病毒单独或者混合侵染均可在西番莲上引起严重危害。本研究针对3种病毒基因组保守区域设计特异引物并筛选,优化引物浓度、退火温度,建立了可同时扩增3种病毒的多重RT-PCR检测体系。该检测体系产物片段大小分别是TeMV 685 bp、PaMoV 405 bp和EAPV 248 bp,扩增产物清晰、特异,检测TeMV与EAPV的灵敏度分别较普通单重RT-PCR灵敏度低约10倍和100倍,PaMoV灵敏度与普通单重RT-PCR灵敏度一致。采用多重RT-PCR和单一RT-PCR对收集到的田间样品分别检测,结果显示,2种方法检测结果一致,表明该方法可准确、快速、灵敏地检测复合侵染的3种病毒,可用于田间发病样品的检测。 展开更多
关键词 西番莲 夜来香花叶病毒 东亚西番莲病毒 西番莲斑驳病毒 多重rt-pcr
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柑橘3种病毒类病原多重RT-PCR检测技术的建立及应用
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作者 袁琳凯 马崇欢 +5 位作者 李丁山 陈志炜 江宵烽 丁新伦 张洁 吴祖建 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期339-344,共6页
【目的】建立柑橘黄化脉明病毒(citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)、柑橘衰退病毒(citrus tristeza virus,CTV)和啤酒花矮化类病毒(hop stunt viroid,HSVd)的多重RT-PCR检测体系。【方法】设计多重RT-PCR引物,分析其特异性,确... 【目的】建立柑橘黄化脉明病毒(citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)、柑橘衰退病毒(citrus tristeza virus,CTV)和啤酒花矮化类病毒(hop stunt viroid,HSVd)的多重RT-PCR检测体系。【方法】设计多重RT-PCR引物,分析其特异性,确定其最佳浓度比、最适退火温度及灵敏度,在此基础上对福建地区的柑橘样品进行检测。【结果】确定了CYVCV-F/R、CTV-F/R和HSVd-F/R等3对引物的最佳浓度比例为1∶1∶2,最适退火温度为52.9℃,灵敏度结果显示该体系可检测模板稀释到10^(-2)的阳性样品。应用该体系对采自福建部分地区的157份柑橘样品进行检测,结果发现,CYVCV、CTV和HSVd的检出率分别为47.1%、56.7%和22.9%。【结论】成功建立了柑橘CYVCV、CTV和HSVd病原的多重RT-PCR检测方法,为该类病害的检测提供准确、快速的检测方法。 展开更多
关键词 柑橘黄化脉明病毒 柑橘衰退病毒 啤酒花矮化类病毒 多重rt-pcr
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赤羽病病毒、牛疱疹病毒1型和牛病毒性腹泻病毒多重RT-PCR检测方法的建立
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作者 张帆帆 韦家禛 +6 位作者 李杰茂 谭美芳 胡利珍 曾艳兵 龚小齐 杨群 徐俊 《福建农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第11期1242-1247,共6页
【目的】旨在建立一种可同时检测赤羽病病毒(akabane virus,AKAV)、牛疱疹病毒1型(bovine herpesvirus1,BoHV-1)和牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)的多重RT-PCR检测方法,为牛繁殖障碍类疫病鉴别诊断及防控奠定基础... 【目的】旨在建立一种可同时检测赤羽病病毒(akabane virus,AKAV)、牛疱疹病毒1型(bovine herpesvirus1,BoHV-1)和牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)的多重RT-PCR检测方法,为牛繁殖障碍类疫病鉴别诊断及防控奠定基础。【方法】针对AKAV的S基因、BoHV-1的gH基因和BVDV的3'UTR保守区域设计3对引物,通过反应条件参数的优化,建立AKAV、BoHV-1和BVDV多重RT-PCR检测方法。