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复杂数量性状的遗传分析及功能作图
被引量：
2
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作者
黄中文
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2006年第11期19-22,共4页
大多数重要的生物学、生化和农学性状是数量性状,受1个基因网络控制,且易受环境因素影响。近20年来,随着统计学和分子生物学的迅猛发展,对数量性状的研究也逐渐深入,提出了很多研究方法。文中综述了QTLs的检测方法进展,评价了各种方法...
大多数重要的生物学、生化和农学性状是数量性状,受1个基因网络控制,且易受环境因素影响。近20年来,随着统计学和分子生物学的迅猛发展,对数量性状的研究也逐渐深入,提出了很多研究方法。文中综述了QTLs的检测方法进展,评价了各种方法的优劣,着重介绍了目前国际上最新提出的多维数量性状的研究方法———功能作图的思想。
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关键词
复杂数量性状
动态
性状
功能作图
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职称材料
基于全基因组选择预测玉米籽粒含水率
2
作者
董春林
张利
+5 位作者
李昊洋
宋莹璐
张鹏艳
张正
卜华虎
常建忠
《山西农业科学》
2025年第5期1-7,共7页
玉米作为我国重要的粮食作物,在保障我国粮食安全等方面发挥着重要作用。玉米成熟期籽粒含水率是玉米机械化粒收的重要衡量指标之一。培育成熟期低籽粒含水率的玉米品种是当前玉米育种的重要方向之一。籽粒含水率受复杂数量性状控制,单...
玉米作为我国重要的粮食作物,在保障我国粮食安全等方面发挥着重要作用。玉米成熟期籽粒含水率是玉米机械化粒收的重要衡量指标之一。培育成熟期低籽粒含水率的玉米品种是当前玉米育种的重要方向之一。籽粒含水率受复杂数量性状控制,单靠表型选择效率较低,全基因组选择技术能够对复杂数量性状进行快速筛选改良。在忻州和榆次2个地点对组配的250份玉米杂交种的籽粒含水率进行鉴定,结合基因型数据,利用9种GS模型开展全基因组选择分析。结果表明,玉米杂交种平均籽粒含水率为21.51%,变异系数为5.31%,广义遗传力为0.41,特殊和一般配合力方差比值σ^(2) SCA/σ^(2) GCA为0.20,表明玉米杂交种的籽粒含水率主要受加性效应控制。全基因组选择分析结果表明,9个GS模型的预测准确度平均为0.592,其中,rrBLUP、RKHS、BayesC、SVM等4个模型预测准确性较高,准确度均为0.600,LASSO模型的预测准确性最低,为0.572;当标记密度为2000个、训练群体大小为70%时,预测准确性就能达到较高水平。在此基础上,利用rrBLUP模型对4700份玉米杂交种GMC进行预测,发现Top 100杂交种的籽粒含水率平均为22.63%,Bottom 100杂交种的籽粒含水率平均为18.56%。选择籽粒含水率预测结果的Bottom 100杂交种进行育种,新玉米品种籽粒含水率相对于Top 100降低4.08%,相当于17.98%的增益。
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关键词
玉米
复杂数量性状
籽粒含水率
全基因组选择分析
标记密度
预测准确度
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职称材料
题名
复杂数量性状的遗传分析及功能作图
被引量：
2
1
作者
黄中文
机构
河南科技学院生命科技学院
出处
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2006年第11期19-22,共4页
基金
河南科技学院研究生重点支持项目(02130)
文摘
大多数重要的生物学、生化和农学性状是数量性状,受1个基因网络控制,且易受环境因素影响。近20年来,随着统计学和分子生物学的迅猛发展,对数量性状的研究也逐渐深入,提出了很多研究方法。文中综述了QTLs的检测方法进展,评价了各种方法的优劣,着重介绍了目前国际上最新提出的多维数量性状的研究方法———功能作图的思想。
关键词
复杂数量性状
动态
性状
功能作图
分类号
Q-332 [生物学]
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职称材料
题名
基于全基因组选择预测玉米籽粒含水率
2
作者
董春林
张利
李昊洋
宋莹璐
张鹏艳
张正
卜华虎
常建忠
机构
太原生态工程学校
山西农业大学山西有机旱作农业研究院
出处
《山西农业科学》
2025年第5期1-7,共7页
基金
山西农业大学生物育种工程(YZGC146)
中央引导地方科技发展资金项目(YDZJSX20231C018)
+1 种基金
山西省重点研发计划(202302140601018-2)
山西省现代农业产业技术体系建设专项(2025CYJSTX01-09)。
文摘
玉米作为我国重要的粮食作物,在保障我国粮食安全等方面发挥着重要作用。玉米成熟期籽粒含水率是玉米机械化粒收的重要衡量指标之一。培育成熟期低籽粒含水率的玉米品种是当前玉米育种的重要方向之一。籽粒含水率受复杂数量性状控制,单靠表型选择效率较低,全基因组选择技术能够对复杂数量性状进行快速筛选改良。在忻州和榆次2个地点对组配的250份玉米杂交种的籽粒含水率进行鉴定,结合基因型数据,利用9种GS模型开展全基因组选择分析。结果表明,玉米杂交种平均籽粒含水率为21.51%,变异系数为5.31%,广义遗传力为0.41,特殊和一般配合力方差比值σ^(2) SCA/σ^(2) GCA为0.20,表明玉米杂交种的籽粒含水率主要受加性效应控制。全基因组选择分析结果表明,9个GS模型的预测准确度平均为0.592,其中,rrBLUP、RKHS、BayesC、SVM等4个模型预测准确性较高,准确度均为0.600,LASSO模型的预测准确性最低,为0.572;当标记密度为2000个、训练群体大小为70%时,预测准确性就能达到较高水平。在此基础上,利用rrBLUP模型对4700份玉米杂交种GMC进行预测,发现Top 100杂交种的籽粒含水率平均为22.63%,Bottom 100杂交种的籽粒含水率平均为18.56%。选择籽粒含水率预测结果的Bottom 100杂交种进行育种,新玉米品种籽粒含水率相对于Top 100降低4.08%,相当于17.98%的增益。
关键词
玉米
复杂数量性状
籽粒含水率
全基因组选择分析
标记密度
预测准确度
Keywords
maize
complex quantitative traits
grain moisture content
genomic selection analysis
marker density
predic⁃tion accuracy
分类号
S513 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
复杂数量性状的遗传分析及功能作图
黄中文
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2006
2
在线阅读
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职称材料
2
基于全基因组选择预测玉米籽粒含水率
董春林
张利
李昊洋
宋莹璐
张鹏艳
张正
卜华虎
常建忠
《山西农业科学》
2025
0
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