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塔序润楠转录组测序及开花相关基因分析
1
作者
郜锐菲
辛静
+5 位作者
李启少
曹正英
李建运
王飞
袁梅
辛培尧
《种子》
北大核心
2025年第4期115-124,135,共11页
对塔序润楠(Machilus pyramidalis)开花相关基因进行分析,可为进一步开展塔序润楠生长发育、代谢调控等方面提供基础数据。基于Illumina HiSeq 2000高通量测序技术对塔序润楠的幼叶、花苞和成熟花3个组织进行转录组测序,并对获得的转录...
对塔序润楠(Machilus pyramidalis)开花相关基因进行分析,可为进一步开展塔序润楠生长发育、代谢调控等方面提供基础数据。基于Illumina HiSeq 2000高通量测序技术对塔序润楠的幼叶、花苞和成熟花3个组织进行转录组测序,并对获得的转录组数据进行功能注释、代谢通路等分析,利用相关软件挖掘花苞期和盛花期激素信号通路相关的表达基因。试验共获得120150条高质量Unigenes。经比对,在Nr、KEGG、KOG、Swiss-prot、GO等数据库中能得到注释的Unigene分别为39133、14929、37473、28345、17314条。在塔序润楠中鉴定出76个与拟南芥(Arabidopsis thaliana)开花相关的同源基因,其中有关花发育、光周期途径中鉴定到的最多。此外,还鉴定出58个与拟南芥植物激素信号同源的基因,它们分别参与了生长素、细胞分裂素及油菜素内酯素等信号通路。因此认为,生长素和赤霉素通路可能在塔序润楠花苞中表达增强,而油菜素内酯通路可能在成熟花中得到增强。
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关键词
塔序润楠
转录组
功能注释
开花基因
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题名
塔序润楠转录组测序及开花相关基因分析
1
作者
郜锐菲
辛静
李启少
曹正英
李建运
王飞
袁梅
辛培尧
机构
西南林业大学国家林业和草原局西南风景园林工程技术研究中心
云南林业职业技术学院
出处
《种子》
北大核心
2025年第4期115-124,135,共11页
基金
云南省重大科技计划专项(202302AE090018)。
文摘
对塔序润楠(Machilus pyramidalis)开花相关基因进行分析,可为进一步开展塔序润楠生长发育、代谢调控等方面提供基础数据。基于Illumina HiSeq 2000高通量测序技术对塔序润楠的幼叶、花苞和成熟花3个组织进行转录组测序,并对获得的转录组数据进行功能注释、代谢通路等分析,利用相关软件挖掘花苞期和盛花期激素信号通路相关的表达基因。试验共获得120150条高质量Unigenes。经比对,在Nr、KEGG、KOG、Swiss-prot、GO等数据库中能得到注释的Unigene分别为39133、14929、37473、28345、17314条。在塔序润楠中鉴定出76个与拟南芥(Arabidopsis thaliana)开花相关的同源基因,其中有关花发育、光周期途径中鉴定到的最多。此外,还鉴定出58个与拟南芥植物激素信号同源的基因,它们分别参与了生长素、细胞分裂素及油菜素内酯素等信号通路。因此认为,生长素和赤霉素通路可能在塔序润楠花苞中表达增强,而油菜素内酯通路可能在成熟花中得到增强。
关键词
塔序润楠
转录组
功能注释
开花基因
Keywords
Machilus pyramidalis
transcriptome
function annotation
flowering gene
分类号
S663.1 [农业科学—果树学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
塔序润楠转录组测序及开花相关基因分析
郜锐菲
辛静
李启少
曹正英
李建运
王飞
袁梅
辛培尧
《种子》
北大核心
2025
0
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