【结果】特异性结果显示,该方法仅对AKAV、BoHV-1和BVDV阳性样品检测为阳性,对牛细小病毒(bovine parvovirus,BPV)、牛呼吸道合胞体病毒(bovine respiratory syncytial virus,BRSV)、牛副流感病毒3型(bovine parainfluenza virus 3,BPIV3)、口蹄疫病毒(foot-and-mouth disease virus,FMDV)、牛流行热病毒(bovine ephemeral fever rhabdovirus,BEFV)等阳性样品检测为阴性。敏感性结果显示,该方法对AKAV、BoHV-1和BVDV重组质粒的下限阈值均为1.0×10^(3)拷贝·μL^(-1)。重复性结果显示,批内、批间重复性均较好。利用建立的方法对143份患繁殖障碍的牛全血/组织样品进行测定,并与现有的地方标准进行对比,验证本检测方法的实际临床应用效能。结果显示,AKAV、BoHV-1和BVDV的阳性率分别为2.80%(4/143)、21.68%(31/143)、38.46%(55/143),存在混合感染现象,与AKAV、BoHV-1和BVDV地方标准检测方法的符合率为99.3%、98.6%和97.2%,Kappa系数分别为0.885、0.960和0.942,表明本研究建立的方法与地方标准检测结果一致性良好。【结论】本研究开创性建立了一种特异性强、灵敏度高和成本低的多重RT-PCR检测方法,适用于AKAV、BoHV-1和BVDV的鉴别检测。 展开更多
关键词 赤羽病病毒 牛疱疹病毒1型 牛病毒性腹泻病毒 多重rt-pcr 繁殖障碍
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葡萄病毒病多重RT-PCR检测技术体系优化分析 被引量:16
5
作者 牛建新 陈萍 马兵钢 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期120-123,共4页
在确立葡萄卷叶病毒Ⅲ和扇叶病毒RT-PCR优化体系基础上,研究了多重PCR的主要成分:dNTPS、TaqDNA聚合酶、MgCl2对PCR反应的影响,从而确立了GLRaVⅢ、GFLV的多重RT-PCR检测体系。研究结果表明,多重PCR反应体系中TaqDNA聚合酶的用量较单重... 在确立葡萄卷叶病毒Ⅲ和扇叶病毒RT-PCR优化体系基础上,研究了多重PCR的主要成分:dNTPS、TaqDNA聚合酶、MgCl2对PCR反应的影响,从而确立了GLRaVⅢ、GFLV的多重RT-PCR检测体系。研究结果表明,多重PCR反应体系中TaqDNA聚合酶的用量较单重PCR反应体系要低,而且可降低成本和缩短检测时间。 展开更多
关键词 葡萄卷叶病毒Ⅲ(GLRaV Ⅲ) 葡萄扇叶病毒(GFLV) 多重rt-pcr检测体系
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马铃薯病毒PVY,PVS和PLRV多重RT-PCR检测 被引量:7
6
作者 黄丹 余琨 +2 位作者 陈建斌 蔡红 朱有勇 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期535-540,共6页
病毒是马铃薯生产过程中危害较大的一类病原,为快速检测出云南省马铃薯主要病毒种类,依据病毒外壳蛋白基因序列设计合成了马铃薯Y病毒(PVY)、马铃薯S病毒(PVS)、马铃薯卷叶病毒(PLRV)的特异性引物,从退火温度、最低检测浓度、热反应循... 病毒是马铃薯生产过程中危害较大的一类病原,为快速检测出云南省马铃薯主要病毒种类,依据病毒外壳蛋白基因序列设计合成了马铃薯Y病毒(PVY)、马铃薯S病毒(PVS)、马铃薯卷叶病毒(PLRV)的特异性引物,从退火温度、最低检测浓度、热反应循环条件、病毒间的模板及引物间的最佳组合浓度进行优化,建立了三重RT-PCR反应体系。结果表明:该优化体系可同步扩增出上述3种病毒,分别得到480 bp(PVY)、187 bp(PVS)、336 bp(PLRV)大小的扩增片段。优化的三重RT-PCR反应体系可快速、灵敏、简便的检测到单一或复合侵染的马铃薯病毒,有利于马铃薯病毒病的早期检测和防治,将为云南省马铃薯种苗脱毒、继代、田间植株的高产栽培等有重要实践作用。 展开更多
关键词 马铃薯 病毒 多重rt-pcr检测
