SSR多态性信息含量(PIC)对大麦糖化力的选择效果 被引量：3

1

作者 钱刚 平军娇 +2 位作者 王大忠 张珍 刘茂生 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第14期120-123,共4页

通过检测103份贵州地方栽培大麦(Hordeum vulgare L.)的糖化力和麦芽无水浸提率,并在此基础上选择22对麦芽品质紧密连锁的SSR引物进行遗传标记。不同糖化力群体的引物多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)的分析结果表... 通过检测103份贵州地方栽培大麦(Hordeum vulgare L.)的糖化力和麦芽无水浸提率,并在此基础上选择22对麦芽品质紧密连锁的SSR引物进行遗传标记。不同糖化力群体的引物多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)的分析结果表明,与低糖化力群体相比,高糖化力种群具有丰富的谱带信息和更高的PIC参数(包括平均等位位点数、PIC平均值、PIC值大于0.5的比例和PIC值大于0.5的平均等位位点数),表明大麦的高糖化力可能与数量性状的基因加性效应有关,也提示了麦芽品质紧密连锁的SSR位点可作为大麦糖化力分子辅助选择(marker assisted selection,MAS)的候选指标。 展开更多

关键词 大麦 糖化力 SSR 多态性信息含量(pic)

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盐津乌骨鸡微卫星DNA多态性研究 被引量：14

2

作者 陈涛 苗永旺 +5 位作者 霍金龙 杨泽宇 罗正雄 徐志兰 张昌东 宁勤刚 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 2007年第4期543-546,共4页

筛选了33对微卫星引物对盐津乌骨鸡的53个个体进行了遗传多样性检测分析,共检测到136条DNA片段,每个座位观察等位基因数从2个到8个不等,群体等位基因数平均为4.12个,平均有效等位基因数为3.18,平均杂合度和平均多态信息含量分别为0.6232... 筛选了33对微卫星引物对盐津乌骨鸡的53个个体进行了遗传多样性检测分析,共检测到136条DNA片段,每个座位观察等位基因数从2个到8个不等,群体等位基因数平均为4.12个,平均有效等位基因数为3.18,平均杂合度和平均多态信息含量分别为0.6232和0.5712。以上数据表明:盐津乌骨鸡群体遗传多态性较高。 展开更多

关键词 盐津乌骨鸡 微卫星标记 多态性 杂合度 多态信息含量

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西安荷斯坦奶牛群5个基因座位遗传多态性的PCR-RFLP分析 被引量：12

3

作者 张润锋 陈宏 +4 位作者 蓝贤勇 田燚 潘传英 胡沈荣 苏利红 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期545-549,共5页

应用PCR RFLP方法对西安荷斯坦牛的κcn、βlg、βlg 5′侧翼区、CSN1S2、IGFBP 3 共5 个基因座位进行了多态性分析。结果表明,在西安荷斯坦牛群中,没有发现携带CSN1S2F 等位基因的个体,其多态信息含量为0。κcn基因座位呈现低度多态(PI... 应用PCR RFLP方法对西安荷斯坦牛的κcn、βlg、βlg 5′侧翼区、CSN1S2、IGFBP 3 共5 个基因座位进行了多态性分析。结果表明,在西安荷斯坦牛群中,没有发现携带CSN1S2F 等位基因的个体,其多态信息含量为0。κcn基因座位呈现低度多态(PIC=0 236 6),βlg、βlg 5′侧翼区、IGFBP 3 基因座位的多态信息含量分别为0 316 8、0 368 9、0 443 9,均呈现中度多态。κcn、βlg、βlg 5′侧翼区、IGFBP 3、CSN1S2 基因座位的杂合度和DNA多态度分别为0 274 2、0 394 7、0 487 9、0 489 1、0和0 025 5、0 011 6、0 033 3、0 011 2、0。而且,在西安荷斯坦牛群中,κcn、βlg、βlg 5′侧翼区、IGFBP 3 共4 个基因座位均处于Hardy Weinberg平衡状态,CSN1S2 基因座位处于纯合状态。 展开更多

