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型特异性引物PCR研究HBV基因型与临床表现的关系 被引量:20
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作者 温志立 谭德明 +1 位作者 侯周华 杨永峰 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期50-53,共4页
目的 :研究乙肝病毒 (HBV)基因型与临床表现的关系。方法 :收集湖南省慢性携带、慢性轻度、慢性中度、慢性重度和慢性重型等 5种临床类型的慢性乙肝病人的血清 2 2 0例 ,采用型特异性引物进行巢式PCR ,对血清中的HBV进行基因分型 ,比较... 目的 :研究乙肝病毒 (HBV)基因型与临床表现的关系。方法 :收集湖南省慢性携带、慢性轻度、慢性中度、慢性重度和慢性重型等 5种临床类型的慢性乙肝病人的血清 2 2 0例 ,采用型特异性引物进行巢式PCR ,对血清中的HBV进行基因分型 ,比较不同基因型的临床资料。结果 :发现B ,C两种基因型 ,比例分别为 86 .4 %和 13.6 %。随着病情加重 ,基因C型的比例增加 (P <0 .0 5 )。C型的谷丙转氨酶 (ALT)、总胆红素 (TBIL)、HBV DNA等平均水平均较B型高 ,但无统计学意义。C型的ALT升高率 (96 .7% )显著高于B型 (75 .2 % ) (P <0 .0 5 )。B ,C两型的HBeAg阳性率总体无差别 ,但在慢性重型以及 2 130岁年龄段的患者中 ,C型的HBeAg阳性率 (35 .0 %和 5 0 .0 % )均显著高于B型 (14 .4 %和 2 4 .5 % ) (均P <0 .0 5 )。结论 :湖南省HBV基因型以B ,C型为主 ,基因型与临床表现有相关性 。 展开更多
关键词 异性引物巢式pcr HBV 基因 临床表现 琼脂糖电泳 乙肝病毒标志物
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型特异性引物PCR技术在HBV基因分型中的应用
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作者 宋世会 齐俊英 +5 位作者 邢铭友 杨道锋 张振纲 肖非 马科 田德英 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期191-194,共4页
目的应用乙型肝炎病毒(HBV)型特异性引物PCR的基因分型方法,了解武汉地区HBV基因型的分布及其临床意义。方法选择298例HBV感染者,分成表面抗原携带者(ASC)、急性肝炎(AH)、慢性肝炎(CH)、重型肝炎(SH)、肝硬化(LC)和原发性肝癌(HCC)6组... 目的应用乙型肝炎病毒(HBV)型特异性引物PCR的基因分型方法,了解武汉地区HBV基因型的分布及其临床意义。方法选择298例HBV感染者,分成表面抗原携带者(ASC)、急性肝炎(AH)、慢性肝炎(CH)、重型肝炎(SH)、肝硬化(LC)和原发性肝癌(HCC)6组,用多对型特异性引物PCR方法检测HBV的基因型;并对4份血清HBVDNA进行序列分析。结果多对型特异性引物PCR法可简便、快速、准确地鉴定HBV基因型;298份HBV DNA阳性的血清标本中,B基因型197例(66.1%),BC混合型68例(22.8%),C基因型33例(11.1%);B基因型在ASC、AH、CH、SH和HCC组患者中均占绝对优势,分别为63.6%、71.9%、68.7%、89.5%和65.9%,C基因型在各组患者中的分布差异无显著性意义,BC混合基因型在各组患者中的分布存在差异,更多见于肝硬化患者;各基因型在ALT水平、HBeAg阳性率及HBV DNA水平上差异无显著性意义(均P>0.05)。结论多对型特异性引物PCR扩增法能快速准确地进行HBV基因分型检测,可用于大规模的流行病学调查;武汉地区HBV感染者中,优势基因型为B型,其次为BC混合型和C型,BC混合型更多见于肝硬化患者。 展开更多
关键词 肝炎病毒 基因 异性引物
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OsDREB3大豆品系特异性巢式PCR及多重PCR检测方法的建立 被引量:2