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3种大白菜病毒多重RT-PCR检测技术的建立 被引量:4
7
作者 刘欢 李春游 +2 位作者 刘斐 郝兴安 吴云锋 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2017年第9期109-115,共7页
【目的】建立3种大白菜病毒病多重RT-PCR检测技术,为病毒病快速检测、白菜病毒病防治与抗病育种提供参考。【方法】针对我国大白菜芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)、烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)和黄瓜花叶病毒(Cucu... 【目的】建立3种大白菜病毒病多重RT-PCR检测技术,为病毒病快速检测、白菜病毒病防治与抗病育种提供参考。【方法】针对我国大白菜芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)、烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)和黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)3种病毒的外壳蛋白(CP)基因保守区序列,设计特异性检测引物,从多重RT-PCR(mRT-PCR)扩增引物、Mg^(2+)浓度、Taq DNA聚合酶及dNTPs浓度、退火温度、延伸时间和循环次数等方面对RT-PCR检测技术进行优化。【结果】在dNTPs浓度为0.24 mmol/L,Mg2+浓度为2.8mmol/L,Taq DNA聚合酶浓度为0.12U/μL,退火温度为52℃,延伸时间为30s,循环30次,即可成功地在一个体系中对TuMV、TMV和CMV 3种病毒复合侵染的大白菜病样进行多重RT-PCR扩增,扩增得到228,305和460bp3条特异性条带,其大小与试验设计相符合。灵敏度接近单重RT-PCR(sRT-PCR),体现了多重RT-PCR的优越性。【结论】建立了能同时检测大白菜样品中TuMV、TMV和CMV的多重RT-PCR检测体系,该多重RT-PCR方法能对田间大白菜样品进行3种病毒的准确、快速、高效检测。 展开更多
关键词 大白菜 芜菁花叶病毒 烟草花叶病毒 黄瓜花叶病毒 多重rt-pcr检测
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烟草中TMV、CMV和PVY多重RT-PCR检测体系的建立与应用 被引量:16
8
作者 杨金广 张帅 +5 位作者 申莉莉 钱玉梅 陈德鑫 王长栓 黄瑾 王凤龙 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 2010年第4期83-88,共6页
利用DNAMAN软件对GenBank数据库中已登录的烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaicvirus,CMV)和马铃薯Y病毒(Potato virusY,PVY)全基因组序列进行序列比对,选择最保守的区域,进行相应病毒的引物设计,建... 利用DNAMAN软件对GenBank数据库中已登录的烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaicvirus,CMV)和马铃薯Y病毒(Potato virusY,PVY)全基因组序列进行序列比对,选择最保守的区域,进行相应病毒的引物设计,建立了多重RT-PCR检测烟草中TMV、CMV和PVY的技术体系。对3条扩增片段进行回收、测序和BLAST比较,结果表明多重RT-PCR所扩增的片段序列均与预期设计序列相符,同源性均在98%以上。利用多重RT-PCR对广西区132个烟草病毒病样品进行检测分析,结果表明TMV检出率为91.7%,CMV检出率为18.2%,PVY检出率为55.3%。较单一的RT-PCR,具有简便、快速和经济的特点。与酶联免疫吸附法(Enzyme Linked Immunosorbent Assay,ELISA)相比,其检测限度高出ELISA的检测限度104级数,具有更高的特异性与准确性。该方法可以同步快速、特异地检测出烟草中TMV、CMV和PVY病毒的侵染。 展开更多
关键词 烟草 多重rt-pcr 病毒检测 应用