关键词 PCR-RFLP分析 基因座位 遗传多态性 西安 奶牛群 多态信息含量 多态性分析 DNA多态 荷斯坦牛 等位基因 平衡状态 杂合度 纯合

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猪Pit-1基因的多态性研究 被引量：12

4

作者 庞瑾 李宏滨 +1 位作者 郑友民 杜立新 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期531-535,共5页

选取7个中国地方猪种和3 个国外引入猪种共473 头,应用PCR SSCP技术在7 个中国地方猪种中检测到1个Pit 1基因第4外显子上的突变;应用PCR RFLP技术在3个国外引入猪种中,扩增长度为1 747 bp的片段中检测到1个RsaⅠ限制性内切酶的多态酶切... 选取7个中国地方猪种和3 个国外引入猪种共473 头,应用PCR SSCP技术在7 个中国地方猪种中检测到1个Pit 1基因第4外显子上的突变;应用PCR RFLP技术在3个国外引入猪种中,扩增长度为1 747 bp的片段中检测到1个RsaⅠ限制性内切酶的多态酶切位点。遗传多态性分析结果表明:外显子4上的突变,在7个中国地方猪种中是A型等位基因和AA基因型频率占优势。其中沂蒙黑猪和巴马小型猪处于Hardy Weinberg平衡;北京黑猪、沂蒙黑猪、巴马小型猪、滇南小耳猪和香猪处于中度多态。RsaⅠ酶切多态位点的突变在3个国外引入猪种中也是A型等位基因和AA基因型频率占优势。其中大白猪和杜洛克猪处于Hardy Weinberg平衡;3 个国外引入猪种的多态信息含量均为中度多态。 展开更多

关键词 Hardy-Weinberg平衡 多态性研究 PCR-SSCP技术 PCR-RFLP技术 中国地方猪种 基因型频率 巴马小型猪 限制性内切酶 多态信息含量 等位基因 沂蒙黑猪 遗传多态性 酶切位点 分析结果 北京黑猪 多态位点 杜洛克猪 外显子 Rsa

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微卫星标记OarAE101和MCM38在三个山羊品种中的遗传多态性研究 被引量：17

5

作者 张英杰 赵有璋 +3 位作者 刘月琴 李玉 孙少华 李菲 《草食家畜》 2003年第2期24-26,共3页

本文利用两个微卫星标记OarAE10 1和MCM 38对波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数和杂合度进行了遗传检测 ,结果表明 :微卫星位点OarAE10 1和MCM38在三个山羊品种中存在多态性 ,可以用于... 本文利用两个微卫星标记OarAE10 1和MCM 38对波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数和杂合度进行了遗传检测 ,结果表明 :微卫星位点OarAE10 1和MCM38在三个山羊品种中存在多态性 ,可以用于山羊遗传多样性的评估 ;位点OarAE10 1比位点MCM 38变异较大 ,从不同品种来看 ,波尔山羊的遗传变异程度最大 ,而河北奶山羊的遗传变异程度相对较小。 展开更多

关键词 微卫星标记 OarAE101 MCM38 波尔山羊 太行山羊 河北奶山羊 等位基因频率 群体多态信息含量 有效等位基因数 杂合度 遗传多态性

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丝羽乌骨鸡微卫星多态性及其与产蛋性能的关系 被引量：4

6

作者 朱庆 张义正 +2 位作者 刘益平 孙桂荣 李亮 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期79-83,共5页

选用12个微卫星标记,通过对丝羽乌骨鸡多态性扩增,计算出这些微卫星标记座位的等位基因频率、多态信息含量、群体杂合度.通过标记多态性与产蛋性状的最小二乘分析和多重比较,进行了分子标记与产蛋性状的相关分析.结果表明,12个微卫星标... 选用12个微卫星标记,通过对丝羽乌骨鸡多态性扩增,计算出这些微卫星标记座位的等位基因频率、多态信息含量、群体杂合度.通过标记多态性与产蛋性状的最小二乘分析和多重比较,进行了分子标记与产蛋性状的相关分析.结果表明,12个微卫星标记中,9个表现出丰富的多态性.微卫星标记座位平均检测到4.5556个等位基因(3～7个).9个微卫星标记平均多态信息含量为0.6072.标记平均杂合度为0.7423.通过最小二乘分析,检测到4个标记G31913、X82867、Z95315、G01672与3种性能指标(4个月连产蛋量、开产蛋重、500天产蛋量)存在显著相关.标记G31913中基因型AB的开产体重最小二乘均值最高,Z95315的基因型CC的开产蛋重、开产体重最小二乘均值最高,标记G31913的基因型AB和标记Z95315的基因型CC有望作为开产蛋重、开产体重早期选择辅助标记,标记X82867基因型为CD的产蛋量较低,而基因型为AB的产蛋量相应较高. 展开更多

