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紫薇R2R3-MYB基因家族鉴定及其外源激素响应表达分析
1
作者
刘子依
王景芸
+1 位作者
续言
蔡明
《江西农业大学学报》
北大核心
2025年第4期947-960,共14页
【目的】旨在探究紫薇R2R3-LiMYB基因家族的特征及其在外源激素响应中的作用,为紫薇芳香品种的分子育种提供理论基础。【方法】以三年生紫薇‘Whit III’盆栽苗为试验材料,基于紫薇基因组,采用生物信息学方法对R2R3-LiMYB家族进行全基...
【目的】旨在探究紫薇R2R3-LiMYB基因家族的特征及其在外源激素响应中的作用,为紫薇芳香品种的分子育种提供理论基础。【方法】以三年生紫薇‘Whit III’盆栽苗为试验材料,基于紫薇基因组,采用生物信息学方法对R2R3-LiMYB家族进行全基因组鉴定,并通过qPCR技术检测分析17个在开花期表达的R2R3-LiMYBs基因在茉莉酸甲酯(0.25%)和水杨酸(0.4,0.7,1.5 g/L)处理下的表达模式。【结果】(1)在紫薇基因组中共鉴定出207个R2R3-LiMYBs基因,其不均匀分布于24条染色体上,主要定位于细胞核、线粒体和叶绿体。系统进化分析将紫薇与拟南芥的R2R3-MYBs分为21个亚组,其中3个进化枝仅包含R2R3-AtMYBs基因。(2)顺式作用元件分析表明,R2R3-LiMYBs基因的启动子区域含有大量光响应、非生物胁迫响应及激素响应元件,且不同成员具有不同的元件组合。(3)表达模式分析显示,多数R2R3-LiMYBs基因在紫薇初开期和盛开期高表达;qPCR结果表明12个R2R3-LiMYBs经过0.25%MeJA处理后下调表达,但其表达量有差异;只有Lin_chr3_1451和Lin_chr10_0902在3个质量浓度的SA处理下表达量均下调,其余R2R3-LiMYBs经过SA处理后上调表达,但不同基因对不同质量浓度的SA的响应模式各异,其中6个基因在0.7 g/L处理下表达量最高。【结论】R2R3-LiMYBs基因在花发育过程中呈现阶段特异性表达,并对植物激素信号(如茉莉酸甲酯和水杨酸)表现出动态响应,其表达水平受激素质量浓度调控。R2R3-LiMYBs基因可能参与紫薇对MeJA和SA的复杂响应机制。
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关键词
紫薇
R2R3-MYB基因家族
生物信息学
外源激素响应
表达模式
在线阅读
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职称材料
番茄复三螺旋基因响应外源激素和非生物胁迫的研究
被引量：
3
2
作者
崔宝禄
李纷芬
陈国平
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第8期1372-1379,共8页
复三螺旋(double-trihelix)基因在植物形态建成和植株抗逆性方面发挥关键作用。该研究以番茄自交品种AC++为试验材料,运用生物信息学方法与qRT-PCR技术对5个复三螺旋成员(SlGTL1~SlGTL5)在番茄体内不同器官的表达模式、以及基因对激素...
复三螺旋(double-trihelix)基因在植物形态建成和植株抗逆性方面发挥关键作用。该研究以番茄自交品种AC++为试验材料,运用生物信息学方法与qRT-PCR技术对5个复三螺旋成员(SlGTL1~SlGTL5)在番茄体内不同器官的表达模式、以及基因对激素与非生物胁迫的响应进行表达分析,以探讨番茄复三螺旋基因的功能。结果表明:(1)生物信息学分析显示,番茄中含有5个复三螺旋基因(SlGTL1~SlGTL5);进化树分析表明,番茄复三螺旋基因具有物种特异性。(2)qRT-PCR分析显示,番茄SlGTL3基因在根和茎中特异表达,其他4个基因均在果实中较高表达,表明不同番茄复三螺旋基因的表达具有组织特异性。(3)激素诱导表达结果显示,SlGTL1只响应ABA(1种)激素,而SlGTL5基因可响应4种激素,且速度较快。(4)非生物胁迫诱导证实,SlGTL3、SlGTL5基因可响应盐胁迫,SlGTL3~SlGTL5基因可响应极端温度,SlGTL3和SlGTL4基因可响应机械损伤;SlGTL1、SlGTL4和SlGTL5可响应脱水胁迫。研究认为,SlGTL3的功能可能与植株形态建成和非生物胁迫有关,其他4个基因的功能可能与果实的发育有关;推测SlGTL1可能与ABA信号途径有关,SlGTL5快速响应多种激素,可能位于信息传递的节点,其功能可能与信号传递有关。
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关键词
番茄
复三螺旋基因
表达模式分析
外源激素响应
非生物胁迫
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职称材料
题名
紫薇R2R3-MYB基因家族鉴定及其外源激素响应表达分析
1
作者
刘子依
王景芸
续言
蔡明
机构
北京林业大学
出处
《江西农业大学学报》
北大核心
2025年第4期947-960,共14页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(31500574)
