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芽孢杆菌对黄芪内生细菌群落多样性及结构的影响
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作者 沙月霞 田兴芳 +1 位作者 贺彦怀 徐瑾瑜 《西北农业学报》 北大核心 2025年第5期949-958,共10页
为详细了解芽孢杆菌(Bacillus)浸种结合灌根处理对黄芪不同组织内生细菌群落多样性及结构的影响。提取黄芪内生细菌群落的总DNA后,采用植物微生物组测序技术检测黄芪根系及茎叶部组织的内生细菌群落的16SrRNA基因V3-V4序列,剖析黄芪根... 为详细了解芽孢杆菌(Bacillus)浸种结合灌根处理对黄芪不同组织内生细菌群落多样性及结构的影响。提取黄芪内生细菌群落的总DNA后,采用植物微生物组测序技术检测黄芪根系及茎叶部组织的内生细菌群落的16SrRNA基因V3-V4序列,剖析黄芪根部和茎叶部内生细菌群落多样性及结构特征。结果表明,芽孢杆菌浸种结合灌根显著影响黄芪幼苗根部和茎叶部组织的内生细菌群落多样性和丰富度,增加了分类单元OTU(OperationalTaxonomicUnits)(序列数≥5)的数量;黄芪幼苗根部内生厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Actinobacteria)的相对丰度是空白对照的2.27倍以上,茎叶部厚壁菌门的丰度增加约42.70%、拟杆菌门(Bacteroidetes)的丰度降低约19.38%;对根部与茎叶部的变形菌门(Proteobacteria)丰度、根部变形菌纲(Proteobacteria)及拟杆菌纲(Bacteroidia)丰度的影响趋势不一致;茎叶部的变形杆菌纲丰度降低约32.98%,增加了梭菌纲(Clostridia)、芽孢杆菌纲(Bacilli)、放线菌纲(Actinobacteria)和酸微菌纲(Acidimicro-biia)的相对丰度;芽孢杆菌处理组根部优势菌属(相对丰度≥5%)为根瘤菌属(Rhizobium),空白对照为嗜酸菌属(Acidovorax);贝莱斯芽孢杆菌(Bacillusvelezensis)S5浸种结合灌根后黄芪幼苗茎叶部优势菌属为嗜酸菌属,短小芽孢杆菌(Bacilluspumilus)J2浸种结合灌根后茎叶部没有相对丰度≥5%的细菌属,空白对照为鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas);增加了未分类根瘤菌(unclassifiedRhizobium)、芽孢杆菌、假单胞菌(Pseudomonas)、中慢生根瘤菌(Mesobradybioticrhizobium)和德沃斯菌(unclassified_Devosia)的种水平丰度,降低了未分类嗜酸菌(unclassifiedAcidophil)和纤维弧菌(Cellvibrio)的种水平丰度。PICRUSt2功能预测分析表明芽孢杆菌浸种结合灌根增加了黄芪组织中参与代谢、环境信息处理、遗传信息处理、细胞过程4个代谢通路的内生细菌相对丰度。总之,芽孢杆菌浸种结合灌根显著提高黄芪组织的内生细菌群落结构及多样性,改变优势菌属,改善黄芪幼苗生长的微生态环境。 展开更多
关键词 芽孢杆菌 黄芪 内生细菌群落 多样性及细菌群落结构 植物微生态学
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秸秆还田下连作对黄瓜土壤细菌群落结构和多样性的影响
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作者 李杨 宋立群 +4 位作者 敖静 刘晓辉 高晓梅 孙玉禄 朱巍巍 《中国土壤与肥料》 北大核心 2025年第2期65-75,共11页
为研究秸秆还田下设施黄瓜连作不同年限对土壤细菌群落结构和多样性的影响,探索秸秆还田下连作土壤修复的微生物学机理,以玉米秸秆还田下设施黄瓜连作1、3、5、10和15年的根区土壤为研究对象,利用高通量测序和实时定量PCR技术解析土壤... 为研究秸秆还田下设施黄瓜连作不同年限对土壤细菌群落结构和多样性的影响,探索秸秆还田下连作土壤修复的微生物学机理,以玉米秸秆还田下设施黄瓜连作1、3、5、10和15年的根区土壤为研究对象,利用高通量测序和实时定量PCR技术解析土壤细菌群落组成、群落多样性和潜在功能的变化特征,分析其变化规律。秸秆还田下连作土壤有机质和全氮含量提高,铵态氮含量降低,土壤pH呈先降后升的趋势,电导率呈逐年上升的趋势,碱性磷酸酶和蔗糖酶活性升高。不同处理土壤细菌的基因拷贝数为2.98×10^(9)~7.81×10^(9)个/g,秸秆还田下连作提高了土壤细菌的丰度。放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、厚壁菌门(Firmicutes)4个菌门相对丰度稳定在75%以上,随着连作年限延长绿弯菌门和酸杆菌门(Acidobacteria)的相对丰度均有所增加,厚壁菌门的相对丰度有所减少。多样性分析表明,秸秆还田下土壤中细菌的多样性无显著变化(P>0.05)。主坐标分析显示,连作可以影响细菌群落结构,不同处理细菌群落结构均差异极显著(P<0.01)。FAPROTAX功能预测显示,化能异养型和好氧化能异养型为主要类型。共现网络分析中,秸秆还田下连作提升了属水平网络的复杂度和稳定性。冗余分析结果显示,全磷对土壤细菌群落结构的影响最为显著(F=3.5,P=0.002),解释了21.3%的群落变化,贡献率依次为全磷>铵态氮>有效磷>pH>速效钾>电导率>全氮>有机质;细菌群落对脲酶的影响最显著(F=4.6,P=0.002),解释了26.3%的群落变化,对各酶活的影响顺序为脲酶>过氧化氢酶>蔗糖酶>多酚氧化酶>碱性磷酸酶。因此,秸秆还田对稳定连作土壤细菌多样性具有积极作用及在缓解设施作物连作障碍中的有益效果,土壤全磷是影响土壤细菌群落结构变化的主效环境因子,细菌群落的改变对土壤脲酶活性影响最大。 展开更多
