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三种食源性致病菌多重荧光PCR检测方法的建立
被引量:
5
1
作者
韩春来
《家禽科学》
2011年第8期11-14,共4页
根据沙门氏菌、空肠弯曲杆菌和单核增生李斯特氏菌的保守基因序列,设计特异性引物和以不同荧光素标记的探针。通过对荧光PCR反应体系和反应条件的优化筛选,建立了检测沙门氏菌、空肠弯曲杆菌和单核增生李斯特氏菌的三重荧光PCR检测方法...
根据沙门氏菌、空肠弯曲杆菌和单核增生李斯特氏菌的保守基因序列,设计特异性引物和以不同荧光素标记的探针。通过对荧光PCR反应体系和反应条件的优化筛选,建立了检测沙门氏菌、空肠弯曲杆菌和单核增生李斯特氏菌的三重荧光PCR检测方法。为了评价所建立的实时PCR检测体系的特异性,试验中选取了阳性菌株及干扰菌株进行特异性验证。同时对梯度稀释的纯化DNA和不同浓度引物探针进行检测以确定方法的灵敏度。结果表明,该方法有效、特异、敏感、稳定,对于动物产品中沙门氏菌、空肠弯曲杆菌和单核增生李斯特氏菌的快速检测具有重要应用价值。
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关键词
沙门氏菌
空肠弯曲杆菌
单核增生李斯特氏菌
多重荧光pcr检测
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职称材料
4种致牛腹泻病毒多重荧光定量PCR检测方法的建立及应用
被引量:
3
2
作者
高睿
徐伟
+3 位作者
罗艳
谢晓刚
李梦磊
张琪
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2023年第10期20-28,共9页
【目的】建立牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛冠状病毒(BCoV)、牛轮状病毒(BRV)、牛恶性卡他热病毒(MCFV)4种致牛腹泻病毒多重荧光定量PCR检测方法,为BVDV、BCoV、BRV和MCFV的鉴别诊断提供技术支持。【方法】根据BVDV的5′UTR基因、BCoV的N...
【目的】建立牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛冠状病毒(BCoV)、牛轮状病毒(BRV)、牛恶性卡他热病毒(MCFV)4种致牛腹泻病毒多重荧光定量PCR检测方法,为BVDV、BCoV、BRV和MCFV的鉴别诊断提供技术支持。【方法】根据BVDV的5′UTR基因、BCoV的N基因、BRV的VP6基因和MCFV的ORF9基因的保守区域设计引物,克隆目的基因构建标准阳性重组质粒,建立可同时检测4种致牛腹泻病毒的多重荧光定量PCR检测方法,并对该方法的特异性、敏感性和重复性进行评价。用建立的多重荧光定量PCR检测方法对76份临床样品进行检测,并与常规PCR检测方法的结果进行比较。【结果】建立了BVDV、BCoV、BRV和MCFV多重荧光定量PCR检测方法,该方法建立的标准曲线线性关系良好,仅可特异性扩增出4种目标基因片段;对BVDV、MCFV、BRV和BCoV的最低检出限分别为9.4×10^(1),1.4×10^(3),9.1×10^(1)和1.2×10^(2)拷贝/μL,与普通PCR相比,灵敏性高出10~1000倍;批内、批间差异均小于5%。76份临床样品检测结果显示,多重荧光定量PCR检测结果与普通PCR检测结果的符合率分别为98.7%(BCoV)、97.4%(BRV)、100.0%(BVDV)和100.0%(MCFV)。【结论】建立了BVDV、BCoV、BRV和MCFV多重荧光定量PCR检测方法,该方法特异性强、灵敏度高、重复性好,可用于牛腹泻病毒病原的实验室检测。
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关键词
牛腹泻病
牛病毒性腹泻病毒
牛冠状病毒
牛恶性卡他热病毒
牛轮状病毒
多重
荧光
定量
pcr
检测
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职称材料
多重TaqMan荧光定量PCR检测仔猪先天性震颤相关病毒方法的建立与应用
被引量:
2
3
作者
杨晓宇
陈世界
+3 位作者
林华
张婧
安微
朱玲
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第4期971-977,共7页
旨在研究能够快速、准确、灵敏地鉴别、诊断引起仔猪先天性震颤的猪非典型瘟病毒(Atypical porcine pestivirus,APPV)、猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)、猪圆环病毒3型(Porcine circoviruses type 3,PCV-3)及猪捷申病毒1型...
