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基于多重相似性和增强注意力预测药物-靶标相互作用
1
作者
王伟
余梦雪
+5 位作者
孙斌
万仕彤
刘栋
周运
张红军
王鲜芳
《河南师范大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第2期99-107,共9页
在新药发现和药物重定位研究中,发现药物与靶标之间的相互作用是重要的研究内容.针对药物与靶标相互作用网络,提出一种基于多重相似性和增强注意力机制的图卷积神经网络模型(RSGCN)预测药物-靶标相互作用.首先,提出了多重相似性来捕捉...
在新药发现和药物重定位研究中,发现药物与靶标之间的相互作用是重要的研究内容.针对药物与靶标相互作用网络,提出一种基于多重相似性和增强注意力机制的图卷积神经网络模型(RSGCN)预测药物-靶标相互作用.首先,提出了多重相似性来捕捉网络结构特征,以充分利用节点间的直接或间接关系.然后,通过PCA降维减少相似性噪声对实验结果的影响.最后,采用图卷积神经网络(graph convolution neural network,GCN)获得节点嵌入表示,并融入基于注意力的增强层,通过增强注意力机制获得节点间的注意力权重,能够高效地预测药物与靶标之间的相互作用.在黄金标准数据集上的实验结果表明RSGCN模型具有较好的性能.
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关键词
图卷积神经网络(GCN)
多重相似性
PCA
增强注意力机制
药物-靶标相互作用
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职称材料
评价中药指纹图谱批次相似性的h多重相似性指数
2
作者
朱浩宇
顾荣领
+1 位作者
杜士杰
徐路
《分析测试学报》
北大核心
2025年第6期1202-1207,共6页
该研究提出一种新的h多重相似性指数(HMSI)用于中药指纹图谱的批次一致性评价。h多重相似性指数的定义如下:基于批次内所有样品的两两相似性(取值在[0,1]之间),如果有M%的两两相似性不低于M%,则该批次样品的h多重相似性指数为M%。基于...
该研究提出一种新的h多重相似性指数(HMSI)用于中药指纹图谱的批次一致性评价。h多重相似性指数的定义如下:基于批次内所有样品的两两相似性(取值在[0,1]之间),如果有M%的两两相似性不低于M%,则该批次样品的h多重相似性指数为M%。基于麦冬和清胃黄连丸的高效液相色谱(HPLC)指纹图谱,采用h多重相似性指数方法进行了不同批次中药指纹图谱的一致性评价,并与平均相似性和中位数相似性进行了比较。结果表明,h多重相似性指数适用于HPLC指纹图谱的一致性评价,在批次一致性评价方面比平均相似性和中位数相似性更加合理。该指数不仅考虑了批次内样品的相似性强度,还考虑了高相似性覆盖的样品数目,是一种简单、稳健且更为全面的中药指纹图谱批次一致性评价指标。
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关键词
中药
指纹图谱
批次一致性
h
多重相似性
指数
相似性
评价
高效液相色谱
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职称材料
基于改进三元组网络和K近邻算法的入侵检测
被引量：
10
3
作者
王月
江逸茗
兰巨龙
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2021年第7期1996-2002,共7页
入侵检测一直以来被视作是保证网络安全的重要手段。针对网络入侵检测中检测准确率和计算效率难以兼顾的问题,借鉴深度度量学习思想,提出了改进三元组网络(imTN)结合K近邻(KNN)的网络入侵检测模型imTNKNN。首先,设计了适用于解决入侵检...
入侵检测一直以来被视作是保证网络安全的重要手段。针对网络入侵检测中检测准确率和计算效率难以兼顾的问题,借鉴深度度量学习思想,提出了改进三元组网络(imTN)结合K近邻(KNN)的网络入侵检测模型imTNKNN。首先,设计了适用于解决入侵检测问题的三元组网络结构,以获取更有利于后续分类的距离特征;其次,为了应对移除传统模型中的批量归一化(BN)层造成过拟合进而影响检测精度的问题,引入了Dropout层和Sigmoid激活函数来替换BN层,从而提高模型性能;最后,用多重相似性损失函数替换传统三元组网络模型的损失函数。此外,将imTN的距离特征输出作为KNN算法的输入再次训练。在基准数据集IDS2018上的对比实验表明:与现有性能良好的基于深度神经网络的入侵检测系统(IDS-DNN)和基于卷积神经网络与长短期记忆(CNN-LSTM)的检测模型相比,在Sub_DS3子集上,imTN-KNN的检测准确率分别提高了2.76%和4.68%,计算效率分别提高了69.56%和74.31%。
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关键词
网络安全
入侵检测
深度学习
三元组网络
K近邻
多重相似性
损失函数
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职称材料
题名
基于多重相似性和增强注意力预测药物-靶标相互作用
1
作者
王伟
余梦雪
孙斌
万仕彤
刘栋
周运
张红军
王鲜芳
机构
河南师范大学计算机与信息工程学院
河南师范大学河南省教育人工智能与个性化学习重点实验室
河南理工大学鹤壁工程技术学院
河南工学院计算机科学与技术学院
出处
《河南师范大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第2期99-107,共9页
基金
国家自然科学基金(62072160
62072157)
+1 种基金
河南省科技攻关项目(242102211045
242102210001).