“十三五”国家重点研发计划项目(2019YFD1001000)。
文摘
【目的】旨在探究紫薇R2R3-LiMYB基因家族的特征及其在外源激素响应中的作用,为紫薇芳香品种的分子育种提供理论基础。【方法】以三年生紫薇‘Whit III’盆栽苗为试验材料,基于紫薇基因组,采用生物信息学方法对R2R3-LiMYB家族进行全基因组鉴定,并通过qPCR技术检测分析17个在开花期表达的R2R3-LiMYBs基因在茉莉酸甲酯(0.25%)和水杨酸(0.4,0.7,1.5 g/L)处理下的表达模式。【结果】(1)在紫薇基因组中共鉴定出207个R2R3-LiMYBs基因,其不均匀分布于24条染色体上,主要定位于细胞核、线粒体和叶绿体。系统进化分析将紫薇与拟南芥的R2R3-MYBs分为21个亚组,其中3个进化枝仅包含R2R3-AtMYBs基因。(2)顺式作用元件分析表明,R2R3-LiMYBs基因的启动子区域含有大量光响应、非生物胁迫响应及激素响应元件,且不同成员具有不同的元件组合。(3)表达模式分析显示,多数R2R3-LiMYBs基因在紫薇初开期和盛开期高表达;qPCR结果表明12个R2R3-LiMYBs经过0.25%MeJA处理后下调表达,但其表达量有差异;只有Lin_chr3_1451和Lin_chr10_0902在3个质量浓度的SA处理下表达量均下调,其余R2R3-LiMYBs经过SA处理后上调表达,但不同基因对不同质量浓度的SA的响应模式各异,其中6个基因在0.7 g/L处理下表达量最高。【结论】R2R3-LiMYBs基因在花发育过程中呈现阶段特异性表达,并对植物激素信号(如茉莉酸甲酯和水杨酸)表现出动态响应,其表达水平受激素质量浓度调控。R2R3-LiMYBs基因可能参与紫薇对MeJA和SA的复杂响应机制。
关键词
紫薇
R2R3-MYB基因家族
生物信息学
外源激素响应
表达模式
Keywords
Lagerstroemia indica
R2R3-MYB gene family
bioinformatics
exogenous hormone response
expression pattern
分类号
S682.32 [农业科学—观赏园艺]
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
番茄复三螺旋基因响应外源激素和非生物胁迫的研究
被引量：
3
2
作者
崔宝禄
李纷芬
陈国平
机构
黔南民族师范学院生物科学与农学院
重庆大学生物工程学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第8期1372-1379,共8页
基金
国家自然科学基金(31960605)
贵州省科技厅基础研究计划([2018]1144)
+2 种基金
贵州省教育厅拔尖人才项目(黔教合[2016]111)
贵州省植物学重点支持学科(qnsyzw1802)
黔南民族师范学院重大科研创新基金(QNSY2018BS019,QNSY2018PT001)。
文摘
复三螺旋(double-trihelix)基因在植物形态建成和植株抗逆性方面发挥关键作用。该研究以番茄自交品种AC++为试验材料,运用生物信息学方法与qRT-PCR技术对5个复三螺旋成员(SlGTL1~SlGTL5)在番茄体内不同器官的表达模式、以及基因对激素与非生物胁迫的响应进行表达分析,以探讨番茄复三螺旋基因的功能。结果表明:(1)生物信息学分析显示,番茄中含有5个复三螺旋基因(SlGTL1~SlGTL5);进化树分析表明,番茄复三螺旋基因具有物种特异性。(2)qRT-PCR分析显示,番茄SlGTL3基因在根和茎中特异表达,其他4个基因均在果实中较高表达,表明不同番茄复三螺旋基因的表达具有组织特异性。(3)激素诱导表达结果显示,SlGTL1只响应ABA(1种)激素,而SlGTL5基因可响应4种激素,且速度较快。(4)非生物胁迫诱导证实,SlGTL3、SlGTL5基因可响应盐胁迫,SlGTL3~SlGTL5基因可响应极端温度,SlGTL3和SlGTL4基因可响应机械损伤;SlGTL1、SlGTL4和SlGTL5可响应脱水胁迫。研究认为,SlGTL3的功能可能与植株形态建成和非生物胁迫有关,其他4个基因的功能可能与果实的发育有关;推测SlGTL1可能与ABA信号途径有关,SlGTL5快速响应多种激素,可能位于信息传递的节点,其功能可能与信号传递有关。
关键词
番茄
复三螺旋基因
表达模式分析
外源激素响应
非生物胁迫
Keywords
Solanum lycopersicum
double-trihelix genes
expression patterns
phytohormonal treatments
abiotic stress
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
紫薇R2R3-MYB基因家族鉴定及其外源激素响应表达分析
刘子依
王景芸
续言
蔡明
《江西农业大学学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
番茄复三螺旋基因响应外源激素和非生物胁迫的研究
崔宝禄
李纷芬
陈国平
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
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