关键词 秸秆还田 连作 细菌群落多样性 功能预测 土壤理化性质
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不同生境沙氏鹿茸草根际土壤细菌群落结构和多样性分析
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作者 李峰卿 刘素贞 +3 位作者 罗桂生 邹玉玲 黄维 曾满生 《林业科学》 北大核心 2025年第1期47-56,共10页
【目的】分析江西省内野生和人工栽培沙氏鹿茸草根际土壤细菌群落结构和多样性及其与土壤理化性质的关系,为构建沙氏鹿茸草健康的根际微环境,进一步探究沙氏鹿茸草仿野生栽培模式提供理论依据。【方法】应用高通量测序技术,比较油茶、... 【目的】分析江西省内野生和人工栽培沙氏鹿茸草根际土壤细菌群落结构和多样性及其与土壤理化性质的关系,为构建沙氏鹿茸草健康的根际微环境,进一步探究沙氏鹿茸草仿野生栽培模式提供理论依据。【方法】应用高通量测序技术,比较油茶、栀子、马尾松林下野生以及人工栽培2种生境下沙氏鹿茸草根际土壤细菌群落结构和多样性,结合根际土壤理化性质进行相关性分析。【结果】2种生境下,沙氏鹿茸草根际土壤理化性质差异显著,人工仿野生栽培的根际微生物Alpha多样性最高,但在各林分类型间差异未达显著水平;各生境下优势菌门均为变形菌门、酸杆菌门、绿弯菌门、放线菌门,共有优势属包括卡氏伯克霍尔德菌属、慢生根瘤菌属、Candidatus_Solibacter、Occallatibacter、苔藓杆菌属和uncultured bacterium等有益菌;野生生境和人工栽培土壤细菌群落结构存在明显差异,人工栽培生境下变形菌门丰度最高;野生生境特有优势菌属(嗜酸栖热菌属、FCPS473、丛毛单胞菌属、酸杆菌属、未培养酸杆菌属、uncultured_forest_soil_bacterium等)的丰度在人工栽培生境下显著降低,而人工栽培生境特有优势细菌属(鞘脂单胞菌属、粒状胞菌属、嗜盐囊菌属、 Mucilaginibacter)的丰度较野生生境增加明显。冗余分析表明,根际细菌群落与土壤全氮、速效钾、碱解氮、有机质含量密切相关。【结论】在野生和人工栽培生境间,沙氏鹿茸草根际土壤理化性质、细菌群落结构具有显著差异,但野生生境沙氏鹿茸草根际细菌群落之间的相似性较高。土壤全氮、速效钾、碱解氮和有机质含量是影响细菌群落结构的主要环境因子。 展开更多
关键词 沙氏鹿茸草 土壤细菌 群落结构 生境
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青稞根腐病根际土壤细菌多样性及群落结构变化规律
4
作者 李雪萍 许世洋 +1 位作者 李建军 漆永红 《草业学报》 北大核心 2025年第5期118-129,共12页
青稞根腐病危害严重,其发生、蔓延与其根际土壤细菌群落动态密切相关。为明确青稞根腐病的发生对其根际土壤细菌多样性及群落结构的影响,本研究通过对甘肃甘南藏族自治州青稞种植区的根腐病进行系统调查,采集不同发病率青稞根际土壤样品... 青稞根腐病危害严重,其发生、蔓延与其根际土壤细菌群落动态密切相关。为明确青稞根腐病的发生对其根际土壤细菌多样性及群落结构的影响,本研究通过对甘肃甘南藏族自治州青稞种植区的根腐病进行系统调查,采集不同发病率青稞根际土壤样品,采用高通量测序获得其根际土壤细菌群落遗传信息,分析其多样性及演替规律,并通过COG基因库注释其基因功能。结果发现,青稞根际土壤细菌物种组成丰富,均匀程度高,能全面反映样品细菌群落结构。健康样品与发病率为5%青稞根际土壤细菌群落距离最近,发病率越高,则与健康样品的距离越大。随青稞根腐病发病率升高,不同发病样本特有物种数呈先增高后降低趋势;变形菌门相对丰度先升高后降低,与绿弯菌门、酸杆菌门、拟杆菌门、放线菌门和芽单胞菌门变化相反;芽孢杆菌目、硝化螺旋菌目,芽单胞菌科、芽孢杆菌科、硝化螺旋菌科及对应的芽单胞菌属、芽孢杆菌属、硝化螺旋菌属相对丰度先升高后降低,简单芽孢杆菌相对丰度先升高后降低,而醋酸钙不动杆菌、嗜根寡养单胞菌等相对丰度先降低后升高。青稞根际土壤细菌氨基酸转运代谢、转录、脂肪转运代谢及翻译后修饰、蛋白质折叠和伴侣蛋白等功能基因的丰度因根腐病的发生而降低,信号转导机制、能量生成和转换等功能基因的丰度则升高。 展开更多
关键词 青稞 根腐病 群落结构 物种多样性 高通量
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石榴根腐病植株和健康植株根际土壤细菌群落结构及多样性分析
5
作者 王燕平 杨永利 +3 位作者 陈松 王毛 刘旭 张翠翠 《中国果树》 2025年第6期88-95,共8页