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作者 刘营 张明辉 +2 位作者 甄贞 李璐 高学军 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期7-11,共5页
为建立转基因大豆OsDREB3巢式PCR检测方法和转基因大豆多重PCR检测方法,选择转基因大豆GTS40-3-2、A2704-12及OsDREB3 DNA作为多重PCR方法的待检测基因模板,成功实现3种转基因大豆、4组不同片段同时扩增和检测。结果表明,可视性好,检测... 为建立转基因大豆OsDREB3巢式PCR检测方法和转基因大豆多重PCR检测方法,选择转基因大豆GTS40-3-2、A2704-12及OsDREB3 DNA作为多重PCR方法的待检测基因模板,成功实现3种转基因大豆、4组不同片段同时扩增和检测。结果表明,可视性好,检测下限达0.1%。转基因大豆OsDREB3巢式PCR方法所用引物满足品系特异定性检测方法要求,其检测灵敏度达0.005%。 展开更多
关键词 转基因大豆 OsDREB3 品系异性 巢式pcr 多重pcr
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猕猴桃6个LOX基因家族成员实时定量PCR引物特异性的检测与应用 被引量:5
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作者 张波 徐昌杰 陈昆松 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期262-267,共6页
从基因家族成员的视角开展基因表达研究是阐明基因功能的重要组成内容,实时定量PCR(QPCR)技术是分析基因表达的有效手段.以猕猴桃脂氧合酶(LOX)基因家族6个成员为对象,分析了引物特异性的检测方法.该方法整合了熔点曲线分析、琼脂糖电... 从基因家族成员的视角开展基因表达研究是阐明基因功能的重要组成内容,实时定量PCR(QPCR)技术是分析基因表达的有效手段.以猕猴桃脂氧合酶(LOX)基因家族6个成员为对象,分析了引物特异性的检测方法.该方法整合了熔点曲线分析、琼脂糖电泳、交叉PCR扩增和PCR产物测序等分析手段,有效消除其它成员的交叉扩增干扰,为利用QPCR检测基因家族成员表达提供了特异、准确与可行的途径. 展开更多
关键词 猕猴桃脂氧合酶基因家族成员 引物 异性 实时定量pcr
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猪圆环病毒2型特异性荧光定量PCR检测方法的建立与应用 被引量:6
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作者 吴晓燕 刘涛 +6 位作者 李俊 时建立 韩偲 刘洋 吴家强 周顺 王金宝 《家畜生态学报》 2011年第2期41-46,共6页
研究旨在建立基于SYBR Green I荧光定量PCR检测PCV 2的技术方法。根据GenBank中的猪圆环病毒2型(PCV 2)的基因序列(HQ148879),设计一对特异性引物,利用普通PCR技术扩增出PCV 2的ORF2基因702bp片段,并克隆到pVAX1载体,以纯化的质粒作为PC... 研究旨在建立基于SYBR Green I荧光定量PCR检测PCV 2的技术方法。根据GenBank中的猪圆环病毒2型(PCV 2)的基因序列(HQ148879),设计一对特异性引物,利用普通PCR技术扩增出PCV 2的ORF2基因702bp片段,并克隆到pVAX1载体,以纯化的质粒作为PCR检测的标准模板,以10倍梯度稀释质粒为阳性标准品,摸索荧光定量PCR试验,并绘制标准曲线,以此建立一种荧光定量PCR特异性检测猪圆环病毒的方法。结果表明,该方法对PCV 2有很好的特异性,其敏感性比常规PCR高100倍,批间与批内重复试验变异系数均小于2.5%。经临床应用表明荧光定量PCR方法的建立实现了对PCV 2特异性的快速诊断和定量检测。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2 SYBR Green I 荧光定量pcr 异性
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巢式甲基化特异性PCR检测肺癌患者基因异常甲基化 被引量:2
