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一种多视角图嵌入的miRNA-疾病关系预测方法
1
作者
翁骞
孙宇平
凌捷
《小型微型计算机系统》
北大核心
2025年第4期876-882,共7页
MicroRNA(miRNA)在人类复杂疾病的发生发展中发挥着重要作用.由于生物学实验耗时费力,开发一种准确的计算预测方法对于识别疾病相关的miRNA是必不可少的.本文提出了一种多视角图嵌入的miRNA-疾病关联识别新方法(MGEMDA).该方法首先构建m...
MicroRNA(miRNA)在人类复杂疾病的发生发展中发挥着重要作用.由于生物学实验耗时费力,开发一种准确的计算预测方法对于识别疾病相关的miRNA是必不可少的.本文提出了一种多视角图嵌入的miRNA-疾病关联识别新方法(MGEMDA).该方法首先构建miRNA与疾病的多个相似网络,表征miRNA与疾病的关系.其次引入混合图表示学习框架,同时学习miRNA和疾病的特征.最后将特征输入到神经归纳矩阵补全模型中进行miRNA-疾病关联预测.在5折交叉验证中AUC值达到0.9454,与现有几种最先进的方法相比具有优异的性能.此外,对3种疾病(结肠癌、肺癌、乳腺癌)的案例研究进一步证实了MGEMDA对潜在疾病相关miRNA的预测能力.
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关键词
miRNA-疾病关联预测
多视角相似性网络
图卷积网络
图注意力网络
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职称材料
题名
一种多视角图嵌入的miRNA-疾病关系预测方法
1
作者
翁骞
孙宇平
凌捷
机构
广东工业大学计算机学院
出处
《小型微型计算机系统》
北大核心
2025年第4期876-882,共7页
基金
国家自然科学基金项目(62002070)资助.
文摘
MicroRNA(miRNA)在人类复杂疾病的发生发展中发挥着重要作用.由于生物学实验耗时费力,开发一种准确的计算预测方法对于识别疾病相关的miRNA是必不可少的.本文提出了一种多视角图嵌入的miRNA-疾病关联识别新方法(MGEMDA).该方法首先构建miRNA与疾病的多个相似网络,表征miRNA与疾病的关系.其次引入混合图表示学习框架,同时学习miRNA和疾病的特征.最后将特征输入到神经归纳矩阵补全模型中进行miRNA-疾病关联预测.在5折交叉验证中AUC值达到0.9454,与现有几种最先进的方法相比具有优异的性能.此外,对3种疾病(结肠癌、肺癌、乳腺癌)的案例研究进一步证实了MGEMDA对潜在疾病相关miRNA的预测能力.
关键词
miRNA-疾病关联预测
多视角相似性网络
图卷积网络
图注意力网络
Keywords
miRNA-disease association
multi-view similarity networks
graph convolution network
graph attention network
分类号
TP393 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种多视角图嵌入的miRNA-疾病关系预测方法
翁骞
孙宇平
凌捷
《小型微型计算机系统》
北大核心
2025
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