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基因组顺序快速测定法——引物移动法
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作者 贾志茹 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1993年第9期45-46,共2页
遗传学家们一致认为,他们需要更有效的手段来测定基因组顺序,这样才有希望按时按预定预算完成"人类基因组计划"。但许多专家怀疑,目前受青睐的"鸟枪"法("Shotgun"method)——先测定随机选择的一些重叠DN... 遗传学家们一致认为,他们需要更有效的手段来测定基因组顺序,这样才有希望按时按预定预算完成"人类基因组计划"。但许多专家怀疑,目前受青睐的"鸟枪"法("Shotgun"method)——先测定随机选择的一些重叠DNA片段的顺序,然后再将它们拼凑在一起——是否会使人类基因测序完成得更快速、更经济。 展开更多
关键词 基因顺序 测定 引物移动法
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植物热激蛋白基因表达的调控
2
作者 林鹿 傅家瑞 《生物技术通报》 CAS CSCD 1993年第12期1-2,共2页
植物热激蛋白(heat-shock proteins HSPs)是一类热激响应蛋白,在非热激情况下也存在于植物细胞的胞质、核、内质网、叶绿体、线粒体和微体内,热激时迅速增加。植物热激蛋白根据分子量和基因顺序分析可分为六个类型:HSP110(96~110kD、HS... 植物热激蛋白(heat-shock proteins HSPs)是一类热激响应蛋白,在非热激情况下也存在于植物细胞的胞质、核、内质网、叶绿体、线粒体和微体内,热激时迅速增加。植物热激蛋白根据分子量和基因顺序分析可分为六个类型:HSP110(96~110kD、HSP90(80~95kD)、HSP70(63~79kD)、HSP60(53~62kD)、HSP20(10~30kD)、和 HSP8.5(【9kD,又称泛有素 ubiquitin)。植物热激蛋自在进化上是高度保守的,不同植物的20kD 的 HSP20多肽氨基酸顺序有75%的相同性。 展开更多
关键词 热激蛋白 基因表达的调控 氨基酸顺序 UBIQUITIN 基因顺序 保守的 相同性 微体 非热 结构域
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儿童青少年双相情感障碍相关基因的生物信息学分析 被引量:10
3
作者 杨超 傅岳文 +2 位作者 张莉 王艳 杨萍 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2018年第33期4098-4103,共6页
目的揭示儿童青少年双相情感障碍(PBD)的发病机制,为PBD的基础研究和临床治疗提供新思路。方法 2018年2—7月,分别以"pediatric bipolar disorder sequencing""youth bipolar disorder sequencing"为关键词,在PubMe... 目的揭示儿童青少年双相情感障碍(PBD)的发病机制,为PBD的基础研究和临床治疗提供新思路。方法 2018年2—7月,分别以"pediatric bipolar disorder sequencing""youth bipolar disorder sequencing"为关键词,在PubMed检索2014年1月—2018年7月的文献,共获得32篇文献。挑选其中应用全外显子组测序或转录组测序研究且纳入患者例数超过10例的数据集,经检索筛选共得到5套完整数据集,包含4套全外显子组测序研究(去重之后共计包含175个潜在与PBD风险相关的基因)及1套转录组测序研究(包含41个潜在与PBD风险相关的重要基因)。去重之后的基因按照不同组学方法分成两组:来自全外显子组测序的175个基因(全外显子组)与来自转录组测序的41个基因(转录组),分别使用生物信息软件DAVID、KEGG、Panther、WebGestalt进行每组基因生物学功能(BP)的富集分析,通过KEGG、Panther数据库计算其所富集的通路。结果全外显子组基因富集分析结果显示,共得到9个显著富集的BP分类,发生重要影响功能变异基因的主要作用与阴离子跨膜转运、氯离子运输、胚胎发育、神经管发育模式相关,另有少量基因显著富集与肾上腺发育功能相关。转录组基因富集分析结果显示,共得到10个显著富集的BP分类,发生异常表达的基因主要集中在组蛋白泛素化、甲状腺素合成与水解、蛋白折叠、组蛋白修饰等蛋白合成或水解相关的功能。全外显子组基因在KEGG数据库中显著富集的通路主要为肌醇磷酸盐代谢、磷脂酰肌醇信号系统通路;转录组基因在KEGG数据库中显著富集的通路主要为泛素化调控的蛋白水解通路。全外显子组基因在Panther数据库中显著富集的通路主要包括血管生成相关通路与帕金森疾病类通路;转录组基因在Panther数据库中未见显著富集的通路。结论 PBD患者异常突变的PLCD3、DAG1、APLNR、EPAS1等基因与胚胎发育相关,且该类变异属于遗传自父母的胚系突变;PBD患者中异常突变或表达的基因与磷脂酰肌醇信号系统以及血管生成相关。 展开更多
关键词 双相情感障碍 儿童 青少年 基因组学 基因顺序 计算生物学
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DNA核苷酸顺序分析技术的新进展
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作者 张春燕 柴建华 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1993年第8期39-42,共4页
关键词 DNA 核苷酸 基因顺序