6
作者 姚群峰 张利平 +2 位作者 宁勇 曾卫 周宜开 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2005年第15期894-895,共2页
关键词 MGMT基因 巢式甲基化异性pcr 肺癌
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等位基因特异性引物和TaqMan-MGB探针双抑制野生等位基因扩增的实时荧光定量PCR检测JAK2V617F突变率 被引量:2
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作者 梁国威 邵冬华 +1 位作者 何美琳 曹清芸 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期1486-1491,共6页
本研究建立在外周血基因组DNA中定量检测JAK2V617F突变率的荧光定量PCR检测方法并探讨其临床应用价值。在实时荧光定量PCR分析系统中,应用等位基因突变引物和等位基因野生TaqMan-MGB探针共同抑制JAK2V617F野生等位基因扩增,从而特异性... 本研究建立在外周血基因组DNA中定量检测JAK2V617F突变率的荧光定量PCR检测方法并探讨其临床应用价值。在实时荧光定量PCR分析系统中,应用等位基因突变引物和等位基因野生TaqMan-MGB探针共同抑制JAK2V617F野生等位基因扩增,从而特异性地扩增JAK2V617F突变等位基因。通过测定不同JAK2V617F突变率标准品及其循环阈值(Ct值),建立JAK2V617F突变率定量测定方法,并对89例表观健康人外周血基因组DNA中JAK2V617F突变率进行检测。结果表明,建立的方法定量检测JAK2V617F突变率的下限为0.1%,检测JAK2V617F突变率的批内、批间平均变异率分别为4.1%和6.1%。对89例表观健康人外周血基因组DNA中JAK2V617F突变率检测显示,其中2例为JAK2V617F阳性,突变率分别为0.64%和0.98%。结论:建立的JAK2V617F突变率定量检测方法具有检测灵敏度高和重复性好的特性,适合骨髓增殖性疾病的诊断及疾病进程和疗效监测。本方法检测原理可用于各种单碱基突变率的检测,具有广泛的应用前景。 展开更多
关键词 JAK2V617F突变 骨髓增殖性疾病 实时荧光定量pcr 等位基因异性引物 TAQMAN-MGB探针 双抑 制扩增 野生等位基因
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ARMS实时PCR基因分型特异性的研究 被引量:2
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作者 郑薇薇 梁基选 李庆阁 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第B06期135-139,共5页
以原癌基因Kras基因12位密码子的4种基因型(野生型为GGT,突变型为AGT、TGT、CGT)质粒DNA为研究模型,采用SYBRGreenⅠ为实时PCR指示剂,进行ARMS实时PCR基因分型特异性的研究.结果表明:在和模板匹配的ARMS引物3′端附近引入故意错配碱基,... 以原癌基因Kras基因12位密码子的4种基因型(野生型为GGT,突变型为AGT、TGT、CGT)质粒DNA为研究模型,采用SYBRGreenⅠ为实时PCR指示剂,进行ARMS实时PCR基因分型特异性的研究.结果表明:在和模板匹配的ARMS引物3′端附近引入故意错配碱基,将ARMS引物浓度稀释10倍,并对传统三步PCR循环进行改良,即根据目的产物和引物二聚体的熔点差异,在传统延伸步骤之后增加一步恒温80℃检测荧光步骤,可消除引物二聚体的影响,使ARMS引物的特异性增强,得到清晰的基因分型结果.实验表明这种基于SYBRGreenⅠ的ARMS实时PCR基因分型方法,无需合成探针,实验设计简单,是一种快速、简便、经济、特异性好的基因分型方法,可推广用于其他基因的分型,并可望成为应用于临床的基因诊断技术之一. 展开更多
关键词 基因分 异性 pcr 实时 Green 引物二聚体 基因诊断技术 SYBR 方法 RAS基因 质粒DNA 原癌基因 研究模 引物浓度 模板匹配 实验设计 GGT 野生 基因 密码子 12位 AGT 突变 TGT 指示剂 R基因 传统 碱基 错配