研究石榴根腐病病株与健康植株的根际土壤细菌群落结构及多样性变化,为探究石榴根腐病的微生态发病机理及防治提供理论基础。利用高通量测序技术,分析和比较石榴根腐病患病植株和健康植株的根际土壤细菌群落结构组成及多样性特点。结果... 研究石榴根腐病病株与健康植株的根际土壤细菌群落结构及多样性变化,为探究石榴根腐病的微生态发病机理及防治提供理论基础。利用高通量测序技术,分析和比较石榴根腐病患病植株和健康植株的根际土壤细菌群落结构组成及多样性特点。结果表明:患病植株与健康植株相比,根际土壤细菌多样性和丰富度均未达到显著差异;Beta多样性分析表明,患病植株与健康植株根际土壤的细菌群落组成存在明显差异;在优势门菌群中,放线菌门(Actinobacteriota)和变形菌门(Proteobacteria)相对丰度在患根腐病的植株根际土壤中均显著高于健康植株,而酸杆菌门(Acidobacteriota)、芽单胞菌门(Gemmatimonadota)、绿弯菌门(Chloroflexi)以及黏球菌门(Myxococcota)相对丰度在健康植株的根际土壤中均高于患病植株。在属水平上,链霉菌属(Streptomyces)、Actinospica属、分枝杆菌属(Mycobacterium)相对丰度在患病植株根际土壤中均高于健康植株;而芽单胞菌属(Gemmatimonas)相对丰度在健康植株根际土壤中高于患病植株;LefSe分析结果表明,放线菌门和芽单胞菌门在患病植株和健康植株根际土壤中的差异最大。综上所述,健康石榴植株感染根腐病后,根际土壤细菌群落结构和多样性发生了一定程度变化,链霉菌属为相对丰度最高的属,在患根腐病的植株根际土壤中明显富集,可作为候选生防菌群。 展开更多
关键词 石榴 根腐病 高通量测序 细菌多样性 群落结构
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西藏典型高山河流尼洋河水体细菌多样性及群落结构
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作者 母雪艳 李佳蔚 +4 位作者 郝兆 王艳红 黄帅帅 德吉 周永洪 《生态学报》 北大核心 2025年第15期7710-7721,共12页
本研究通过高通量测序的方法探究了尼洋河水体细菌多样性及群落结构,发现尼洋河上中下游以及支流之间细菌群落结构存在显著差异。尼洋河水体细菌群落主要由变形菌门、放线菌门、拟杆菌门、蓝藻门、浮霉菌门等类群组成,优势种多为未知种... 本研究通过高通量测序的方法探究了尼洋河水体细菌多样性及群落结构,发现尼洋河上中下游以及支流之间细菌群落结构存在显著差异。尼洋河水体细菌群落主要由变形菌门、放线菌门、拟杆菌门、蓝藻门、浮霉菌门等类群组成,优势种多为未知种,分别为Sporichthyaceae_sp.、Pseudarcicella_sp.、Limnohabitans_sp.、Flavobacterium_sp.、Candidatus_planktophila、Rhodoferax_sp.、Candidatus_nanopelagicus、f-Ilumatobacteraceae和hgcI_sp.,大量未知种的发现为青藏高原远古细菌多样性研究以及开发相关生物功能提供了可能。尼洋河上游的ASV数明显高于其它河段,α-多样性指数分析显示,其Shannon指数、ACE指数、Simpson多样性指数、pielou指数、以及Chao1指数均显著高于其它分段,说明尼洋河上游水体细菌的多样性最为丰富。中性群落拟合分析显示,相较于确定性过程而言,随机性过程对尼洋河水体细菌群落构建过程影响更大,不同区段细菌菌群差异主要与物种替换相关。生态位分析显示,巴河区段水体的生态位宽度均值最高但生态位重叠指数均值最低,说明巴河区段细菌优势种之间竞争程度较低。总的来说尼洋河水体细菌资源丰富,这对于青藏高原细菌多样性研究以及高原极端环境下功能性细菌开发利用具有重要意义。 展开更多
关键词 高原河流 尼洋河 水体细菌 多样性 群落结构
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秋茄内生细菌群落结构特征与多样性研究
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作者 林文波 陈有先 +3 位作者 郭萍萍 王思凡 刘芳 袁宗胜 《西南林业大学学报(自然科学)》 北大核心 2025年第4期116-123,共8页
为探究内生细菌与秋茄的互作关系,通过采集秋茄根、枝、叶组织样本,提取样本基因组DNA,采用16S rDNA高通量测序技术分析秋茄内生细菌群落结构与多样性,分析秋茄不同部位内生细菌群落的结构特征。结果表明:检测到26门、45纲、107目、186... 为探究内生细菌与秋茄的互作关系,通过采集秋茄根、枝、叶组织样本,提取样本基因组DNA,采用16S rDNA高通量测序技术分析秋茄内生细菌群落结构与多样性,分析秋茄不同部位内生细菌群落的结构特征。结果表明:检测到26门、45纲、107目、186科、391属的内生细菌,共1 893个OTUs。变形菌门在秋茄内生细菌群落中占据主体地位,甲基杆菌属是秋茄根、枝中的优势菌属,在秋茄叶中的相对丰度低于蓝细菌属。内生细菌群落丰富度呈现根>枝>叶,均匀度呈现枝>根>叶。优势菌群落与秋茄的新陈代谢、环境适应与遗传信息等功能显著相关。因此,秋茄根、枝、叶组织内生细菌群落的结构特征、多样性、优势菌属存在显著差异,内生细菌可能是秋茄具有优异适应性与抗逆性的重要因素。 展开更多
关键词 秋茄 内生细菌 生理功能 群落结构 多样性
