目的:应用网络药理学方法探讨三仁汤治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)和2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的作用机制,为中药“异病同治”提供科学的理论依据。方法:利用中药数据库(traditional Chinese med...目的:应用网络药理学方法探讨三仁汤治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)和2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的作用机制,为中药“异病同治”提供科学的理论依据。方法:利用中药数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中医药综合数据库(traditional Chinese medicine integrated database,TCMID)、中医药整合药理学研究平台(integrative pharmacology-based research platform of traditional Chinese medicine,TCMIP)、中药成分靶点平台2.0(HIT 2.0)、传统中医分子机制生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechANism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)、草药-中医证候-西医症状-成分-靶标-疾病关联网络数据库(symmap integrates traditional Chinese medicine,SymMap)等平台获取和筛选三仁汤的活性成分,并判断其生物活性;得到有效活性成分对应的靶点基因,输入Uniprot数据库,将靶点标准化;利用人类基因组数据库(the Human Gene database,GeneCards)、药物靶标数据库(therapeutic target database,TTD)、比较毒物基因组学数据库(the comparative toxicogenomics database,CTD)和药物银行数据库(DrugBank)获取PCOS和T2DM疾病靶点,得到三仁汤治疗PCOS和T2DM的共同作用靶点;采用Cytoscape 3.7.1软件绘制三仁汤“异病同治”的“单味药-活性成分-共同靶点”网络图;利用STRING平台绘制蛋白相互作用网络;通过注释、可视化和综合发现数据库(the database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)、R语言(R studio)等平台进行生物过程分析,获得Mode节点分析、基因本体论(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析结果。结果:共筛选得到三仁汤有效活性成分50个、PCOS疾病靶点23332个、T2DM疾病靶点28438个,三仁汤“异病同治”PCOS和T2DM的共同靶点214个;蛋白质相互作用(protein-protein interaction networks,PPI)筛选出39个关键靶点;GO及KEGG富集分析结果显示:三仁汤“异病同治”主要涉及炎症反应、缺氧反应、凋亡过程、HIF-1信号通路、钙离子信号通路、胰岛素抵抗等;MCODE分析结果显示:三仁汤“异病同治”可能与活性氧反应、凋亡相关信号通路、白细胞介素17(interleukin-17,IL-17)信号通路、脂肪酸代谢过程等相关;三仁汤“异病同治”的关键靶点为蛋白激酶B1(protein kinase b alpha,AKT1)、肿瘤蛋白53(tumor protein p53,TP53)、半胱天冬酶3(caspase 3,CASP3)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)及IL-6等。结论:三仁汤可能通过多靶点、多通路、多途径的作用机制,对PCOS和T2DM患者发挥作用,取得异病同治的效果。展开更多
文摘目的:应用网络药理学方法探讨三仁汤治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)和2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的作用机制,为中药“异病同治”提供科学的理论依据。方法:利用中药数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中医药综合数据库(traditional Chinese medicine integrated database,TCMID)、中医药整合药理学研究平台(integrative pharmacology-based research platform of traditional Chinese medicine,TCMIP)、中药成分靶点平台2.0(HIT 2.0)、传统中医分子机制生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechANism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)、草药-中医证候-西医症状-成分-靶标-疾病关联网络数据库(symmap integrates traditional Chinese medicine,SymMap)等平台获取和筛选三仁汤的活性成分,并判断其生物活性;得到有效活性成分对应的靶点基因,输入Uniprot数据库,将靶点标准化;利用人类基因组数据库(the Human Gene database,GeneCards)、药物靶标数据库(therapeutic target database,TTD)、比较毒物基因组学数据库(the comparative toxicogenomics database,CTD)和药物银行数据库(DrugBank)获取PCOS和T2DM疾病靶点,得到三仁汤治疗PCOS和T2DM的共同作用靶点;采用Cytoscape 3.7.1软件绘制三仁汤“异病同治”的“单味药-活性成分-共同靶点”网络图;利用STRING平台绘制蛋白相互作用网络;通过注释、可视化和综合发现数据库(the database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)、R语言(R studio)等平台进行生物过程分析,获得Mode节点分析、基因本体论(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析结果。结果:共筛选得到三仁汤有效活性成分50个、PCOS疾病靶点23332个、T2DM疾病靶点28438个,三仁汤“异病同治”PCOS和T2DM的共同靶点214个;蛋白质相互作用(protein-protein interaction networks,PPI)筛选出39个关键靶点;GO及KEGG富集分析结果显示:三仁汤“异病同治”主要涉及炎症反应、缺氧反应、凋亡过程、HIF-1信号通路、钙离子信号通路、胰岛素抵抗等;MCODE分析结果显示:三仁汤“异病同治”可能与活性氧反应、凋亡相关信号通路、白细胞介素17(interleukin-17,IL-17)信号通路、脂肪酸代谢过程等相关;三仁汤“异病同治”的关键靶点为蛋白激酶B1(protein kinase b alpha,AKT1)、肿瘤蛋白53(tumor protein p53,TP53)、半胱天冬酶3(caspase 3,CASP3)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)及IL-6等。结论:三仁汤可能通过多靶点、多通路、多途径的作用机制,对PCOS和T2DM患者发挥作用,取得异病同治的效果。