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提高半巢式PCR特异性探讨
9
作者 金杨 季晓辉 +1 位作者 李玉峰 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1997年第4期393-394,共2页
提高半巢式PCR特异性探讨金杨季晓辉李玉峰姚(南京医科大学微生物学教研室,南京210029)关键词半巢式PCR;B淋巴细胞白血病;特异性近年来,在巢式聚合酶链反应(PCR)的基础上半巢式PCR亦有所发展。普通PCR需... 提高半巢式PCR特异性探讨金杨季晓辉李玉峰姚(南京医科大学微生物学教研室,南京210029)关键词半巢式PCR;B淋巴细胞白血病;特异性近年来,在巢式聚合酶链反应(PCR)的基础上半巢式PCR亦有所发展。普通PCR需用一对(即两段)引物,巢式PC... 展开更多
关键词 巢式pcr B淋巴细胞 白血病 异性 pcr
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柑桔黄龙病常规PCR检测4对引物的特异性和灵敏度 被引量:9
10
作者 高玉霞 卢占军 +5 位作者 钟八莲 易龙 赖特明 刘志芳 肖珍 夏宜林 《中国南方果树》 北大核心 2014年第1期5-8,共4页
通过荧光定量PCR标定柑桔黄龙病菌核酸浓度的方法,对目前各实验室常规PCR检测中应用较广泛的4对引物(P400f/P400r、P535f/P535r、OI1/OI2和16Sf/16Sr)进行特异性和灵敏度比较。结果表明,4对引物均能排除其他来源核酸的干扰,特异性均强;... 通过荧光定量PCR标定柑桔黄龙病菌核酸浓度的方法,对目前各实验室常规PCR检测中应用较广泛的4对引物(P400f/P400r、P535f/P535r、OI1/OI2和16Sf/16Sr)进行特异性和灵敏度比较。结果表明,4对引物均能排除其他来源核酸的干扰,特异性均强;4对引物灵敏度大小关系为16Sf/16Sr>P400f/P400r>P535f/P535r=OI1/OI2,灵敏度最高的引物16Sf/16Sr可检测的柑桔黄龙病菌核酸浓度低限可达1.87×10-2ng/μL。 展开更多
关键词 柑桔黄龙病 常规pcr检测 引物 灵敏度 异性
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等位基因特异性引物延伸法在婴儿型和幼儿型神经元蜡样质脂褐质沉积病产前诊断中的应用(英文) 被引量:1
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作者 NanbertZHONG WeinaJU +6 位作者 DorotaMOROZIEWICZ AnettaWRONSK MarilynLI KrystynaWISNIEWSKI SusanSklowerBROOKS EdmundJENKINS W.TedBROWN 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期20-25,共6页
Infantile (INCL, NCL1) and late-infantile (LINCL, NCL2) neuronal ceroid lipofuscinoses have been found to result from genetic deficiency of genes CLN 1 and CLN 2, respectively. The application of molecular analyses ca... Infantile (INCL, NCL1) and late-infantile (LINCL, NCL2) neuronal ceroid lipofuscinoses have been found to result from genetic deficiency of genes CLN 1 and CLN 2, respectively. The application of molecular analyses can facilitate prenatal diagnosis for families affected by NCL1 or NCL2, in which