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题名基于基因重测序信息的大豆基因靶向CAPS标记开发
被引量：7
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作者
束永俊
李勇
柏锡
才华
纪巍
朱延明
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机构
东北农业大学生命科学学院
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出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第11期2015-2021,共7页
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基金
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2006AA100104和2007AA10Z193)资助
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文摘
为了开发大豆基因靶向的功能分子标记,本研究采用生物信息学方法分析了大豆基因重测序数据,筛选出酶切位点突变的SNP位点,设计PCR引物163对,选用东北地区主栽品种绥农14的DNA为模板进行PCR扩增,其中139对引物获得大小为400～1200bp的特异片段。以大豆绥农14、合丰25、Acher、Evans、Peking、PI209332、固新野生大豆、科丰1号和南农1138-2的DNA为模板,采用筛选的139对引物进行PCR扩增,对扩增产物进行酶切分析,发现73对引物的PCR产物具有酶切多态性,开发出CAPS标记73个。通过功能注释分析发现,这73个CAPS标记靶向的基因主要参与细胞内亚细胞定位过程、蛋白质的结合与催化以及代谢过程等,与大豆重要农艺性状的形成相关,可以用于大豆品种的鉴定和分子系统进化的研究。
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关键词
大豆
重测序数据
单核苷酸多态性
酶切扩增多态性序列
基因靶向功能标记
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Keywords
Soybean
Resequencing data
SNP
CAPS
Gene-driven functional marker
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分类号
S565.1
[农业科学—作物学]
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