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闽江河口湿地土壤细菌群落结构与多样性特征
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作者 张马啸 毛梦圆 +4 位作者 陈宇龙 袁宗胜 李树斌 潘辉 周丽丽 《西南林业大学学报(自然科学)》 北大核心 2025年第1期88-95,共8页
以闽江河口典型植被类型(秋茄、芦苇、短叶茳芏)为研究对象,光滩为对照,利用16S rRNA高通量测序技术,探讨不同植被类型湿地土壤表层细菌的多样性特征。结果表明:土壤样品中获得6 410个OTUs,分属97门、191纲、359目、468科、582属和170... 以闽江河口典型植被类型(秋茄、芦苇、短叶茳芏)为研究对象,光滩为对照,利用16S rRNA高通量测序技术,探讨不同植被类型湿地土壤表层细菌的多样性特征。结果表明:土壤样品中获得6 410个OTUs,分属97门、191纲、359目、468科、582属和170种。在门水平上,优势菌门为Proteobacteria、Bacteroidota、Cyanobacteria、Firmicutes等,其中光滩土壤的主导菌门为Cyanobacteria,秋茄群落为Bacteroidota,芦苇群落和短叶茳芏群落为Proteobacteria;在纲水平上,Cyanobacteriia和Bacilli的相对丰度比例均为光滩>秋茄>芦苇>短叶茳芏;在目水平上,秋茄和芦苇群落中占主导地位的目均为Flavobacteriales;在科水平上,Flavobacteriaceae同为秋茄、芦苇和短叶茳芏土壤中的优势菌科,其相对丰度比例分别为29.60%、18.02%和6.17%;在属水平上,Flavobacterium均为3种有植被覆盖土壤中的主要优势菌属;在种水平上,Jeotgalibacillus malaysiensis为光滩中的特有菌种。不同植被群落的物种数量、Shannon指数、Simpson指数均表现为短叶茳芏>芦苇>秋茄>光滩,光滩与3种植被群落的土壤差异显著。闽江河口湿地细菌群落结构与多样性会根据有无植被覆盖及不同类型植被覆盖而表现出特定的环境偏好。 展开更多
关键词 植被类型 湿地 表层土壤 高通量测序 细菌群落结构 多样性
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典型喀斯特地貌森林土壤细菌多样性、群落结构及其影响因素
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作者 温宇力 招礼军 +1 位作者 吴庆标 蒙凤群 《广西林业科学》 2025年第2期141-150,共10页
为探究典型喀斯特地貌森林土壤细菌多样性、群落结构及其影响因素,以拟建西南岩溶国家公园3个典型喀斯特地貌片区[都安-大化(DA处理)、乐业(LY处理)和环江片区(HJ处理)]土壤为研究对象,以非典型喀斯特地貌土壤为对照(CK),测定土壤基本性... 为探究典型喀斯特地貌森林土壤细菌多样性、群落结构及其影响因素,以拟建西南岩溶国家公园3个典型喀斯特地貌片区[都安-大化(DA处理)、乐业(LY处理)和环江片区(HJ处理)]土壤为研究对象,以非典型喀斯特地貌土壤为对照(CK),测定土壤基本性质,采用16S rRNA测序技术,分析土壤细菌多样性、群落结构及其影响因素。结果表明,共鉴定细菌2界52门109纲289目442科768属619种。CK及HJ、LY和DA处理土壤特有细菌OTU数量分别为3 859、3 104、3 054和2 941个。CK及HJ、LY和DA处理间土壤细菌丰富度和均匀度均相似;HJ、LY和DA处理的土壤细菌群落结构较相似,CK的土壤细菌群落结构与HJ、LY和DA处理均差异较大。在门水平下,CK及HJ、LY和DA处理的土壤优势菌门均为变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和绿弯菌门(Chloroflexota);CK及LY和DA处理的变形菌门相对丰度均最高,HJ处理的放线菌门相对丰度最高。在目水平下,HJ、LY和DA处理的土壤细菌优势菌目均为嗜邻聚杆菌目(Vicinamibacterales)、根瘤菌目未命名目(Rhizobiales_A_504705)、盖亚女神菌目(Gaiellales)和罗库菌目(Rokubacteriales),CK的土壤细菌优势菌目为根瘤菌目未命名目、未鉴定目(Acidoferrales)、酸杆菌目(Acidobacteriales)和嗜邻聚杆菌目。pH值、交换性铝和交换性锌含量是影响典型喀斯特地貌土壤细菌群落结构差异的关键环境因子。 展开更多
关键词 土壤细菌 多样性 群落结构 土壤基本性质 喀斯特
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薰衣草不同连作年限根际土壤细菌多样性及群落结构的变化
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作者 张晓乐 吾尔恩·阿合别尔迪 +3 位作者 恩特马克·布拉提白 木古丽·木哈西 袁青青 白茹 《新疆农业科学》 北大核心 2025年第3期706-714,共9页