关键词 丝羽乌骨鸡 微卫星多态性 产蛋性能 多态信息含量 最小二乘分析 微卫星标记 等位基因频率 开产蛋重 开产体重 标记座位 产蛋性状 基因型 平均杂合度 产蛋量 多重比较 相关分析 分子标记 性能指标 早期选择 500 AB 检测

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广西巴马小型猪近交群体的遗传结构分析 被引量：5

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作者 黄建芳 李小楷 +2 位作者 蒋钦杨 郭亚芬 兰干球 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第2期426-431,共6页

本研究以33头广西巴马小型猪为研究对象，利用19个微卫星标记，通过估算其等位基因数（N）、多态信息含量（PIC）和近交系数（F）等参数，对广西巴马小型猪近交群F10～F15世代进行了遗传学检测。试验结果显示，19个微卫星座位上共检测... 本研究以33头广西巴马小型猪为研究对象，利用19个微卫星标记，通过估算其等位基因数（N）、多态信息含量（PIC）和近交系数（F）等参数，对广西巴马小型猪近交群F10～F15世代进行了遗传学检测。试验结果显示，19个微卫星座位上共检测到31个等位基因，其中F10F15分别具有27、29、28、27、26和25个等位基因，平均每个位点分别仅有1．42、1．53、1．47、1．42、1．37和1．32个等位基因；6个世代群体平均多态信息含量为0．1044。广西巴马小型猪F10～F15世代的平均近交系数分别为0．8070、0．8263、0．8491、0．8710、0．8904、0．9118。结果表明，广西巴马小型猪近交群体的基因多态性低、近交程度高，是一个遗传性稳定的群体。 展开更多

关键词 广西巴马小型猪 微卫星 多态信息含量(pic) 近交系

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微卫星标记对高原小型蕨麻猪遗传变异的研究 被引量：4

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作者 李军成 景志忠 +1 位作者 路彩霞 余四九 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 2008年第2期22-27,共6页

用9个微卫星DNA标记对蕨麻猪的等位基因变异、多态信息含量(PIC)、群体杂合度(H)进行了分析.在5个群体中共检测出148个等位基因,蕨麻猪的等位基因数最少,为55个,平均观察杂合度(Ho)为0.836 6,平均期望杂合度(HE)为0.861 5,PIC平均值为0.... 用9个微卫星DNA标记对蕨麻猪的等位基因变异、多态信息含量(PIC)、群体杂合度(H)进行了分析.在5个群体中共检测出148个等位基因,蕨麻猪的等位基因数最少,为55个,平均观察杂合度(Ho)为0.836 6,平均期望杂合度(HE)为0.861 5,PIC平均值为0.824 8.结果显示:蕨麻猪群体的杂合度和多态信息含量与兰州、临洮、青海和武威4种猪相比低,但Ho>0.7,HE>0.8,PIC>0.7,仍然比较高,受野猪血缘影响的可能性很大.表明蕨麻猪的杂合程度比较高,遗传变异大,遗传多态性丰富,适应高寒恶劣环境的能力较强,比其它地方猪品种具有更丰富的基因资源. 展开更多