旨在研究能够快速、准确、灵敏地鉴别、诊断引起仔猪先天性震颤的猪非典型瘟病毒(Atypical porcine pestivirus,APPV)、猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)、猪圆环病毒3型(Porcine circoviruses type 3,PCV-3)及猪捷申病毒1型(Porcine teschovirus 1,PTV-1)的方法。通过对GenBank中登录的APPV的NS3基因序列、CSFV的E2基因序列、PCV-3的ORF2基因序列和PTV-1的VP1基因序列进行分析,设计针对4种病毒的特异性引物和TaqMan水解探针。通过对反应条件和反应程序进行优化,拟建立针对仔猪先天性震颤相关病毒的多重TaqMan荧光定量PCR检测方法。结果显示,研究得到的多重TaqMan荧光定量PCR检测方法能够特异性检测APPV、CSFV、PCV-3和PTV-1,而与其他病原无交叉反应;该研究方法对APPV、CSFV、PCV-3和PTV-1的最低检测量分别为1μl 9.2×10^2拷贝、48拷贝、56拷贝和17拷贝。重复性试验结果显示,组内、组间变异系数均小于2.10%,重复性和稳定性较为突出。用该方法对273份临床样品进行检测,结果显示,APPV、CSFV、PTV-1和PCV-3的阳性率分别为20.5%、2.9%、1.5%和10.6%,其中APPV、CSFV二者共同感染的检出率为1.5%,APPV、PCV-3二者共同感染的检出率为4.4%,APPV、PTV-1二者共同感染的检出率为1.5%,APPV、CSFV、PCV-3共同感染的检出率为1.1%。该检测方法操作简单、耗时短、不易对环境造成污染,检测结果灵敏、准确,基于该方法对四川地区仔猪先天性震颤相关病毒共感染情况进行的流行病学调查,可以为后期研究提供重要的数据基础。
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关键词
猪先天性震颤
猪非典型瘟病毒
猪瘟病毒
猪圆环病毒3型
猪捷申病毒1型
多重
TaqMan
荧光
定量
pcr
检测
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职称材料
题名
三种食源性致病菌多重荧光PCR检测方法的建立
被引量:
5
1
作者
韩春来
机构
北京市动物卫生监督所
出处
《家禽科学》
2011年第8期11-14,共4页
文摘
根据沙门氏菌、空肠弯曲杆菌和单核增生李斯特氏菌的保守基因序列,设计特异性引物和以不同荧光素标记的探针。通过对荧光PCR反应体系和反应条件的优化筛选,建立了检测沙门氏菌、空肠弯曲杆菌和单核增生李斯特氏菌的三重荧光PCR检测方法。为了评价所建立的实时PCR检测体系的特异性,试验中选取了阳性菌株及干扰菌株进行特异性验证。同时对梯度稀释的纯化DNA和不同浓度引物探针进行检测以确定方法的灵敏度。结果表明,该方法有效、特异、敏感、稳定,对于动物产品中沙门氏菌、空肠弯曲杆菌和单核增生李斯特氏菌的快速检测具有重要应用价值。
关键词
沙门氏菌
空肠弯曲杆菌
单核增生李斯特氏菌
多重荧光pcr检测
Keywords
multiplex real-time
pcr
Salmonella
Listeria monocytogenes
Campylobacter jejuni
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
4种致牛腹泻病毒多重荧光定量PCR检测方法的建立及应用
被引量:
3
2
作者
高睿
徐伟
罗艳
谢晓刚
李梦磊
张琪
机构
杨凌职业技术学院动物工程分院/动物疫病防控陕西省高校工程研究中心
陕西省彬州市动物疫控中心
西北农林科技大学动物医学院
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2023年第10期20-28,共9页
基金
陕西省重点研发计划一般项目(2022NY-098)。
文摘
【目的】建立牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛冠状病毒(BCoV)、牛轮状病毒(BRV)、牛恶性卡他热病毒(MCFV)4种致牛腹泻病毒多重荧光定量PCR检测方法,为BVDV、BCoV、BRV和MCFV的鉴别诊断提供技术支持。【方法】根据BVDV的5′UTR基因、BCoV的N基因、BRV的VP6基因和MCFV的ORF9基因的保守区域设计引物,克隆目的基因构建标准阳性重组质粒,建立可同时检测4种致牛腹泻病毒的多重荧光定量PCR检测方法,并对该方法的特异性、敏感性和重复性进行评价。用建立的多重荧光定量PCR检测方法对76份临床样品进行检测,并与常规PCR检测方法的结果进行比较。【结果】建立了BVDV、BCoV、BRV和MCFV多重荧光定量PCR检测方法,该方法建立的标准曲线线性关系良好,仅可特异性扩增出4种目标基因片段;对BVDV、MCFV、BRV和BCoV的最低检出限分别为9.4×10^(1),1.4×10^(3),9.1×10^(1)和1.2×10^(2)拷贝/μL,与普通PCR相比,灵敏性高出10~1000倍;批内、批间差异均小于5%。76份临床样品检测结果显示,多重荧光定量PCR检测结果与普通PCR检测结果的符合率分别为98.7%(BCoV)、97.4%(BRV)、100.0%(BVDV)和100.0%(MCFV)。【结论】建立了BVDV、BCoV、BRV和MCFV多重荧光定量PCR检测方法,该方法特异性强、灵敏度高、重复性好,可用于牛腹泻病毒病原的实验室检测。