【目的】探究不同连作年限薰衣草根际土壤细菌群落结构和多样性特征以及演变规律,为薰衣草土壤科学管理及增产提供参考。【方法】采集新疆伊犁哈萨克自治州霍城县不同连作年限以及未种植薰衣草土壤样品各3组,对16S rDNA序列进行Illumin... 【目的】探究不同连作年限薰衣草根际土壤细菌群落结构和多样性特征以及演变规律,为薰衣草土壤科学管理及增产提供参考。【方法】采集新疆伊犁哈萨克自治州霍城县不同连作年限以及未种植薰衣草土壤样品各3组,对16S rDNA序列进行Illumina高通量测序。比较各样品组细菌多样性和群落分布规律及与种植年限的关联。【结果】随着连作年限的增加Shannon指数和Chao1指数均先降低后增高。在门水平上,酸杆菌门、变形菌门、放线菌门为优势菌门。在属水平上优势菌属为酸杆菌门中未被分类的一个属、鞘氨醇单胞菌属和嗜酸性杆菌属,不同年限的薰衣草土壤间细菌群组成相近,但相对丰度有所差异。Beta多样性与未种植土壤相比亦发生显著变化,其中第1年与第5年相似,均与第3年有较大差异。【结论】薰衣草连作种植造成根际土壤细菌群落结构和多样性改变。 展开更多
关键词 薰衣草 连作障碍 高通量测序 细菌多样性 群落结构
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云南兰坪箐花甸国家湿地公园植物多样性及群落结构研究 被引量：1
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作者 王有兵 姜健发 +5 位作者 杨淑娇 胡昌平 杨国斌 梁建忠 余皖云 罗燕彬 《林业调查规划》 2025年第1期89-94,共6页
基于前期综合科学考察资料,对云南兰坪箐花甸国家湿地公园展开了全域植物种类及植被类型补充调查,分析湿地公园植物多样性组成及群落α多样性特征。结果表明,湿地公园共记录到维管束植物397种,隶属86科252属;含10种以上的科有13个,占总... 基于前期综合科学考察资料,对云南兰坪箐花甸国家湿地公园展开了全域植物种类及植被类型补充调查,分析湿地公园植物多样性组成及群落α多样性特征。结果表明,湿地公园共记录到维管束植物397种,隶属86科252属;含10种以上的科有13个,占总科数的15.1%,其中包含有203个种,占湿地公园全部种数的51.1%;禾本科、蔷薇科、菊科及毛茛科植物为常见科,各科含种数均超过20种;单种科占比31.4%,单种属占比66.3%;种子植物属的区系以温带成分为主,累计占比达65.2%,其中北温带分布属有104个,占种子植物属的43.3%;湿地公园的植被可划分为6个植被型,8个植被亚型,12个群系组和18个群系,灌丛面积占比最高(38.37%),其次为草甸类(30.71%),再次为乔木林类(29.97%);α多样性指数呈现乔木林和灌丛类较草甸和水生植被类高。 展开更多
关键词 植物多样性 群落结构 区系 植被类型 α多样性指数 云南兰坪箐花甸国家湿地公园
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饲草种植利用对宁夏灌区盐渍化土壤古菌群落结构及多样性的影响
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作者 李凤霞 王长军 +6 位作者 王占军 杜建民 郭永忠 沈婧丽 孙娇 母养秀 张永宏 《草业科学》 北大核心 2025年第5期1172-1181,共10页
为了探究饲草种植利用对盐渍化土壤古菌的影响,采用宏基因组测序技术,对宁夏银北灌区紫花苜蓿(Medicago sativa)、甜高粱(Sorghum bicolor)、玉米(Zea mays)、湖南稷子(Echinochloa crusgalli)4种饲草地0-20 cm盐渍化土壤的古菌群落结... 为了探究饲草种植利用对盐渍化土壤古菌的影响,采用宏基因组测序技术,对宁夏银北灌区紫花苜蓿(Medicago sativa)、甜高粱(Sorghum bicolor)、玉米(Zea mays)、湖南稷子(Echinochloa crusgalli)4种饲草地0-20 cm盐渍化土壤的古菌群落结构和多样性进行研究。结果表明,4种饲草地共检测到古菌物种297个OTUs,隶属于7个门7个纲15个目18个科75个属。4种饲草地土壤古菌总物种数和特有物种数表现为甜高粱>紫花苜蓿>玉米>湖南稷子。4种饲草地土壤古菌Simpson指数、Chao1指数、Shannon-Wiener指数和Ace指数变化趋势均表现为湖南稷子>甜高粱>玉米>紫花苜蓿,Simpson指数、Chao1和Ace指数在紫花苜蓿与湖南稷子之间差异显著(P<0.05)。土壤主要优势菌门有泉古菌门(Crenarchaeota)(51.50%)、广古菌门(Euryarchaeota)(19.85%)和Thaumarchaeota(17.10%);优势菌属有硝酸候选菌属(Candidatus_Nitrosocosmicus)(5.50%)、盐碱球菌属(Halalkalicoccus)(4.78%)、硝基水杨酸菌属(Nitrosarchaeum)(6.73%)等。湖南稷子种植增加了硝酸候选菌属(7.77%)、硝基水杨酸菌属(17.26%)和甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)(7.91%)的相对丰度。高粱种植增加了土壤盐碱球菌属(15.47%)相对丰度,玉米种植增加了盐碱球菌属(3.28%)相对丰度。土壤全盐(TS)、有机质(OM)、全氮(TN)、速效氮(AN)、全磷(TP)是影响土壤古菌群落相对丰度主要的环境因子。因此,饲草种植利用对于促进盐渍化土壤质量提升、区域种植结构优化和土壤生态系统稳定性改善具有重要意义。 展开更多