关键词 蕨麻猪 微卫星DNA 杂合度 多态信息含量 遗传多态性

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西北肉用绵羊新品群陶滩寒组合的微卫星标记研究

9

作者 杨博辉 刘建斌 +3 位作者 郎侠 郭健 孙晓萍 程胜利 《中国畜牧兽医》 CAS 2008年第8期48-51,共4页

利用微卫星标记技术,分析了无角陶赛特羊、滩羊、小尾寒羊及其杂交后代滩寒F1、陶滩寒F15个绵羊群体的遗传多样性,结果表明,7个微卫星位点均为高度多态位点,平均多态信息含量（PIC）达0.7077-0.8395;5个群体平均位点杂合度达0.7454-0.8... 利用微卫星标记技术,分析了无角陶赛特羊、滩羊、小尾寒羊及其杂交后代滩寒F1、陶滩寒F15个绵羊群体的遗传多样性,结果表明,7个微卫星位点均为高度多态位点,平均多态信息含量（PIC）达0.7077-0.8395;5个群体平均位点杂合度达0.7454-0.8665。以Nei氏遗传距离的UPGMA和NJ聚类结果表明,滩羊与滩寒F1具有较近的亲缘关系,小尾寒羊与陶滩寒F1具有较近的亲缘关系,可聚为一类;滩羊、小尾寒羊与陶赛特羊具有较远的亲缘关系。 展开更多

关键词 绵羊 微卫星 多态信息含量(pic) 遗传多态性 Nei氏遗传距离

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四十八份青花菜品种SSR指纹图谱构建 被引量：4

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作者 林朦婕 温慧萍 +1 位作者 肖建中 郑强 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第12期2304-2312,共9页

为筛选一套适用于青花菜品种DNA指纹鉴定的核心简单重复序列标记(simple sequence repeat,SSR)引物,给青花菜品种的特异性、真实性、准确性鉴定提供依据,以12份性状差异较大的青花菜品种为材料,结合聚丙烯酰胺凝胶电泳与荧光毛细管电泳... 为筛选一套适用于青花菜品种DNA指纹鉴定的核心简单重复序列标记(simple sequence repeat,SSR)引物,给青花菜品种的特异性、真实性、准确性鉴定提供依据,以12份性状差异较大的青花菜品种为材料,结合聚丙烯酰胺凝胶电泳与荧光毛细管电泳检测技术,从945对芸薹属SSR引物中筛选出20对引物作为青花菜品种的核心SSR引物。利用该套核心SSR引物在48份青花菜主要栽培品种中共扩增出等位基因位点79个,平均每对引物扩增得到等位基因与基因型数量为3.95、5.55个;引物多态性信息含量(PIC)介于0.302~0.750,平均为0.547;20对核心SSR引物的杂合度介于0.3500~0.7849,均值为0.6082。用该套核心SSR引物构建的48份青花菜品种的指纹图谱,每一条指纹都具有唯一性,可表征一个品种,该指纹图谱为青花菜品种鉴定与资源保护提供了科学依据。 展开更多

关键词 青花菜 简单重复序列标记 指纹图谱 等位基因 多态性信息含量

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利用微卫星标记分析三个绵羊品种及杂交后代遗传多样性 被引量：3

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作者 孙永锋 杨博辉 +5 位作者 梁春年 孙伟丽 郎侠 刘建斌 曾玉峰 郭宪 《中国草食动物》 2007年第3期3-6,共4页

利用微卫星标记技术,分析了无角陶赛特羊、滩羊、小尾寒羊及其杂交后代滩寒F1、陶滩寒F15个绵羊群体的遗传多样性,结果表明：7个微卫星位点均为高度多态位点,平均多态信息含量（PIC）达0.7077-0.8396;5个群体平均位点杂合度达0.7454-0.8... 利用微卫星标记技术,分析了无角陶赛特羊、滩羊、小尾寒羊及其杂交后代滩寒F1、陶滩寒F15个绵羊群体的遗传多样性,结果表明：7个微卫星位点均为高度多态位点,平均多态信息含量（PIC）达0.7077-0.8396;5个群体平均位点杂合度达0.7454-0.8665。以Nei氏遗传距离的UPGMA和NJ聚类结果表明,滩羊与滩寒F1具有较近的亲缘关系,小尾寒羊与陶滩寒F1具有较近的亲缘关系,可聚为一类;滩羊、小尾寒羊与陶赛特羊具有较远的亲缘关系。 展开更多

关键词 绵羊 微卫星 多态信息含量(pic) 遗传多样性 Nei氏遗传距离

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