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颈链血苔虫线粒体基因组的测定及其系统发育学意义 被引量:2
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作者 孙名安 吴志刚 +4 位作者 申欣 任建峰 刘锡兴 刘斌 刘会莲 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2010年第1期89-94,共6页
本研究测定了颈链血苔虫的线粒体基因组。它是一个双链闭合环状分子,全长14144bp,与其他后生动物相比相对较小;颈链血苔虫线粒体基因组所有的基因都编码在同一条链上。相比其他后生动物它具有独特的基因排列顺序,而且与已发表的两个苔... 本研究测定了颈链血苔虫的线粒体基因组。它是一个双链闭合环状分子,全长14144bp,与其他后生动物相比相对较小;颈链血苔虫线粒体基因组所有的基因都编码在同一条链上。相比其他后生动物它具有独特的基因排列顺序,而且与已发表的两个苔藓动物线粒体基因组相比,基因排列顺序也显著不同,这说明苔藓动物线粒体基因组经历了大规模的基因重排过程。基因排列顺序比较分析的结果支持苔藓动物为原口动物的观点,提示我们基因排列顺序的比较分析可能会成为苔藓动物门进化地位确定的良好途径。 展开更多
关键词 苔藓动物 颈链血苔虫 线粒体全基因 系统发生 基因排列顺序
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普通小麦-簇毛麦6V代换系45S rDNA和5S rDNA位点的FISH分析 被引量:7
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作者 杨学明 姚金保 +1 位作者 马鸿翔 陈佩度 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期464-467,472,共5页
采用顺序基因组原位杂交和双色荧光原位杂交技术,对普通小麦-簇毛麦6V代换系K0736的45S rDNA和5S rDNA基因位点进行了分析。结果表明,该代换系2n=42,有1对簇毛麦6V染色体,为6V/6A代换系,45S rDNA位点有8对,位于7对染色体上。5S rDNA位点... 采用顺序基因组原位杂交和双色荧光原位杂交技术,对普通小麦-簇毛麦6V代换系K0736的45S rDNA和5S rDNA基因位点进行了分析。结果表明,该代换系2n=42,有1对簇毛麦6V染色体,为6V/6A代换系,45S rDNA位点有8对,位于7对染色体上。5S rDNA位点有6对,分别位于6对染色体上。在1AS、1BS、5DS的端部同时存在45S rDNA和5S rDNA位点,并在物理位置上紧密相邻。同时讨论了rDNA位点的数目和分布位置存在变异的可能因素。 展开更多
关键词 普通小麦-簇毛麦6V代换系 RDNA 顺序基因组原位杂交和荧光原位杂交技术
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分子和细胞遗传
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《麦类文摘》 1995年第5期59-59,共1页
W953692 操纵大麦几丁酶基因糊粉-特异性表达的强化子/沉默基因顺序的识别〔刊,英〕/Leah, R.…//Plant Journal. -1994. 6(4). -579~589〔WBTA.1995. 12(1). 683〕W953693 一种与Dnak类似的植物线粒体热激蛋白HSP68〔刊,英〕/Neumann,... W953692 操纵大麦几丁酶基因糊粉-特异性表达的强化子/沉默基因顺序的识别〔刊,英〕/Leah, R.…//Plant Journal. -1994. 6(4). -579~589〔WBTA.1995. 12(1). 683〕W953693 一种与Dnak类似的植物线粒体热激蛋白HSP68〔刊,英〕/Neumann, D. …//Planta. -1993. 展开更多
关键词 大麦发育 几丁酶基因 热激蛋白 植物线粒体 特异性表达 基因顺序 细胞遗传 标记基因 识别 糊粉
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大肠杆菌中三酶耦联合成α-酮异戊酸
8
作者 李雅婷 周丽 周哲敏 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2020年第13期18-23,共6页
α-酮异戊酸是生物合成和化学合成领域中重要的中间体,在医药和化学合成领域中具有广泛的研究和应用价值。将α-酮异戊酸合成途径中的乙酰乳酸合成酶、乙酰乳酸异构还原酶、二羟基酸脱水酶3种关键酶编码基因BsalsS、EcilvC、EcilvD克隆... α-酮异戊酸是生物合成和化学合成领域中重要的中间体,在医药和化学合成领域中具有广泛的研究和应用价值。将α-酮异戊酸合成途径中的乙酰乳酸合成酶、乙酰乳酸异构还原酶、二羟基酸脱水酶3种关键酶编码基因BsalsS、EcilvC、EcilvD克隆于pETDuet-1载体上,在E.coli BL21(DE3)中加强α-酮异戊酸的合成途径,获得出发菌株SDC。进一步优化3个关键酶基因在质粒上的排列顺序,并分别在基因后添加终止子,通过比较菌株粗酶液催化丙酮酸钠底物合成α-酮异戊酸产物的能力,获得了菌株CTSDT,其α-酮异戊酸合成量比菌株SDC提高了2.28倍。菌株CTSDT以葡萄糖为碳源发酵16 h后,α-酮异戊酸产量达到1.70 g/L,是改造前菌株SDC的3.36倍。研究结果为大肠杆菌中α-酮异戊酸的高效发酵合成奠定了基础。 展开更多
关键词 三酶耦联 α-酮异戊酸 基因排列顺序 生物合成 发酵
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