关键词 古菌 群落结构 多样性 饲草 盐渍土 宁夏灌区
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不同生态型蚯蚓对有机茶园土壤真菌群落结构及多样性的影响
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作者 张香凝 陈涛 +3 位作者 史福刚 李太魁 赵丰华 郭战玲 《中国生态农业学报(中英文)》 北大核心 2025年第6期1094-1102,共9页
茶园老化、茶园地力退化和土壤生物多样性差等已成为制约有机茶产量及品质的重要因素。本研究在有机茶园接种了不同生态型蚯蚓,探讨不同生态型蚯蚓对有机茶园土壤真菌群落组成的影响。试验共设置4个处理:接种密度为300条·m^(-2)的... 茶园老化、茶园地力退化和土壤生物多样性差等已成为制约有机茶产量及品质的重要因素。本研究在有机茶园接种了不同生态型蚯蚓,探讨不同生态型蚯蚓对有机茶园土壤真菌群落组成的影响。试验共设置4个处理:接种密度为300条·m^(-2)的赤子爱胜蚓(E),接种密度为100条·m^(-2)的威廉腔环蚓(P),同时接种密度为150条·m^(-2)的赤子爱胜蚓和密度为50条·m^(-2)的威廉腔环蚓(EP),以及未接种蚯蚓(CK);通过高通量测序研究土壤真菌群落组成及多样性。结果表明:与CK处理相比,接种蚯蚓处理(E、P和EP)显著增加了土壤真菌操作分类单元(OTU)个数,优势OTU个数从100增至269。与CK处理相比,接种蚯蚓增加了土壤真菌群落的α多样性,Shannon、Simpson和Fisher指数均有所提高(除EP处理外,其余均显著)。子囊菌门和担子菌门是茶园土壤真菌优势类群,接种单一类型蚯蚓的处理中,子囊菌门进一步增加,混合接种不同类型蚯蚓处理中略有减少。与CK处理相比,EP处理被孢霉门相对丰度(10.16%)增幅最大;EP处理出现了更多未知真菌,其比例约为29.61%,种群均匀性最好。与常规有机茶园相比,接种蚯蚓可以在降低腐生营养型真菌相对丰度的同时,促进病理-腐生-共生过渡型真菌的生长;P处理还可以增加病理型真菌的生长;EP处理可以减少专性腐生真菌,促进病理-腐生-共生真菌生长及腐生-共生过渡型真菌的生长,减少病理真菌。由此可见,蚯蚓类型之间的相互促进作用胜过竞争,混合接种不同生态型蚯蚓有助于控制潜在病原体,从而为改善有机茶园土壤生物多样性和提升土壤质量提供可持续发展的方案。 展开更多
关键词 蚯蚓 真菌群落多样性 有机茶园 真菌群落结构
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长白落叶松-白桦混交林土壤细菌群落结构及多样性
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作者 富哲峰 《中国林副特产》 2025年第4期17-19,共3页
以辽宁新宾县的长白落叶松-白桦混交林为研究对象,并以相似立地条件的自然荒地为对照组,分析长白落叶松-白桦混交林与自然荒地土壤细菌群落结构,多样性及影响因素。结果表明:放线菌门、变形菌门、酸杆菌门是混交林及荒地表层(0~20 cm)... 以辽宁新宾县的长白落叶松-白桦混交林为研究对象,并以相似立地条件的自然荒地为对照组,分析长白落叶松-白桦混交林与自然荒地土壤细菌群落结构,多样性及影响因素。结果表明:放线菌门、变形菌门、酸杆菌门是混交林及荒地表层(0~20 cm)和底层(20~40 cm)土壤的优势门类。在科、属水平上,黄色杆菌科、分枝杆菌属、慢生根瘤菌属等为混交林地表层土壤的优势细菌类群,其相对丰度显著高于山地土壤。 展开更多
关键词 长白落叶松 白桦树 混交林 土壤细菌群落 群落结构 多样性 影响因素
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大球盖菇—大豆—豆丹种养循环模式对土壤细菌群落结构和多样性的影响
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作者 苏文英 王一璞 +4 位作者 刘晓梅 纪伟 孙潇潇 胡曙鋆 任立凯 《江西农业学报》 2025年第3期47-53,62,共8页
以普通种植模式(CK)及大球盖菇—大豆—豆丹种养循环模式(JZ)为研究对象,采用高通量测序技术对不同种植模式下的土壤理化性质、细菌群落的多样性和结构进行了测定分析,探讨了大球盖菇—大豆—豆丹种养循环模式对土壤细菌群落多样性及结... 以普通种植模式(CK)及大球盖菇—大豆—豆丹种养循环模式(JZ)为研究对象,采用高通量测序技术对不同种植模式下的土壤理化性质、细菌群落的多样性和结构进行了测定分析,探讨了大球盖菇—大豆—豆丹种养循环模式对土壤细菌群落多样性及结构的影响。结果表明:JZ组的有机质、硝态氮、有效磷含量较CK明显增加,但EC值、速效钾、盐含量较CK明显降低。在2种种植模式下,土壤细菌的优势菌群为放线菌门、变形菌门、芽单胞菌门、酸杆菌门及绿弯菌门,种养循环模式后,土壤中放线菌门、绿弯菌门、奇古菌门的占比降低;变形菌门、芽单胞菌门、酸杆菌门的占比上升。Alpha多样性结果表明,CK的Chao1指数、ACE数、Shannon指数、Simpson指数均高于JZ组,说明在种养循环模式后,土壤中的细菌多样性降低。应用大球盖菇—大豆种植模式可提高土壤中的有机质含量和氮、磷含量,土壤细菌群落的丰度和多样性降低,但拟杆菌门、变形菌门、放线菌门等有益菌相对丰度的提高可以减少病害的发生。该研究结果可为优化土壤微生态调控机制及推进区域农业结构转型提供理论依据和数据支撑。 展开更多
