期刊文献+
共找到3篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
多等位基因PCR-SSO反相杂交法及其在HLA-DR_4亚型结构分析中的应用
1
作者 失迺硕 王亚新 陈诗书 《生物化学杂志》 CSCD 1993年第3期299-303,共5页
本文介绍一种适合于多等位基因定型和结构分析的反相顺序特异性寡核苷酸探针杂交方法。将化学合成的多种探针分别经脱氧核苷末端转移酶(TdT)催化,于3′端加上100个以上碱基的Poly(dT)尾,然后将各探针分别以斑点固定于同一张尼龙膜上。用... 本文介绍一种适合于多等位基因定型和结构分析的反相顺序特异性寡核苷酸探针杂交方法。将化学合成的多种探针分别经脱氧核苷末端转移酶(TdT)催化,于3′端加上100个以上碱基的Poly(dT)尾,然后将各探针分别以斑点固定于同一张尼龙膜上。用PCR法对该基因位点进行扩增,扩增的同时加入α-^(32)P-dCTP以直接参入放射标记,然后将PCR产物与膜固定探针杂交,以四甲基氯化铵根据探针长度统一洗涤温度。该方法克服了以往对同一份样品进行多个等位基因检测时需要进行多次探针标记和杂交的缺点。我们用该方法对中国人群MHC-Ⅱ类DR4多等位基因进行了研究。 展开更多
关键词 反相杂交法 多等位基因 检测
在线阅读 下载PDF
利用群体特异性参考基因组鉴定中国瘤牛SNPs的优势
2
作者 李艾欣 李紫阳 +4 位作者 陈文洁 田雨阳 雷初朝 李志钢 陈宁博 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第10期4963-4972,共10页
本研究旨在以中国瘤牛群体特异性基因组为参考基因组,系统评估其在单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)鉴定中的优势。以60头中国瘤牛的全基因组重测序数据为研究对象,分别基于欧洲普通牛参考基因组(ARS-UCD1.2)和中... 本研究旨在以中国瘤牛群体特异性基因组为参考基因组,系统评估其在单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)鉴定中的优势。以60头中国瘤牛的全基因组重测序数据为研究对象,分别基于欧洲普通牛参考基因组(ARS-UCD1.2)和中国瘤牛群体特异性参考基因组(雷琼牛参考基因组:ASM3988116v1)进行SNPs的鉴定和比较。针对利用ARS-UCD1.2基因组检测到的多等位SNPs,构建基因组之间的坐标映射链式文件,将其转换为ASM3988116v1基因组坐标下的双等位SNPs,并开展深度注释分析。结果表明,在分析中国瘤牛群体遗传变异时,利用ASM3988116v1群体特异性参考基因组相较于ARS-UCD1.2基因组具有显著优势:1)可以更全面地鉴定内含子和非翻译区变异,提升低频和罕见变异的检测灵敏度;2)可以降低由于参考偏倚造成的变异鉴定过程中出现的假阳性;3)实现将部分由于基因组参考偏倚过滤掉的多等位SNPs转换为双等位SNPs,这些SNPs共注释到8352个基因,其中包含与瘤牛生长发育及环境适应性相关的重要基因,如肌肉发育(CTNNA1)、免疫(SIL1)、血液循环(VPS13A)、肌肉发育和光周期(EYA3)等。针对我国地方黄牛群体的特异性参考基因组能够提升变异检测灵敏度,降低基因组参考偏倚,并挖掘更多具有重要意义的功能位点,为群体遗传学研究和畜禽精准育种提供了高置信度的数据基础,具有重要的理论与实际意义。 展开更多
关键词 群体特异性参考基因 单核苷酸多态性 参考偏倚 等位/多等位基因SNPs 功能基因
在线阅读 下载PDF
Polymorphism of HLA-A and HLA-B in pre-eclampsia 被引量:1
3
作者 Zhan ZHANG Li-ting JIA Lin-in ZHANG 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期418-425,共8页
Objective:To investigate the association between the polymorphism of HLA-A,HLA-B genes and pre-eclampsia. Methods:HLA-A,HLA-B genotyping was performed by polymerase chain reaction sequence-specific primer (PCR-SSP) in... Objective:To investigate the association between the polymorphism of HLA-A,HLA-B genes and pre-eclampsia. Methods:HLA-A,HLA-B genotyping was performed by polymerase chain reaction sequence-specific primer (PCR-SSP) in 119 preeclampsia patients,117 normal pregnant women and their neonates. Results:The study showed that 16 HLA-A and 39 HLA-B alleles were obtained in pre-eclamptic patients and normal pregnant women. 15 HLA-A and 37 HLA-B alleles were obtained in their neonates. No significant difference was found in maternal or neonatal HLA-A,HLA-B alleles between pre-eclampsia group and control group (P_(c)>0.05). The frequencies of HLA-A11,HLA-A24,HLA-B13,HLA-B14,HLA-B15,HLA-B52 maternal/fetus genetic assoications were significantly diffe-rent between pre-eclampsia group and control group (P<0.05). Conclusion:Some HLA-A,HLA-B maternal/fetus special bindings may be associated with the susceptibility or protective of pre-eclampsia. 展开更多
关键词 HLA A antigens HLA B antigens PRE-ECLAMPSIA Polymorphism genetic ALLELE
在线阅读 下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部