文摘
在新药发现和药物重定位研究中,发现药物与靶标之间的相互作用是重要的研究内容.针对药物与靶标相互作用网络,提出一种基于多重相似性和增强注意力机制的图卷积神经网络模型(RSGCN)预测药物-靶标相互作用.首先,提出了多重相似性来捕捉网络结构特征,以充分利用节点间的直接或间接关系.然后,通过PCA降维减少相似性噪声对实验结果的影响.最后,采用图卷积神经网络(graph convolution neural network,GCN)获得节点嵌入表示,并融入基于注意力的增强层,通过增强注意力机制获得节点间的注意力权重,能够高效地预测药物与靶标之间的相互作用.在黄金标准数据集上的实验结果表明RSGCN模型具有较好的性能.
关键词
图卷积神经网络(GCN)
多重相似性
PCA
增强注意力机制
药物-靶标相互作用
Keywords
graph convolution neural network
multiple similarity
PCA
enhanced attention mechanisms
drug-target interaction
分类号
TP181 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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职称材料
题名
评价中药指纹图谱批次相似性的h多重相似性指数
2
作者
朱浩宇
顾荣领
杜士杰
徐路
机构
铜仁学院材料与化学工程学院
铜仁学院大健康学院
浙江海正药业股份有限公司
出处
《分析测试学报》
北大核心
2025年第6期1202-1207,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(82260896)。
文摘
该研究提出一种新的h多重相似性指数(HMSI)用于中药指纹图谱的批次一致性评价。h多重相似性指数的定义如下:基于批次内所有样品的两两相似性(取值在[0,1]之间),如果有M%的两两相似性不低于M%,则该批次样品的h多重相似性指数为M%。基于麦冬和清胃黄连丸的高效液相色谱(HPLC)指纹图谱,采用h多重相似性指数方法进行了不同批次中药指纹图谱的一致性评价,并与平均相似性和中位数相似性进行了比较。结果表明,h多重相似性指数适用于HPLC指纹图谱的一致性评价,在批次一致性评价方面比平均相似性和中位数相似性更加合理。该指数不仅考虑了批次内样品的相似性强度,还考虑了高相似性覆盖的样品数目,是一种简单、稳健且更为全面的中药指纹图谱批次一致性评价指标。
关键词
中药
指纹图谱
批次一致性
h
多重相似性
指数
相似性
评价
高效液相色谱
Keywords
traditional Chinese medicine
fingerprints
batch consistency
h multiple similarity index
similarity evaluation
high-performance liquid chromatography
分类号
O657.7 [理学—分析化学]
R282 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
基于改进三元组网络和K近邻算法的入侵检测
被引量：
10
3
作者
王月
江逸茗
兰巨龙
机构
战略支援部队信息工程大学
出处
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2021年第7期1996-2002,共7页
基金
国家重点研发计划项目(2018YFB0804002)。
文摘
入侵检测一直以来被视作是保证网络安全的重要手段。针对网络入侵检测中检测准确率和计算效率难以兼顾的问题,借鉴深度度量学习思想,提出了改进三元组网络(imTN)结合K近邻(KNN)的网络入侵检测模型imTNKNN。首先,设计了适用于解决入侵检测问题的三元组网络结构,以获取更有利于后续分类的距离特征;其次,为了应对移除传统模型中的批量归一化(BN)层造成过拟合进而影响检测精度的问题,引入了Dropout层和Sigmoid激活函数来替换BN层,从而提高模型性能;最后,用多重相似性损失函数替换传统三元组网络模型的损失函数。此外,将imTN的距离特征输出作为KNN算法的输入再次训练。在基准数据集IDS2018上的对比实验表明:与现有性能良好的基于深度神经网络的入侵检测系统(IDS-DNN)和基于卷积神经网络与长短期记忆(CNN-LSTM)的检测模型相比,在Sub_DS3子集上,imTN-KNN的检测准确率分别提高了2.76%和4.68%,计算效率分别提高了69.56%和74.31%。
关键词
网络安全
入侵检测
深度学习
三元组网络
K近邻
多重相似性
损失函数
Keywords
network security
intrusion detection
deep learning
triplet network
K-Nearest Neighbor(KNN)
MultiSimilarity loss function
分类号
TP309.1 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于多重相似性和增强注意力预测药物-靶标相互作用
王伟
余梦雪
孙斌
万仕彤
刘栋
周运
张红军
王鲜芳
《河南师范大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
评价中药指纹图谱批次相似性的h多重相似性指数
朱浩宇
顾荣领
杜士杰
徐路
《分析测试学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
基于改进三元组网络和K近邻算法的入侵检测
王月
江逸茗
兰巨龙
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2021
10
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职称材料
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