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不同外植体对草莓病毒脱除效果及病毒的多重RT-PCR检测 被引量:12
9
作者 孙崇波 蒋桂华 +4 位作者 施季森 张慧琴 吴延军 郭方其 谢鸣 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期447-450,468,共5页
以草莓茎尖和花药为外植体,多重RT-PCR为检测方法研究了不同培养材料对3种草莓病毒,即斑驳病毒(strawberry mottle virus,SMoV)、轻型黄边病毒(strawberry mild-yellow edge virus,SMYEV)和镶脉病毒(strawberry vein-band virus,SVBV)... 以草莓茎尖和花药为外植体,多重RT-PCR为检测方法研究了不同培养材料对3种草莓病毒,即斑驳病毒(strawberry mottle virus,SMoV)、轻型黄边病毒(strawberry mild-yellow edge virus,SMYEV)和镶脉病毒(strawberry vein-band virus,SVBV)的脱除情况。结果表明,花药愈伤组织再生苗途径对3种病毒的脱除率为100%。而不同大小茎尖脱除病毒效果不同:0.2mm茎尖可完全脱除3种病毒,但成苗率低;0.5mm茎尖可有效脱除SMoV和SVBV,但对SMYEV脱除不彻底;0.5mm茎尖成苗率明显高于0.2mm茎尖,但较难脱除SMYEV。综合病毒脱除率和成苗率,对花药再生频率较高的草莓基因型(如红颊)可以采用花药愈伤组织再生途径进行病毒脱除,而对于花药再生困难的基因型可以考虑选用茎尖分生组织途径获取脱毒苗。 展开更多
关键词 草莓 茎尖 花药 脱病毒 多重rt-pcr 检测
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应用多重RT-PCR检测甘蔗黄叶病毒和高粱花叶病毒 被引量:8
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作者 王洪星 张雨良 +5 位作者 罗志文 杨文君 龚殿 孙玉娟 张树珍 刘志昕 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期128-131,共4页
建立了多重RT-PCR同时检测甘蔗黄叶病毒(Sugarcane yellow leaf virus,ScYLV)和高粱花叶病毒病毒(Sorghummosaic virus,SrMV)的技术体系,该体系可有效地对甘蔗田间植株和试管苗进行检测。根据引物之间的互补性及引物的Tm值筛选多重PCR... 建立了多重RT-PCR同时检测甘蔗黄叶病毒(Sugarcane yellow leaf virus,ScYLV)和高粱花叶病毒病毒(Sorghummosaic virus,SrMV)的技术体系,该体系可有效地对甘蔗田间植株和试管苗进行检测。根据引物之间的互补性及引物的Tm值筛选多重PCR引物。确定适宜的PCR缓冲液的浓度为1×,退火温度为53℃,延伸温度为72℃。 展开更多
关键词 多重rt-pcr 病毒检测 甘蔗
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侵染甘薯的SPCSV、SPVG、SPFMV多重RT-PCR检测方法的建立及应用 被引量:15
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作者 李华伟 许泳清 +4 位作者 邱思鑫 刘中华 邱永祥 汤浩 余华 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1464-1470,共7页
为建立可同时检测甘薯褪绿矮化病毒(SPCSV)、甘薯G病毒(SPVG)和甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV)多重RT-PCR检测方法,本文根据SPCSV热激蛋白基因(hsp70)及SPVG、SPFMV外壳蛋白基因(CP)基因核苷酸序列的保守区域设计特异性引物,通过引... 为建立可同时检测甘薯褪绿矮化病毒(SPCSV)、甘薯G病毒(SPVG)和甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV)多重RT-PCR检测方法,本文根据SPCSV热激蛋白基因(hsp70)及SPVG、SPFMV外壳蛋白基因(CP)基因核苷酸序列的保守区域设计特异性引物,通过引物筛选,优化多重RT-PCR反应条件,建立了能同时检测SPCSV、SPVG和SPFMV 3种病毒的多重RT-PCR检测方法。该体系能有效扩增出大小为304、433、601 bp 3个特异性片段。测序结果表明3种病毒与参考序列的一致性达94%-99%。应用建立的多重RT-PCR检测方法可稳定、准确、灵敏地同时检测单一或复合侵染3种甘薯病毒,为甘薯脱毒和病毒病诊断奠定基础。 展开更多
