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利用外转录间隔区对中国人参和西洋参进行分子鉴定
被引量：
1
1
作者
邓菁
张甜甜
+2 位作者
王迪
金海珠
王洪涛
《食品与生物技术学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期420-423,共4页
人参和西洋参是我国两种重要的中药材。两者虽然形态相似,但药性差异较大。为了建立一种简单高效的中国人参和西洋参的分子鉴别方法,作者利用从核DNA的外转录间隔(ETS)发掘的人参和西洋参单核苷酸多态性位点(SNP),分别设计了人参和西洋...
人参和西洋参是我国两种重要的中药材。两者虽然形态相似,但药性差异较大。为了建立一种简单高效的中国人参和西洋参的分子鉴别方法,作者利用从核DNA的外转录间隔(ETS)发掘的人参和西洋参单核苷酸多态性位点(SNP),分别设计了人参和西洋参的等位基因特异性引物,并利用多重PCR对人参和西洋参进行了鉴定。结果表明,作者建立的多重PCR体系可以有效地对人参、西洋参及两者的混合品进行鉴定。
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关键词
人参
西洋参
外转录间隔区
单核苷酸多态性
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职称材料
栽培丹参居群外转录间隔区(ETS)遗传多样性分析
被引量：
2
2
作者
冯洁
尹艳艳
+4 位作者
廖芳
孔德英
马浩予
唐嘉浩
李关荣
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第12期29-38,共10页
为了解栽培丹参居群核糖体RNA基因外转录间隔区(ETS)的遗传多样性及其系统发育关系,该研究以征集到的国内40份栽培丹参居群为材料,采用PCR首次成功扩增了栽培丹参居群的ETS序列,利用生物信息学手段对其序列进行了分析比较.结果表明:40...
为了解栽培丹参居群核糖体RNA基因外转录间隔区(ETS)的遗传多样性及其系统发育关系,该研究以征集到的国内40份栽培丹参居群为材料,采用PCR首次成功扩增了栽培丹参居群的ETS序列,利用生物信息学手段对其序列进行了分析比较.结果表明:40个栽培丹参居群的ETS序列长度为421~433 bp,其中32个栽培丹参居群ETS序列长度为422 bp;GC含量为56.8%~62.8%,向GC方向偏斜;共有241个单核苷酸多态性(SNP)变异位点,变异率高达54.8%,有205个简约信息位点;基于ETS序列的SNP指纹可以鉴定14个栽培丹参居群.贝叶斯分析表明:其最佳核苷酸替代模型为HKY+I.对ETS序列的遗传多样性分析表明:栽培丹参在物种水平上存在非常丰富的遗传多样性.中性检验显示其在p>0.10的水平差异不具有统计学意义,符合中性进化模型.基于ETS序列的系统进化树表明:40个栽培丹参居群聚类在2个系支上,其中最大似然法(ML)和邻近连接法(NJ)聚类结果一致,较最大简约法更适合丹参ETS聚类分析.
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关键词
丹参
栽培居群
外转录间隔区
遗传多样性
系统发育关系
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职称材料
题名
利用外转录间隔区对中国人参和西洋参进行分子鉴定
被引量：
1
1
作者
邓菁
张甜甜
王迪
金海珠
王洪涛
机构
烟台大学生命科学学院
出处
《食品与生物技术学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期420-423,共4页
基金
山东省自然科学基金项目(2013ZRCQ021)
文摘
人参和西洋参是我国两种重要的中药材。两者虽然形态相似,但药性差异较大。为了建立一种简单高效的中国人参和西洋参的分子鉴别方法,作者利用从核DNA的外转录间隔(ETS)发掘的人参和西洋参单核苷酸多态性位点(SNP),分别设计了人参和西洋参的等位基因特异性引物,并利用多重PCR对人参和西洋参进行了鉴定。结果表明,作者建立的多重PCR体系可以有效地对人参、西洋参及两者的混合品进行鉴定。
关键词
人参
西洋参
外转录间隔区
单核苷酸多态性
Keywords
Panax ginseng
,Panax quinquefolius,ETS,SNP
分类号
R282.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
栽培丹参居群外转录间隔区(ETS)遗传多样性分析
被引量：
2
2
作者
冯洁
尹艳艳
廖芳
孔德英
马浩予
唐嘉浩
李关荣
机构
西南大学农学与生物科技学院
天津海关动植物与食品检测中心
重庆海关技术中心
出处
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第12期29-38,共10页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFF0210303,2017YFF0210305).
文摘
为了解栽培丹参居群核糖体RNA基因外转录间隔区(ETS)的遗传多样性及其系统发育关系,该研究以征集到的国内40份栽培丹参居群为材料,采用PCR首次成功扩增了栽培丹参居群的ETS序列,利用生物信息学手段对其序列进行了分析比较.结果表明:40个栽培丹参居群的ETS序列长度为421~433 bp,其中32个栽培丹参居群ETS序列长度为422 bp;GC含量为56.8%~62.8%,向GC方向偏斜;共有241个单核苷酸多态性(SNP)变异位点,变异率高达54.8%,有205个简约信息位点;基于ETS序列的SNP指纹可以鉴定14个栽培丹参居群.贝叶斯分析表明:其最佳核苷酸替代模型为HKY+I.对ETS序列的遗传多样性分析表明:栽培丹参在物种水平上存在非常丰富的遗传多样性.中性检验显示其在p>0.10的水平差异不具有统计学意义,符合中性进化模型.基于ETS序列的系统进化树表明:40个栽培丹参居群聚类在2个系支上,其中最大似然法(ML)和邻近连接法(NJ)聚类结果一致,较最大简约法更适合丹参ETS聚类分析.
关键词
丹参
栽培居群
外转录间隔区
遗传多样性
系统发育关系
Keywords
Danshen(Salvia miltiorrhiza)
cultivated population
external transcribed spacer(ETS)
genetic diversity
phylogenetic relationship
分类号
Q949.777.6 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用外转录间隔区对中国人参和西洋参进行分子鉴定
邓菁
张甜甜
王迪
金海珠
王洪涛
《食品与生物技术学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
栽培丹参居群外转录间隔区(ETS)遗传多样性分析
冯洁
尹艳艳
廖芳
孔德英
马浩予
唐嘉浩
李关荣
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
在线阅读
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职称材料
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