关键词 种养循环 高通量测序 土壤细菌群落 农业结构调整
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刘家峡水库主动源试验区浮游硅藻群落结构及其多样性
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作者 陈凌云 刘乐 +4 位作者 申啸天 陈锷 成丹 孔维宝 杜海峰 《兰州大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第1期65-75,共11页
以刘家峡水库主动源试验区为研究区域,选取10个采样位点,对试验区浮游硅藻群落结构特征和功能多样性进行调查,结合水质理化指标,分析影响浮游硅藻群落特征的环境因子.结果表明,试验区共检出浮游硅藻90种,隶属于2纲6目9科32属,优势类群... 以刘家峡水库主动源试验区为研究区域,选取10个采样位点,对试验区浮游硅藻群落结构特征和功能多样性进行调查,结合水质理化指标,分析影响浮游硅藻群落特征的环境因子.结果表明,试验区共检出浮游硅藻90种,隶属于2纲6目9科32属,优势类群主要为曲丝藻属;浮游硅藻群落的Shannon多样性指数、Margalef丰富度指数和Pielou均匀度指数变化范围分别为2.02~2.21、4.11~4.95和0.56~0.61;对浮游硅藻群落丰度进行聚类分析和非度量多维尺度分析,结果显示采样点可划分为4个群组,其中A群组为样点S1、S2和S3,B群组为样点S4、S5和S6,C群组为样点S7和S8,D群组为样点S9和S10;相似性分析检验结合相似百分比分析,结果显示浮游硅藻群落存在极显著差异(R=0.959,P=0.01),且造成差异的主要贡献种为高尔夫曲丝藻、亚显曲丝藻、高山曲丝藻和尖肘形藻;分别对鉴定的8大功能类群代表种属进行主坐标典型分析,结果显示各群落间存在一定的异质性;对浮游硅藻类群与环境因子分别进行生物环境连接分析和基于距离的冗余分析,结果显示总氮、pH、化学需氧量和NO-3-N为影响浮游硅藻群落的主要环境因子.主动源试验区气枪激发活动扰动水体后,可能会对周边浮游硅藻的物种分布和群落结构产生轻微影响. 展开更多
关键词 浮游硅藻 群落结构 生物多样性 生态效应 刘家峡水库
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河西内陆河流域大型底栖动物群落结构及生物多样性特征
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作者 王昱 信雅玲 +5 位作者 李浩霖 苗天 袁兴鹏 李能安 雒天峰 王娟 《生态与农村环境学报》 北大核心 2025年第6期781-791,共11页
为研究河西内陆河流域大型底栖动物群落结构特征、生物多样性与环境因子之间的关系,于2023年8月对讨赖河与石羊河2条典型干旱内陆河的大型底栖动物、水体理化指标以及环境因子进行采样调查。结果表明,此次采样共采集到52种大型底栖动物... 为研究河西内陆河流域大型底栖动物群落结构特征、生物多样性与环境因子之间的关系,于2023年8月对讨赖河与石羊河2条典型干旱内陆河的大型底栖动物、水体理化指标以及环境因子进行采样调查。结果表明,此次采样共采集到52种大型底栖动物,隶属3门6纲14目32科44属,节肢动物(75.3%)在全流域占优势地位。讨赖河平均密度和生物量分别为23 m^(-2)和1.8599 g·m^(-2),石羊河为32 m^(-2)和2.7211 g·m^(-2)。2条河大型底栖动物密度表现为下游农区段(251 m^(-2))>中游城区段(170 m^(-2))>上游山区段(76 m^(-2)),生物量表现为中游城区段(19.5444 g·m^(-2))>下游农区段(16.6575 g·m^(-2))>上游山区段(5.0278 g·m^(-2))。Shannon-Wiener多样性指数、Margalef丰富度指数分布特征均为中下游大于上游;Simpson优势度指数与Pielou均匀度指数在2条河流内变化较为平稳。由Jaccard相似性指数分析得出,讨赖河与石羊河各采样点之间共有物种较少,群落结构相似程度较低,表现出2条河流因河段异质性、河床组成、水生植被及底质组成等河流生境的不同,大型底栖动物群落结构空间分布差异显著。影响大型底栖动物群落结构的主要环境因子为水草丰富度、底质、海拔(ALT)、植被覆盖度、五日生化需氧量(BOD5)、电导率(EC)、溶解氧(DO)浓度、溶解性总固体(TDS)含量及盐度。 展开更多
关键词 河西内陆河 大型底栖动物 群落结构 生物多样性 生境因子
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竹节参内生真菌群落结构组成与多样性分析
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作者 梁娥 金睿 +3 位作者 唐婷婷 黄系伦 朱正美 张来 《现代农业科技》 2025年第10期146-153,158,共9页