关键词 甘薯病毒 褪绿矮化病毒 G病毒 羽状斑驳病毒 多重rt-pcr 检测方法
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三种马铃薯病毒多重RT-PCR检测体系建立 被引量:5
12
作者 张威 白艳菊 +5 位作者 罗丽环 范国权 高艳玲 申宇 张抒 孟宪欣 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期13-18,共6页
马铃薯卷叶病毒(PLRV)、马铃薯Y病毒(PVY)和马铃薯S病毒(PVS)是马铃薯生产田中发生率较高、危害较严重的病毒,通常复合侵染。研究通过综合评价和筛选,确定每种病毒的特异性引物,对PCR部分各试剂用量和反应程序进行优化,在同一体系中对... 马铃薯卷叶病毒(PLRV)、马铃薯Y病毒(PVY)和马铃薯S病毒(PVS)是马铃薯生产田中发生率较高、危害较严重的病毒,通常复合侵染。研究通过综合评价和筛选,确定每种病毒的特异性引物,对PCR部分各试剂用量和反应程序进行优化,在同一体系中对三种病毒复合侵染的马铃薯材料进行多重RT-PCR扩增,得到长度分别为336、447、729 bp的3条特异性条带,建立能同时检测PLRV、PVY和PVS病毒的多重RT-PCR检测体系。应用该体系对田间样品进行检测,检测结果特异性强、灵敏度高,表明该多重RT-PCR体系能够同时检测三种马铃薯病毒。 展开更多
关键词 马铃薯 PLRV PVY PVS 多重rt-pcr 检测
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酿酒葡萄4种病毒多重RT-PCR检测体系的建立 被引量:6
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作者 苏静 陈佰鸿 +3 位作者 毛娟 左存武 胡紫璟 王凯 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期632-638,共7页
【目的】建立快速、灵敏的葡萄病毒多重RT-PCR检测体系。【方法】通过设计6对不同引物,在退火温度分别为48.0、49.0、50.0、51.0、52.0、53.0、54.0、55.0、56.0、57.0、58.0、59.0和60.0℃,采用单一RT-PCR技术检测酿酒葡萄6种常见的葡... 【目的】建立快速、灵敏的葡萄病毒多重RT-PCR检测体系。【方法】通过设计6对不同引物,在退火温度分别为48.0、49.0、50.0、51.0、52.0、53.0、54.0、55.0、56.0、57.0、58.0、59.0和60.0℃,采用单一RT-PCR技术检测酿酒葡萄6种常见的葡萄病毒,即葡萄病毒A(Grapevine virus A,GVA)、葡萄斑点病毒(Grapevine fleck virus,GFKV)、葡萄扇叶病毒(Grapevine fanleaf virus,GFLV)、葡萄卷叶病毒1(Grapevine leafroll associated virus-1,GLRa V-1)、葡萄卷叶病毒2(Grapevine leafroll associated virus-1,GLRa V-2)和葡萄卷叶病毒4(Grapevine leafroll associated virus-4,GLRa V-4)。在此基础上,对退火温度相似、扩增片段长度不同的引物进行组合,建立能同时检测2种或2种以上病毒的多重RT-PCR检测体系。【结果】单一RT-PCR结果显示,退火温度为49℃、55℃和60℃时,可分别检测GVA和GLRa V、GLRa V和GFKV以及GFLV和GLRa V。多重RT-PCR结果显示,退火温度分别为49℃和55℃时,引物GVA和GLRa V-2以及引物GLRa V-1和GFKV组合所建立的2个多重RT-PCR检测体系可同时检测葡萄叶片中GVA和GLRa V以及GLRa V和GFKV。所检测的河西地区16份样品普遍携带葡萄病毒,部分葡萄样品同时携带两种病毒。其中,5份样品为GVA阳性,8份为GLRa V-1阳性,3份为GLRa V-2阳性,5份为GFKV阳性,所有样品均未检测到GFLV和GLRa V-4。退火温度分别为49℃和55℃时所建立的GVA和GLRa V以及GLRa V和GFKV两个多重PCR扩增体系检测结果与各样品单一PCR检测结果均一致。【结论】建立2套多重PCR检测体系,可同时有效地检测GVA和GLRa V-2或GLRa V-1和GFKV,可用于田间葡萄样品的快速检测。 展开更多
