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耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌基因检测及多位点序列分析 被引量:8
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作者 金亮 王启 王术艺 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2017年第24期4156-4160,共5页
目的探讨2016年1-6月耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)高分离率的原因、耐药机制及同源性,为医院感染控制提供依据。方法收集秦皇岛市第一医院2016年1-6月分离的CRKP,采用改良Hodge试验进行碳青霉烯酶表型的确认,用PCR方法扩增碳青霉烯... 目的探讨2016年1-6月耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)高分离率的原因、耐药机制及同源性,为医院感染控制提供依据。方法收集秦皇岛市第一医院2016年1-6月分离的CRKP,采用改良Hodge试验进行碳青霉烯酶表型的确认,用PCR方法扩增碳青霉烯酶基因,并对扩增产物测序确定其基因型,通过多位点序列分型(MLST)分析其同源性。结果 2016年1-6月临床共分离非重复性KPN89株,其中CRKP41株,分离率为46.07%,CRKP主要分离自重症医学科、神经外科、呼吸科等,标本类型为痰、血液、尿液、脑脊液标本,41株CRKP除对多粘菌素100%敏感、对替加环素95.12%敏感和对米诺环素4.88%敏感外,对其余23种抗菌药物均耐药,41株CRKP菌株改良Hodge试验均阳性,测序确认全部携带KPC-2型碳青霉烯酶,MLST分型结果均属于ST11型。结论我院本次暴发流行CRKP为MLST分型ST11型,耐药情况严重,可能为同一克隆菌株在不同病区不同患者之间传播,主要耐药机制是产KPC-2型碳青霉烯酶,各相关部门应及时进行流行病学调查,做好防控工作,谨防此类事件再次发生。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 碳青霉烯酶 耐药机制 多序列位点分析
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卷烟包装特性与市场前景间的多序列相关分析
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作者 何建龙 邹娟 +12 位作者 张涛 王海娟 陶鹰 李永煜 石凤学 刘卉 郭珺 冷思漩 苗菘 杨蕾 徐艳群 浦倩 冯洪涛 《湖北农业科学》 2016年第23期6169-6171,6175,共4页
以云产卷烟14个研发新品在10个城市的市场调研数据为基础,采用多序列相关分析了卷烟产品包装特性与市场前景态度的相关性。结果表明,卷烟包装的总体印象评价得分基本由色彩得分和构图得分决定,且色彩和构图得分对总体印象具有协同作用;... 以云产卷烟14个研发新品在10个城市的市场调研数据为基础,采用多序列相关分析了卷烟产品包装特性与市场前景态度的相关性。结果表明,卷烟包装的总体印象评价得分基本由色彩得分和构图得分决定,且色彩和构图得分对总体印象具有协同作用;色彩、构图和总体印象评分越高其市场前景态度有明显偏向于看好的趋势,而评分越低其市场前景态度有明显偏向于不好的趋势。 展开更多
关键词 卷烟 包装特性 市场前景 多序列相关分析
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隐马尔可夫模型的多序列比对研究 被引量:2
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作者 罗泽举 宋丽红 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2010年第7期171-174,共4页
研究一种关于隐马尔可夫模型的多序列比对,利用值和特征序列的保守性,通过增加频率因子,改进传统隐马尔可夫模型算法的不足。实验表明,新算法不但提高了模型的稳定性,而且应用于蛋白质家族识别,平均识别率比传统隐马尔可夫算法提高了3.... 研究一种关于隐马尔可夫模型的多序列比对,利用值和特征序列的保守性,通过增加频率因子,改进传统隐马尔可夫模型算法的不足。实验表明,新算法不但提高了模型的稳定性,而且应用于蛋白质家族识别,平均识别率比传统隐马尔可夫算法提高了3.3个百分点。 展开更多
关键词 隐马尔可夫模型 多序列分析 蛋白质识别
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鲴亚科分子系统学研究 被引量:2
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作者 李琳 陈蔚涛 +3 位作者 汤永涛 周传江 何舜平 冯晨光 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期628-636,共9页
为探讨鲴亚科(Xenocyprinae)鱼类系统发育关系,研究基于2种线粒体基因和5种核基因序列对鲴亚科各物种的系统发育关系和分化时间进行评估。结果显示:不同方法和数据类型获得了基本一致的拓扑结构。3个属的单系性都得到了很好地支撑;但是... 为探讨鲴亚科(Xenocyprinae)鱼类系统发育关系,研究基于2种线粒体基因和5种核基因序列对鲴亚科各物种的系统发育关系和分化时间进行评估。结果显示:不同方法和数据类型获得了基本一致的拓扑结构。3个属的单系性都得到了很好地支撑;但是,它们之间的进化关系却随着分子标记的不同而改变。这一结果可能是由于早期的基因流或谱系的随机分选所致。此外,银鲴(Xenocypris argentea)、云南鲴(Xenocypris yunnanensis)和黄尾鲴(Xenocypris davidi)之间呈现出嵌套型的谱系关系,暗示它们之间存在基因交流的可能性。基于化石地层年代校正的分子钟估算结果显示,鲴亚科主要类群的分化发生在中新世晚期,约15—12百万年前(Millions of years ago,Ma),这与东亚季风强盛时期的时间相吻合。 展开更多
关键词 系统发育 多序列分析 分化时间估算 鲴亚科
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Oil–water two-phase flow pattern analysis with ERT based measurement and multivariate maximum Lyapunov exponent 被引量:9
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作者 谭超 王娜娜 董峰 《Journal of Central South University》 SCIE EI CAS CSCD 2016年第1期240-248,共9页