the familial mutation(s) have been identified. Molecular testing with allele-specific primer extension and DNA sequencing was performed in nine pregnancies, four from two NCL1 families and five from five NCL2 families. Lysosomal enzyme activity assays were carried out as well.Four fetuses from three pregnancies in NCL1 families were found to be carriers for a mutation 451C-T in the CLN 1 gene and one was normal. Prenatal testing of three NCL2 families who carried mutation R208X in the CLN 2 gene showed that all fetuses were carriers. In NCL2 families who carried either mutation IVS5-1C or/and IVS5-1A two normal pregnancies were detected. Our studies indicate that DNA testing, which may provide definitive prenatal diagnosis for NCL, may be used in combination with lysosomal enzyme activity analyses. 展开更多
关键词 脂褐质 产前诊断 神经元 等位基因 婴儿 异性引物 DNA 幼儿 延伸 应用
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过量DMSO显著降低低模板浓度PCR扩增的特异性 被引量:6
12
作者 肖志壮 曲音波 +2 位作者 汪天虹 高培基 刘梦海 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期341-343,共3页
DMSO通常经验性地用于提高PCR扩增的效率 ,但是过量的DMSO可以显著降低特异序列的扩增效率 ,尤其是导致非特异性扩增的现象却被忽视。在 6 %的DMSO存在时 ,开始出现非特异条带 ,同时特异扩增产物减少。本文首次报道DMSO对PCR产物特异性... DMSO通常经验性地用于提高PCR扩增的效率 ,但是过量的DMSO可以显著降低特异序列的扩增效率 ,尤其是导致非特异性扩增的现象却被忽视。在 6 %的DMSO存在时 ,开始出现非特异条带 ,同时特异扩增产物减少。本文首次报道DMSO对PCR产物特异性的影响并确定了克服上述现象产生的途径 ,即通过增加模板 -引物的比例消除非特异条带。而通常提高复性温度只能部分减少非特异产物 ,不能避免非特异扩增。本文结果有助于提高常规PCR ,尤其是分子遗传学分析中经常使用的随机扩增多态性DNA (randomamplifiedpolymorphicDNA ,RAPD)检测的准确度。 展开更多
关键词 DMSO pcr 异性 效率 基因扩增 模板-引物比例
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等位基因差异特异性PCR检测HBVDNA的前C区1896突变位点及其临床意义 被引量:5
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作者 李文清 陈玉丽 +1 位作者 王承党 林经安 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2002年第1期23-24,共2页