关键词 酿酒葡萄 病毒 检测 多重rt-pcr
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三种甘薯病毒多重RT-PCR检测技术的建立 被引量:11
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作者 蒋素华 程喜梅 +3 位作者 宋彩霞 许申平 梁芳 崔波 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期126-130,共5页
本文根据GenBank中甘薯G病毒(SPVG)、甘薯卷叶病毒(SPLCV)和甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV)外壳蛋白(CP)基因序列设计特异引物,对多重RT-PCR退火温度、延伸温度、模板浓度、引物浓度进行改良优化,建立能同时检测3种甘薯病毒的多重RT-PCR方法... 本文根据GenBank中甘薯G病毒(SPVG)、甘薯卷叶病毒(SPLCV)和甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV)外壳蛋白(CP)基因序列设计特异引物,对多重RT-PCR退火温度、延伸温度、模板浓度、引物浓度进行改良优化,建立能同时检测3种甘薯病毒的多重RT-PCR方法。该方法能同时扩增出SPVG、SPLCV和SPFMV特异片段,其大小分别是800、276和570bp。测序结果表明,扩增出的3种病毒序列与相应参考序列相似性达到98%以上。灵敏度分析结果表明,多重RT-PCR方法能够检测cDNA的量为0.1ng。应用建立的多重RT-PCR检测方法对田间样品进行检测,结果显示该方法可以特异、快速、灵敏地同时检测3种甘薯病毒。这些研究结果可为甘薯病毒检测提供参考。 展开更多
关键词 甘薯 病毒 多重rt-pcr
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猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒和猪A群轮状病毒多重RT-PCR检测方法的建立及临床应用 被引量:93
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作者 张坤 何启盖 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期1001-1005,共5页
本试验旨在建立能同时检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪A群轮状病毒(GAR)的多重RT-PCR检测方法。根据GenBank收录的PEDVM基因、TGEVN基因、GARVP7基因,利用软件Pri mer 5.0设计合成能分别特异性扩增PEDV、TGEV... 本试验旨在建立能同时检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪A群轮状病毒(GAR)的多重RT-PCR检测方法。根据GenBank收录的PEDVM基因、TGEVN基因、GARVP7基因,利用软件Pri mer 5.0设计合成能分别特异性扩增PEDV、TGEV、GAR相应基因的引物。利用这3对引物,作者建立了一种新的能够同时检测PEDV、TGEV和GAR的多重RT-PCR方法,并将这种方法和常规的RT-PCR进行了比较。实验室检测中,多重RT-PCR检测方法能够检测到35 pg的TGEV-PEDV-GAR三联苗的混合RNA。应用该方法检测了华中地区75份腹泻猪粪样,同时利用常规RT-PCR检测方法对该检测方法的敏感性和特异性进行了分析,结果表明该方法检测PEDV、TGEV、GAR的敏感性分别为92%、100%、100%,特异性均为100%。该方法敏感性高、特异性强,是一种新的检测PEDV、TGEV和GAR的方法。 展开更多