Oil–water two-phase flow patterns in a horizontal pipe are analyzed with a 16-electrode electrical resistance tomography(ERT) system. The measurement data of the ERT are treated as a multivariate time-series, thus th... Oil–water two-phase flow patterns in a horizontal pipe are analyzed with a 16-electrode electrical resistance tomography(ERT) system. The measurement data of the ERT are treated as a multivariate time-series, thus the information extracted from each electrode represents the local phase distribution and fraction change at that location. The multivariate maximum Lyapunov exponent(MMLE) is extracted from the 16-dimension time-series to demonstrate the change of flow pattern versus the superficial velocity ratio of oil to water. The correlation dimension of the multivariate time-series is further introduced to jointly characterize and finally separate the flow patterns with MMLE. The change of flow patterns with superficial oil velocity at different water superficial velocities is studied with MMLE and correlation dimension, respectively, and the flow pattern transition can also be characterized with these two features. The proposed MMLE and correlation dimension map could effectively separate the flow patterns, thus is an effective tool for flow pattern identification and transition analysis. 展开更多
关键词 oil-water two-phase flow flow patterns electrical resistance tomography (ERT) multivariate time-series multivariate maximum Lyapunov exponent correlation dimension
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Ecology detection of moderate thermophilic enrichment at Lau Basin hydrothermal vents 被引量:2
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作者 周洪波 姬厚国 +2 位作者 魏曼曼 王玉光 陈新华 《Journal of Central South University》 SCIE EI CAS 2011年第2期392-398,共7页
Culturable thermophilic microorganisms were enriched from samples collected from Lau Basin hydrothermal vents in artificial seawater medium at 45 ℃ and pH 7.0. Microbial diversities of the enriched communities were d... Culturable thermophilic microorganisms were enriched from samples collected from Lau Basin hydrothermal vents in artificial seawater medium at 45 ℃ and pH 7.0. Microbial diversities of the enriched communities were defined by performing a restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of 16S rRNA gene sequences with enzymes MspI and Hin6 I. A total of 14 phylotypes have been detected by the RFLP patterns identified for 16S rRNA clone libraries of the enrichment. Analysis of sequences showed that at least four bacterial divisions presented in the clones libraries. The phyla Proteobacteria and Firmicutes were the most dominant groups. The majority of the sequences included in this analysis affiliated with Gamma Proteobacteria (71%) and Bacillus (23%). Scanning electron micrographs revealed that there were abundant rod and coceoidal forms encased in sulphur and sodium chloride precipitate. These results revealed that there were a diversity of moderate thermophilic bacterial populations thrived in Lau Basin hydrothermal vents that were previously not detected by either molecular retrieval or strain purification techniques. 展开更多
关键词 hydrothermal vents phylogenetic analysis enrichment culture RCR-RFLP microbial diversity SEDIMENTS
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