以竹节参根、茎、叶、果实和根状茎为试材,采用高通量测序技术和传统培养分离方法,基于ITS序列,利用生物信息学方法分析竹节参内生真菌群落结构与多样性,以期为后续研究竹节参内生真菌的生物活性,探寻能够产生竹节参皂苷类活性物质或促... 以竹节参根、茎、叶、果实和根状茎为试材,采用高通量测序技术和传统培养分离方法,基于ITS序列,利用生物信息学方法分析竹节参内生真菌群落结构与多样性,以期为后续研究竹节参内生真菌的生物活性,探寻能够产生竹节参皂苷类活性物质或促进该物质积累的菌株提供参考依据。通过高通量测序25个样本共获得2668个ASVs,被注释到10门35纲98目242科475属714种,竹节参5个组织内生真菌丰富度和多样性表现为叶>茎>根状茎>根>果实,不同组织之间物种丰富度和多样性存在差异。采用组织培养法获得形态特征差异明显的53株内生真菌,经ITS序列测序后,序列同源性大于97%的45株菌株被注释子囊菌门的3纲7目10科14属,不同组织之间真菌群落结构组成存在明显差异。2种方法比较下,茎和果实内生真菌物种组成相较于其他组织更为丰富。通过分析比较获得竹节参优势真菌如链格孢属(Alternaria)、镰刀菌属(Fusarium)、炭疽菌属(Colletotrichum)等,为后续探究竹节参内生真菌的生物活性奠定了基础。 展开更多
关键词 竹节参 内生真菌 群落结构组成 多样性
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人工生草对干热河谷区芒果园杂草多样性和群落结构的影响 被引量：2
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作者 耿沙 张钦 +5 位作者 段春芳 车彬 沈正松 熊贤坤 严炜 刘倩 《草地学报》 北大核心 2025年第4期1228-1238,共11页
为分析人工生草对芒果园杂草多样性和群落结构的影响,本研究选用柱花草(Stylosanthes guianensis)、穗序木蓝(Indigofera hendecaphylla)、紫花苜蓿(Medicago sativa)、红三叶(Trifolium pratense)和大翼豆(Macroptilium lathyroides)等... 为分析人工生草对芒果园杂草多样性和群落结构的影响,本研究选用柱花草(Stylosanthes guianensis)、穗序木蓝(Indigofera hendecaphylla)、紫花苜蓿(Medicago sativa)、红三叶(Trifolium pratense)和大翼豆(Macroptilium lathyroides)等5个豆科草种作为试验组在芒果园进行生草试验,以自然生草芒果园为对照,研究人工生草对芒果园杂草的生态位、多样性、群落结构相似性及功能群的影响。结果表明:与自然生草相比,5种人工生草模式均能降低芒果园的杂草生物量、物种数、个体数和ACE估计值(Abundance-based Coverage Estimator),提高干热河谷区的芒果园杂草多样性。人工生草影响了芒果园的杂草生态位宽度和重叠度,改变果园杂草的生态位、功能群和群落结构,增加果园的生态稳定性。在5种人工生草模式中,穗序木蓝生草芒果园具有较高的杂草多样性和较低的杂草生物量,是干热河谷区芒果园最理想的杂草管理模式。 展开更多
关键词 果园生草 芒果园 杂草多样性 群落结构
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辽河口湿地不同植被类型根际土壤微生物群落结构及多样性分析 被引量：1
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作者 岳航宇 郭成久 +1 位作者 苏芳莉 魏超 《生态环境学报》 北大核心 2025年第2期222-232,共11页
湿地是重要生态系统,微生物对维持其生态稳定发挥着重要作用。了解辽河口湿地不同植被类型根际土壤微生物群落结构和多样性特征对于揭示该区域植被与土壤的相互作用具有重要科学意义。以辽河口湿地为研究对象,选取芦苇分布区-芦苇根际土... 湿地是重要生态系统,微生物对维持其生态稳定发挥着重要作用。了解辽河口湿地不同植被类型根际土壤微生物群落结构和多样性特征对于揭示该区域植被与土壤的相互作用具有重要科学意义。以辽河口湿地为研究对象,选取芦苇分布区-芦苇根际土壤(D1)、芦苇-盐地碱蓬交错区-芦苇根际土壤(D2)、芦苇-盐地碱蓬交错区-盐地碱蓬根际土壤(D3)、盐地碱蓬分布区-盐地碱蓬根际土壤(D4)以及潮滩沉积物(D5),利用Illumina Miseq PE300高通量测序技术进行16S rRNA基因测序分析不同植被类型根际土壤微生物的多样性和群落结构特征,并探究土壤理化因子与其之间的关系。研究结果表明,1)辽河口湿地根际微生物检测出40门,95纲,184目,311科,528属,888种。2)在门水平上,变形菌门是最优势菌群。3)湿地各采样区域土壤微生物群落多样性分析表明,盐地碱蓬分布区-盐地碱蓬根际土壤微生物群落丰富度和多样性最高。4)冗余分析结果表明,土壤总氮、有机质、氯离子含量是影响土壤微生物群落结构的主要因素。研究成果可从微生态学角度为中国北方滨海湿地生态系统功能的研究和保护提供参考。 展开更多
关键词 辽河口湿地 植被类型 高通量测序 土壤微生物 微生物多样性 群落结构
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