关键词 多重rt-pcr PEDV TGEV GAR
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四种草莓病毒SMoV、SVBV、SCV、SMYEV多重RT-PCR检测 被引量:32
16
作者 朱海生 花秀凤 +1 位作者 陈敏氡 温庆放 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1630-1635,共6页
我国草莓病毒主要有草莓斑驳病毒(SMoV)、草莓镶脉病毒(SVBV)、草毒皱缩病毒(SCV)和草莓轻型黄边病毒(SMYEV),通常发生混合侵染。本研究针对我国4种草莓病毒的外壳蛋白基因部分序列设计引物,通过优化多重RT-PCR反应条件,建立起能同时检... 我国草莓病毒主要有草莓斑驳病毒(SMoV)、草莓镶脉病毒(SVBV)、草毒皱缩病毒(SCV)和草莓轻型黄边病毒(SMYEV),通常发生混合侵染。本研究针对我国4种草莓病毒的外壳蛋白基因部分序列设计引物,通过优化多重RT-PCR反应条件,建立起能同时检测4种草莓病毒的多重RT-PCR检测体系。应用该体系成功对4种病毒复合侵染的草莓材料进行多重RT-PCR扩增,得到278、394、731和861bp共4条特异性条带。测序结果表明,4种病毒序列与相应的参考序列相似性均达98%以上。对草莓茎尖脱毒和叶片离体再生的试管苗样品进行检测,结果显示,该方法可以同步、快速、特异地检测出受侵染寄主植物中的4种病毒,并且灵敏度高。 展开更多
关键词 草莓 病毒 多重PCR 检测
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重要呼吸道病毒病原的多重RT-PCR检测 被引量:10
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作者 赵海龙 姜涛 +5 位作者 陈水平 赵慧 李晓峰 秦成峰 于曼 秦鄂德 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期890-892,共3页
目的建立一种可同时快速检测引起人呼吸道感染的重要病毒病原的检测方法。方法通过对PCR反应条件的优化,建立同时检测甲型流感病毒(IA)、呼吸道合胞病毒(RSV)和SARS冠状病毒(SARS-CoV)的多重RT-PCR方法。结果该法可同时或分别扩增IA258b... 目的建立一种可同时快速检测引起人呼吸道感染的重要病毒病原的检测方法。方法通过对PCR反应条件的优化,建立同时检测甲型流感病毒(IA)、呼吸道合胞病毒(RSV)和SARS冠状病毒(SARS-CoV)的多重RT-PCR方法。结果该法可同时或分别扩增IA258bp、RSV348bp和SARS-CoV438bp的基因片段。检测的敏感性分别为101.7TCID50/ml、10TCID50/ml和101·5TCID50/ml。采用相同的反应体系和条件,分别对其他7种呼吸道病毒(包括乙型流感病毒,副流感病毒2型,柯萨奇病毒B3和B5血清型及腺病毒2、3和7血清型)进行扩增,均未检测出扩增产物。结论此种多重RT-PCR法可在6h内完成,适用于三种重要呼吸道病毒的快速甄别。 展开更多
关键词 多重rt-pcr 流感病毒A型 呼吸道合胞病毒 SARS病毒
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甘薯病毒病害(SPVD)的多重RT-PCR检测方法及其应用 被引量:21
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作者 张盼 兰新芝 +5 位作者 乔奇 张德胜 秦艳红 田雨婷 王爽 张振臣 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期86-90,100,共6页
