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多基因DNA条形码鉴定6个鳗鱼物种
被引量:
6
1
作者
陈文炳
邵碧英
+4 位作者
缪婷玉
彭娟
陈彬
张志灯
江树勋
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期163-169,共7页
建立6种鳗鱼的物种多基因DNA条形码精准鉴定方法。以鳗鱼DNA为模板,采用3对通用引物对6种鳗鱼的3个基因(16S rRNA、Cyt b、COⅠ)部分DNA片段进行聚合酶链式反应扩增、测序,结果6种鳗鱼各获得3条16S r DNA(638~643 bp)、Cyt b(464~466 bp...
建立6种鳗鱼的物种多基因DNA条形码精准鉴定方法。以鳗鱼DNA为模板,采用3对通用引物对6种鳗鱼的3个基因(16S rRNA、Cyt b、COⅠ)部分DNA片段进行聚合酶链式反应扩增、测序,结果6种鳗鱼各获得3条16S r DNA(638~643 bp)、Cyt b(464~466 bp)、COⅠ(705~707 bp)基因部分DNA序列,从中选取各物种序列同源的片段设计3对新引物对6种鳗鱼的16S rRNA、Cyt b、COⅠ基因部分DNA片段进行PCR扩增,其产物大小分别为504~507、400、609 bp,再从各片段中筛选出具有6种鳗鱼物种特异性强的、碱基数分别为262、280、300 bp的3条DNA片段序列,作为6种鳗鱼物种的3个基因的标准DNA条形码,应用DNAMAN V6软件进行同源性分析,并通过Gen Bank数据库的比对验证,制定了供检测实践用的同源率判别指标,建立鳗鱼物种的多基因条形码检测方法。应用该方法对30个待检鳗鱼样品进行检测,结果表明,各样品基于3个基因DNA条形码的比对,符合同源率指标,物种判别结果互相吻合,从而精准判别样品的所属物种。该方法稳定、精准、易于操作,可应用于6种鳗鱼的物种鉴定,值得推广。
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关键词
16S
RRNA
基因
CYT
B
基因
COⅠ
基因
多基因dna条形码
鳗鱼物种鉴定
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下载PDF
职称材料
题名
多基因DNA条形码鉴定6个鳗鱼物种
被引量:
6
1
作者
陈文炳
邵碧英
缪婷玉
彭娟
陈彬
张志灯
江树勋
机构
福建出入境检验检疫局检验检疫技术中心
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期163-169,共7页
基金
福建省科技计划农业引导性项目(2015N0016)
文摘
建立6种鳗鱼的物种多基因DNA条形码精准鉴定方法。以鳗鱼DNA为模板,采用3对通用引物对6种鳗鱼的3个基因(16S rRNA、Cyt b、COⅠ)部分DNA片段进行聚合酶链式反应扩增、测序,结果6种鳗鱼各获得3条16S r DNA(638~643 bp)、Cyt b(464~466 bp)、COⅠ(705~707 bp)基因部分DNA序列,从中选取各物种序列同源的片段设计3对新引物对6种鳗鱼的16S rRNA、Cyt b、COⅠ基因部分DNA片段进行PCR扩增,其产物大小分别为504~507、400、609 bp,再从各片段中筛选出具有6种鳗鱼物种特异性强的、碱基数分别为262、280、300 bp的3条DNA片段序列,作为6种鳗鱼物种的3个基因的标准DNA条形码,应用DNAMAN V6软件进行同源性分析,并通过Gen Bank数据库的比对验证,制定了供检测实践用的同源率判别指标,建立鳗鱼物种的多基因条形码检测方法。应用该方法对30个待检鳗鱼样品进行检测,结果表明,各样品基于3个基因DNA条形码的比对,符合同源率指标,物种判别结果互相吻合,从而精准判别样品的所属物种。该方法稳定、精准、易于操作,可应用于6种鳗鱼的物种鉴定,值得推广。
关键词
16S
RRNA
基因
CYT
B
基因
COⅠ
基因
多基因dna条形码
鳗鱼物种鉴定
Keywords
16S rRNA
Cyt b
COⅠ
polygenic
dna
barcode
identification of eel species
分类号
Q953 [生物学—动物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
多基因DNA条形码鉴定6个鳗鱼物种
陈文炳
邵碧英
缪婷玉
彭娟
陈彬
张志灯
江树勋
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018
6
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