为了探讨HBV前C区 1896突变位点检测的临床意义,采用3-末瑞等位基因差异特异性PCR方法对95例乙型肝炎病毒感染者的HBVDNA1 896位点进行基因型(野生株/突变株)的检测,结果显示:总突变率为64.2%,总... 为了探讨HBV前C区 1896突变位点检测的临床意义,采用3-末瑞等位基因差异特异性PCR方法对95例乙型肝炎病毒感染者的HBVDNA1 896位点进行基因型(野生株/突变株)的检测,结果显示:总突变率为64.2%,总野生率为55.8%,纯野生型和纯突变型的检出率分别为28.4%和27.4%;不同临床类型的乙肝病毒感染者均可出现突变,其野生型、突变型和混合感染型的检出率之间的比较无显著性差异(P>0.05),急性乙肝与慢性乙肝、携带者、肝硬化和肝癌的总突变率存在差异(P<0.05);血清不同HBe系统均可发生突变.抗- HBe阳性组的突变率显著高于HBeAg阳性和HBe系统阴性组(P<0.05),提示:机体感染了HBV后.变异主要是发生在慢性持续性感染过程中.突变株逐渐替代了野生株并成为优势株.使宿主得以持续感染HBV。 展开更多
关键词 等位基因差异异性pcr 1896突变位点 基因 HBVDNA 慢性持续感染
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利用物种特异性PCR技术快速鉴定南瓜实蝇 被引量:2
14
作者 黄振 侯有明 +1 位作者 郭琼霞 陈韶萍 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期215-220,共6页
【目的】快速鉴定我国进境植物检疫性害虫南瓜实蝇Bactrocera tau(Walker),防止该虫传入扩散。【方法】基于物种特异性PCR(SS-PCR)技术,选取20种形态近似的常见实蝇,将南瓜实蝇作为阳性对照,提取基因组DNA模板,选用mt DNA COⅠ序列,检... 【目的】快速鉴定我国进境植物检疫性害虫南瓜实蝇Bactrocera tau(Walker),防止该虫传入扩散。【方法】基于物种特异性PCR(SS-PCR)技术,选取20种形态近似的常见实蝇,将南瓜实蝇作为阳性对照,提取基因组DNA模板,选用mt DNA COⅠ序列,检查同源系列,设计筛选1对可快速准确鉴定南瓜实蝇的种特异性引物NF404和NR610,并进行PCR检测和验证,建立一种利用种特异性引物的快速鉴定方法。【结果】南瓜实蝇在207 bp的位置扩增出一条清晰且单一的目标条带,其余果实蝇未见条带。将截获的南瓜实蝇与其同亚属的近缘种具条实蝇、瓜实蝇的不同虫态和成虫部分虫体组织的虫样,采用本实验室建立的SS-PCR鉴定方法进行验证,结果一致。【结论】建立的南瓜实蝇的SS-PCR鉴定方法种特异性和稳定性强,能快速鉴定目标种类,解决口岸进境果蔬中截获实蝇幼虫、蛹等不同虫态和残体难于快速鉴定问题。 展开更多
关键词 南瓜实蝇 mt DNA COI 异性引物 物种异性pcr(SS-pcr) 快速鉴定
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巢式PCR检测北京地区乙型肝炎病毒基因型的分布 被引量:1
15
作者 殷继明 李卓 +3 位作者 刘芳 刘道洁 郝娃 牛京勤 《首都医科大学学报》 CAS 2006年第3期358-360,共3页
目的了解北京地区乙型肝炎病毒(HBV)感染者HBV基因型分布情况。方法从前S1基因到S基因中的保守序列设计出10条内外引物,将其中8条内引物分成A、B组,分别扩增A、B、C、D、E、F型HBV,根据PCR产物片断判定HBV基因型。结果用此种方法检测HB... 目的了解北京地区乙型肝炎病毒(HBV)感染者HBV基因型分布情况。方法从前S1基因到S基因中的保守序列设计出10条内外引物,将其中8条内引物分成A、B组,分别扩增A、B、C、D、E、F型HBV,根据PCR产物片断判定HBV基因型。结果用此种方法检测HBV感染的不同转归类型患者血清728份,对HBV DNA阳性标本进行基因型分析。HBV DNA阳性者276例,其中自限性感染者阳性率为5.8%(14/243),慢性无症状HBV携带者血清HBV阳性率为42.6%(113/265),慢性肝炎患者HBV阳性率为67.7%(149/220)。慢性肝炎组HBV DNA检出率与其他2组比较差异有统计学意义(P<0.05)。在276例HBV DNA阳性标本中,各基因型在不同组分布不同,但差异无统计学意义。HBV基因型总检出率以C型为主,占76.8%,B型占21·7%,同时检出B型和C型为1.5%,未检出A、D、E、F基因型。结论北京地区感染HBV基因型为B型和C型,以C型为主,感染结局不同组间基因型分布比较差异无统计学意义。 展开更多
关键词 肝炎病毒 基因 基因异性引物pcr