关键词
牛腹泻病
牛病毒性腹泻病毒
牛冠状病毒
牛恶性卡他热病毒
牛轮状病毒
多重
荧光
定量
pcr
检测
Keywords
bovine diarrheal disease
bovine viral diarrhea virus
bovine coronavirus
bovine malignant catarrhal fever virus
bovine rotavirus
multiple fluorescence quantification
pcr
分类号
S852.653 [农业科学—基础兽医学]
在线阅读
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职称材料
题名
多重TaqMan荧光定量PCR检测仔猪先天性震颤相关病毒方法的建立与应用
被引量:
2
3
作者
杨晓宇
陈世界
林华
张婧
安微
朱玲
机构
四川农业大学动物医学院
成都海关检验检疫技术中心
四川农业大学动物疫病与人类健康四川省重点实验室
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第4期971-977,共7页
基金
“十三五”国家重点研发计划项目(2018YFD0501102)
四川省科技支撑计划项目(2018NZ0150)
+1 种基金
四川省“十三五”育种攻关计划项目(2016NYZ0052)
国家农业产业技术体系四川兽药创新团队专项(CARS-SVDIP)。
文摘
旨在研究能够快速、准确、灵敏地鉴别、诊断引起仔猪先天性震颤的猪非典型瘟病毒(Atypical porcine pestivirus,APPV)、猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)、猪圆环病毒3型(Porcine circoviruses type 3,PCV-3)及猪捷申病毒1型(Porcine teschovirus 1,PTV-1)的方法。通过对GenBank中登录的APPV的NS3基因序列、CSFV的E2基因序列、PCV-3的ORF2基因序列和PTV-1的VP1基因序列进行分析,设计针对4种病毒的特异性引物和TaqMan水解探针。通过对反应条件和反应程序进行优化,拟建立针对仔猪先天性震颤相关病毒的多重TaqMan荧光定量PCR检测方法。结果显示,研究得到的多重TaqMan荧光定量PCR检测方法能够特异性检测APPV、CSFV、PCV-3和PTV-1,而与其他病原无交叉反应;该研究方法对APPV、CSFV、PCV-3和PTV-1的最低检测量分别为1μl 9.2×10^2拷贝、48拷贝、56拷贝和17拷贝。重复性试验结果显示,组内、组间变异系数均小于2.10%,重复性和稳定性较为突出。用该方法对273份临床样品进行检测,结果显示,APPV、CSFV、PTV-1和PCV-3的阳性率分别为20.5%、2.9%、1.5%和10.6%,其中APPV、CSFV二者共同感染的检出率为1.5%,APPV、PCV-3二者共同感染的检出率为4.4%,APPV、PTV-1二者共同感染的检出率为1.5%,APPV、CSFV、PCV-3共同感染的检出率为1.1%。该检测方法操作简单、耗时短、不易对环境造成污染,检测结果灵敏、准确,基于该方法对四川地区仔猪先天性震颤相关病毒共感染情况进行的流行病学调查,可以为后期研究提供重要的数据基础。
关键词
猪先天性震颤
猪非典型瘟病毒
猪瘟病毒
猪圆环病毒3型
猪捷申病毒1型
多重
TaqMan
荧光
定量
pcr
检测
Keywords
congenital tremor
atypical porcine pestivirus
classical swine fever virus
porcine circoviruses type 3
porcine teschovirus 1
multiple TaqMan fluorescence quantitative
pcr
分类号
S852.651 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
三种食源性致病菌多重荧光PCR检测方法的建立
韩春来
《家禽科学》
2011
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
4种致牛腹泻病毒多重荧光定量PCR检测方法的建立及应用
高睿
徐伟
罗艳
谢晓刚
李梦磊
张琪
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2023
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
多重TaqMan荧光定量PCR检测仔猪先天性震颤相关病毒方法的建立与应用
杨晓宇
陈世界
林华
张婧
安微
朱玲
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2020
2
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