根据甘薯褪绿矮化病毒(Sweet potato chlorotic stunt virus,SPCSV)热激蛋白(Hsp70)基因和甘薯羽状斑驳病毒(Sweet potato feathery mottle virus,SPFMV)外壳蛋白(CP)基因核苷酸序列的保守区域设计了4对引物,以单一RT-PCR反应体系为基础... 根据甘薯褪绿矮化病毒(Sweet potato chlorotic stunt virus,SPCSV)热激蛋白(Hsp70)基因和甘薯羽状斑驳病毒(Sweet potato feathery mottle virus,SPFMV)外壳蛋白(CP)基因核苷酸序列的保守区域设计了4对引物,以单一RT-PCR反应体系为基础,分别对影响多重RT-PCR扩增的退火温度、Taq DNA聚合酶浓度、dNTPs浓度、Mg2+浓度、引物浓度等条件进行了优化,建立了能同时检测SPVD两种病原的多重RT-PCR方法。该方法能有效区分SPFMV的主要株系类型。灵敏性试验表明,建立的多重RT-PCR方法对SPFMV-CH2、SPFMV-CH和SPCSV的最低检测浓度分别为1.42×104、1.32×104拷贝/μL和2.47×104拷贝/μL。该方法可用于甘薯叶片和薯块中病毒的检测,为SPVD的监测预警提供了一个有用的工具。 展开更多
关键词 甘薯病毒病害 甘薯羽状斑驳病毒 甘薯褪绿矮化病毒 多重rt-pcr
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禽流感病毒4个亚型一步法多重RT-PCR检测方法研究 被引量:3
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作者 侯义宏 林祥梅 +6 位作者 张晓臣 朱中武 贾广乐 梅琳 吕建强 钱永华 韩雪清 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2007年第8期29-33,共5页
为了建立简便、快速的AIV检测方法,根据禽流感病毒H5、H7、H9亚型HA基因和N1亚型NA基因的保守序列,设计了4对RT-PCR引物,对H5、H7、H9、N1 4个亚型进行了多重RT-PCR扩增,通过多重RT-PCR敏感性和特异性试验,建立了多重RT-PCR检测方法;应... 为了建立简便、快速的AIV检测方法,根据禽流感病毒H5、H7、H9亚型HA基因和N1亚型NA基因的保守序列,设计了4对RT-PCR引物,对H5、H7、H9、N1 4个亚型进行了多重RT-PCR扩增,通过多重RT-PCR敏感性和特异性试验,建立了多重RT-PCR检测方法;应用所建立的多重RT-PCR方法和病毒分离的经典方法对395份(4省20多个地区)口岸检样进行了平行检测,并对其检测结果进行了比较。结果表明,H5、H7、H9、N1 4个亚型的扩增产物大小分别为380,641,493和328 bp,对NDVI、BV、ARVI、BDV、MDV、FPV扩增均为阴性,平行检测结果完全吻合,说明所建立的多重RT-PCR检测方法具有较好的敏感性和特异性。 展开更多
关键词 禽流感 病毒检测 多重rt-pcr
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应用多重RT-PCR检测甘肃‘成县迟蒜’中的大蒜潜隐病毒和洋葱黄矮病毒 被引量:12
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作者 许蕊 栗孟飞 +1 位作者 王雅琳 李唯 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期46-49,54,共5页
根据大蒜潜隐病毒(garlic latent virus,GLV)和洋葱黄矮病毒(onion yellow dwarf virus,OYDV)的外壳蛋白基因核苷酸序列分别设计2对特异性引物,在单重RT-PCR检测的基础上,建立同时检测GLV和OYDV的多重RT-PCR技术体系.结果表明:该方法可... 根据大蒜潜隐病毒(garlic latent virus,GLV)和洋葱黄矮病毒(onion yellow dwarf virus,OYDV)的外壳蛋白基因核苷酸序列分别设计2对特异性引物,在单重RT-PCR检测的基础上,建立同时检测GLV和OYDV的多重RT-PCR技术体系.结果表明:该方法可从带病的甘肃‘成县迟蒜’大蒜样品中扩增出GLV(849bp)和OYDV(571bp)的2条特异性片段.GLV扩增产物与GenBank中登录的其他分离物核苷酸同源性在90.00%~99.76%,OYDV扩增产物与其他分离物核苷酸的同源性为90.00%~98.00%. 展开更多
关键词 大蒜 多重rt-pcr 大蒜潜隐病毒 洋葱黄矮病毒
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