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特异性标签序列快速鉴定乙肝病毒B、C基因型的方法及应用
16
作者 蔡颖 卫国 +2 位作者 李学成 陈铭 李彦 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第15期1641-1642,共2页
目的建立一种乙肝病毒(hepatitis B virus,HBV)基因分型方法,并观察其临床应用效果。方法利用HBV大S区的型间特异性位点密集序列,建立了一种直接多重PCR方法,并对重庆地区250例临床样本进行应用性观察。结果使用该方法对重庆地区250例... 目的建立一种乙肝病毒(hepatitis B virus,HBV)基因分型方法,并观察其临床应用效果。方法利用HBV大S区的型间特异性位点密集序列,建立了一种直接多重PCR方法,并对重庆地区250例临床样本进行应用性观察。结果使用该方法对重庆地区250例随机临床HBV阳性血清进行了检测,结果显示B基因型占73.6%(184/250),C基因型占16.4%(41/250),BC混合型占6.4%(16/250),总检出率为97%左右,与重庆周边地区HBV基因型的区域分布具有一致性。结论该方法能够快捷而准确地鉴定乙肝病毒B、C基因型。 展开更多
关键词 乙肝病毒 基因 pcr诊断 异性序列
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基于种特异性PCR技术快速鉴定葡萄根瘤蚜
17
作者 余慧 罗金燕 +3 位作者 吕进 赵玉强 陈磊 姚红梅 《浙江农业科学》 2016年第6期901-904,共4页
葡萄根瘤蚜是一种严重威胁葡萄生产的入侵性害虫。由于蚜虫类害虫种类多、体型微小、形态相似,难以快速准确地进行鉴别。文章以葡萄根瘤蚜为研究对象,以常见果树蚜虫为参照,采用基于线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的种特异性PCR方... 葡萄根瘤蚜是一种严重威胁葡萄生产的入侵性害虫。由于蚜虫类害虫种类多、体型微小、形态相似,难以快速准确地进行鉴别。文章以葡萄根瘤蚜为研究对象,以常见果树蚜虫为参照,采用基于线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的种特异性PCR方法,研究葡萄根瘤蚜的快速鉴定技术。利用mt DNA COI基因通用型引物LCO-1490/HCO-2198获得葡萄根瘤蚜及其他果树常见蚜虫的COI序列,根据测序结果设计1对种特异性SS-COI引物(Vit F269/VitR557),扩增片段大小为308 bp。种特异性检验结果显示,该对引物仅对葡萄根瘤蚜的mt DNA COI基因具有扩增效果,其他5种蚜虫均没有扩增条带。 展开更多
关键词 葡萄根瘤蚜 异性引物 快速鉴定 pcr
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应用种特异性PCR技术快速鉴定辣椒实蝇 被引量:13
18
作者 黄振 陈韶萍 +1 位作者 谢婧 郭琼霞 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期460-466,共7页
【目的】辣椒实蝇Bactrocera latifrons(Hendel)为我国重要的检疫性有害生物,其寄主范围广泛,危害严重。由于传统鉴定方法受到饲养周期、饲养条件、虫态等因素的限制,使得果蔬进出口贸易通关速度、疫情快速鉴定受到较大的影响,因此迫切... 【目的】辣椒实蝇Bactrocera latifrons(Hendel)为我国重要的检疫性有害生物,其寄主范围广泛,危害严重。由于传统鉴定方法受到饲养周期、饲养条件、虫态等因素的限制,使得果蔬进出口贸易通关速度、疫情快速鉴定受到较大的影响,因此迫切需要开发关于实蝇的快速鉴定识别的技术。【方法】本研究基于mt DNA COI序列设计了一对能够准确鉴定辣椒实蝇的种特异性引物FL680和RL1057,选用辣椒实蝇作为阳性对照,选用番石榴实蝇B.correcta(Bezzi)、桔小实蝇B.dorsalis(Hendel)和颜带实蝇B.cilifer(Hendel)等20种实蝇作为阴性对照,进行PCR扩增并将PCR产物进行电泳检测。【结果】仅目标种辣椒实蝇能够扩增出清晰且单一的约378 bp的条带,其余实蝇种类均未出现条带。将本实验建立的种特异性PCR(SS-PCR)鉴定方法应用于实际检疫工作中并得到了验证,表明该方法具有强的种特异性。【结论】本文提出辣椒实蝇快速鉴定识别技术可应用于实蝇的疫情监测和口岸的检疫检测工作。 展开更多
关键词 辣椒实蝇 异性引物 异性pcr MTDNA COI 快速鉴定
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23个梨新品种S基因型的鉴定与分析
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作者 王亚楠 张向展 +3 位作者 王苏珂 苏艳丽 王龙 薛华柏 《果树学报》 北大核心 2025年第3期453-461,共9页
【目的】鉴定梨新品种的S基因型可为合理配置授粉树、杂交亲本选配提供理论依据。【方法】为鉴定23个梨新品种的S基因型,设计新的特异引物FTQQYQ-B和anti-GIIWPN,对梨新品种的基因组DNA进行S基因特异扩增,并对扩增片段进行回收、克隆、... 【目的】鉴定梨新品种的S基因型可为合理配置授粉树、杂交亲本选配提供理论依据。【方法】为鉴定23个梨新品种的S基因型,设计新的特异引物FTQQYQ-B和anti-GIIWPN,对梨新品种的基因组DNA进行S基因特异扩增,并对扩增片段进行回收、克隆、测序,对各序列进行同源性搜索比对,最终确定各品种的S基因型。同时,对S基因出现频率和各品种授粉亲和性进行分析。【结果】确定23个梨新品种S基因型为:红香酥S_(22)S_(39);中梨1号S_(1)S_(4);红酥宝、早红玉、红玛瑙、恬心和金香玉S3S_(39);丹霞红、中梨秋香和六月香S_(4)S_(39);红酥蜜S_(4)S_(22);中梨碧玉S5Sd;中梨蜜脆S_(4)S5;中梨291 S_(12)S_(28);阳光蜜露S_(12)S_(22);早白蜜、T109和红玉S5S_(12);红酥脆、满天红和美人酥S_(4)S_(12);中梨金福S5S_(39);秋月S3S_(4);库尔勒香梨S_(22)S_(28)。统计发现S_(4)和S_(39)基因在新品种中出现频率最高。【结论】研究鉴定出23个梨新品种的S基因型,为新品种商业化栽培配置适宜授粉树提供了理论依据。 展开更多
关键词 自交不亲和 S基因 异性引物
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稻瘟病广谱抗性基因Pigm特异性分子标记的开发和应用 被引量:20
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作者 陈涛 孙旭超 +9 位作者 张善磊 梁文化 周丽慧 赵庆勇 姚姝 赵凌 赵春芳 朱镇 张亚东 王才林 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期28-36,共9页
【目的】来自籼稻品种谷梅4号的Pigm是一个对稻瘟病菌具有广谱和持久抗性的重要基因。为有效提高Pigm基因的选择效率,有必要开发具有特异性的共显性分子标记进行辅助育种。【方法】本研究根据谷梅4号Pigm位点存在的特异性核苷酸变异,利... 【目的】来自籼稻品种谷梅4号的Pigm是一个对稻瘟病菌具有广谱和持久抗性的重要基因。为有效提高Pigm基因的选择效率,有必要开发具有特异性的共显性分子标记进行辅助育种。【方法】本研究根据谷梅4号Pigm位点存在的特异性核苷酸变异,利用Tetra-primerARMS-PCR和KASP两种不同的基因分型技术开发出分子标记T-Pigm和K-Pigm,对不同品种(品系)以及淮稻9号/谷梅4号的F2分离群体进行基因型检测,并结合穗颈瘟人工接种鉴定,对标记的准确性进行评价。【结果】序列比对分析表明,谷梅4号Pigm位点中Pigm-Nbs2基因起始密码子上游515 bp处存在一个特殊的单核苷酸变异。利用已开发的两种类型的分子标记能够有效区分3种不同的基因型,且基因型与穗颈瘟人工接种鉴定结果完全一致。【结论】利用分子标记T-Pigm和K-Pigm可以实现对Pigm基因型快速、准确的检测,加快抗稻瘟病水稻新品种的选育进程。 展开更多
关键词 稻瘟病 Pigm 异性标记 引物扩增受阻突变体系pcr 竞争性等位基因异性pcr
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